体的选择和工程菌的构建过程中应注意的问题.ppt

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1、载体的选择和工程菌的构建过程中应注意的问题,一、获取目的基因,二、重组,三、转化,反转录法反转录-聚合酶链反应法化学合成法对已发现的基因的改造,载体选择,重组方法,受体细胞的选择,转化方法,方法,四、筛选,五、表达,筛选方法,注意的问题,抗性筛选,蓝白班筛选,是否容易产生抗性突变,是否有假阳性,融合表达,包含体表达,分泌型表达,表达方式,一、获取目的基因,目的基因,来源,用途,(决定载体和受体细胞的选择),克隆,表达,分泌型表达,融合表达,包含体表达,反转录法反转录-聚合酶链反应法化学合成法对已发现的基因的改造,目的基因提取方法,二、重组,质粒载体,噬菌体载体,柯斯质粒载体,M13噬菌体载体,

2、噬菌粒载体,载体,(一)载体的选择,载体,表达型载体:如pUC18/19,pGEM-T载体,克隆型载体:如pBR322,TA载体,(二)重组方法:用T4DNA聚合酶将粘性末端连接起来,1.克隆基因的酶切位点问题2.载体的酶切问题3.连接片段浓度比的问题,需要考虑的问题:,(1)黏性末端连接;(2)平末端连接;(3)同聚物接尾连接;(4)接头连接法。,三、转化,(一)受体细胞的选择,大肠杆菌,枯草杆菌,链霉菌,酵母菌,昆虫细胞(家蚕),哺乳动物细胞(中国仓鼠卵巢细胞 CHO),植物细胞(拟南芥菜、烟叶),常用的受体,大肠杆菌,用于接受质粒:C600、W3110、HB101、JM83、JM101(

3、Aps、Tcs、Cms)用于接受l-DNA:LE392、ED8654,酵母菌,哺乳动物细胞 CHO,毕赤酵母,啤酒酵母,重组和转化需要共同注意的问题,目的基因的稳定性,酶切位点载体的酶切位点,选择标记载体的拷贝数,载体和受体的相容性受体的表达系统目的菌对密码子的偏爱,四、筛选,(一)筛选方法,(二)注意事项,(1)遗传学方法(2)物理筛选法(3)核酸杂交法(4)表达产物分析法,1.连接酶用量与DNA片段的性质有关,连接平齐末端,必须加大酶量,一般连接粘性末端酶量的10-100倍。2.在连接带有粘性末端的DNA片段时,DNA浓度一般为2-10mgml,在连接平齐末端时,需加入DNA浓度至100-

4、200mgml。3.连接反应后,反应液在0储存数天,-80储存2个月,但是在-20冰冻保存将会降低效率。4.粘性末端形成的氢键在低温下更加稳定,所以尽管T4 DNA连接酶的最适反应温度为37,在连接粘性末端时,反应温度以10-16为好,平齐末端则以15-20为好。5.在连接反应中,如不对载体进行去5磷酸基处理,便用过量的外源DNA片段(2-5倍),这将有助于减少载体的自身环化,增加外源DNA和载体连接的机会。6.麦康凯选择性琼脂组成的平板,在含有适当抗生素时,携有载体DNA的转化子为淡红色菌落,而携有带插入片段的重组转化子为白色菌落。该产品筛选效果同蓝白斑筛选,且价格低廉。但需及时挑取白色菌落

5、,当时间延长,白色菌落会逐渐变成微红色,影响挑选。7.X-gal是5-溴-4-氯-3-吲哚-b-D-半乳糖(5-bromo-4-chloro-3-indolyl-b-D-galactoside)以半乳糖苷酶(b-alactosidase)水解后生成的吲哚衍显蓝色。IPTG是异丙基硫代半乳糖苷(Isopropylthiogalactoside),为非生理性的诱导物,它可以诱导lacZ的。8.在含有X-gal和IPTG的筛选上,携带载体DNA的转化子为蓝色菌落,而携带插入片段的重组质粒转化子为白色菌落,平板如在37培养后放于冰箱3-4小时可使显色反应充分,蓝色菌落明显。,五、表达,(一)分泌型表达,目的蛋白稳定性高,目的蛋白易于分离,目的蛋白末端完整,(二)包含体表达,能简化外源基因表达产物的分离操作,能在一定程度上保持表达产物的结构稳定,(三)融合表达,目的蛋白稳定性高,目的蛋白易于分离,目的蛋白表达率高,目的蛋白溶解性好,目的蛋白需要回收,小组成员:沈迪、曾宇、屠言贝、张钰英、张寒光、温馨、谢丹、王亮杰、郭正兵、周明毅制作:曾宇,谢谢,

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