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1、1. 抽提RNA都是为了得到其mRNA,而mRNA和组织的状态密切相关,因此需要超低温的状态,一般选择用液氮保存组织。而且去的时候要尽可能的新鲜,动作要快,取后立即放入液氮罐中。2.提取RNA前要对脑组织进行研磨,切记要在液氮中进行,也是为了防止rna的降解。研磨要充分,使组织块变小。3.加入trizol后要充分吹打开,目的是使组织中的核蛋白体,多糖等与rna分离。4.其次是注意外源性的rna酶污染,操作全过程要戴口罩,手套。操作速度要快,冰上进行。我做过大鼠下丘脑组织的RT-PCR,在动物房将组织取好先放在RNafree的EP管中,放在冰盒内,然后再转移到实验室的70冰箱内,在抽RNA的时候
2、,脑组织最好要氯仿抽提两次,这个是我在别的地方看到的,但是真的很好用,可以改善RNA抽提的质量。用生理盐水或PBS冲洗掉血液,分切成50-100mg大小的组织块,早点把提RNA的试剂盒买过来就可以根据说明书加入变性液中(ep管内),80储存,到时候拿出来组织就很容易撵碎了。如果试剂盒没到,那就直接放在EP管中,提RNA的时候再拿出来再加也可以。就是组织可能会不容易撵碎一些。我觉得你可以用高压过的EDPC处理的水进行清洗(23次),后迅速切成合适的大小的组织(具体大小与RNA提取方法相关,我用的是TRNZOL法,一般取50100mg,)于EP管中,直接放到80度冰箱,不需要液体浸泡!到时直接取出
3、提取RNA即可!建议你的剪刀、镊子等物品最好DEPC处理过!1.组织块若没有很多血液,可直接冻存;2.若有较多血液,可用生理盐水冲洗;3.我以前取小肠组织时,先剪开自来水冲洗,再生理盐水冲洗;4.一般1cm左右就可以,根据标本将来的用途。5.直接原组织冻存。本实验室做过人子宫内膜FGF基因的克隆,方法是从子宫肌瘤切除的人子宫中撕下新鲜内膜组织,冻存与液氮总备用,实验前在液氮中充分研磨后提取总RNA。因为我们的目的是PCR出目的基因,因此并不要求材料100的纯净,只要引物正确,反应条件合适一般能克隆出目的基因。例如:从猪肝脏中提取总RNA(本人实验经验):采用Trizol试剂从新鲜猪肝脏组织中提
4、取总RNA。将液氮冻存的新鲜猪肝脏组织约50mg放入EP管中,用研磨杵迅速研磨,然后加入1mL Trizol试剂室温裂解5min。然后10000r/min,离心1min,将上清液转移到另一新的EP管中,加入200L氯仿轻轻混匀,室温静置3min。4,12000r/min,离心10min,转移上层水相至另一新的EP管中,加入0.5mL异丙醇混匀,室温静置5min。4,12000r/min,离心10min,可以看到白色的RNA沉淀贴于EP管底部,弃上清后用75%的乙醇洗涤,真空干燥后用100LDEPC处理过的ddH2O溶解RNA沉淀。含有RNA的溶解液立即反转录,剩余部分零下70冻存。另外我用过R
5、NA提取试剂盒效果也很好,方便,快速,纯度较高组织匀浆器械:DEPC水处理的匀浆器,一次性换药包,一次性刀片,DEPC水处理枪头,电动匀浆器1.新鲜或冰冻组织用蒸馏水冲洗除去表面污物切下1mm(3)组织块2.将组织放入1。5ml的试管底,试管配有研棒3.加入1mlTrizol4.插入研棒研磨碎组织块,旋转研棒将组织挤压在使馆壁上,10次左右(电动12次)5.因标本已匀浆话,将匀浆管至于4度冰桶中提取组织RNA提取RNA提取组织RNA的准备事项1。准备DEPC泡的枪头,以及DEPC泡的匀浆器2。用DEPC配制的1*PBS清洗组织3。准备DEPC水配制的75%的酒精,泡制手术器械。带者酒精在火上燎
