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1、1,“科学研究的过程同时也是 积累前人已有成果并与其交流的过程”,知识是积累性的，人类历史上每一次突破性的重大发现在很大程度上都是前人研究成果的继续延伸。引自Yale Bulletin and Calendar 2000年29(34)卷,2,“文献的分析、阅读和整理贯穿于科研过程的始终”,提出问题分析问题解决问题实验分析写作发表同行交流,3,检索,阅读,分析,整理,消化吸收,4,我们正处于一个“文献爆炸”的时代,文 献 检 索,服 务 科 研,泛读,分析整理,去粗取精去伪存真,精读跟踪更新,5,对获得的文献进行合理分类是前提,通常，我们打算把收集到的相关论文都看一看，但我们要的其实是“时不时地
2、阅读”从数据库中下载了一系列课题相关的论文，也许希望把论文打印出来，慢慢看如果这样，绝不要使这堆论文在没有阅读的情况下“长”得太高。很快你会忘了这些论文究竟有用没用。推荐一个简单的做法，就是把这一大堆论文分为“基本的”“有时间可以读一读的”“天知道我为什么要打印这一篇论文？”这可以帮助你把论文放得更为有序，使你可以较为容易地找到你需要的论文。另一个方法是在计算机中将各篇论文的PDF进行分类，也不一定要把论文打印出来（根据各人喜好而定）。,6,关于文献的整理-文献管理软件Endnote,中国期刊网,Web of Science,PubMed网站数据库,文献管理统计分析,文献,导入,撰写论文与书籍
3、等,Library,Endnote,SpringerLink,ScienceDirect,WileyInterScience,7,关于文献的整理,与文献管理软件（Endnote等）互补使用：按照文献期刊类别，专题技术方向等装订成册 好处：便于随时查阅，方便精读，有助于课题资料的传承和积累,8,按数据库（课题进行初期）,9,按专题技术方向（课题进行中后期，不断拓展和衍生）,Glucose-xylose Co-fermentation,细菌的磷酸转移酶系统（PTS）,BioflavorsReview,10,关于文献阅读：总的原则,由点到面由杂到精量变到质变好记性不如烂笔头关注文献，但不要做文献收藏
4、家,11,提高阅读速度是关键,即使是经过分类，必须看的论文也可能还是一大堆。如果你平时看书速度慢，那么提高你的阅读速度是第一件要事。如果时间太紧，不妨只看每个段落的第一句话和最后一句话，直至阅读到与你所需最相关的那个部分。这里也可能是作者放入关键信息的地方。,12,提高文献阅读速度的方法,整体上快速把握文献信息！,13,一些阅读的细节,适当的时间，适当的地点在得到最重要的新学术论文时，趁热马上很快很认真且稍带欣赏性地阅读一遍这样做，至少在更为详细地阅读和分析这篇论文之前有了认真的了解一些不紧迫的资料：在办公室或实验室挑一个安静的地方，利用两个实验之间短短的20分钟休息之时阅读如果已经太累了或者
5、根本看不进去，就不要阅读了,14,对自己课题之外的专业领域不甚关心,只知埋头于自己的课题小方向,Tips 1.不做深井之中的科学家,15,从学科专业发展的角度、多阅读专业领域的TOP期刊，以全局的观点来观察和理解专业领域的最新进展！,Tips 2.登高而望远,16,举例1：从Science,Nature等旗帜性刊物看微生物菌种改造技术的发展,Nature Vol 460,894-899.13 August 2009,Multiplex automated genome engineering(MAGE)多基因组工程技术,Metabolic Engineering(ME)代谢工程,Global
6、Transcriptional Machinery Engineering(gTME)基因转录重组细胞工程技术,Science Vol 314,1565-1568.8 December 2006,Science Vol 252,1668-1675.21 June 1991,“单基因水平”,“基因转录水平”,“多基因组水平”,Genome shuffling 基因组重排技术,Nature 415,644-646 7 February 2002,“基因组水平”,结论：以微生物菌种为核心的工业生物技术的快速发展依赖于生物科学尤其是分子生物学技术的快速进步，转录水平和组学水平的研究是一种趋势！,17,
7、举例2：结合文献资源与实验现象指导选题（生物合成1,3-丙二醇2,3-丁二醇3-羟基丁酮）,1,3-propanediol,2,3-butanediol,3-Hydroxybutanone,The Presential Green Chemistry Challenge Awards2003,（本科论文）,（博士论文）,（某师弟课题）,18,1,3-丙二醇,2,3-丁二醇,Ji and Huang,et al.Appl Biochem Biotechnol(2009)159:605613,1,3-丙二醇：47.5 g/L2,3-丁二醇：17.5 g/L,2,3-丁二醇是我国白酒行业广泛使用的香
