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1、HLA配型与无关供体HSCT,南京医科大学第一附属医院江 苏 省 人 民 医 院汪承亚 2010年2月,前 言,1957 年首例人类双生子之间骨髓移植成功,为治疗白血病等恶性血液病开创了新疗法。继使用HLA 匹配的无关供者造血干细胞移植成功后,1988年美国率先建立起无关供者骨髓库(美国国家骨髓供者计划,简称NMDP),尔后又建立了公共脐带血库。根据世界骨髓供者协会(WMDA)资料目前已有60个国家或地区的骨髓库、37个脐血库参加WMDA;登记在案的骨髓供者数超过900万人;库存脐带血达18万份;全球每年无关供者骨髓移植病例超过5000例。与此同时,HLA分型技术也从简单的血清学方法,转变为更
2、精确的基因分型。目前中国造血干细胞捐献者资料库管理中心(简称中华骨髓库)的供者数已超过100万人,使用无关供者的造血干细胞移植也已普遍开展,1997-2007:Worldwide unrelated donorhematopoietic cell transplantation,Bone marrow Peripheral blood stem cells Cord blood(approximate),NMDP facilitated transplants(fiscal year 19872008),Cord blood Peripheral blood stem cellsBone ma
3、rrow,NMDP Transplant Recipients by Diagnosis Selected Malignancies NMDP移植治疗恶性肿瘤统计,NMDP Transplant Recipients by Age NMDP移植年龄统计,Acute Myeloid Leukemia in Adults成人急性髓性白血病,Myelodysplastic Syndrome in Adults,Acute Leukemia,CR1 in Children,Acute Leukemia,CR2 in Children,Severe Aplastic Anemia in Adults,S
4、evere Aplastic Anemia in Children,前 言（续）,尽管有关HLA 配合程度对造血干细胞移植结果影响的报告数以百计，但是由于在样本数、疾病类型和病情、HLA 分型水平等方面的异质性，所得到的结论不尽相同，此外HLA 基因分型结果及其生物学意义的解释也显得日趋复杂。这些情况对于非HLA 专业人员,在选择HLA 最佳配合无关供者方面产生了一定困扰。为解决此问题，WMDA、美国NMDP以及欧洲免疫遗传学联盟(EFI)等组织相继推出与HLA 配型有关的工作指南。,HLA 抗原和基因,HLA 抗原：HLA 抗原是细胞表面上的一种蛋白质,它能刺激宿主免疫系统可产生相应抗体。因
5、此,最初HLA 抗原是使用血清学方法检测出来的(表1)。使用血清学鉴定的同一个HLA 抗原,可以是许多等位基因的产物,因此已鉴定出的等位基因数,远远多于HLA 抗原数,同时由于HLA 抗体来源以及抗体特异性的限制,并非所有等位基因对应的HLA 抗原都可以用血清学方法鉴定。换言之,在DNA水平上的HLA多态性,只有其中一部分可以用血清学方法来识别。,HLA 抗原和基因（续）,HLA 抗原交叉反应性：HLA 抗原之间存在交叉反应性,比如,某个体只受到一个HLA-B7 抗原的免疫刺激,结果产生抗-B7 和抗-B27 等多种特异性抗体。根据交叉反应性的特点,HLA 抗原可以分成许多交叉反应组(表2)。
6、同一个交叉反应组中的抗原,共有一些免疫学决定簇,或称为抗原表位。,表2 HLA-A,B,DR 抗原交叉反应组 A 座位 B 座位 DR 座位A1,11,36 B7,42,54(22),55(22),56(22)DR1,15(2),16(2)A2,203,210,28 B38(16),39(16),8 DR3,11(5),12(5),13(6),14(6)A3,11,1 B45(12),50(21),41 DR4,7,9A23(9),24(9),2403 52(5),53 DR11(5),12(5),8A25(10),32 B44(12),49(21)DR13(6),14(6),17(3),18
7、(3)A26(10),33,34,43,66 B49(21),44(12),A30,31 B51(5),52(5),53A36,1,80 B57(17),62(15),63(15)A68(28),2,69(28)B58(17),22A74,32 B60(40),61(40),48 B62(15),35,70,75(15),76(15)B63(15),53,57(17),58(17)B64(14),65(14),8 B71(70),35,62(15),72(70),*每一行代表一个交叉反应组,括号中数字代表对应的宽特异性,HLA 抗原和基因（续）,HLA 基因：HLA 基因位于细胞核内,存在于D
8、NA分子中,它编码细胞表 面的HLA蛋白分子。在移植免疫反应中,HLA基因本身不直 接参与，而是其编码的HLA抗原在发挥作用。HLA基因分型 的基本原理是检测DNA序列的差异。虽然HLA-类和类 基因都含有多个外显子，但实际临床HLA-A,B,C 基因分 型只检测相应基因外显子2和外显子3 的DNA序列，DR基 因分型只检测相应外显子2。,外显子,核甘,密码子(HLA一类),HLA常见等位基因大都在2，3外显子的碱基序列差异 罕见等位基因大都在2，3外显子以外区域的碱基变异,外显子,核甘,密码子(二类),HLA-DR位点常见等位基因大都在第2外显子的碱基序列变异 罕见等位基因大都在第2外显子以
