统计学常用数据处理软件ppt课件.ppt

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1、Chapter 13,常用数据处理和实验设计等科学软件,1 统计处理软件,通俗:EXCEL(非专业软件!)功能强大的统计学软件包:SAS,SPSS,SYSTAT简单实用:GraphPad Prism、Origin国产软件:DAS、DPS,Statistics Analysis System(SAS),统计软件界的巨无霸 (1G)设计上完全针对专业用户进行设计,因此其操作至今仍以编程为主,人机对话界面不友好,并且在编程操作时需要用户对所使用的统计方法有较清楚的了解,非统计专业人员掌握起来困难,SPSS,SPSS :Statistical Package for the Social Scienc

2、e。SPSS公司已决定将其全称更改为Statistical Product and Service solutions(统计产品与服务解决方案)。 是世界上公认的三大数据分析软件之一(SAS、SPSS和SYSTAT)相对好学,,SYSTAT,模块最完整之通用数据统计分析软件-SYSTAT结合高等统计与交谈绘图探索与分析资料.图形直接与资料相连增加资料探索的能力,可同时显示2D/3D图形, 像Excel一样的操作方式直觉好用. 而且常用的统计功能都要含在软件内。,SigmaPlot,SigmaPlot可以轻松地制作精美的二维与三维图形,图形效果远远超过SPSS统计软件。它还可以进行快速图形变换,

3、提供了多种图形模板,并且可以用html的文件格式输出。此外它也具有一般统计分析软件的功能,比如进行数据处理、统计检验以及数据打印。,SigmaPlot,SigmaPlot软件帮助你迅速建立精确的图表SigmaPlot与MicrosoftOffice系列全面兼容因此能从Excel容易地存取数据并且在PowerPoint中展示你的结果。SigmaPlot特别设计给科学家使用,允许自行建立任何所需的图型,可插入多条水平或垂直轴,指定Errorbar的方向,让您的图更光彩耀眼,只要用SigmaPlot将图制作完成即可动态连结给其它软件展示使用,并可输出成EPS、TIFF、JPEG等图形格式,,Grap

4、hPad Prism,Prism 统计分析绘图软件。特色:绘图迅速、页面编排容易、最容易使用的Curve fitting(具有线性及非线性功能)、内建统计功能及统计辅助辅导员、各种2D绘图方式。InStat统计软件,会一步一步的协助您,清楚的分析选项,独特的分析检查条列让您更容易了解结果。,GraphPad Prism is a powerful combination of biostatistics, curve fitting (nonlinear regression) and scientific graphing in one comprehensive program. Easi

5、ly organize, analyze and graph repeated experiments; pick appropriate statistical tests and interpret the results. PrismV 5 is available for both Windows and Macintosh.Prism is ideally suited to data plotting and analysis applications in the life sciences.,GraphPad InStat,InStat guides you step by s

6、tep. You dont have to know the name of the test you need. InStat helps you pick an appropriate test by asking questions about your data. If you are unsure, consult the extensive help screens, which explain the statistical reasoning in plain language,GraphPad InStat,InStat takes a kinder, gentler app

7、roach.All prompts to the user are in plain English and simple to follow. The program guides the user through a four-step process; defining the data type, entering data, choosing a statistical test, and presenting the results.The user navigates easily through these steps, to lucid and complete output

8、.The analysis checklists are a masterstroke.This small, but effective package is highly recommended.,Origin8-科学绘图和分析软件,Origin软件是OriginLab公司研发出的专业绘图和数据分析软件来提供研究人员、工程师和科学人员使用.。Origin的设计是以容易使用但却多功能且功能强大来满足广大的客户群的需求。Origin整合了C语言的程序计式功能可供用户自行开发客制化的绘图和分析工具。,Drug And Statistics( DAS),作者:孙瑞元 陈志扬 郑青山 特点:(1)针

