第七章数量性状遗传.ppt

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1、第七章 数量性状遗传分析,提纲,I.数量性状的遗传分析1.数量性状及其特性2.数量性状的多基因假说(polygene hypothesis)II.数量性状遗传分析的统计方法III.数量性状的遗传变异和遗传率,质量性状(qualitative character):数量性状(quantitative character,quantitative trait,QT):,Back,遗传性状,数量性状的遗传分析,1.数量性状及其特性2.数量性状的多基因假说(polygene hypothesis),Back,1.数量性状及其特性,(1)连续变异的性状:如牛的泌乳量,农作物产量(2)不连续变异的性状:阈

2、性状(threshold character):如单胎动物每胎仔数。,2.数量性状的多基因假说(1).多基因假说及其实验证据:,多基因假说(polygene hypothesis,multiple factor hypothesis):数量性状是由许多对基因共同作用的结果,其中每一个基因的单独作用较小,与环境影响所造成表型差异差不多大小,因此,各种基因型所表现的表型就成为连续分布的数值了。例如:玉米穗长度的遗传 小麦粒色的遗传(Nilsson Ehle实验),玉米穗长度的遗传,AaBb,F1:,F2:,小麦粒色的遗传,Back,How the mutiple factor hypothesis

3、 accounts for the 1:4:6:4:1 phenotypic ratio of grain color when all alleles designated by uppercase letters are additive and contribute an equal amount of pigment to the phenotype.,阈值模型(threshold model),基本物质为呈连续分布的数量性状,而表型性状则为不连续分布的质量性状。基本物质处于某一特定范围内,表现为正常,如果超出某一阈值,表型就不正常,如血压,血糖含量等。基本物质受多基因控制,但性状的改

4、变仅发生在基本物质达到或者超过某一阈值时才发生。所以多基因控制的性状,也可以表现为非此即彼,全或无的表型。,Back,1 1一对基因 1 2 1 1 3 3 1两对基因 1 4 6 4 1 1 5 10 10 5 1三对基因 1 6 15 20 15 6 1 1 7 21 35 35 21 7 1四对基因 1 8 28 56 70 56 28 8 1,扬辉三角,The results of crossing two heterozygotes when polygenic inheritance is operative with 1-5 gene pairs.,A normal freque

5、ncy ditribution characterized by a bell-shaped curve.,表:多基因控制的数量遗传中等位基因数 目和基因型、表型数及分离比的关系,(2).微效多基因学说要点,1909年 Nilsson-Ehle 提出:其要点是:1 数量性状是许多对微效基因或多基因(polygene)的联合效应所造成。2 多基因中的每一对基因对性状表型的表现所产生的效应是微小的。多基因不能予以个别辨认,只能按性状的表现一道研究。3 微效基因的效应是相等而且相加的,故又可称多基因为累加基因。4 微效基因之间往往缺乏显性。有时用大写字母表示增效,小写字母表示减效。5.微效基因对环境

6、敏感,因而数量性状的表现容易受环境因素的影响而发生变化。微效基因的作用常常被整个基因型和环境的影响所遮盖,难以识别个别基因的作用。6 多基因往往有多效性,多基因一方面对于某一个数量性状起微效基因的作用,同时在其他性状上可以作为修饰基因(改变其他基因效果的基因)而起作用,使之成为其他基因表现的遗传背景。7多基因与主效基因(major gene)一样都处在细胞核的染色体上,并且具有分离、重组、连锁等性质。,Back,(3).数量性状的主效基因,主效基因:绵羊布罗拉(booroola)的基因:Montgomerry 等(1994),绵羊第6号染色体上。与绵羊的产羔数有关。猪应急综合征基因氟烷敏感基因

7、:第6染色体上。,(4)数量性状与选择,1909,约翰森:纯系说 纯系:,表:数量性状和质量性状的区别,II.数量性状遗传分析的统计方法,:性状统计资料:x1,x2,x3,xn平均数(mean):方差(variance,mean square):标准差(standard deviation,SD):直线相关与回归,1.平均数(mean):对性状的集中程度的度量。,例如:玉米穗长度资料:长度(cm):5 6 7 8 总计个数:4 21 24 857总和及总平方和:x=45+621+724+88=378x2=52 4+6221+7224+828=2544平均值:,X,I,表示样本中各个体的量度值。

8、如果在样本中有的个体量,度值相等,则可以合并为一组,以,m,i,表示组内的个体数,或,以,f,i,表示占总体样本的频数,则均值可表示为,:,X=,fi Xi,X=,fi Xi,=0.05(11)+0.15(12)+0.20(13)+0.35(14)+0.15(15)+0.10(16),=13.7,2.方差(variance),方差是度量离开平均数的变异程度,用变数(x)与平均数(x)的偏差的平均平方和(mean square)来表示。,3.标准差(standard variance):,标准差就是方差的平方根。,4、直线相关与回归(1)、直线相关(correlation)(相关)度量变量间相关

9、程度的统计量,XY:相关系数(correlation coefficient)-1 1,(2)、协方差(covariance)两个相关变量(x、y)共同变异量的度量:COVxy,1,XY=COVxy/Sx.Sy,(3)回归系数(cofficient of regression)度量当一个变量变化是,另一个变量所改变的程度。,III.数量性状的遗传率,1、数量性状的表型值表型值是在实践中所度量或观察到的数值。P=G+E P=性状的表型值 G=性状的基因型值 E=环境效应,基因型值(G),A(additive effect):基因的累加效应 又称为“育种值”D(dominance deviatio

10、n):显性离差I(interaction 或 epistatic deviation):互作离差或上位效应,G=A+D+I,2、数量性状的方差,方差可用来测量变异的程度,表型方差可以剖分为遗传方差和环境方差两部分:VP=VG+VE VP=表型方差 VG=遗传(基因型)方差 VE=环境方差,遗传率又叫遗传力,广义遗传力(H2):遗传方差在总的表型方差中所占的比例。H2=VG VP=VG(VG+VE),3、数量性状的遗传率(heritability),狭义遗传力(narrow-sense heritability):育种值方差在总的表型方差中所占的比例,广义遗传力(broad-sense heri

11、tability),近亲繁殖和杂种优势,(一)近交与杂交,杂交(crossbreeding):基因型不同的纯合子之间的交配,又称异型交配。相同基因型之间的交配称为同型交配。,近交(inbreeding,)又称为近亲交配或近亲繁殖,是完全的或不完全的同型交配,(二)近交与杂交的遗传效应,1、近交使基因纯合,使群体中遗传趋于稳定;杂交使基因杂合。见下页表,2、近交系数(coefficient of inbreeding,F)与血缘系数(Rxy),3、通径分析法计算近交系数,(1)通径与通径链通径:通径系数:通径链:,(2)计算:,Rxy=(1/2)L=(1/2)n1+n2,Rxy,=(1/2)4+(1/2)4,F=R,1/2,Fx=RSE,1/2,Fx=(1/2)n1+n2+1=(1/2)N,Fx=(1/2)N=(1/2)6+(1/2)6,4、近交的影响,(三)杂种优势(heterosis),杂种优势的遗传理论:,1、显性学说:,2+1+2+2+1=8,1+2+1+1+2=7,2+2+2+2+2=10,2、超显性学说:,2+2+2+2+2=10,1+1+1+1+1=5,1+1+1+1+1=5,

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