9、外区域的碱基变异,外显子与核甘序列(Exon/Nucleotide),10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 A*01010101ATGGCCGTCA TGGCGCCCCG AACCCTCCTC CTGCTACTCT CGGGGGCCCT GGCCCTGACC CAGACCTGGG CGG|GCTCCCA CTCCATGAGG TATTTCTTCA A*02010101-G-T-|-T-110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 A*01010101CATCCGTGTC CCGGCCCGGC CGCGGGGAGC CCCGCTTCAT
10、CGCCGTGGGC TACGTGGACG ACACGCAGTT CGTGCGGTTC GACAGCGACG CCGCGAGCCA A*02010101-A-210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 A*01010101GAAGATGGAG CCGCGGGCGC CGTGGATAGA GCAGGAGGGG CCGGAGTATT GGGACCAGGA GACACGGAAT ATGAAGGCCC ACTCACAGAC TGACCGAGCG A*02010101-G-T-GG-A G-C-T-310 320 330 340 350 360 370 380 390
11、 400 A*01010101AACCTGGGGA CCCTGCGCGG CTACTACAAC CAGAGCGAGG ACG|GTTCTCA CACCATCCAG ATAATGTATG GCTGCGACGT GGGGCCGGAC GGGCGCTTCC A*02010101G-C-|-G-GG-T-T-410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 A*01010101TCCGCGGGTA CCGGCAGGAC GCCTACGACG GCAAGGATTA CATCGCCCTG AACGAGGACC TGCGCTCTTG GACCGCGGCG GACATGGCAG
12、CTCAGATCAC A*02010101-AC-T-A-C-510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 A*01010101CAAGCGCAAG TGGGAGGCGG TCCATGCGGC GGAGCAGCGG AGAGTCTACC TGGAGGGCCG GTGCGTGGAC GGGCTCCGCA GATACCTGGA GAACGGGAAG A*02010101-A-C-T-TT-C-AC-G T-610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 A*01010101GAGACGCTGC AGCGCACGG|A CCCCCCC
13、AAG ACACATATGA CCCACCACCC CATCTCTGAC CATGAGGCCA CCCTGAGGTG CTGGGCCCTG GGCTTCTACC A*02010101-|-G-A-G-T-G-TG-A-A-,每个外显子包含一定数量的核甘酸 不同的核甘酸序列决定不同的等位基因,外显子2的起始位置,外显子3的起始位置,外显子4的起始位置,外显子与密码子(Exon/Codon),-20-15-10-5 1 A*01010101ATG GCC GTC ATG GCG CCC CGA ACC CTC CTC CTG CTA CTC TCG GGG GCC CTG GCC CTG ACC
14、CAG ACC TGG GCG G|GC A*02010101-G-T-|-5 10 15 20 25 A*01010101TCC CAC TCC ATG AGG TAT TTC TTC ACA TCC GTG TCC CGG CCC GGC CGC GGG GAG CCC CGC TTC ATC GCC GTG GGC A*02010101-T-A-30 35 40 45 50 A*01010101TAC GTG GAC GAC ACG CAG TTC GTG CGG TTC GAC AGC GAC GCC GCG AGC CAG AAG ATG GAG CCG CGG GCG CCG TG
15、G A*02010101-G-55 60 65 70 75 A*01010101ATA GAG CAG GAG GGG CCG GAG TAT TGG GAC CAG GAG ACA CGG AAT ATG AAG GCC CAC TCA CAG ACT GAC CGA GCG A*02010101-T-GG-A G-C-T-80 85 90 95 100 A*01010101AAC CTG GGG ACC CTG CGC GGC TAC TAC AAC CAG AGC GAG GAC G|GT TCT CAC ACC ATC CAG ATA ATG TAT GGC TGC A*0201010