9、对新药申报资料的特点 (2)不懂计算机的也能使用 (3)不精通医药统计的也能使用。独创的“仿例输入”和“一键完成”的功能大大方便用户的使用,确保DAS易用性。统计功能强大, 模块覆盖面广统计功能包括药学统计、定量药理、临床药理、群体分析、生物统计、回归与相关等6大模块是药学研究专业最好的软件要买!,DPS(Data Processing System ),制作单位:中国水稻研究所 唐启义 全中文用户界面、操作简便。在统计分析和模型模拟方面功能齐全,易于掌握,尤其是对广大中国用户,其工作界面友好。,2 设计、最佳化软件,做为一个科学研究人员,实验是免不了的。 1.如何提高实验的效率及精确性是一大

10、课题。 2.找出最少的实验次数且有最大精确性。用实 验设计的方法找出最佳化方法。3.简而言之,实验设计是运用统计分析的方法(如 直交法等)去藕合Decouple, Decomposition分 解出重要因子,用最少的成本和时间,去找出影 响实验的重要因子。,设计软件,Design Expert V7.1正交设计助手均匀设计,Design Expert V7.1,是目前使用最广的实验设计软件,非常容易使用。可作10个Factor, Responsesurface分析,提供3维图形观察,可大幅减少试验成本,并找出质量的关键;交谈式的二维图形可观察等高线图,并可以预测其特性,提供三维图形, 观察响应

11、曲面,以求得最佳化值,还可以实时的旋转任何角度并观察其变化.图形式最佳化,可以很清楚的显示多重响应的最佳值,Design-Expert拥有混合式设计可以最短的时间发现最佳化的公式。,例如若您的实验因子有X,Y,Z三项 透过实验设计可找出系统的反应 假设系统的反应是 f(x,y,z)=100X+10Y+Z 那我们就可以忽略Z因子,甚至是Y因子 因为整个系统几乎是由X因子所操控 系统的反应可以简化成 f(x,y,z)=100X,Design Ease V 7.0,Design Ease 是最容易最实用的实验设计软件,可分析2 level factorial, fractional factoria

12、l (到15变量),Plackett-Burman可到31变数。,Multisimplex V 2,实验设计及最佳化软件 MultiSimplex 用于实验设计及最佳化,使用Simplex Optimization方法求解最佳化之值,本方法在工业界及学术界使用超过30年以上。MultiSimplex可用于改进:产品质量改善、制程效率改进 、设备性能改善。主要特色:基本与修改之simplex方法、数值及绘图评估、从试验中发现最佳化条件之方向、可以处理数种最佳化问题、完整手册及在线辅助系统。,3 其他相关软件,图像数字化处理: Scion Image 4.03文献处理: EndndNote V 1

13、1 Reference Manager 9.0分子生物学软件,Scion Image 4.03,Scion Image for Windows is the Windows version of Scion Image, which is in turn a version of the popular Macintosh program, NIH Image, written at the National Institutes of Health. Scion Image may be used to capture, display, analyze, enhance, measure,

14、 annotate, and output images. Scion Image extensively supports Scion CG-7, LG-3, VG-5 and AG-5 frame grabber boards, and provides a powerful and complete image acquisition environment.,Scion Image 4.03,Scion Image for Windows supports color and grayscale image capture with Scion frame grabbers. It i

15、ncludes advanced capturing capabilities such as frame averaging and summation, frame sequence capture, and on-chip integration support. All current features of NIH Image have been included,Reference Manager 9.0,可以在线通过查找关键词搜索PubMed和609个Z39.50数据库中的专业资料,保存为本地文件。 资料内容和记录分上下两个屏幕,如有全文或想连接网络时敲键盘就可到相应的全文文章和

16、摘要。可以直接在WORD中查找资料,插入。在文章中对引用的文献格式化,引用的参考资料格式有很强的用户自定义功能,符合各种杂志对引用格式的要求,引用时不用多窗口切换。,Endnote,专门用于科技文章中管理参考文献数据库的软件。而且通过插件可以很方便地在word中插入所引用的文献,软件自动根据文献出现的先后顺序编号,并根据指定的格式将引用的文献附在文章的最后。如果在文章中间插入了引用的新文献,软件将自动更新编号,并将引用的文献插入到文章最后参考文献中的适当的位置。主要优点:英文文献兼容性好,可以通过Internet到Pubmed直接检索后保存到数据库中或者读入各种格式的 medline检索的结果

