PubMedLISTA数据库使用报告.doc

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1、-数据库使用报告【PubMed, LISTA】目录1PubMed1简介22收录围22.1MEDLINE22.2In Process Citations22.3OLDMEDLINE22.4Publisher-Supplied Citations23PubMed的特点34PubMed的检索界面35PubMed基本检索功能36辅助检索工具36.1移动的PubMed(PubMed Mobile)36.2单个引文匹配器(PubMed Single Citation Matcher)36.3批量引文匹配器(Batch Citation Matcher)36.4临床检索(Clinical Queries)3

2、6.5主题明确的查询(Topic-Specific Queries)37检索结果展示38实习作业38.1超声影像学在冠心病诊断中的应用研究39参考文献3目录2LISTA1.数据库名称32.数据库的资源情况33.检索技术与相应检索算符34.检索结果的呈现式和输出式35.是否有原文获取的36.选择一个题目,利用数据库进行检索3参考文献3PubMed数据库使用报告1 简介PubMed是一个医学文献检索服务系统。它提供免费MEDLINE等数据库检索,并提供部分付费全文服务,是美国医学图书馆(NLM)所属的生物技术信息中心(NCBI)于2000年4月开发的,基于的生物医学信息检索系统,建立在NCBI平台

3、上,是一个生命科学文献书目信息数据库,也是NCBI的巨大检索系统的一部分。主要提供基于Web的MEDLINE数据库检索服务,PubMed界面提供与综合分子生物学数据库的,其容包括:DNA与蛋白质序列,基因图数据,3D蛋白构象,人类孟德尔遗传在线,也包含着与提供期刊全文的出版商网址的等PubMed系统的特征工具栏提供辅助检索功能、侧栏提供其它检索如期刊数据库检索、主题词数据库检索和特征文献检索。提供原文获取服务免费提供题录和文摘,可与提供原文的网址,提供检索词自动转换匹配,操作简便、快捷。l 创建机构:美国医学图书馆(NLM)的全国生物技术信息中心(NCBI)l 官l 中国PubMed: pub

4、med./l 文献类型: 期刊论文、综述、以及与其它数据库l 载体类型:网络版文摘、全文数据库l 数量:PubMed包含超过2400万个生物医学文献的引文MEDLINE,生命科学期刊和网络书籍1。l 学科领域:生物医学2 收录围PubMed医学文献检索服务系统,其数据主要来源有:MEDLINE、OLDMEDLINE、Record in process、Record supplied by publisher等。2.1 MEDLINEMEDLINE数据库由美国医学图书馆(National Library of Medicine,简称NLM)编制,是印刷刊Inde* Medicus(医学索引)、I

5、nde* to Dental Literature(牙科文献索引)和Internationgal Nursing Inde*(国际护理索引)的光盘版,数据摘自3700种期刊,是生物医学的主要数据库。时间跨度1966年至今。2.2 In Process CitationsIn Process Citations 1996年8月开始,每天收录由MEDLINE的期刊出版商提供的尚未经过规化处理的数据,该库中的记录只具有简单的书目信息和文摘、记录标记为PubMed-in process。当该库中数据被标引MeSH词、文献类型及其他数据时,每星期转入MedLine一次,而被处理前的数据从该数据库中删除。

6、2.3 OLDMEDLINEOLDMEDLINE:含1950年至1965年期间发表的200万篇生物医学文献。OldMedline的记录没有MeSH字段和摘要,记录的标记为:PubMed-OLDMEDLINE for Pre1966。2.4 Publisher-Supplied CitationsPublisher-Supplied Citations (Articles Not in MEDLINE or IN Process)是由出版商提供的电子文献,每条记录标有PubMedas supplied by publisher。这些文献包括两种来源:MEDLINE收录围的文献,每日被添加到In

7、Process Citation中去,换上PubMedin process的标记,并赋予一个MEDLINE的数据识别号UI;不属于MEDLINE收录围的文献则只有PubMed数据识别号PMID而没有MEDLINE UI。3 PubMed的特点l 免费提供题录和文摘l 可与提供原文的网址(部分免费获取)l 提供检索词自动转换匹配l 操作简便、快捷4 PubMed的检索界面简单检索界面其他更多的资源辅助检索工具相关介绍基本检索框高级检索界面,提供布尔逻辑检索及各种类别的检索。5 PubMed基本检索功能l 单词、短语、词组检索在检索框中输入具有实际含义的上述词,系统会自动匹配,得到检索结果。l 作