16、1G-C-|-G-GG-105 110 115 120 125 A*01010101GAC GTG GGG CCG GAC GGG CGC TTC CTC CGC GGG TAC CGG CAG GAC GCC TAC GAC GGC AAG GAT TAC ATC GCC CTG A*02010101-T-T-AC-T-130 135 140 145 150 A*01010101AAC GAG GAC CTG CGC TCT TGG ACC GCG GCG GAC ATG GCA GCT CAG ATC ACC AAG CGC AAG TGG GAG GCG GTC CAT A*020101
17、01-A-C-A-C-155 160 165 170 175 A*01010101GCG GCG GAG CAG CGG AGA GTC TAC CTG GAG GGC CGG TGC GTG GAC GGG CTC CGC AGA TAC CTG GAG AAC GGG AAG A*02010101-T-TT-C-AC-G T-180 185 190 195 200 A*01010101GAG ACG CTG CAG CGC ACG G|AC CCC CCC AAG ACA CAT ATG ACC CAC CAC CCC ATC TCT GAC CAT GAG GCC ACC CTG A*0
18、2010101-|-G-A-G-T-G-T G-A-,每个密码子对应由三个核甘组成的一个氨基酸 第2外显子的第一个氨基酸,其位置为密码子1,外显子2的起始位置,HLA等位基因发现数量进展(2008年6月),HLA一类等位基因,HLA二类等位基因,IMGT/HLA 数据库统计,版本:2.24(2009年1月发表)HLA等位基因总数为3,371个 其中一类为2,351 A位点:733 B位点:1,115 C位点:392 二类1,020个 DRB1位点:608其它与HLA相关等位基因106个(MICA:65个;MICB:30个),Version Report-2.252(May)VS.2.26(Ju
19、ly)2009,HLA 抗原和基因（续）,HLA等位基因的命名：HLA 等位基因由世界卫生组织(WHO)HLA 命名委员会统一命名,采用数字命名方法。一个完整的HLA 等位基因最多需要用9 个数字表示。HLA 座位用大写字母右上角加星号表示。星号后第1、2 位数字代表相应血清学特异性;第3、4 位代表等位基因,即编码的氨基酸序列有所改变;第5、6 位表示外显子中的非编码取代,该核苷酸碱基取代不改变所编码的氨基酸,因此,对应的HLA 抗原的分子结构未改变;第7、8 位代表内含子区域中的碱基取代。第9 位后缀字母S 代表该等位基因的产物是可溶性HLA 分子,不存在于细胞表面;L 代表编码低表达抗原
20、;N代表无效基因,该基因不产生相应的HLA 抗原分子。,HLA 抗原和基因（续）,HLA 等位基因数字命名原则示例,HLA检测分辨率:(Level of resolution):低分辨率(Low level):A*02 中分辨率(Medium level):A*0201/0205/0209/0240/0266N 高分辨率(High level):A*020101/0209 等位基因水平(Allele level):A*02010101模棱两可(Ambiguity):Using medium level resolution typing it is possible to exclude so
21、me but not all alleles from a group,hence the NMDP codes.B*1501 or B*1502=B*15AB B*1501/1502/1505/1515/1521/1545/1556/1570=B*15FGR,HLA 命名委员会,Steven Marsh,PhD.March 13,2009,Allele Group Alleles F（%）Allele Group Alleles F（%）A*01 A*0101 1.7422 A*24（16.79）A*2402 17.2456 A*0102 0.1742 A*2407 0.5226 A*010
22、3 0.1742 A*26（2.81）A*2601 2.1776 A*02（29.55）A*0201 12.7649 A*29 A*2901 1.2195 A*0202 0.1742 A*2902 0.1742 A*0203 2.7875 A*30（9.13）A*3001 9.9796 A*0205 0.3484 A*31（3.74）A*3101 3.5927 A*0206 4.2967 A*32 A*3201 1.6428 A*0207 6.0514 A*33（10.02）A*3303 10.3621 A*03（2.43）A*0301 2.9617 A*66 A*6601 0.1742 A*
23、11（18.56）A*1101 17.6551 A*68 A*6801 0.5226 A*1102 0.5226 A*6802 0.1742 A*23 A*2301 0.8711 A*69 A*6901 0.6969,HLA-A位点常见等位基因频率表（高分N=287）,HLA-B位点常见等位基因频率表（高分N=287）,Allele Group Alleles F（%）Allele Group Alleles F（%）Allele Group Alleles F（%）B*07 B*0701 0.1742 B*27 B*2705 0.3484 B*46（9.41）B*4601 7.6222（2.
