细菌的分类与命名.ppt

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1、第六章 细菌的分类与命名,一、生物的分类六界:动物界、植物界、真菌界、原生生物界、原核生物界、病毒界。细菌分类层次与其他生物相同,即:界、门、纲、目、科(Family)、属(Genus)、种(Species)。,二、细菌分类的指征1.形态学特性 2.培养特性 3.生活方式 4.生理生化特性 5.抗原构造 6.对噬菌体的敏感性7对抗生素及其他化学物质的敏感性8病原性 9遗传学特征。,三、细菌分类的方法 1、数值分类法 2分子生物学分类法 3血清学方法:共同抗原 4化学分类法:比较细菌各种细胞成分,1.数值分类法 其分类范畴的基本单位是种,根据比较细菌在形态、生理和生化等方面的特性,计算出相似值来

2、确定种的分类归属。,2分子生物学分类法(种系发生)1)DNA中G+C摩尔百分数(%)含量测定(G+C)mol%含量:某一生物DNA中的G+C配对碱基按摩尔数计算占全部碱基的百分数。(反映该生物遗传性能的一种本质特征)。测定方法:梯度密度离心法、解链温度法(Tm)等。,2)DNA或RNA同源性的测定DNA-DNA杂交试验(hybridization)原理:同源DNA单链或非同源DNA单链,只要它们彼此在核苷酸序列上有相应互补的部分,就可产生不同程度的结合。应用:通过在体外测定菌株间DNA的杂合率,据此推算出DNA的相似程度,判断它们在亲缘关系上的亲疏,帮助分类鉴定。,3)rRNA的分析 rRNA

3、在遗传信息传递中起重要作用,特别是16S rRNA能反映各种细菌间在系统发生方面的关系。从该rRNA的碱基序列可绘制系统发生树。,四、细菌的分类体系 细菌分类有三个主要体系 前苏联、法国、美国伯杰氏分类系统细菌学手册,该手册共四卷(1984-1989)。并于1994年出版了伯杰氏鉴定细菌学手册第9版,将细菌门分为33个部分,其中与兽医学和医学有关的计13个部分。,五、细菌种的划分和种以下的分类单位(一)种(Species)种是生物分类的基本单位。凡属同种的生物,均具有共同的基本性状特征。它是生物在一定演化阶段,具有相对稳定的一定性状特征的实体。,(二)种以下的分类单位1.亚种(subspeci

4、es):种内可能存在一些在某些性状上相互差异的类别。2.型(type)与亚型(subtype):仅仅是某一方面的性状,如血清型。型内还可按进一步的性状差异区分为不同亚型。,3.菌株(strain)(品系):是指同种细菌中不同来源的纯培养物。具有典型特征的菌株称为典型株或代表株或标准株。不同菌株可能性状完全相同,也可能有某种微小差异。,六、细菌的命名“双名法”命名(国际细菌命名规约)由属名和种名两部分组成。属名(第一字母大写)在前,种名在后。均用拉丁文或拉丁化的文字表示。翻译时,种名在前,属名在后。如Staphylococcus aureus未确定种名的细菌命名:在属名后加上sp.或spp.。新种的命名:在学名之后加注sp.nov.(novo species)。亚种的命名:subsp.,

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