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1、人类基因组DNA提取及琼脂糖凝胶电泳分析,中南大学生命科学学院,第一节 实验目的,掌握人类基因组DNA提取的基本原理和方法,掌握琼脂糖凝胶电泳检测基因组DNA方法,第二节 实验原理,核酸提取思路:,破膜:细胞膜、核膜 分离:通过酶,有机溶剂,调节pH值,离心等 纯化:去除杂质,DNA提取原则:,保证DNA一级结构的完整性 排除其他分子的污染,使其纯度尽可能高 排除有机溶剂和金属离子的污染 蛋白质、多糖、脂类等降低到最低程度 排除其他核酸分子的污染,样品来源:,培养细胞 组织标本 血液样本,用细胞裂解液裂解细胞膜,收集细胞核,加入SDS破裂核膜,用蛋白酶K使核蛋白降解成小片段并从DNA上解离下来
2、,经苯酚氯仿抽提去除蛋白质,无水乙醇沉淀DNA,75%乙醇洗涤DNA沉淀,真空干燥后,溶解于TE中即得到高分子量的DNA。,本次实验使用的试剂盒系直接加入裂解液裂解细胞后,用蛋白酶K使核蛋白降解成小片段并从DNA上解离下来,再利用特殊硅基质膜吸附DNA的特性,可快速、高效地纯化回收基因组DNA。,离心吸附柱内的硅基质膜在高盐,低pH值状态下选择性地结合溶液中的DNA,再通过漂洗液将杂质去除,最后低盐,高pH值的洗脱缓冲液或去离子水将DNA从硅基质膜上洗脱。,高盐,低pH值:选择性结合DNA,漂洗,低盐,高pH值:DNA从硅基质膜上洗脱,第三节 主要试剂,主要试剂,培养细胞 RNase A(10
3、0mg/ml) ProteaseBuffer GR Buffer GL 无水乙醇 Buffer GW1 Buffer GW2 Buffer GE,第四节 主要仪器,微量移液器,台式微量离心机,电泳仪,凝胶成像系统,主要仪器,LIFE,第五节 操作步骤,1.样品处理:取1管细胞,做好标记,5000rpm离心3分钟,弃上清,收集细胞。,3.向以上溶液中加入20 l Protease K,混匀。,4.加入200 l Buffer GL,颠倒混匀15次,剧烈震荡至少1分钟。 注意:不要直接将Protease直接加入到Buffer GL。,5. 56孵育10分钟,其间颠倒混匀数次,6.加入200 l无水
4、乙醇,颠倒混匀10次,剧烈震荡。短暂离心,使管壁和壁盖上 的液体集中到管底。,第五节,操作步骤,7.将步骤5所得溶液全部加入到已装入收集管的吸附柱中,一次不能加完溶液,可分多次转入。12,000 rpm离心1分钟,倒掉收集管中废液,吸附柱重新放回收集管中。,2.加入200l GR,用移液器反复吸打几次,使细胞悬浮。,10.吸附柱置于一个新的离心管中,向吸附柱中间部位悬空加入60l Buffer GE, 室温放置2分钟,12,000 rpm离心1分钟,收集DNA溶液,-20保存DNA。,7.向吸附柱中加入500 l Buffer GW1,12,000 rpm离心1分钟,倒掉收集管中的 废液,将吸
5、附柱重新放回收集管中。,8.向吸附柱中加入500 l Buffer GW2,12,000 rpm离心1分钟,倒掉收集管中的 废液,将吸附柱重新放回收集管中。,9.10,000 rpm离心2分钟,倒收集管中的废液。吸附柱置室温2分钟,以彻底晾干。,第五节,操作步骤,11.取5 -10l基因组DNA,并加入2 l上样缓冲液,混匀,加样到1琼脂糖凝胶点样孔中,电泳检测分析。,第六节 注意事项,(1)试剂配制及保存规范,离心管及Tip头需经高压灭菌处理。,(2)基因组DNA长而弯曲,易断裂。操作过程中尽量轻缓,避免过度的 溶液吹打转移,以及过高的温度。,第六节,注意事项,第七节 结果分析,第七节,结果
6、分析,量:越多越好。量越多电泳区带越明亮。质量: a. 纯度越纯越好。A260/A280越接近1.8越好 b. 分子量越大越好。DNA分子量大于30KB,可满足一般实验要求。1.0的琼脂糖凝胶电泳,理想电泳结果:靠近点样孔,落后于Marker最后一条区带(约21KB)的位置可见一条明亮的区带。区带前方,不应有拖尾(降解),或较弥散的小分子量区带(RNA)。,M: DNA/HindIII+EcoRI DNA Marker;1-5: 基因组DNA基因组DNA的琼脂糖凝胶电泳结果图,第七节,结果分析,LIFE,课程相关资源,课程简介,课程简介,医学分子生物学-国家精品资源共享课,2013(http:/202.197.64.71:4505/),医学分子生物学-国家精品课程(本科),2008( http:/,生命科学学院资源共享平台( http:/),谢谢!,0731-8480 5449,