24、46）B*0702 1.9164 B*2707 0.3484 B*48 B*4801 1.5679 B*0705 0.8711 B*35 B*3501 2.6132 B*49 B*4901 0.3484 B*0723 0.1742（4.64）B*3502 0.1742 B*50 B*5001 0.5226 B*08 B*0801 0.3484 B*3503 1.3937 B*51（6.67）B*5101 4.6711 B*13 B*1301 4.007 B*3505 0.5226 B*5102 0.3484（13.17）B*1302 10.0367 B*37 B*3701 1.1344 B*5
25、2（3.07）B*5201 4.1812 B*15 B*1501 4.8462 B*38 B*3802 1.9164 B*53 B*5301 0.1742（14.40）B*1502 1.9164（2.41）B*39 B*3901 1.3937 B*54（3.73）B*5401 4.8462 B*1507 0.3484 B*3905 0.1742 B*55（2.48）B*5502 2.2648 B*1511 1.2195 B*40 B*4001 10.0529 B*5504 0.3950 B*1517 0.1742（13.58）B*4002 2.6132 B*5507 0.1742 B*1518
26、 1.9164 B*4003 0.1742 B*56 B*5601 0.5226 B*1525 0.3484 B*4006 3.4843 B*57 B*5701 1.0453 B*1527 0.6969 B*4040 0.1742 B*58（6.60）B*5801 7.0735 B*1558 0.1742 B*41 B*4101 0.6969 B*67 B*6701 0.5226 B*18 B*1801 0.3484 B*44 B*4402 1.0453 B*81 B*8101 0.1742 B*27 B*2703 0.1742（3.75）B*4403 3.4843 B*2704 1.2195
27、 B*45 B*4501 0.3484,Allele Group Alleles F(%)Allele Group Allele F(%)DRB1*01 DRB1*0101 2.6132 DRB1*11(5.27)DRB1*1101 4.4062 DRB1*0102 0.1742 DRB1*1104 0.3484DRB1*03(4.76)DRB1*0301 4.9378 DRB1*1105 0.1742DRB1*04(12.41)DRB1*0401 1.2195 DRB1*12(12.22)DRB1*1201 2.6132 DRB1*0403 1.7422 DRB1*1202 9.0224 D
28、RB1*0404 0.1742 DRB1*13(6.57)DRB1*1301 2.1731 DRB1*0405 4.7038 DRB1*1302 5.3465 DRB1*0406 2.2648 DRB1*1307 0.1742 DRB1*0408 0.1742 DRB1*1312 0.6969 DRB1*0410 0.1742 DRB1*14(4.80)DRB1*1402 0.3484 DRB1*07(12.51)DRB1*0701 13.1048 DRB1*1403 0.1742DRB1*08(7.36)DRB1*0801 0.1742 DRB1*1404 0.3484 DRB1*0802
29、0.1742 DRB1*1405 2.4390 DRB1*0803 7.7570 DRB1*1454 1.9164 DRB1*0804 0.1742 DRB1*15(13.09)DRB1*1501 8.5574DRB1*09(16.15)DRB1*0901 15.5624 DRB1*1502 2.2648DRB1*10 DRB1*1001 1.5288 DRB1*16 DRB1*1602 1.2195,HLA-DRB1位点常见等位基因频率表（高分N=287）,由于新的等位基因不断地被发现,且越发现越多,很多等位基因其核苷序列的不同已经超过了100种,两位数字已经无法涵盖。为了解决这问题以往是一
30、组等位基因排位99后的另列命名，如A*9240（A*02140），B*9503（B*15103）。现在的新命名将以往前四位数字的内容扩大到了五位数字,如A*02:140,B*15:103.随着新的等位基因不断地上报,可以想象,仅A2家族,就会不断延伸,如A*02:150,A*02:151。,HLA等位基因的新命名,HLA等位基因的新命名,A*01010101 becomes A*01:01:01:01A*02010102L becomes A*02:01:01:02LA*260101 becomes A*26:01:01A*3301 becomes A*33:01B*0808N becomes