6、一下。4。器械:离心管2支,吸管4个,酒精灯,打火机,记号笔,200ul,1000UL枪,DEPC泡过的枪头EP管,紫外照过的手套。滤纸,DEPC纯水(750ml无水乙醇150mlDEPC水,剧烈振荡,使劲的摇晃,直至混匀),氯仿,75酒精,异丙醇,Trizol,预冷的离心机(两种),EP管架(洗液擦洗),手套,灭菌剪刀,镊子(2个),冰桶,冰块,高灵敏度称量仪1.将组织取出后用眼科剪剪成1mm3左右的小块2.组织样品按50100mg/mlTrizol加入Trizol(组织体积不能超过Trizol体积的10,否则匀浆效果不好,(此时可预冷另一个离心机),研磨10次左右(剩余的组织至于冰桶中,最
7、后存于液氮中3.4度,12000g离心去除不溶物(匀浆得时候最好将匀浆器放置在冰水中以免发热)4.带双层手套,混合好的样品全部移置到0.1ml的EP管中,室温1530度静置5分钟5.加入0.2ml氯仿/1mlTrizol,盖好EP管,剧烈振荡(上下颠倒),15秒钟,室温静置23min6.28度,离心,10500rpm/min,15min,取上清,用200ul在20ul刻度使用,小心不要使界面混淆,剩余界面上不要)7.上清中加入等量的异丙醇(一般是0.5:1),颠倒5次(用200ul枪加小心),室温静置10min7. 2-8度离心,10500rmp/min,10min,弃上清8. RNA洗涤:7
8、5酒精(这次用的100。未影响)1ml沉淀,轻轻弹其底部(直接放入70度冰箱可以长期保存,静置几秒钟9 28度离心,8500rpm/min,5min ,弃上清10 取出滤纸,将EP管敞开放在滤纸上,管口向酒精灯(不要完全干燥,不好溶解)11. DEPC水溶解(30ul,可变),分装,2ul电泳,2ul比色,其余5ul分装至于手套中冻于20度中大概量为组织(ugRNA/mg组织):110ug28s是18s亮度的两倍(晾干时间过长会使RNA降解)根据我抽提的经验,当提取组织RNA时一般都有白色沉淀,当细胞量多的时候也可以看到少许,不应该是蛋白质。用酒精洗涤两次比洗一次好,然后等到差不多完全透明以后
9、再加DEPC水溶解,可以放四度冰箱过夜,然后比色。最好比色1.82.0,一般1.70以上都可以逆转录,没问题的。据我提取RNA的经验,一般在加入异丙醇并离心后都会在管底部看到一抹带状的白色沉淀,量不会很大,如果很大的话,预后并不乐观,蛋白污染而且严重降解。如果提取材料量少的话,也有看不到任何东西的情况,我就会弃之增大样本量,因为肉眼看不到的话,即使有也有限。而且我一般会在提取总RNA以后,跑胶看看提取的质量,有无降解,有无DNA污染,然后定量后才做RT的。所以我认为你应该适当增加提取的细胞数。1.TRIZOL:无论保存还是使用的时候都不要摇动,因为我们使用TRIZOL提取RNA实际利用的是异硫
10、氰酸胍/苯酚法,苯酚很容易被氧化,所以不要摇动,使用时也要从最底层吸取,也就是避免破坏表面的保护层。2.标本保存:提取组织RNA时涉及保存标本的问题,现在有一种样品储存液,其中含有RNase抑制剂,可以帮助保护RNA,当然仍需低温.另外还可以将标本浸在TRIZOL里,70或20即可。3.减少DNA污染:可以适当多加一些TRIZOL4.晾干:75酒精洗涤RNA沉淀后,需要晾干。建议75酒精洗后再用无水乙醇冲洗一边,这样液体挥发的比较快2.4.晾干:75酒精洗涤RNA沉淀后,需要晾干。建议75酒精洗后再用无水乙醇冲洗一边,这样液体挥发的比较快 我认为第四步有点问题,原理和操作都有问题!通常我这么来
