《肉及肉制品中猪牛羊马驴鸡鸭鹅兔源性成分的快速鉴定 实时PCR法》行业标准.doc

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1、ICS点击此处添加ICS号SB中华人民共和国国内贸易行业标准SB/T XXXXX2012肉及肉制品中猪、牛、羊、马、驴、鸡、鸭、鹅、兔源性成分的快速鉴定 实时PCR法Species identification of porcine, bovine, sheep, horse, donkey, chicken, duck, goose and rabbit derived materials in meat and meat products RT-PCR method点击此处添加与国际标准一致性程度的标识 - XX - XX发布XXXX - XX - XX实施中华人民共和国商务部发布前言本标

2、准按照GB/T 1.1-2009标准化工作导则 第1部分:标准的结构和编写给出的规则起草。本标准由中华人民共和国商务部提出并归口。 本标准起草单位: 本标准主要起草人:肉及肉制品中猪、牛、羊、马、驴、鸡、鸭、鹅、兔源性成分的快速鉴定 实时PCR法1 范围本标准规定了运用实时PCR技术对肉及肉制品中猪、牛、羊、马、驴、鸡、鸭、鹅、兔源性成分的快速鉴定方法。本标准适用于肉及肉制品中猪、牛、羊、马、驴、鸡、鸭、鹅、兔源性成分的快速定量鉴定。本标准中所建立的检测方法对猪、牛、羊、马、兔源性成分DNA的检测下限为0.001 ng/L,对驴、鸡、鸭、鹅的检测下限为0.01 ng/L。注:本标准中“肉及肉制

3、品”主要指新鲜肌肉组织或经过初步加工的生肉制品。2 规范性引用文件下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本标准。GB/T 6682 分析实验室用水规格和试验方法GB/T 27403 实验室质量控制规范 食品分子生物学检测 SN/T 1193 基因检测实验室技术要求GB/T 21103-2007 动物源性饲料中哺乳动物源性成分定性检测方法 实时荧光PCR方法3 术语、定义和缩略语3.1实时荧光 PCR real time PCR实时荧光聚合酶链式反应。3.2Ct值 cycle time

4、每个反应管内的荧光信号达到设定的阈值时所经历的循环数。4 原理 采用TaqMan实时荧光PCR技术,根据线粒体DNA的细胞色素氧化酶b(cytochrome oxidase subunit b,cytb)基因上畜禽各物种间序列差异而进行动物源性成分鉴定。以Genbank上公布的猪、牛、羊、马、驴、鸡、鸭、鹅、兔的cytb基因序列,设计合成检测各自的特异性引物对;利用裂解液破碎细胞,三氯甲烷抽提蛋白质,异丙醇沉淀得到DNA;以提取的DNA为模板,使用各物种的特异性引物进行实时荧光PCR扩增,并通过标记报告基因6-羧基荧光素(6-carboxyfluorescein, FAM)、淬灭基因6-羧基四

5、甲基若丹明(6 - carboxyl tetramethyl rhodamine, TAMRA)的探针进行特异性杂交。观察实时荧光PCR的增幅曲线,从而对肉及肉制品中的动物源性成分进行快速测定。5 试剂和材料 试剂的配制及试验中的操作规范应按GB/T 27403-2008和SN/T 1193的规定执行。除另有规定外,试剂应为分析纯或化学纯级别,实验用水应符合GB/T 6682的要求。部分试剂的配制方法可参考附录A的介绍。5.1 猪源性成分检测用引物(对)序列为:FP(正向引物):5- CGACAAAGCAACCCTCACAC-3RP(反向引物):5- TGCGAGGGCGGTAATGAT-3P

6、ro(探针):5 FAM- CTTCGCCTTCCACTTTATCCTGCCATTC-TAMRA 35.2 牛源性成分检测用引物(对)序列为:FP:5- CTCCTCGGAGACCCAGATAAC -3RP:5- AGAAGTATCACTCGGGTTTG -3Pro:5 FAM- CCAGCCAATCCACTCAACACACCC-TAMRA 35.3 羊源性成分检测用引物(对)序列为:FP:5- CAGCCCTCGCCATAGTTCAC -3RP:5- AGGGTGGAAGGGAATTTTATCTG -3Pro:5 FAM- TCTTCCTCCACGAAACAGGATCCAACA-TAMRA

