Chemwindow6.0教程.ppt

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1、Chemwindow 主讲:张艳霞,Chemwindows6.0简介,ChemWindow常见的有3.0 5.0 6.0 三个版本,6.0 版的安装文件15M 左右。安装后即可运行。程序打开后,窗口界面与一般Win9x 的软件相似,依次包括菜单栏、工具栏和文档区。工具栏提供了许多常用的化学分子及化学键,使用时用鼠标点一下工具栏中所需的工具,在合适位置点击鼠标,则分子结构式就会出现,使用非常方便。ChemWindow 6.0 还支持Windows 剪贴板,所有结构式可以方便地以对象形式剪贴到Word 文档中,而当要进行修改时,只需在Word 文档中双击结构式,即可打开ChemWindow 进行修

2、改。下面我们就从工具栏开始按功能分类介绍ChemWindow 6.0 软件的使用方法和技巧。,Chemwindows6.0工具栏,ChemWindow 6.0 的工具栏与 Windows95 的风格统一,同时提供了更多的工具按钮以及增加了工具栏选择的自由度。1、View 菜单中可以设置显示工具栏2、鼠标单击带有右红三角的工具按钮3、在工作区单击鼠标右键,可以直接打开选择工具栏:,Chemwindows6.0工具栏类型,1)常用工具栏(Standard Tools):提供了选择、套索、化学标记、键、环、模板以及可选择工具按钮:,2)自定义工具栏(Custom Palette):提供可选择工具按钮

3、:,3)命令工具栏(Commands):提供保存、打印、编辑及一些图形关系操作按钮,Chemwindows6.0工具栏,4)键工具栏(Bond tools):提供化学键按钮,5)图形工具栏(Graphic Tools):提供文字、表格、箭头和自由绘图工具等按钮,6)轨道工具栏(Orbital Tools):提供各种轨道图形按钮,Chemwindows6.0工具栏,7)其它工具栏(Other Tools):提供板擦、环、长链等工具按钮,8)反应工具栏(Reaction Tools):提供反应箭头工具按钮,9)符号工具栏(Symbol Tools):提供电荷、自由基和其它符号标记按钮,10)模板工

4、具栏(Templete Tools):提供一些模板按钮,Chemwindows6.0工具栏,11)格式工条(Style Bar):提供分子结构样式、字体、字号、颜色以及其它格式按钮,12)图形格式条(Graphics Style Bar):提供图形样式按钮,13)缩放工具条(Zoom Bar):提供缩放工具按钮,化学键的绘制,与键有关的工具,1)单键(),共同性质 单击鼠标左键新产生的键将出现在能量最低 的方向,单独的键将出现在水平方向。b)采用拉伸的方式产生键,同时按住Shift 键则 产生任意长的键,按住Ctrl 键则可至任意方 向,在初始点结束则取消。,化学键的绘制,c)键端可以用周期表

5、或用键盘快捷输入,一些键盘快捷键为:b=Br,c=C,f=F,h=H,l=Cl,n=N,o=O,p=P,s=S;空格=不标记 的C;其它快捷键请参考help 文件。基团 上的氢数自动给出,多次按键则给出不同 氢原子数的集团。如按n 则依次给出NH2,N,NH。另外也可自己设置快捷键(Other:Edit Hot Keys)。,d)鼠标左击键中央可以在各种键型之间可以互换。,化学键的绘制,B.特殊性质,b)按住Alt 键单击则产生短线双键。,c)鼠标移到键中央,产生黑块后按住鼠标 左键左右/上下拖动,可改变键的状态。,d)单击键中央可以改变键方向。,化学键的绘制,2)双键、多重键及长链(),a)

6、鼠标左键单击键中央转换为短双键;短双键单击可以改变短键的位置;鼠标移到键中央按住鼠标左键左右拖动,可改变双键的宽度;上下拖动改变短键的长短。,化学键的绘制,b)按住鼠标左键拖动可以产生长链多键,右方数字代表键的个数,松开鼠标则确定。同时按Shift 键为任意键长;按Ctrl 键为任意方向;按Alt 键为不饱和双键长链。,c)其它双键和多重键,使用方法与短双键使用相同。,与环有关的工具,1)饱和环,a)只划一个环时:单击鼠标左键,水平方向上产生一个环;按住鼠标拖动可翻转,至所需方向松开鼠标即可得到所要方向的环。按Shift 键为不同键长;按Alt 键加不饱和环。,b)与其它原子相连:单击某原子,

