《生物外文文献ppt课件.pptx》由会员分享，可在线阅读，更多相关《生物外文文献ppt课件.pptx（22页珍藏版）》请在三一办公上搜索。
1、Granulin, a novel STAT3-interacting protein, enhances STAT3 transcriptional function and correlates with poorer prognosis in breast cancer,Reporter：,Triple-negative breast cancers,三阴性乳腺癌特指雌激素受体、孕激素受体及人表皮生长因子受体2均阴性的乳腺癌患者。三阴乳腺癌的预后与肿瘤大小和淋巴结状况关系不大，复发相对迅速，1-3年是复发高峰，脑转移发生率高。目前还没有特有的针对三阴性乳腺癌的治疗指南。因此其治疗一般按乳
2、腺癌常规标准治疗进行。,STAT3,信号传导与转录激活因子（SignalTransducerandActivatorofTranscription，STAT）蛋白家族是一组可以被不同的细胞因子受体激活的相关蛋白，在细胞因子-受体相互作用的过程中充当载体，保持信号在细胞内传递的内在特异性。在这些STAT蛋白当中，STAT3由于其与肿瘤的关系较为密切，越来越受到人们的重视。,STAT3被受体相关的Janus激酶（JAK）磷酸化，形成同二聚体或异二聚体，并转移到细胞核，在那里它们作为转录激活子。在许多细胞过程如细胞生长和凋亡中起关键作用。STAT3缺陷的小鼠胚胎在胚胎发育开始之后不能发育超过胚胎第7
3、天。似乎在这些发展的早期阶段，需要STAT3激活来进行胚胎干细胞（ESC）的自我更新。,FIG.1,15.5%,FIG.2,58%,GRN knockdown reduced the mRNA expression of these genes, similar to the effects of STAT3 knockdown,染色质免疫共沉淀技术（ chromatin immunoprecipitation assay, CHIP ）,染色质免疫共沉淀技术的原理是在保持组蛋白和DNA联合的同时，通过运用对应于一个特定组蛋白标记的生物抗体，染色质被切成很小的片断，并沉淀下来。是目前唯一研究体
4、内DNA与蛋白质相互作用的方法。这项技术主要用来分析目标基因有没有活性、或者分析一种已知蛋白（转录因子）的靶基因有哪些。ChIP-Seq的原理是：首先通过染色质免疫共沉淀技术（ChIP）特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段，并对其进行纯化与文库构建；然后对富集得到的DNA片段进行高通量测序。研究人员通过将获得的数百万条序列标签精确定位到基因组上，从而获得全基因组范围内与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段信息。,58%,Suggest that GRN may modulate the expression of STAT3 target genes in multiple ways. For
5、some STAT3 target genes, GRN enhances STAT3 DNA binding. For other genes, GRN does not significantly affect STAT3 DNA binding but may play a role in recruiting critical transcriptional cofactors instead.,FIG.3,SK-BR-3 cell，HER2过表达的乳腺癌细胞，STAT3可以通过特定的细胞因子激活。HER2是重要的乳腺癌预后判断因子，HER2阳性（过表达或扩增）的乳腺癌，其临床特点和生
6、物学行为有特殊表现，治疗模式也与其他类型的乳腺癌有很大的区别。,36%,FIG.4,LIF刺激,These findings are consistent with the observed reductions in STAT3 DNA binding and gene expression.,These findings indicate that GRN enhances cytokine-induced STAT3 activation and nuclear accumulation.,FIG.5,These findings suggest that the effect of g
7、ranulin depletion is mediated by decreased STAT3 transcriptional activity.,Suggesting that inhibiting GRN preferentially affects cells with activated STAT3,70%,Suggesting that some but not all phenotypes associated with GRN knockdown can be rescued by constitutively active STAT3.,FIG.6,These finding
8、s indicate that in primary breast cancers, GRN expression specifically correlates with enhanced STAT3 transcriptional activity in the presence of tyrosine-phosphorylated STAT3,2.2倍,Indicate that in primary breast cancers, GRN expression specifically correlates with enhanced STAT3 transcriptional act
9、ivity in the presence of tyrosine-phosphorylated STAT3,Discussion,STAT3 interacts with GRN in breast cancer cells,GRN enhances constitutive STAT3 transcriptional activity,GRN is necessary for maximal cytokine-induced STAT3 transcriptional activity,GRN increases the kinetics of STAT3 phosphorylation
10、and nuclear translocation,GRN enhances the tumorigenic phenotype of TNBC cells,GRN expression correlates with STAT3 gene expression signatures and reduced patient survival in human breast cancers,Thank You,Luciferase报告基因系统,Luciferase报告基因系统是以荧光素(luciferin)为底物来检测萤火虫荧光素酶(fireflyluciferase)活性的一种报告系统。荧光素
11、酶可以催化luciferin氧化成oxyluciferin，在luciferin氧化的过程中，会发出生物荧光(bioluminescence)。然后可以通过荧光测定仪也称化学发光仪(luminometer)或液闪测定仪测定luciferin氧化过程中释放的生物荧光。荧光素和荧光素酶这一生物发光体系，可以极其灵敏、高效地检测基因的表达。是检测转录因子与目的基因启动子区DNA相互作用的一种检测方法。,皮尔森相关系数（Pearson correlation coefficient）也称皮尔森积矩相关系数(Pearson product-moment correlation coefficient) ，是一种线性相关系数。皮尔森相关系数是用来反映两个变量线性相关程度的统计量。相关系数用r表示，其中n为样本量，分别为两个变量的观测值和均值。r描述的是两个变量间线性相关强弱的程度。r的绝对值越大表明相关性越强。,