7、35.4 马源性成分检测用引物(对)序列为: FP:5- CCAATGCGTATTCTGACTCTTAGTG -3RP:5- CGATAATTACGTATGGGTGTTCC -3Pro:5 FAM- CTGACACTAACATGAATCGGCGGACAGC-TAMRA 35.5 驴源性成分检测用引物(对)序列为:FP:5- CCTCAGCACTCCCCCTCAT -3RP:5- AAGGATAAGGGCTAATACACCA -3Pro:5 FAM- CCAGAATGGTATTTCCTATTTGCTTACGCC-TAMRA35.6 鸡源性成分检测用引物(对)序列为:FP:5- CGACAACCC

8、AACCCTTACC -3RP:5- AGGAAGGTGAGGTGGATGATA -3Pro:5 FAM- ACACTTCCTCCTCCCCTTTGCAATCGC-TAMRA35.7 鸭源性成分检测用引物(对)序列为:FP:5- GGCCACACAAATCCTCACAG -3RP:5- TGTGTTGGCTACTGAGGAGAAA -3Pro:5 FAM- CCTACTGGCTATGCACTACACCGCAGAC-TAMRA35.8 鹅源性成分检测用引物(对)序列为:FP:5- AGACAATCCAACCTTAACCCGA -3RP:5- GGACTAGGGTGATTCCTGCA -3Pro:

9、5 FAM-CCATCCACTTCCTACTGCCCTTCCTA-TAMRA35.9 兔源性成分检测用引物(对)序列为:FP:5-GTTCTCGTCGCAGATCTTCTCA -3RP:5- TACTTGTCCAATGGTGATGAAC -3Pro:5 FAM- CACTCACATGAATCGGAGGCCAACCAGTA-TAMRA35.10 液氮。5.11 DNA提取裂解液:1CTAB(cetyltrithylammonium bromide,十六烷基三甲基溴化铵),0.05 mol/L Tris-HCl(pH 8.0)Tris:tri (hydroxymethyl) aminomethan

10、e,三(羟甲基)氨基甲烷,0.7 mol/L NaCl,0.01 mol/L EDTA(pH 8.0)(ethylene diaminetetraacetic acid,乙二胺四乙酸)。5.12 TaqMan Gene Expression Master Mix。6 仪器和设备6.1 天平:量程 2 kg,感量 0.1 g;量程 100 g,感量 0.001 g。6.2 组织捣碎机。6.3 研钵。6.4 恒温水浴锅。6.5 台式冷冻离心机:离心力 12000g。6.6 微量移液器:量程分别为:0.1 L-2.5 L、0.5 L-10 L、10 L-100 L、50 L-200 L。6.7 pH

11、计。6.8 核酸蛋白分析仪。6.9 实时荧光PCR检测系统。6.10 实时荧光PCR反应管。7 样品制备在样品粉碎区进行。样品的采集和制备是肉及肉制品中肉种成分鉴别的重要步骤,为了防止交叉污染,应使用一次性消耗品,研钵应经 160 干烤2 h,其他不宜干烤或高压处理的器皿应使用1%次氯酸钠溶液浸泡。取样应尽量采取肌肉组织。对于同一批样品,应多点采集合并后,作为一份样品进行均质,提取DNA。采样过程应快速完成,将采取的样品迅速放入组织捣碎机中进行均质成糜状,充分混匀。取 0.1 g充分混匀的样品,放入研钵中,加入液氮,待样品冷冻完全后快速、用力研磨至粉末状。研磨时应间断加入液氮以防止材料融化。8

12、 检验步骤8.1 样品的总DNA提取在样品制备区进行,同时设立一种已知肉品作为提取方法的质控对照。a)将研钵移入 65水浴,当样品粉末刚开始融化时,向研钵中加入 700 LDNA提取裂解液,研磨 30 s;b)65 水浴 3 h,期间不时振荡混匀;c)12000 rpm离心 5 min,取上清至新的 1.5 mL离心管内;d)加入等体积酚,充分混匀后,12000 rpm离心5 min;e)取上清,加等体积三氯甲烷:异戊醇(体积比 24:1),充分混匀,12000 rpm离心 5 min;f)取上清,加2倍体积预冷的无水乙醇和1/10体积的 3 mol/L 醋酸钠混匀,-20 静置 1 h,12