31、 B*08:08NDRB1*01010101 becomes DRB1*01:01:01:01,HLA等位基因的新命名,For allele families that have more than 100 alleles such as the A*02 and B*15 groups it will be possible to encode these in a single series.Thus the A*92 and B*95 alleles will now be renamed in to the A*02 and B*15 allele series.For example
32、:A*9201 becomes A*02:101A*9202 becomes A*02:102A*9203 becomes A*02:103 etcB*9501 becomes B*15:101B*9502 becomes B*15:102B*9503 becomes B*15:103 etc,HLA等位基因的新命名,The w will be removed from the HLA-C allele names,but will be retained in the HLA-C antigens names,to avoid confusion with the factors of th
33、e complement system and epitopes on the HLA-C molecule often termed C1 and C2 that act as ligands for the Killer-cell Immunoglobulin-like Receptors.Cw*0103 becomes C*01:03Cw*020201 becomes C*02:02:01Cw*07020101 becomes C*07:02:01:01 etc,HLA等位基因的新命名,The DPB1 allele names that have been previously ass
34、igned names within the existing system will also be renamed,for example:DPB1*0102 becomes DPB1*100:01DPB1*0203 becomes DPB1*101:01DPB1*0302 becomes DPB1*102:01DPB1*0403 becomes DPB1*103:01DPB1*0502 becomes DPB1*104:01 etcLists of old and new allele names will be made available through the IMGT/HLA D
35、atabase(),WHO命名委员会还定义了某些等位基因串(String of Alleles)的代码.,2，3外显子多肽序列相同的等位基因串将以大写的P注明，如A*02:01P(包括02:01/02:09/02:66/02:75/02:89/02:97/02:132/02:134/02:140)。其临床意义在于P组里的等位基因可转成同一多肽.因此,抗体不能区分P组里的等位基因.2，3外显子核苷序列相同的等位基因串将以大写的G 注明,如A*02:01:01G(包括A*02:01/02:09/02:43N/02:66/02:75/02:83N/02:89/02:97/02:132/02:134/
36、02:140).,国际影响,2005年9月，北爱尔兰国家组织免疫相容性实验室主任Prof Derek Middleton了解到我室发现新等位基因，表示希望能参与合作，共享等位基因频率等遗传资料。同年9月，国际组织相容性协作组（International Histocompatibility work group,IHWG负责人教授邀请我实验室参加第14届国际组织相容性协作会议，共同讨论HLA领域相关问题。,表1 HLA 血清学分型和DNA 分型比较分型方法 检 材 检测对象A,B,C 血清学分型 单个核细胞 细胞表面抗原DR 血清学分型 B 淋巴细胞 细胞表面抗原A,B,C 基因分型 基因组D
