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1、大数据时代的临床研究设计,科学研究的实质,用数据说话,数据是米,统计是锅,怎样用谷子做一顿香喷喷的饭,食 谱,稻谷:Raw data大数据,精米:Data,胃口:临床问题,食谱:临床研究设计,米制美食:米饭(RCT)年糕(队列研究)粽子(病例对照研究)汤圆(横断面研究)锅巴(Meta分析),临床研究成果论文,大数据处理,大数据时代的临床研究过程,大数据时代的新增特点,Cook 统计处理,加工,常用临床研究设计内容,观察性研究:描述性研究:病例报告、横断面研究、 纵向研究分析性研究:队列研究、病例对照研究试验性研究:随机对照研究(RCT)二次研究:系统评价、Meta分析、临床经 济学分析,随机对
2、照(RCT)研究,临床结局,干预,对照,随机分组,队列研究,临床结局,暴露,非暴露,病例对照研究,时间,病例组,对照组,调查方向,暴露,非暴露,暴露,非暴露,横断面研究,某人群,患者,非患者,随机样本,9,统计方法,初级统计方法:如t检验、方差分析、卡方检验等 只能得出两组间有差异的结论高级统计方法: 如线性回归、逻辑回归、Cox回归等 能得出某指标与疾病间的关系,统计难学吗,想成为统计专家,创新统计方法: So hard! 想用常用统计方法分析临床数据: So easy! Just so so!,11,统计方法学习投入,初级统计方法:一课时讲座 + 一次实践(发表一篇论文)高级统计方法: 二
3、课时讲座 + 一次实践(发表一篇论文),数据、大数据,传统数据: 可耗竭的Exhaustible,大数据: 极大的数据量, 一般情况下取之不尽,医学大数据: 极大的特征尺寸, 不规则时间序列, 高度多样化, 高度异质性, 高度稀疏,Its all about relative data size.,举个栗子 :,10列,2亿+行,TDW(Translational data warehouse ) Concepts,CATEGORY|CONCEPT,CPTICD9ICD10DEMLABNAACCRVITALRXCNDCETHNICITYTOB,| 86304: 174.4: D50.0| AG
4、E:57| CMEP:ALK| 2800:023: BP_SYSTOLIC| 895200| 00409189001: NOTHISPANIC| SMO:5,ProcedureDiseaseDiseaseDemographyLaboratory ResultsCancer RegistryVitalRxNorm ConceptNational Drug Code DirectoryEthnicityTobacco Use,Immunoassay for tumor antigen, quantitative; CA 125Malignant neoplasm of female breast,
5、 Upper-outer quadrantIron deficiency anemia secondary to blood loss (chronic)Age 57Comprehensive Metabolic Panel, Alkaline PhosphataseTumor size, 23mmSystolic blood pressureMorphine Sulfate 2 MG/ML Injectable SolutionMorphine Sulfate 2mg/ml 1ml Carpuject Luer Lock Syringe CIINot HispanicSmoking, 5 c
6、igarettes per day,15,DB2和N18的关系,DB2+N18: 418例DB2+N- : 4297例DB- N18: 1833例DB- N- : 6218例,17,exp(coef) exp(-coef) lower .95 upper .95 PDB 0.6194 1.6145 0.5530 0.6938 2e-16 *age 1.0130 0.9872 1.0095 1.0165 2.38e-13 *tob 1.0306 0.9703 0.9985 1.0637 0.0615 . bmi 1.0001 0.9999 1.0000 1.0001 0.0240 * hba1c
7、 1.0050 0.9950 0.9798 1.0308 0.7008 gfr 0.9571 1.0448 0.9532 0.9611 2e-16 *csr 0.9042 1.1060 0.8782 0.9309 1.25e-11 *bun 1.0033 0.9968 1.0005 1.0061 0.0224 * ldl 0.9987 1.0013 0.9957 1.0017 0.3979 hdl 0.9905 1.0096 0.9860 0.9949 2.94e-05 *tc 1.0019 0.9981 0.9992 1.0046 0.1650 tg 0.9999 1.0001 0.9994
8、 1.0003 0.6267 sbp 1.0045 0.9955 1.0024 1.0066 2.38e-05 *dbp 0.9966 1.0034 0.9928 1.0004 0.0794 .,HR,9 5 区 间,P值,HR倒数,18,Type 2 diabetes and incidence of cardiovascular diseases: a cohort study in 19 million people,Lancet Diabetes Endocrinol, 2015, 3: 10513IF: 16.32,DB2 VS,stable angina +, unstable a
9、ngina, myocardial infarction +, unheralded coronary death, heart failure +,transient ischaemic attack, ischaemic stroke +, subarachnoid haemorrhage -*, intracerebral haemorrhage,peripheral arterial disease +, abdominal aortic aneurysm -*,a composite outcome classified as arrhythmia or sudden cardiac
10、 death,怎样用谷子做一顿香喷喷的饭,食 谱,稻谷:Raw data大数据,精米:Data,胃口:临床问题,食谱:临床研究设计,米制美食:米饭(RCT)年糕(队列研究)粽子(病例对照研究)汤圆(横断面研究)锅巴(Meta分析),临床研究成果论文,大数据处理,大数据时代的临床研究过程,Cook 统计处理,加工,20,科学研究培训的升级演化,第一版:游击战 如临床研究沙龙第二版:阵地战 如临床研究骨干培训班第三版:立体化联合作战 如临床研究特训班,21,1. 培训利用思维导图阅读SCI论文的能力-获得idea2. 培训临床研究设计能力-顶层实现idea3. 培训高级统计方法-底层实现idea4. 培训R语言数据挖掘方法-获得可用数据5. 实战训练最终入选人员利用现有数据,完成一篇临床研究SCI论文,科学研究特训班初步规划,对待临床研究应有的态度,1. 热爱临床研究 (Hunger for)2. 在战略上不畏惧 在战术上不轻敌3. Just do it!,谢谢聆听!,