13、 000 rpm离心 5 min,弃去上清;g)用70乙醇洗涤一次,晾干,加入 50 LTE缓冲液,溶解沉淀;h)运用紫外分光光度计对提取的DNA进行测定,OD260 /OD280 在1.8-2.0之间时,适宜于PCR扩增。也可用等效的商品化试剂盒提取组织DNA。8.2 PCR检测8.2.1 扩增试剂准备在扩增区进行,在低温条件下进行体系配制。每个样品测试反应体系配制如下( 20 L反应体系):Master Mix(2) 10.0 L上游引物FP(优化浓度) 2.0 L下游引物RP(优化浓度) 2.0 L探针Probe 2.0 L模板DNA Template(50 ng) 1.2 LDd H2

14、O 2.8 L向每个PCR反应管中加入以上反应混合液,转移至样品制备区。注:阳性对照用相应组织的DNA作为模板,阴性对照用不含相应成分的样品作为模板,空白对照用等体积去离子水作为模板。8.2.2 加样在样品制备区进行。在各设定的实时荧光PCR反应管中分别加入制备好的模板DNA溶液,盖紧管,离心 5 s10 s。8.2.3 实时荧光PCR检测在检测区进行。将8.2.2中离心后的实时荧光PCR反应管放入实时荧光PCR检测系统内,记录样本摆放顺序。循环条件设置:50 2min95 10min40(95 15s60 1min)收集荧光。检测结束后,根据扩增曲线和Ct值判定结果。8.2.4 质控标准检验

15、过程中应设立阳性对照、阴性对照和空白对照。阳性对照用相应组织的DNA作为模板,用不含相应成分的样品作为阴性对照,用等体积去离子水作为模板空白对照。9 结果判定9.1 结果分析条件设定直接读取检测结果。阈值设定原则根据仪器噪声情况进行调整。9.2 结果判定与表述9.2.1 结果的判定 9.2.1.1 有效性原则空白对照:无FAM荧光信号检出,未出现典型的扩增曲线。阴性对照:无FAM荧光信号检出,未出现典型的扩增曲线。阳性对照:有FAM荧光信号检出,并出现典型的扩增曲线,同时应满足以下:猪、牛、羊、马、兔检测体系的Ct值应小于35.0,驴、鸡、鸭、鹅检测体系的Ct值应小于30.0。以上应同时满足,

16、否则本次实验无效。9.2.1.2 样品有FAM荧光信号检出,并出现典型的扩增曲线,同时应满足以下:猪、牛、羊、马、兔检测体系的Ct值应小于35.0时,驴、鸡、鸭、鹅检测体系的Ct值应小于30.0时,判断样品为阳性。9.2.2 结果的表述 结果表述为“检出猪、牛、羊、马、驴、鸡、鸭、鹅、兔源性成分。”和“未检出猪、牛、羊、马、驴、鸡、鸭、鹅、兔源性成分。”9.2.3 测定低限 在上述条件下,本方法本标准中所建立的检测方法对猪、牛、羊、马、兔源性成分DNA的检测下限为0.001 ng/L,对驴、鸡、鸭、鹅的检测下限为0.01 ng/L。10 防止污染的措施检验过程中应严格防止交叉污染,防止交叉污染的措施按照SN/T 1193执行。11 废弃物处理检测过程中的废弃物,收集后在焚烧炉中焚烧处理。AA附录A(资料性附录)试剂配制A.1 DNA提取裂解液A.1.1 成分1(W/V)CTAB,十六烷基三甲基溴化铵 0.05 mol/L Tris,三(羟甲基)氨基甲烷 0.7 mol/L NaCl 0.01 mol/L Na2EDTA,乙二胺四乙酸二钠。A.1.2 配制(配制量1 L)称量CTAB 10 g,Tris 6.1 g,NaCl 41 g, Na2EDTA 3.7 g 置于1 L烧杯中,加入去离子水约 800 mL,充分搅拌混匀,加去离子水定容至 1 L后,室温保存。

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