GenBank数据库检索及其应用课件.ppt

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1、,数据库检索及其应用检索功能,重庆医科大学图书馆,简介,数据库是由美国国立生物技术信息中心()维护的一级核酸序列数据库。,数据库的数据来源有三种:、直接来源于测序工作者提交的序列;、与其它数据机构协作交换的数据;、美国专利局提供的专利数据。,网站网址:,和(序列数据)检索的比较:,、的检索结果是序列及其注释信息;的检索结果是与序列数据相关的文献信息。、数据更新早于,数据库的检全率高于。、可对序列数据进行限制检索,而只能对文献、杂志、作者等进行限制检索,因而数据库的检准率也高于。,检索界面,简介,基本检索输入框,基本检索界面:,执行检索按钮,基本检索输入框,基本检索界面:,点击进入跨库检索,跨库

2、检索界面:,执行检索按钮,跨库检索界面:,点击进入数据库,数据库界面:,数据库界面:,点击进入核苷酸序列数据库检索界面,数据库界面:,特征栏提供辅助检索功能,核苷酸序列数据库检索界面:,核苷酸序列数据库检索界面:,简介,检索界面,基本检索功能,(一)名称、作者姓名、截词检索、布尔逻辑运算,(二)特殊标志符检索,(五)范围检索,(三)序列长度检索,(四)分子重量检索,简介,检索界面,基本检索功能,(一)名称、作者姓名、截词检索、布尔逻辑运算,检索限定词:,、基因名称的检索限定词:、生物体名称的检索限定词:、作者姓名的检索限定词:,简介,检索界面,基本检索功能,(一)名称、作者姓名、截词检索、布尔

3、逻辑运算,(二)特殊标志符检索,特殊标志符的格式(核酸序列):,、序列接受号:()个字母个阿拉伯数字.:()个字母个阿拉伯数字.:,,、序列辨认号():一串阿拉伯数字.:,()记录(*):()基因组重叠群(*):()完整的基因组或染色体(*):()基因组的局部区域(*):()从人类基因组序列注释、加工得到的序列模型记录(,*):,特殊标志符的格式(核酸序列):,、()序列接受号:,特殊标志符的格式(核酸序列):,、序列接受号:个阿拉伯数字个字母.:,序列接受号的检索限定词为,简介,检索界面,基本检索功能,(一)名称、作者姓名、截词检索、布尔逻辑运算,(二)特殊标志符检索,(三)序列长度检索,序

4、列长度的检索限定词:,简介,检索界面,基本检索功能,(一)名称、作者姓名、截词检索、布尔逻辑运算,(二)特殊标志符检索,(三)序列长度检索,(四)分子重量检索,分子重量的检索限定词:,简介,检索界面,基本检索功能,(一)名称、作者姓名、截词检索、布尔逻辑运算,(二)特殊标志符检索,(五)范围检索,(三)序列长度检索,(四)分子重量检索,范围检索:中间用冒号连接,、序列接受号范围检索:、序列长度范围检索:、分子重量范围检索:、日期范围检索:,简介,检索界面,基本检索功能,特征栏辅助检索,限制检索(),预检索索引检索(),检索史管理(),剪贴板管理(),详细匹配过程(),限制检索,预检索索引检索,

5、检索史管理,剪贴板管理,详细匹配过程,简介,检索界面,基本检索功能,特征栏辅助检索,限制检索(),限制检索界面:,限制检索界面:,核苷酸序列数据库分为三个子数据库:,:表达序列标记数据库:基因组测序序列数据库:包含所有未被以上两个子数据库收录的核苷酸序列,核苷酸序列数据库检索界面:,核苷酸序列数据库检索界面:,限制检索界面:,限制检索界面:,检索结果显示界面:,限制检索范围,限制检索():,限制检索范围,排除某种类型的序列,限制分子类型,限制分子类型,限制基因位点,限制基因位点,限制序列片段的显示,限制序列片段的显示,限制数据来源,限制数据来源,限制数据修订日期,限制数据修订日期,简介,检索入

6、口,基本检索功能,特征栏辅助检索,限制检索(),预检索索引检索(),预检索索引检索界面:,索引检索输入框,索引检索按钮,索引检索按钮,序列特性关键词索引,序列特性关键词索引,简介,检索界面,基本检索功能,特征栏辅助检索,限制检索(),预检索索引检索(),检索史管理(),剪贴板管理(),详细匹配过程(),简介,检索入口,基本检索功能,特征栏辅助检索,检索结果的显示,检索结果显示界面:,选择检索结果的显示格式,选择检索结果的显示格式,选择检索结果的显示格式,摘要格式:,联接,格式:,格式:,格式:,格式:,格式:,格式:,格式:,格式:,记录中特性表中的主要关键词:,记录中特性表中的限定词:,格式:,图解显示:,图解显示:,多态性碱基,序列修订记录:,序列修订记录:,序列修订记录:,序列修订记录:,谢 谢!,SCI收录期刊的论文写作技巧及投稿指南主讲人:钟 萍,获取药学信息的途径与方法主讲人:肖廷超,请大家继续关注下周四的读者培训讲座:,

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