第七讲RNA的提取原理及提取技术ppt课件.ppt

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1、,RNA的提取原理及提取技术,RNA的分类: rRNA 核糖体核糖核酸 tRNA 转移核糖核酸 mRNA 信使核糖核酸 一个典型哺乳动物细胞含10-5ugRNA,其中 rRNA占80%-85%(28S、18S和5S) tRNA 占15%-20% mRNA占1%-5%,mRNA是单链的,易受到核酸酶的攻击,而RNA核酸酶存在十分广泛且稳定,耐热,能适应较宽的PH范围。,提取RNA 过程中防止RNA酶污染所采取的措施:,1 所有的玻璃器皿在烘箱(186 )中烘烤4-6h,不能高温灭菌的,用0.1%DEPC水溶液处理,再用洁净的蒸馏水冲洗;2 所用的水先用0.1%DEPC37处理12h以上,再经过高

2、压灭菌;3 全部试验过程中戴手套、口罩操作,并经常更换;,4 RNA电泳槽用去污剂洗涤,用水冲洗,乙醇干燥后,室温下用3%H2O2溶液浸泡10min,最后用0.1%DEPC处理过的水彻底冲洗; 5 工作区域应与进行普通微生物实验的区域分离,最好是单独的操作空间。,影响RNA提取的因素,材料:切忌使用反复冻融的材料;如若材料来源困难,且实验需要一定的时间间隔。可以先将材料贮存在样品贮存液中,于70或20保存;如要多次提取,请分成多份保存;液氮长期保存,70短期保存。,影响RNA提取的因素,样品破碎及裂解: 根据不同材料选择不同的处理方法:培养细胞:通常可直接加裂解液裂解;酵母和细菌:一般TRIz

3、ol可直接裂解,对于一些特殊的材料可先用酶或者机械方法破壁;动植物组织:先液氮研磨和匀浆,后加裂解液裂解。期间动作快速,样品保持冷冻。 注意:样品量适当,保证充分裂解。,TRIzol: 主要成分是苯酚。苯酚的主要作用是裂解细胞,使细胞中的蛋白,核酸物质解聚得到释放。苯酚虽可有效地变性蛋白质,但不能完全抑制RNA酶活性,因此TRIzol中还加入了8羟基喹啉、异硫氰酸胍、-巯基乙醇等来抑制内源和外源RNase。,影响RNA提取的因素,纯化: 在使用氯仿抽提纯化时,一定要充分混匀,且动作快速; 经典的纯化方法,如 LiCl 沉淀等,虽然经济,但操作时间长,易造成 RNA 降解; 亲和层析法纯化。,R

4、NA提取方法,异硫氰酸胍/苯酚法 原理: 异硫氰酸胍能使核蛋白复合体解离,并将RNA释放到溶液中,采用酸性酚/氯仿混合液抽提,低pH值的酚将使RNA进入水相,而蛋白质和DNA仍留在有机相,从而可以完成RNA的提取工作。,操作步骤:,1 液氮研磨组织或细胞;2 加入trizol试剂,进一步在保证RNA完整的情况下破碎细胞并溶解细胞成分;3 加入氯仿抽提,离心分离水相和有机相,收集含有RNA的水相;4 通过异丙醇沉淀,获得RNA 样品。,mRNA的提取,分离纯化完整的mRNA是进行分子克隆、基因表达分析的基础。,DNA或RNA浓度、纯度和相对分子质量的测定,1 仪器测定 紫外分光光度计 ssDNA=33 (OD2600D310) 稀释倍数 dsDNA= 50(OD2600D310) 稀释倍数 ssRNA=40 (OD2600D310) 稀释倍数,核酸蛋白测定仪,DNA纯度的判断 A260/A280=1.8 1.9表明有RNA污染 1.6表明有蛋白质、苯酚等污染RNA纯度的判断 A260/A280 1.72.0 1.7表明有蛋白质、苯酚的污染 2.0表明有异硫氰酸胍残存,2 琼脂糖凝胶电泳鉴定,DNA电泳图谱,RNA电泳图谱,思考题: 1 提取RNA 过程中防止RNA酶污染所采取的措施是什么? 2 如何根据A260/A280 的值判断DNA和RNA的纯度?,

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