7、将原子与新划环以单键连接;按住某原子拖动,至所需方向松开鼠标得到与原子直接连接的环;单击欲连接的键中央:粘贴产生稠环。,与环有关的工具,2)不饱和环:与饱和环有相同操作,不同处为,鼠标在环中心单击可以加共轭环拖动环可以改变环大小,3)其它环:分类提供一些分子:Aromatics、Bicyclics、Conformers、Cycloalkanes、Polyhedra 和Templetes。,与环有关的工具,与划箭头有关的工具,1)反应式箭头(),a)单击产生水平箭头 b)拖动,可以产生各方向箭头;如拖动回原点,可改变箭头类型c)(双线箭头)按住箭头中央黑块拖动,可改变箭头宽度。d)单击箭头中央,

8、可以改变箭头种类,同型方向等。,e)按Shift 键,拖动鼠标可以改变箭头长度f)拖动鼠标可产生90 度箭头,单击端点可改变箭头类型、拖动端点可改变两端的长度和方向,按Shift 键拖动箭头的各端点可改变箭头形状,其操作与弯箭头类似。,2)机理及电子转移箭头(),与划箭头有关的工具,与划箭头有关的工具,a)通过拖动鼠标划出弯箭头。b)拖动鼠标时回通过原点可以使弯箭头翻转。c)刚划的弯箭头有两个方框,可以通过调整方框的位置改变曲线的形状,也可以拖动箭头的首尾改变箭头的形状。d)单击箭头两端可以改变箭头的类型。e)按Shift 键,在箭头上的箭头点和2 个箭头的侧翼点拖动鼠标可改变箭头的形状。f)

9、欲改变箭头,单击箭头可以激活。,与划箭头有关的工具,3)园或园弧及相应箭头工具()使用此工具可以画实或虚线的圆、椭圆、圆弧、椭圆弧及相应带箭头的弧。,a)鼠标选择工具后,在文档中用拖动的方式可以产生相应大小的圆,如按Shift 键,则产生椭圆。b)移动圆/椭圆可用拖动其圆心的方式完成。c)在画好的圆或椭圆内拖动鼠标,则产生相应的弧箭头;d)拖动弧的两端,可改变弧长;e)单击弧箭头,可改变箭头的式样;f)按Shift 键拖动箭头的两翼,可改变箭头的大小及式样。,1)化学符号标记(),化学符号标记()和文字说明Caption(),a)单击要加的位置,产生插入符,输入原子或基团的名称即可。b)以取代

10、基形式插入(按Shift 键可以改变键长)c)直接在空位输入分子式。如H2SO4。d)可以改变键级:单击键中部可以改变为双键或三键,按住Alt 键后单击可以加为短双键,再次单击可以改变短键的位置。e)编辑已标记的内容:鼠标选中后 单击欲编辑的位置即可编辑。,2)文字说明Caption(),化学符号标记()和文字说明Caption(),可以在图形中加文字说明,可以使用各种字体(包括中文),也可以使用Windows 支持的所有符号。该说明文字可以是普通文本、粗体或斜体,也可以使用Formular 格式,字体和样式等可以在菜单上选择。编辑方式与Word 相似。注意不可用Caption 方式加化学标记

11、;该工具所写的文本无法与化学键相连。,编辑工具,包括对象选择工具()、套索工具()与板擦(),主要用于对象的编辑。,1)选择对象工具(),鼠标单击某结构的一点,或单击某对象,或者采用拖动鼠标的方式将矩形内的所有对象选择。选择上的对象边缘有8 个黑点。如欲选择多个对象可以按住Shift 键后选择或用鼠标拖出的方框所包含的对象。,编辑工具,a)移动:可用鼠标拖动到任意位置或使用键盘上的光标移动键逐点移动。移动过程中如果按Ctrl 键则可以复制。b)改变大小和旋转:鼠标选中边上的把手(Handle)后可以水平或垂直放大或缩小;选择角上的把手可以对整个对象放大或缩小;如在选择角上把手时按住Shift

12、键则可水平、垂直方向拉伸;如果选择边上把手时按Shift 键则产生旋转标志,可以旋转所选对象;进行以上操作时如按Ctrl 键则复制对象。,此工具与菜单命令合用,可以改变大小、移动、旋转、复制、删除、改变对象等。,编辑工具,2)套索工具()使用套索可以复制、删除或移动一个结构的一部分;可以用来移动原子标记而不移动键;可以改变键的前后位置;可以在套索选择的位置加标记。,选择:可以用单击选择一个原子或用拖动的方式选择多个原子;按住Shift 键可以进行多次选择。,a)移动一个或多个原子:使用套索选择一个或多个原子;用鼠标拖动到目标位置(使用键盘方向键可以逐点移动)。,编辑工具,b)不移动对应的键而移

