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1、用P软件画图椭圆球图形的画法： 1将后缀为res的文件复制到硬盘根目录下 2启动单晶分析软件XP 3XPread e: 50710c 4XPfmol 5XP kill $q 6XPproj 出现画图框，你可以按右上的按钮旋转或显示所有的原子。将分子结构旋转到适当位置，也就是旋转的尽可能使每个原子都不被挡住。当旋转到适当位置后按右上角的exit退出 7XPlabl 1 450 8XPtelp 0-30 回车至现plorfile:的提示符 9plotfile:mol mol是为你所要画的分子结构图起的名字，你也可以起别的名字。 注意：当你按了回车后会进入画图界面，这时候鼠标已经变成了一个矩形框。将
2、矩形框移动到显示的原子边上合适位置后点击鼠标左键，就对该原子标注了它的顺序。鼠标在你标注了第一个原子后会自动移到下一个要标注的原子上或旁边，你仍将矩形框移动到合适位置后按鼠标左键进行标注。重复以上的操作，直至将全部原子标注完毕。然后按键盘上的b键保存后自动退出到XP程序的dos操作界面 10XPdraw mol mol还是刚才的文件名 11当你上步操作按完回车后会出现一句话，可能的意思是：将该图形保存成什么格式的文件，有几个选项。请选择按键盘上的a键，然后回车 12为你的图形取一个名字，你可以仍用mol 13上步回车后又会出现一句话，意思是要保存为黑白图形还是彩色图形。按回车即保存成黑白图形，
3、请按回车。 以上就画好了分子结构图。你可以在这时候推出XP，即在XP提示符后输入quit或exit。 你也可以继续画堆积图。 14XPcell 回车后会出现5个数字，前3个数字依次表示的是a、b、c轴。 15XPmatr 1 这里matr命令后的数字代表上一步显示的前3个数字中的第一个。这个数字的选择要依照这样的规则：选取3个数字中最小的那个，而matr后的数字就是上步操作的最小数字所在的顺序号。比如上步操作最小的数字是第三个，则应该是matr 3。如果你选择的是1，那么在提交给晶体学报网站的cif文件中的Figure 2的表述里就应该说是“Figure 2. Part of the pack
4、ing of the title compound, viewed down the a direction. Dashed lines indicate hydrogen bonds.” 如果你选择的是2，则应该是viewed down the b direction。 16XP pack 当回车后会进入画图界面。这是要让你确定哪些分子是要保留的，而哪些分子是要删除掉的。一般来将在坐标框以外，同坐标框根本不沾边的要删除掉。删除和保留的方法是：先按回车，会看到坐标框在闪动，然后按键盘上的空格键保留所闪动的坐标框或分子，而按回车键则删除闪动的分子。等全部分子都处理完后，用窗口右上角的SG标示保存
5、退出 17XPtelp cell 这是要画堆积图的意思 18profile:cell 这里的cell是为堆积图文件起的名字，你也可以用另外的名字。 19XPdraw cell 20当你上步操作按完回车后会出现一句话，意思是：将该图形保存成什么格式的文件，有几个选项。请选择按键盘上的a键，然后回车 21为你的图形取一个名字，你可以仍用cell 22上步回车后又会出现一句话，意思是要保存为黑白图形还是彩色图形。按回车即保存成黑白图形，请按回车。等一会儿堆积图就画完了。 双击画好的cell图，用pdf软件打开，既得到所要的图，以PDF形式保存即可。 也可用photoshop打开cell文件，修改到适
6、当的旋转角度后保存为 photoshop(*.PSD;*PDD)这样的文件小很多。 计算二面角 read E:50710C(回车)(即需要将所有的源文件先拷贝到E盘的根目录下) fmol(回车) kill $q(回车) proj(回车给出分子结构图及原子排序的序列号) mpln n1 c1 c6 c5 c4 c3 c2 c8 c9 c10 c11 c12 c7(回车 计算二面角) mpln c1 to c6(回车 计算c1 到c6组成的平面 与上个平面间的二面角) mpln c7 to c12(回车 计算c7 到c12组成的平面与上个平面c1到c6组成的平面之间的二面角） 如果计算一条直线c1
7、3 c14 和c1到c6组成的平面之间的二面角，则为 mpln c7 to c12(回车 ） line c13 c14(回车）即可得到二者之间的二面角 计算两条直线的角度及长度：如计算氢键的C15A-H15A-O1B的角度核长度：link c15a h15a，link h15a o1b，bang h15a，得到 H15A C15A 0.93 H15A O1B 2.541 165.7 C15A 则表示为H15A C15A 长度为 0.93 H15A O1B长度为 2.541，以第一个原子H15为顶点H15AO1B和H15A C15A这两条直线的角度是165.7度。 将两个原子o1b 和c2g以虚
8、线连接：link o1b c2g(回车) 修改命令的简便方法：在需要修改的字母上直接输入所要修改的字母即可 cell,找到最小的那个值是第几个数值，如果是2则 matr 2 pack 堆积图的计算，回车为删除，空格为跳过 计算有没有P-P键 先计算c7a到c12a平面和c7b到c12b平面间的夹角，只有夹角为0时才有可能计算p-p作用 cent/x c7a to c12a (计算c7a到c12a平面的中心x) cent/x c7a to c12b (计算c7b到c12b平面的中心x) envi x1a 3 (计算两个平面之间的距离，从而可以确定是不是有p-p键， 当然，还有中心距离x1a和x1
9、b不是垂直的情况，因此还要用遗以下确认) bang 画堆积图：read, fmol, kill $q, proj cell, (选择最小的数值，如果是第二个，则)matr 2 ,回车或空格键选择所要部分，SG,telp cell,然后取名字为cell，回车后会出现画图的界面，鼠标成框状后，你只要用鼠标点四下(点时千万不要移动鼠标)，就可以将a、b、c、和0轴标好，然后按b保存, 然后draw cell，出现一句话，按a，回车，再建立一个名字，可以写成cell，回车，再回车，等几分钟就可以 画原子序数图 read kill$q proj kill(不想要的原子，包括不要的氢原子)， 旋转到适当位
10、置后，选择xp中的exit就推出到xp的dos操作窗口，对吧 然后输入labl 1 450，回车 再输入telp 030，回车 回车到出现plotfile：提示符 在提示符后输入你要取的文件名，比如bb 回车后就会又进入画图的窗口，这时候鼠标已经变成了方框了，找到这个鼠标方框，看看它在什么地方，把它移到原子的旁边合适的位置，然后点击一下鼠标左键，就标了当前原子的序号.这时候鼠标方框又会自动变位置到下一个要标注的原子上或着旁边，再将方框调整到合适位置点击鼠标左键，依此类推，将所有原子标注完后，按键盘上的b键保存后又回到xp的dos界面 ，然后输入命令draw bb 出现一句比较长话，你按键盘上的a键(表示可以用adobe查看),回车 输入名字bb，回车 然后又有一句话，直接回车，多等一会儿，直至出现xp的提示符就完成画图了 画好的图在你的xp程序所在的目录或文件里，也就上和xp程序在同一个文件夹里 ，然后你再用photoshop打开画的图，将画布旋转至图形正位，然后另存为tif格式的文件就可以了。