8、者检索输入格式:姓+名缩写(不用标点,e.g.: smith ja )系统会自动在作者字段进行检索,或者使用作者的全名,(e.g.: john a smith)l 期刊名称检索在搜索框中输入期刊名称或缩写、ISSN号。例如在journal Molecular Biology of the Cell期刊上搜索关于drosophila。就可以在检索框中输入:molecular biology of the cell drosophilal 截词检索在词的末尾加*”号,PubMed就会检索出以该词为词根的所有的词。截词检索将关闭自动词语匹配功能。l 带逻辑运算符的复合检索如我们要检索肿瘤的诊断和治疗

9、面的文献,我们可以在基本检索输入框中输入:cancer AND (diagnosis OR therapy),布尔逻辑运算符有: AND,OR或NOT。l 该数据库还给出了禁用词列表6 辅助检索工具6.1 移动的PubMed(PubMed Mobile)它可以通过移动设备访问,提供一个移动友好,简化的页面2。包含超过2400万对生物医学文献的引文MEDLINE,生命科学期刊和网络书籍,引用可能包括从公共医学中心和出版商的全文容Error! Reference source not found.。6.2 单个引文匹配器(PubMed Single Citation Matcher)利用该工具可以

10、找到PubMed数据库中的引文。输入题录信息,查找特定文献。刊名要准确,缩写要标准,著者大小写不敏感如查找:智彪教授1997年发表在Ultrason Sonochem期刊上的一篇文章的其他作者的名字6.3 批量引文匹配器(Batch Citation Matcher)如果一次要查找的文献多于一篇,就应该使用Batch Citation Matcher。当文献数小于100篇时,可将待查文献的信息以下列的格式填写到文本框中。journal_title|year|volume|first_page|author_name|your_key|字段之间用竖线之间隔开,结果也应使用一个竖线。不同的文献应用

11、不同的行。当文献数大于100篇时,可以使用email功能。具体的做法是:步骤1:输入你的地址。步骤2:按上面的格式在你的本地建立一个文件,然后按浏览指明该文件。步骤3:经过几分钟的处理后,检索的结果会发送到你的。如果没有找到合适的匹配结果,将会返回下列的字符串。INVALID_JOURNAL输入的期刊名不合法。NOT_FOUND期刊名合法,但没有找到相应的记录。AMBIGUOUS对一条记录找到多条文献,这时应该使用Single Citation Matcher来查找所有的结果。注意:可以用数据库旁边的下拉菜单在PMC和PUBMED之间进行切换。大小写不区分。Your key是你自己选择的标记该

12、文献的一个字符串,服务器不会对它作任的更改,按原样返回。期刊名一栏可以填写全名也可以填写MEDLINE中合法的缩写。除了期刊名外,其他的字段都可以不填写。如果你省略了一个字段,这个字段前后的竖线应该保留。6.4 临床检索(Clinical Queries)这个页面上的搜索结果仅限于特定临床研究领域,综合搜索,检索临床研究法学(循证医学)文献,主要涉及治疗、诊断、病因、和预后四个分类,并提供强调选择,即敏感度(强调查全)或专指度(强调查准)。有三个面的容:研究类别查询:治疗、诊断、病因学及预后系统评价查询医学遗传学查询:诊断、临床描述、管理、基因、分子遗传学、基因测试等容。检索系统评价医学遗传学

13、查询研究类别查询6.5 主题明确的查询(Topic-Specific Queries)该工具可以将检索限定在*一具体的主题中,如下图所示:7 检索结果展示例如检索:aids diagnosis and therapy”检索历史右侧工具栏,提供简单分析是否有全文左侧工具栏,精简检索结果提供全文还可以将检索结果输出8 实习作业8.1 超声影像学在冠心病诊断中的应用研究分析:中心词:超声影像学、冠心病翻译:Ultrasonic imaging,Coronary heart disease (CHD)1) 简单检索:得到检索结果5297条,如下图所示2) 利用主题词检索l 查看Ultrasonic i