17、,Endnote,优点有1、根据杂志的要求自动生产参考文献,所以在写文章的时候你再也不要考虑如何根据杂志的要求进行排版了。2、随时调整参考文献的格式。使用这些软件可以在需要的时候随时调整参考文献的格式。3、方便自己查找文献。可以把自己读过的参考文献全部输入到Endnote里头,这样在查找的时候就非常方便。,Endnote,参考文献库一经建立,以后在不同文章中作引用时,既不需重新录入参考文献,也不需仔细地人工调整参考文献的格式。而且参考文献很多情况下可以直接从网上下载导入至库中,很方便。对文章中的引用进行增、删、改以及位置调整都会自动重新排好序。文章中引用处的形式(如数字标号外加中括号的形式,或

18、者是作者名加年代的形式,等等) 以及文章后面参考文献列表的格式都可自动随意调整。这对修稿另投特别有用。,Endnote,EndNote处理中文有点问题,主要是显示不正确,但其功能不受影响。实际上,真正的不方便之处在于中英文混合引用的时候。这时,由于习惯不同,中英文文献格式会出混乱。比如,某个文献的多位中文作者排列时出现类似“刘某某,张某某,et al”字样而不是中文习惯里的“刘某某、张某某,等”字样。与WORD的真正协同功能。安装了EN后,自动在WORD中建立了一个新的工具栏,我们在写作时最常用的几项功能都只需简单点击这个工具栏即可。,Omiga 2.0,Omiga作为强大的蛋白质、核酸分析软

19、件,它还兼有引物设计的功能。主要功能:编辑、浏览、蛋白质或核酸序列,分析序列组成。用Clustal. W进行同源序列比较,发现同源区。查找核酸限制性酶切位点、基元(Motif),设计并评估PCR、测序引物。查找蛋白质水解位点(Proteolytic Sites)、二级结构等。提供一个很有特色的类似于核酸限制酶分析的蛋白分析,对蛋白进行有关的多肽酶处理后产生的多肽片段分析。,Band leader 3.0,凝胶图像处理软件,提供处理DNA或蛋白分子凝胶电泳图象和从凝胶电泳图象获得相关数据的工具。它可以对电泳图谱进行半定量分析,识别扫描得到的WINDOWS图象格式 .BMP,是一个难得的好软件。注

20、册免费。,Band leader 3.0,Image analysis software for Gel Electrophoresis samplesBand Leader provides tools for processing images and extracting information relevant to Gel Preparations of DNA and protein molecules.The software is intended for researchers and developers in the fields of Genetics and Mole

21、cular Biology who need a tool for the analysis of data available through Gel Electrophoresis and similar methods.,Volocity LE 3.5.1,免费显微图像处理软件。用来处理显微图像,并可对切片图像进行处理,生成3维图像。,Volocity LE 3.5.1,A feature-filled, user friendly software product, provided free of charge to scientists. Positioned at the hea

22、rt of the Volocity family, this no-cost download accepts a range of file formats and includes functionality to view data in 2D, 3D and even 4D, as well as providing tools for image enhancement such as noise reduction filters. Highly useful to any imaging scientist, but also a great way to test drive

23、 the intuitive user interface and core features of the Volocity product range.,科学软件相关网站,http:/,Prism应用实例,Origin 简介,Origin 简介,OriginLab公司的产品最新版本为 V8.0 Pro通用的科技绘图和数据分析软件定位于基础级和专业级之间国际科技出版界公认的标准作图软件科学和工程研究人员的必备软件之一主页:http:/,Origin绘制的图形 (2D部分),Origin绘制的图形 (统计图),Origin绘制的图形 (3D部分),Origin的主要结构体系 (一),表格(Worksheet)数据表操作数据编辑数据的导入导出数据的转换(运算)数据分析相关菜单:Edit, Column, Analysis, Statistics,Origin的主要结构体系 (二),图形处理(Graph)作图(类型选择)图形属性 (包括点、线、坐标、图例)数据点的处理(如Read, Mask)曲线的处理曲线分析曲线拟合图层(Layer)与多条曲线的操作相差菜单:Edit, Data, Analysis, Tools,Origin的主要结构体系 (三),其它函数图排版 (Layout)共享打印编程,

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