11、晾干,1、尽量吸干75的乙醇;2、5000rpm短暂离心;3、再次用黄色tip头吸干,尽量吸干液体4、自然风干5min,绝对可以做以后的实验了!3.其实Trizol的工作容量是有一定限度的,当蛋白质特别丰富的时候,有的时候蛋白质不能全部沉在中间层,可以把上清提出来,用Trizol重新提取,(充分振荡,加氯仿)把蛋白质逐步去处。也可用酚氯仿反复抽提。需要特别指出的是,本人更推荐单独用酚充分振荡,然后再加氯仿,不提倡酚氯仿提前混在一起。我刚做过肝肺的。结果很不错。(斑竹给我加分鼓励我啊)一、组织抽提:1. 取组织块60左右,加入400600ul的TRIZOL用匀浆器撵成浆液状。2. 然后移到1.5
12、ml的EP管中,加入剩余的Trizol,最终Trizol的量为1ml。3. 冰上孵育5分钟5. 离心12,000g 4 5分钟 取上清液移入1.5ml新离心管。注意取组织块不要太多。太多反而效果不好。我们这么做出来的OD值都在1.9左右。后面的步骤就和做细胞的RT-PCR一样了。在反应体系中加入BSA(10100ug/ml)可屏蔽有害物质对PCR的抑制作用,提高扩增成功率。我们的方法如下:1、取材时,最好预先准备好去RNA酶的水或生理盐水,组织取下后,用RNA酶的水或生理盐水冲洗干净;2、器材最好200度干烤2小时,塑料制品用0.1DEPC水浸泡过夜,烤干后高压;3、我们一般放在液氮里,如果不
13、方便的话,可以从液氮里转到-80度冰箱。1各种器械一定要高温(180度4小时或200,2小时)烤,取材用的玻璃器皿,锡箔纸,最好都烤过。2塑料制品泡DEPC,高压后(去除残留的DEPC),烤干。3,操作时动作迅速,戴帽子口罩手套该是常识吧。4尽量用新鲜组织。非要保存当然要液氮,保存时间不宜过长。我们实验室用的只是普通高压过的器械,也没有什么问题。不放心的话,可以用DEPC泡一下再高压,至于TIP头还是泡一下,安全起见,但我同学提的时候从不用DEPC 也照样能提出来啊,他们说新的包装里面一般没有污染的,但装入盒时一定要带口罩阿如何去除RNA酶外源性来源1.被污染的缓冲液2.自动移液装置应采取的措
14、施1.当处理RNA酶时保证自动移液器专用2.将要用到的用于RNA试验的玻璃器皿、塑料制品和缓冲液留出来专用3.分成小份保存溶液或缓冲液并在用后丢弃。不用已经在试验室用于其他目的的材料或储存液4.留出专门用于分离RNA的电泳装置。用清洁剂清洗后再用流水冲洗,乙醇清洗干燥后加入3的H2O2。室温10分钟后用DEPC处理过的水彻底冲洗电泳槽5.准备所有的溶液和缓冲液时,使用无RNA酶的玻璃器皿、DEPC处理过的水,用于RNA的化学用品用一次性刮刀或直接敲击瓶底分离。可能的化,用0.1的DEPC在37处理溶液至少1小时后在15pis(1.05kg/cm2)高压蒸汽灭菌15分钟6.灭菌的玻璃器皿和塑料制
15、品不能有效灭活RNA酶。300烘烤玻璃器皿4小时。用DEPC活其他灭活基于接触的RNA酶的商业化产品处理塑料制品7.用声誉好的厂家证明无RNA酶的一次性移液器头和微量离心管。为了减少污染的机会,当从原包装去除这些小的器皿放在实验室架上时最好用无菌的镊子8.在分离RNA的过程中用抑制剂以抑制RNA酶的活性1 注意无酶操作,包括戴手套,口罩,EP管最好用DEPC水泡后高压。2 操作迅速,留取标本后尽快液氮冷冻保存或冻后放入-70度冰箱保存。使用专门处理过的冷冻管,进口的为佳。手套一定要戴,器械高温(300)消毒,标本液氮保存。组织液氮冻存后短时间内提取RNA,再将RNA -70度保存,可行吗?RN