13、动基团的标记:按Alt 键,用套索拖动标记至目标位置(使用键盘方向键可以逐点移动)。c)移动键的前后位置:用套索选择某键,在Arrange 菜单中选择Bring to Front/Send to Back 命令可以改变与交迭键的前后位置。d)复制套索所选内容:用套索选定部分结构后,按Ctrl 键拖动,可复制选定部分。e)删除套索所选内容:用套索选定部分结构后,按Backspace、Delete 或选择Edit 菜单中的Clear 命令可清除选定部分。f)标记原子:用套索选择后,选择周期表或使用快捷方式标记原子。用空格键除去不想标记的原子。,编辑工具,g)旋转结构中的一部分:选择点,单击旋转工具

14、或选择Arrange 菜单中Free Rotate 命令,可用拖的方式旋转结构中的一部分。,h)其它功能:套索选择后,可以使用编辑及改变模式命令。i)选择工具 也可以用来进行套索操作,其方法是在使用时按Alt 键。,编辑工具,3)板擦(),使用板擦可以删除某个原子、化学标记、键以及图形对象等。,划框、括号及划线工具,1)划框(),a)选定框类型,用鼠标拖出框,松开鼠标即可。如在起始点松开鼠标,则不划框,按Shift 键则划方框。b)改变框大小和位置:使用选择工具 放大或缩小。c)用鼠标拖动左上角改变框线的角的弧度;用鼠标拖动右下角改变框线的阴影大小。,划框、括号及划线工具,2)括号(),a)拖

15、动鼠标产生双括号,对 可在四角可填写相应的上下标内容b)拖动括号下角可以改变双括号形状c)使用选择工具 改变双括号框大小和位置。d)单括号:拖动改变角度;拖动中心改变形状,3)划线及编辑工具(),划框、括号及划线工具,a)单击产生一个点,移动光标至下一位置,单击产生一条线段,单击工具图标结束;按Shift 键可限定线段为水平、垂直或45斜线。b)继续单击可以连续划折线,再次单击工具图标结束折线;如最后单击起始点则为封闭图形,其可以填充。c)单击一点,移至第二点拖到第三点,拖动至合适松开鼠标产生曲线,再次单击工具图标结束。d)使用编辑工具可编辑所划的曲线和折线。,原子标记符号等,在某原子上单击产

16、生此符号,拖动则可绕该原子决定符号位置,按Shift 键可改变符号与原子间距离;任意点单击产生单独的符号对象;符号与该原子相关联;符号可使用套索或板擦删除。,轨道符号,起始拖动划轨道符号;按Shift 键可改变大小;按Ctrl 键改变方向;使用Arrange 中的前后变换命令可改变对象间的前后位置。,组合工具,1)水平翻转()和垂直翻转():选择对象,单击水平翻转按钮,可使被选择对象水平方向翻转;选择对象,单击垂直翻转按钮,可使被选择对象垂直方向翻转;,组合工具,2)自由旋转():与Arrange 菜单中Free Rotate 功能相同;使用选择工具选择对象,单击自由旋转图标,击中对象把手拖动

17、鼠标,可以自由旋转到指定角度,旋转中角度显示在旁边。按Ctrl 键则复制出旋转后的对象。,3)组()和取消组():将多个对象组合为一个组,也可以将多个组组合为一个组。与Arrange 菜单中的Group 命令相同。例如,将一个反应式中的反应物和产物组合为一个组,这样可以在某些操作时整个反应式可以同时进行,避免出现遗漏现象。,组合工具,4)连接():将两个相叠或近似相叠的结构直接连接形成一个结构,同Arrange 菜单中Join 命令。注意其与组的区别。,5)对象排列():将选择的对象按水平/垂直方式排列,与Arrange 菜单中的Align Object 命令相同。选择此命令后,出现对话框,水

18、平方向有四个选项:不变、左边、中心和右边;垂直方向也是四个选项:不变、顶部、中心、底部。选择后选择OK 进行排列。此命令有时会使选择对象重叠。,组合工具,6)移到前面()/后面():将选择对象放至图形的前面/后面对象的堆积:ChemWindow 将图形对象像牌一样堆积,一般的结构为透明的,所以堆积结构的次序是没有关系的;一些工具可以可以产生不透明图形(如轨道等),这时前后顺序必须正确。另外,ChemWindow 在处理相互交叠的键时,自动将后面的键断开而产生立体感,使用上两个命令也可以改变键之间的前后顺序。,send to back,bring to front,其它工具,1)表格工具:可拖动

