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1、,2009年8月,医学文献检索,为什么要学习文献检索?,科学研究的一般工作流程:,检索相关的研究 分析现有的研究结果 发现问题 提出假说,制订试验方案 定义试验步骤 试验 数据汇总,数据可视化 数据验证 调整试验 重新校验假说,写作研究论文 发表研究论文,研究活动:反复、重复、动态、以人为中心依赖于各种不同的资源,为什么要学习文献检索?,据美国科学基金会统计,一个科研人员花费在查找和消化科技资料上的时间需占全部科研时间的51%,计划思考占8%,实验研究占32%,书面总结占9%。由上述统计数字可以看出,科研人员花费在科技出版物上的时间为全部科研时间的60%。,基础知识,一.文献及其类型 1.文献
2、(documents,literature):是记录有知识的一切载体。四要素:(1)记录知识的具体内容(2)记录知识的手段,如文字、图像、符号、声频、视频等(3)记录知识的物质载体,如纸张、光盘、录像带等(4)记录知识的表现形态,如图书、期刊、专利说明书等,基础知识,2.文献的类型:(按载体类型、出版形式、内容加工深度、获取难易程度等进行分类)A.文献按内容加工深度可分四类:(1)一次文献(Primary Document):指作者以其本人的研究成果(如实验、观察、调查研究等结果)为基本素材写成的原始创作。(2)二次文献(Secondary Document):即检索工具,是指将大量无序、分散
3、的一次文献收集、整理、加工、著录其特征如著者、篇名、分类、主题、出处等,并按一定的顺序加以编排,形成供读者检索所需一次文献线索的新的文献形式。(3)三次文献(Tertiary Document):科技人员围绕某一主题,利用二次文献的检索,在吸取一次文献内容的基础上,即经过阅读、分析、归纳、概括,撰写而成的新的文献,或综述已取得的成果进展,或加评论、或预测发展趋势。(4)零次文献(Zero Document):指未经信息加工,直接记录在载体上的原始信息,如实验数据、观测记录、调查材料等。,基础知识,B.文献按获取的难易程度可分三类:(1)白色文献:完全公开(2)黑色文献:完全不公开(3)灰色文献
4、:内部交流,基础知识,3.科技文献的作用(社会职能)(1)是科学表现的存在形式,是创造人类财富的智慧资源(2)是衡量科学技术水平的重要依据(3)是传播科学知识的最基本、最主要的手段(4)是确认科学发现与技术发明优先权的认证记录,基础知识,4.医学文献的结构(1)图书的结构:主要包括封面、封底、书脊、书名页、出版说明、前言(序)、目次、附录、后记等。参考文献的格式(NLM采用的ANSI标准格式)Norman IJ,Redfern SJ,editors.Mental healthcare for elderly people.New York:Churchill Livingstone;1996,
5、基础知识,书中的章节:Philips SJ,Whisnant JP.Hypertension and stroke.In:Laragh JH,Brenner BM,editors.Hypertension:pathophysiology,diagnosis,and management.2nd ed.New York:Raven Press;1995.p.465-78.,基础知识,(2)期刊论文结构:期刊论文包括文章题目、作者、摘要、关键词、(分类号)、正文、参考文献。参考文献格式:1)Vega KJ,Pina I,Krevsky B.Heart transplantation is asso
6、ciated with an increased risk for pancreatobiliary disease.Am Intern Med 1996 Jun 1;124(11):980-3,基础知识,2)Semin Oncol 1996;23(1 Suppl 2):80-97 3)Clin Orthop 1995;(320):110-4,基础知识,5.参考工具书的类型与使用 参考工具书(reference books,reference tools)是专供查考资料和线索的特种图书,它广泛汇集某一学科范围的知识信息,按照一定的体例和检索方法编排而成。工具书特点:查考性、概括性、易检性 类型
7、:词典、百科全书、年鉴、手册、名录、医学图谱、药典等。,基础知识,二.文献检索1.定义:根据用户需要,利用检索技术从数据库中查找出相关文献的过程。2.方法:(1)常用法(工具法):顺查法,倒查法,抽查法(2)追溯法(3)分段法(4)浏览法,基础知识,3.文献检索的作用:(1)继承和借鉴前人的成果,避免重复研究。(2)协助决策者做出正确的决策。(3)节省查找文献的时间。(4)继续医学教育作用。,基础知识,4.数据库(database)定义:指由计算机进行处理的一定数量同类信息的有序集合,是用来查找信息的电子化检索工具。,基础知识,类型:文献数据库按其文献信息的内容形式不同可分为如下类型:(1)书