37、NA 外显子2,3DRB1 基因分型 基因组DNA 外显子2 基因分型技术：SSP SSOP（酶标，LUMINEX，芯片）SBT,方法和水平 HLA-A HLA-B HLA-DR血清学分型宽特异性水平 A9,-B15,B40 DR2,DR6窄特异性水平 A24,-B62,B60 DR15,DR13DNA 基因分型低分辨 A*24XX,68XX B*15XX(B62),40XX(B60)DRB1*15XX,13XX中分辨 A*2402/2404 B*1501/1504/1505/1507 DRB1*1501/1503/1505 A*6801/6802/6811N B*4001/4007/4010
38、 DRB1*1301/1305/1306高分辨 A*2404,6811N B*15010101,400103 DRB1*150101,1306,HLA 分型水平比较和报告形式,中华骨髓库要求在括号中注明对应的抗原特异性,HLA 基因分型结果转换成HLA 抗原特异性,移植排斥反应是免疫活性细胞间的相互作用。在移植免疫反应中,宿主细胞识别的是外来HLA 抗原表位,而不是HLA 基因。虽然HLA 基因分型比经典的血清学分型准确,而且可以检测出血清学难以鉴定的HLA 基因产物,但是分型结果只是提供受检者带有哪些HLA 基因的信息,不能直接反映出该基因编码的HLA 抗原在细胞表面的表达情况以及免疫原性。
39、因此临床造血干细胞移植配型角度要求HLA 基因分型结果必需“翻译”成HLA 抗原特异性。在此背景下国际通用的HLA 字典应运而生,而美国NMDP 进一步建立起以血清学代码为基础的SD(search determinants)检索系统。,表 HLA 等位基因对应的血清学特异性以及编码系统示例,等位基因 HLA 字典 美国NMDP 中华骨髓库 特异性 SD 系统 指定特异性B*1501 B62 62 B62B*1502,1511 B75 75 B75B*1503 B72 70 B72B*1509 B70 70 B70 B*1510,1518 B71 70 B71 B*1512 B76 62/76
40、B76 B*1513 B77 77 B77 B*1516 B63 63 B63B*1523-70 B15B*1526N 无效 空白 无效 B*1529 B15 70 B15B*1538-62 B15B*1544-75 B15 B*1547-70 B15B*1555 B15 75 B15 B*1558 B15 62 B15,常见容易混淆的高分结果(高分前两位数字与血清学结果数字不同),中华骨髓库的特异性指定系统基本上以HLA 字典为标准指定HLA 特异性。对于血清学特异性未知的等位基因,采用以血清学宽特异性表示的方法处理。比如B*1523,B*1538,B*1544 和B*1547等位基因,都被
41、指定为B15。按此方法指定的特异性范围一般比SD 系统为宽,但以后可以按照HLA 字典提供的新信息而更新。,HLA 单体型，纯合子，杂合子,HLA 不同座位上的基因,紧密连锁组合成HLA 单体型,在家庭中以共显性等位基因的遗传方式传递。因此,每个人都带有2条分别来自父母的HLA 单体型。父母和孩子之间总是共有一条HLA 单体型。同胞之间,有1/4 的机会得到2 条相同的单体型;有1/4 的机会得到2 条不相同的单体型;还有1/2 的机会得到一条相同的HLA 单体型。如果一个体的某座位上带有2 个相同的等位基因,被称为纯合子;如带有2 个不相同的等位基因即为杂合子。只有通过家系调查才能确定是否为
42、纯合个体。,HLA 等位基因连锁不平衡,HLA 不同座位上的等位基因之间存在连锁不平衡即实际观察到的某些等位基因出现在同一条单体型上的频率显著高于或低于预期值,提示这些等位基因倾向于组合在一起。不同种族中的连锁不平衡格局不尽相同。比如,HLA-A2,B46,DR9 和HLA-A30,B13,DR7是中国人中最常见的存在连锁不平衡的单体型。HLA-A1,B73,DR10 是中国人中发现的罕见连锁不平衡HLA 单体型。,HYPLOTYES eHF(%)aHF(%)A*30-B*13-DRB1*07 6.92 9.01A*02-B*46-DRB1*09 3.53 3.73A*33-B*58-DRB1
43、*03 2.54 2.46A*33-B*58-DRB1*13 1.89 1.62A*11-B*15-DRB1*12 1.46 1.76A*33-B*44-DRB1*13 1.41 1.06A*11-B*15-DRB1*04 1.34 0.77A*02-B*40-DRB1*09 1.31 1.76A*02-B*46-DRB1*08 1.30 1.34A*24-B*40-DRB1*09 1.19 0.99A*02-B*15-DRB1*09 1.17 0.63A*02-B*15-DRB1*15 1.14 0.70A*24-B*15-DRB1*04 1.02 0.56,常见单体型频率举例,HLA-A*