19、制表,因可在Word 中使用更好的制表,一般不提倡使用,2)Newman 投影式:可绘制Newman 投影式,选中后在文档区拖动,选定前面三个原子的位置,松开鼠标,可得到Newman 投影式。,其它工具,3)标注工具单击标注工具,可打开相应的标注工具栏,可对选定的原子进行标注,前5 个为文本框样式、中间5 个为连线样式、后4 个为标注原子的样式,其它工具,4)质谱碎片工具:拖动穿过分子可将分子沿线分作两部分(自由基),分别给出分子量和分子式。,5)质谱标记工具:在相应键上单击可将断开后两部分的分子量和分子式标出。,附加库使用,Chemwindow 6.0 提供了四个附加的图形结构库,这些库默认

20、位置为:C:Program filesBio-Rad LaboratoriesChemWinLibraries 包括:CESymbol:提供化工符号;LabGlass:提供化学实验室的玻璃仪器等的图形;OtherLib 和StrucLib:提供化学物质的结构式;,附加库使用,先打开库文件,选择所需图形或结构,可通过查询命令在库中寻找,通过剪贴板复制到用户的ChemWindow 文档。对于玻璃仪器,其标准口可以自动连接。注意库中所给的蒸馏装置的温度计位置有误,可用套索选中后修改即可。,菜单命令,对常用的菜单命令不再解释,这里仅对一些需要说明的菜单命令进行说明。File 菜单:文件管理、打印等。默

21、认保存为扩展名为“.cwg”的文件,可用Save As 命令将文挡存为Standard Chemistry Format(.SCF)、MDL MolFile(.MOL)、ChemDraw(.CHM)等其它格式。可用Page Setup 命令更改纸张大小,以扩大文档大小。Edit 菜单:包括Undo(撤消)、Redo(重复)、Copy(拷贝)、Paste(粘贴)、Select All(全选)等命令,与其它的Windows 应用程序相近。Join(连接)已在前面工具按钮中说明。如打开的是库文件,可以使用Find in Library 命令在库中查找结构或仪器。Override Style 命令可改

22、变当前样式默认的参数值如键长度、宽度、字体和字号等(注:不要随意改变)。样式可在Style 工具条中改变。View 菜单:决定显示哪些工具栏,是否显示标尺和状态栏等。,菜单命令,4)Arrange 菜单:包括前后位置设置(Bring to Front,Send to Back)、组(Group,Ungroup),旋转(Rotate,Free Rotate)、放大缩小(Scale)、翻转(Flip Horizontal,Flip Vertical)和对象排列(Space Objects,Align Objects)等命令 Rotate(R):将选择的对象旋转指定角度,使用该命令时,产生一对话框,

23、输入欲旋转的角度并单击OK 确认即可。其旋转方向为逆时针方向,如欲顺时针旋转,角度值可以输入负数。Scale(5):比例放缩所选择对象的大小。所有在ChemWindow 中的对象均可以用两种方法放缩,其一为使用鼠标,选择对象,将鼠标选中对象的把手远离或朝向对象拖动至目标大小(拖动时显示放缩的比例);其二是使用键盘,选择对象后用Arrange 菜单中Scale 命令,在对话框中输入百分比确认即可。Size:设置对象大小及位置。Space Objects:等距排列对象;对象间的距离用点数表示。选择多个对象,使用Arrange 菜单中Space Objects 命令,出现对话框,选择对象间隔的点数和

24、排列方式,确认即可。Align Objects:将选择的对象排成一行或列。,菜单命令,5)Analytical 菜单 Calculate Mass:计算所选择结构的分子量。选择一个结构或一个结构的一部分,选择Calculate Mass 命令,可计算出分子量、分子式和组成百分比,按Paste 按钮可将选中的项粘贴到ChemWindow 的文档中。Formular Calculater:计算分子量及不同摩尔数的分子质量。Periodic Table:显示周期表。选择原子,其信息显示在中间窗口上,按Edit 键可显示个各同位素参数并可进行编辑。周期表也可用于标记原子,用套索选择某结构中的一个或多个

25、原子,从周期表中单击要选的原子,该原子就被加到结构上,相应的氢原子个数也被加上。,菜单命令,6)Other 菜单:Check Chemistry:检查结构是否正确。Other 菜单中选择Check Syntax 命令,将检查文档中所有结构是否正确,如发现错误,其光标将移到错误位置;检查窗口的上部将提供错误的信息;改变错误后,Ignore 按钮将变为Continue,单击继续检查。,Make Stick Structure:将简写结构变为结构图Make Labeled Structure:将结构图改为简写形式,菜单命令,Edit Users Chemistry:用户可根据自己需要加入基团或分子的简写,在计算分子量等操作中程序可以辨认。Edit Hot Keys:用户可自己增加基团的热键,如默认中4=Ph,在刚加上一单或双键时,按热键程序可自动加入相应基团。Symapps:对选择的分子直接打开Symapps 程序显示三维结构。7)Windows 和Help 菜单:与一般程序同,

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