8、料配方成份之一，目前国内基本靠进口，此外，2,3-丁二醇还是一种潜在的大宗化学品，可用于脱水制备甲乙酮和丁二烯；基于国内的2,3-丁二醇市场缺口和其作为一种精细化学品的优势，考虑到化学法合成成本较高，我们开始着手准备开展生物法合成2,3-丁二醇的研究,以甘油为底物，改变发酵过程的pH，发现偏酸性条件下：,19,以葡萄糖为底物，改变发酵过程的溶氧控制模式时，发现溶氧较高条件下：,Ji and Huang,et al.Bioresource Technology(2009)100:3410-3414,2,3-丁二醇：78.5 g/L3-羟基丁酮：13.4 g/L,3-羟基丁酮,2,3-丁二醇,3-
9、羟基丁酮是一种比2,3-丁二醇附加值更高的香料，主要作为配置奶油、乳品、酸奶和草莓等香型，售价高达30万元/吨，同时通过阅读文献，我们发现在同一菌种体内催化2,3-丁二醇和3-羟基丁酮相互转化的反应是可逆的，只需通过外部氧化还原条件的改变，即可实现3-羟基丁酮选择性的积累。,20,如何在阅读文献时“挖掘有益信息，为我所用”？,举例：关于文章写作过程中题目的确定好的题目是成功的一半如何根据拟写文章的内容确定文章标题呢？对于母语非英语的中国学生而言模仿是最好的解决办法（多读-多总结-多思考）,21,在内容层次很多的情况下，如果难以简短化，最好采用主、副题名相结合的方法,22,为表达直接、清楚，以便
10、引起读者的注意，应尽可能地将表达核心内容的主题词放在题名开头,23,经常浏览最新期刊,了解专业最新动态，密切关注同行进展订购一些所在领域的专业期刊 各全文数据库的Email Alerts利用关键词核实相同或类似的题目，他人的最新发表工作Web of Science 的Email Alerts缺点无法在文章Online时第一时间获得提醒预订这样的期刊过多的话，电子邮箱马上就会“爆满”，可能根本无暇顾及RSS+Google Reader可以克服这一缺点，及时了解相关最新讯息,24,什么是RSS？,RSS：简易资讯聚合(Really Simple Syndication)是一种消息来源格式规范，用以
11、发布经常更新资料的网站，例如部落格文章、新闻、音讯或视讯的网摘。网络摘要专业层面能够使网站自动地发布他们的资料，同时也使读者能更够定期更新他们喜欢的网站或是聚合不同网站的网摘。（维基百科）在网站页面上常用 或者 以及类似的图标来表示,这是不提供RSS的杂志！,这是提供RSS的杂志！,25,RSS可以干什么？,订阅BLOG订阅新闻订阅杂志文章无需逐个数据库的去查看有没有新发表的论文，只要将喜欢的杂志内容订阅在RSS阅读器中，每篇新出版的文章（甚至是刚接受的文章）就会自动地出现在你的阅读器中！订阅最新搜索结果订阅感兴趣的研究方向的最新论文的搜索结果，当该方向有了新论文后，会自动地出现在RSS阅读器
12、中！快速、高效地浏览每一个条目都是以标题和摘要的形式出现，方便快速浏览，可以在最短的时间内浏览海量信息，然后快速地从中找出自己感兴趣的内容！,26,Google Reader,优先推荐使用的RSS Reader在http:/注册（可直接使用Google帐号）,27,ACS杂志的RSS地址列表,如何订阅ACS的杂志文章,28,如何订阅ACS的杂志文章,RSS地址！拷贝这个地址,在这里输入RSS地址添加订阅,29,成功订阅RSS频道！,如何订阅ACS的杂志文章,30,如何订阅ScienceDirect的杂志文章,Click!,RSS地址在这里！,31,Click!,地址在这里！,如何订阅Wiley
13、 Interscience的杂志文章,32,一个PubMed的辅助网站：http:/www.hubmed.org专门为PubMed的搜索结果提供RSS服务，每日自动更新,在这里输入检索的关键词,Click！,如何追踪某个领域的最新文章,33,搜索结果的RSS地址！,当在PubMed上以1,3-propanediol作为关键词进行搜索，出现新的搜索结果时，该结果会自动出现在Google Reader中。即：当出现与1,3-propanediol有关的新的研究成果，就可以第一时间看到！,34,在这里输入科学家的名字，得到搜索结果的RSS地址,如何关注某个研究者/组的最新文章,35,给自己感兴趣的项
14、目加上标记,加注星标！,日后可以随时查看加注星标的项目,36,还可以通过共享或者电子邮件第一时间与朋友分享,Click,共享项目可以让指定好友阅读和订阅！,A very important,useful function for a team!,37,管理自己的订阅,38,RSS+Google Reader：让“偷菜”成为过去！,一个一个杂志地去查看最新发表的文章，每天所需时间：2 h！通过RSS查看最新发表的文章，每天所需时间：30 min！,快捷+详尽,39,我们的目标：通过文献的分析、阅读和整理，站在巨人的肩膀上，更好的为自己的科研生涯服务！,40,“我们必须具有乐观积极的态度，我们对社会的未来具有共同的责任”,卡尔 波普尔，Berlin 199320世纪最著名的学术理论家、哲学家、社会学家,从我做起，关注CO2减排和低碳经济！,