16、A在-70度能保存多久?另一个问题,组织在-70度能保存多久?有个博士说她的组织在-70度保存一段时间后抽不出RNA了,建议一直保存在液氮内。RNA要想保存的时间长,最好保存在甲酰胺里面,用的时候再纯化了使用。或者提取的时候到用75乙醇洗涤时停止,将RNA沉淀保存在75乙醇(DEPC水配置)里面,放在20度冰箱,一年应该没有问题。要用新鲜的组织,至少也是用液氮处理后保存于-70度冰箱的组织.对于刚进实验室的研究生可能一片茫然,为了节省大家的时间,向大家介绍一下RTPCR所需的实验耗材及试剂。 首先,必须设计目的基因引物和内参照引物(或试剂盒自带)。 此时,你需下列产品: 1.DEPC 用纯水按
17、0.1%浓度配制 2.Tip 10ul 200ul 1ml 3.EP Tube (1.5ml) 4.Tip Box(10ul 200ul 1ml) 5.EP Box(1.5ml) 6.PCR Tube(200ul或500ul) 7.PE手套 将耗材及器皿等放入DEPC水中浸泡过夜,第二天高温高压灭菌,烘干,待用。 购买Total RNA试剂盒先做抽提RNA的预实验,也可将抽提样品的RNA于低温保存。最好现提现用。 引物合成好后,就可以做RT-PCR啦。 由于PCR的反应条件相对不好掌握,推荐二步法RT-PCR试剂盒(对于新手)。可以大大降低试剂盒成本。 RT-PCR产物出来后,接下来的工作就是
18、Agarose电泳,需要下列试剂:1.Agarose 2.EB 3.DNA Marker 4.Tris.base 5.EDTA 以上所述可根据个人具体情况作相应的调整。希望能给广大战友带来方便。最好是新鲜的,不就再买只大鼠嘛!另外,脑提RNA和用细胞提差不多,很容易:取出脑组织后放到研钵里,加RNA提取试剂,(不用加液氮),研之,不象其它组织,脑比较易碎.我做过大鼠下丘脑组织的RT-PCR,在动物房将组织取好先放在RNafree的EP管中,放在冰盒内,然后再转移到实验室的70冰箱内,在抽RNA的时候,脑组织最好要氯仿抽提两次,这个是我在别的地方看到的,但是真的很好用,可以改善RNA抽提的质量。
19、1.抽提RNA都是为了得到其mRNA,而mRNA和组织的状态密切相关,因此需要超低温的状态,一般选择用液氮保存组织。而且去的时候要尽可能的新鲜,动作要快,取后立即放入液氮罐中。2.提取RNA前要对脑组织进行研磨,切记要在液氮中进行,也是为了防止rna的降解。研磨要充分,使组织块变小。3.加入trizol后要充分吹打开,目的是使组织中的核蛋白体,多糖等与rna分离。4.其次是注意外源性的rna酶污染,操作全过程要戴口罩,手套。操作速度要快,冰上进行。 经DEPC处理好的东西如冻存管,应先在70-80度烤干后,再高压1、塑料制品:(包括枪头、EP管、匀浆管等)先将DEPC水从容量瓶中倒入瓷缸中,将塑料制品逐个浸泡其中,其中小枪头需要吸管打入DEPC水,过夜,然后高压,再烤干备用,实验前将枪头等放入吸头台,再高压一次(EP管)2、玻璃制品:泡酸过夜,冲洗干净,蒙锡纸烤干备用(DEPC水泡)(洗净后先泡1DEPC过夜,再烤干)3、剪刀 可以用DEPC处理后180-200度干烤2小时