8、目数据库(Bibliographic Database)(2)事实数据库(Fact Database)(3)数值数据库(Numeric Database)(4)全文数据库(Full-text Database)(5)多媒体数据库(Multimedia Database)(6)知识库(Knowledge Base),基础知识,5.常用术语(1)记录(record):构成文献信息数据库的基本单元,它揭示了文献的内容特征和外表特征。(2)字段(field):比记录更小的单位,是组成记录的数据项目(3)文档(document):两重含义:一是指数据库中一部分记录的集合二是从数据库的结构分:顺排文档(按
9、记录的顺序号排列)、倒排文档(按主题词或作者排列),基础知识,6.数据库检索途径:检索途径是指用数据库中记录的某一特征标识作为检索起点,通常体现为字段检索,常用的检索途径有:(1)自由词(文本词)检索:包括标题词、关键词、文摘词、全文词,注意同义词!(2)主题词检索:推荐!医学主题词表MeSH,基础知识,(3)分类检索:中国图书馆分类法(中图法)(4)著者检索:姓前用全称,名后用首字,注意东西方人名书写习惯。(5)引文检索:被引文献引用文献(6)机构检索:名称、所在地、国家,照录原文,注意不同写法(7)刊名检索:全称、缩写、ISSN(8)默认检索:预先设定的多字段组合检索,基础知识,7.文献检
10、索步骤:,基础知识,8.文献检索技术(1)布尔逻辑组配检索 三种逻辑关系:与、或、非,A AND B,A OR B,A NOT B,基础知识,实际检索时通过逻辑运算符号and(与)、or(或)、not(非)将几个检索词连接起来进行逻辑运算,从而达到检索要求。在一个检索式中如果含有两个以上的布尔逻辑运算符,运算次序一般为()NOTANDOR,即先括号内的逻辑关系,再依次算“非”、“与”、“或”关系。,基础知识,(2)截词检索和通配检索截词符和通配符在不同检索系统用不同的符号,一般为*、?、#、$等。截词符代表0到多个字符,可以检索词根相同但词尾不同的检索词,如transplant*,表示检索词根
11、为transplant,词尾可以是-e,-ation,-ing,-able等所有词。通配符?代表0到1个字符,可以检索单复数、英美不同拼写方式等检索词,如rat?代表(rat OR rats),an?esthesia代表(anaesthesia OR anesthesia)使用这两种符号一方面可以避免漏检,同时也避免了多次输入的麻烦。,基础知识,(3)限定检索在绝大多数检索系统中都有一些缩小或约束检索结果的方法,最常用的是对特定字段的限定检索,通常用in、=、等符号对字段进行限定。用这种方法可以将检索词限制在特定的字段中,如LA=chinese,表示检索结果的语种为中文文献,LA代表语种字段。
12、,基础知识,(4)位置运算符在某些数据库检索中,要表达检索词在记录中相互位置关系时使用的符号,不同的检索系统用不同的符号,如same,with,near等。运算符主要有以下4个级别:记录级检索,要求检索词出现在同一记录中;字段级检索,要求检索词出现在同一字段中;子字段级检索,要求检索词出现在同一子字段或同一自然句中;词位置检索,要求检索词之间的相互位置满足某些条件。位置运算符可以弥补布尔逻辑运算、截词运算检索的一些不足。使用位置运算符可以增强选词的灵活性,部分地解决布尔检索不能解决的问题,从而提高文献检索的水平和筛选能力,但美中不足的是提供位置运算符的检索系统并不多。,基础知识,9.检索技巧(
13、1)扩大检索范围的方法:增加同义词,用OR组配;主题词扩展检索(有下位词)或使用上位主题词进行检索;检索相关主题词;使用截词符或通配符;减少检索的字段限定;横向检索;检索引文。,基础知识,(2)缩小检索范围的方法:使用逻辑运算符“and”或“not”;选择专指性的检索词;使用副主题词;主题词加权检索;限制字段检索。,基础知识,10.检索策略的制定 制定检索策略时要注意以下几点:(1)尽可能采用主题词检索;(2)为保证检出切题文献,可使用自由词检索;(3)注意用好逻辑组配关系;(4)如果检出的同类文献过多,使用缩小检索范围的方法;(5)如果检出的同类文献过少,使用扩大检索范围的方法。,基础知识,11.检索效果的评价查全率(recall):指系统在进行某一检索时,检出的相关文献量占系统文献库中相关文献量的比率,它反映该系统文献库中实有的相关文献量在多大程度上被检索出来。R(检出相关文献量/系统文献库中相关文献总量)100%查准率(precision):指系统在进行某一检索时,检出的相关文献量占检出的文献总量的比率,它反映每次从该系统文献库中实际检出的全部文献中有多少是相关的。P=(检出相关文献量/检出文献总量)100%,