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1、第九章 微生物分类鉴定,什么是微生物分类学(microbialtaxonomy):,按照微生物的亲缘关系将其安排成条理清楚的各种分类单元和分类群的科学,微生物分类的目的,把各种微生物按照它们的亲缘关系分群归类，排成系统，以便于人们对微生物进行鉴定和交流,微生物分类学的主要任务,分类(classification)即根据相似性或亲缘关系,将一个有机体放在一个单元中,命名(nomenclature),鉴定(identification)确定一个新的分类物是否归属于已经命名的分类单元的过程,第一节 微生物分类的单位第二节 微生物的命名第三节 微生物在生物界中的地位第四节 微生物的分类鉴定方法,一、微
2、生物的分类单位,界门纲目科属种,常用的几种分类概念,种：亲缘关系较近的微生物有机体的集合，它们在进化发育阶段上有一定的共同形态和生理特征。现代分类学上规定种内菌株的DNA同源性70%小种（亚种）：实验室中获得的微生物变异型称为小种或亚种。菌株（品系）：来源不同的同种微生物的纯培养，均可称为菌株。,大肠杆菌的分类地位,命名的方法：国际法规命名，即林奈所创立的双名法。双名法的规则：微生物的学名依属和种而命名，由两个拉丁字或希腊字或拉丁化了的其它文字组成，属名在前，为名词，开头字母大写，是该微生物的主要特征。种名在后，为形容词。如：Stapylococcus aureus,Streptomyces
3、albosporeus(Krainsky)Waksman et Henrici,Micrococcus sp.(spp.),Bacillus subtilis var.niger,二、微生物的命名,需要牢记的一些微生物学名,大肠杆菌:Escherichia coli枯草杆菌 Bacillus subtilis金黄色葡萄球菌 Staphylococcus aureus酿酒酵母:Saccharomyces cerevisiae灰色链霉菌 Streptomyces griseus粗糙链孢霉：neurospora crassa产黄青霉:penicillium chrysogenum,三、微生物在生物界
4、中的地位,三域学说,四、微生物的分类鉴定方法,1.经典鉴定分类法,2.数值分类法,3.化学分类法,4.遗传分类法,经典鉴定分类法,个体:细胞形态,大小,排列方式,染色,运动等形态特征:菌落形态营养要求:碳源,氮源,矿质元素生理生化特征:代谢产物种类,产量,现色反应酶:产酶种类和反应特征生态学特征:生长温度,氧需求,酸碱度,宿主种类血清学反应噬菌体的敏感性其他:全细胞蛋白的分析等,数值分类法,测定100项以上的各种性状，利用计算机进行菌株的相互比较，并得出总的相似值。一般认为同种微生物菌株之间的相似值80%。,化学分类法,细胞成分 分析内容 在分类水平上的作用 细胞壁 肽聚糖结构 多糖 种和属
5、胞壁酸 脂肪酸 膜 极性类脂 种和属 霉菌酸 蛋白质 氨基酸序列分析 血清学比较 属和属以上单位 电泳图 酶谱 代谢产物 脂肪酸 种和属 全细胞成分分析 热解-气液色谱分析 种和亚种 热解-质谱分析,遗传分类法,1.DNA碱基比例的测定,每一个微生物物种的DNA中的(G+C)mol%的数值是恒定的,不会随着环境及培养条件等的变化而变化,而且在同一个属不同种之间,GC含量不会差异太大,具有一定的范围,因此可以作为判定的微生物间亲缘关系的依据,2.核酸分子杂交法,遗传分类法,3.rRNA寡核苷酸编目分析,遗传分类法,一种通过分析原核或真核细胞中最稳定的rRNA寡核苷酸序列同源行程度,乙确定不同生物间的亲缘关系和进化谱系的方法,五、微生物的快速分类鉴定方法,