44、B*DRB1*频率(%)HLA-A*B*DRB1*频率(%)3001 1302 0701 8.5 1101 4006 0901 0.7 3303 5801 0301 2.8 1101 1301 1501 0.7 0207 4601 0901 1.9 1101 4601 0901 0.7 3303 5801 1302 1.7 1101 5401 0405 0.7 3303 4403 1302 1.7 2402 4001 0803 0.7 2402 4001 0405 0.9 3201 5201 0101 0.7 0207 4601 0803 0.9 3303 5801 0101 0.7 1101
45、 1502 1202 0.9 其他357种单倍型 0.5,167个家系等位基因水平15种常见单倍型,子女与其父或母HLA单体型出现完全相同的家系,P793 M FHLA-A-B-DRB1 30 13 07 30 13 07 30 13 07 33 58 03 33 58 03 24 40 08 P1772 M FHLA-A-B-DRB1 24 40 08 24 40 08 24 40 08 11 40 15 11 40 15 02 15 12,Guidelines for Unrelated Bone Marrow Transplants1 Commen well-documented(CWD
46、)alleles 2 NMDP HLA-Matching Guidelines for Unrelated Marrow Transplants3 permissive un-matching in allo-HSCT,关于CWD(常见等位基因+少见等位基因),ASHI-HLA专家委员会对HLA基因分类的定义:常见等位基因(Common alleles):在任何参照人群中,该等位基因频率均大于0.0012)少见等位基因(Well-documented alleles):无关个体中至少被独立观察到三次的等位基因，但它们的频率未能被准确地评估，某一特定人群中发现的等位基因可能在另外一人群中频率极低
47、。总体上,这类等位基因的频率明显低于常见等位基因3)罕见等位基因(Rare alleles):余下的等位基因被归类于罕见基因 这类等位基因的频率非常低 其最高频率可通过出现在被检测人群的规 模而估算出来例如，被检测的总标本量为万人，该基因被检测出 一次因此，该基因的最高频率为1/20,000。除了与被检测出的个体 具有血缘关系外,很难从其他个体再被发现。,关于CWD(常见等位基因+少见等位基因),由于研究方面的限制，ASHI-HLA专家委员会建议将常见等位基因和少见等位基因归于一类,即CWD等位基因,以便明确区分罕见基因.这样有利于实验室和临床实践.此外,对等位基因的分类应定期加以审查CWD的
48、确定基于在任何参照人群中,其精确的基因频率大于0.001，或者，某一个实验室从三个无关个体中获得明确的高分检测结果,或者，不同实验室报告给IMGT/HLA基因库的至少来自三个无关个体的高分结果,绝大部分CWD序列的差异HLA-I类基因在2和3外显子，HLA-II类基因在外显子2。CWD基因可基本上反映人类各人群HLA系统的基因多态性.综合考虑，迄今为止在每个被研究的人群中,各位点的CWD基因约占99%以上。一些目前不在CWD表中的基因,可能将来会被确认为少见基因，但几率非常低截止到2006年,约27至30的常见HLA位点(HLA-A,B,C,DRB1)的等位基因被认为是CWD等位基因。到200
49、9年4月,CWD等位基因的比例降到20%.随着时间的推移,WHO命名的HLA等位基因会显著增加，而CWD等位基因的数量将保持相对稳定某些不表达的HLA基因(Null alleles)被发现频率并不低,如Cw*0409N DRB4*01030102N，DRB5*0108N;或曾被多次报道过，如A*0104N,A*2409N,A*2411N被列入CWD基因表内但ASHI-HLA专家委员会建议实验室在进行临床检测时可进一步排除这类不表达的基因,关于CWD(常见等位基因+少见等位基因),CWD等位基因与罕见等位基因之比,HLA-A:130 489 26.6 767 17.7HLA-B:245 830
50、29.5 1,178 21.9HLA-C:81 266 30.5 440 20.7HLA-DR 143 463 30.9 707 23.5 CWD=29.2%CWD=19.4%,等位基因总数 等位基因总数 CWD 2006%2009%,世界卫生组织命名的等位基因越来越多.在过去的三年时间里,A,B,C和DR位点增加了1,000多个新等位基因,但CWD等位基因的数目并没有增加.可以预测,再过几年,CWD等位基因数目可能不足10%绝大部分等位基因将为罕见等位基因.需要检测的几乎是常数的CWD,外显子2,3为HLA-I类和 外显子2 为HLA-II类的关键区域,2,3外显子为HLA的关键区域(Key