14、maging是否在MeSH从中可以看出ultrasonngraphy在主题词表中,可以分类在diagnosis底下。l 查看Coronary heart disease是否在MeSH可以看到Coronary disease是在heart disease的分类下,且它具有上位词和下位词。l 确定检索式为coronary diseaseMeSH Terms OR coronary heart diseaseTe*t Word AND ultrasonography Subheading得到检索结果为:2574条l 进一步缩小结果围限定检索围为:diagnosis和therapy.确定检索式为:(C

15、oronary Disease/diagnosisMesh OR Coronary Disease/therapyMesh AND coronary heart disease Te*t Word)AND ultrasonography Subheading9 参考文献1. .ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK3827/*pubmedhelp.PubMed_Quick_Start2. en.wikipedia.org/wiki/PubMed*PubMed_identifierLISTA数据库报告1. 数据库名称LISTA数据库的英文全文名称为Library,Informati

16、on Science & Technology Abstracts,中文名称为图书馆学与信息科学与技术数据库。2. 数据库的资源情况文献类型:包括图书馆学、情报学等领域,在官的help文件中细分有图书馆,分类,编目,文献计量学,网络信息检索,信息管理等主题类型。1起始年限:1965年。官的help文件中介绍为20世纪60年代中期。1当前数量:在官的help文件中介绍为:LISTA包括560种核心期刊、接近50种重点期刊、125种选择性期刊,另外还有书籍、研究报告和会议集。13. 检索技术与相应检索算符有基本检索和高级检索。可以采用布尔逻辑算符,与或非来进行检索。另外,在高级检索中,检索选项比较

17、全,可以选择检索模式:布尔逻辑/词组、查找全部检索词语、查找任检索词语、智能文本检索4种检索模式,并可以勾选是否运用相关词语,还可以限制结果:有无参考、出版日期、出版物类型、语言、图像快速查看类型、有无学术期刊、出版物限定、文献类型、页数、是否图像快速查看这些条件均可以进行选择来限制最终的结果。其中在官的help文件中介绍为:有一些有用的技巧和提示,你可以用来提高你的搜索结果。例如,你可以使用布尔运算符搜索条件;和/或搜索限制到一个特定的标题。有时一个搜索可以过于一般(结果等太多的点击)或过于具体(结果等于几次)。调整您的搜索,你可以使用与,或,而不是运营商来连接你的搜索词。这些运营商将帮助你

18、缩小或扩大搜索围来更好地表达你所寻找的,你需要迅速准确的信息检索条件。使用和”运算符:如果你有一个搜索词,太笼统,你可以添加几项一起使用”和。通过将关键词语,你可以进一步定义你的搜索和减少结果。注意:除非你确定一个特定的搜索领域,结果列表中包含所有搜索词位于引文,或全部显示。例如,技术和信息查找的结果,是指技术信息。使用或”算子:为了扩大搜索,你可以联系在一起用或”操作。用”或连接你的词语,你可以找到多主题文件。这个算子的联系,你的话是同时搜索和彼此独立。作为一个例子,搜索技术和信息或计算机查找结果,参考术语技术”和信息”,或计算机”。使用不”算子:为了缩小搜索,您可以词采用不”算子。此操作将

19、帮助您筛选出特定的主题,你不希望包含在你的搜索部分。14. 检索结果的呈现式和输出式主搜索页面结果呈现如下:进入子页面的结果呈现如下有多种导出式可供选择:5. 是否有原文获取的无6. 选择一个题目,利用数据库进行检索题目:企业战略管理对竞争情报需求的演变研究检索过程:1.首先使用:(keyword) enterprises AND (keyword) petitive intelligence AND (keyword) Strategy进行检索,发现效果不佳。2然后使用:T* enterprises AND T* petitive intelligence AND T* Strategy进行检索,发现效果有所改进。3经过分析,决定把战略”一词去掉,仅限定在企业中的竞争情报即可。发现结果比较理想。参考文献1 web.b.ebscohost./ehost/search/selectdbsid=ec0a3fed-3449-4846-a2c1-2b54b44c5204%40sessionmgr114&vid=0&hid=107. z.

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