《探索遗传语言》PPT课件.ppt

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1、探索遗传语言,1、基因组DNA的奥秘 遗传信息存贮在4种字符组成的核酸序列中“天书”用遗传语言书写的人类遗传蓝本包含的信息量巨大更重要的是目前人类对它了解甚少天书中只有4个字符(碱基A、T、G、C)既没有段落,也没有标点符号是一个长度为3109的一维序列。,科学家对这本天书了解最多的部分就是遗传密码或者说掌握了DNA对蛋白质编码的规律 关于密码子(1)密码子的使用是非随机的 如果密码子的第一、第二位碱基是A、U,那么第三位将尽可能使用G、C;反之亦然。如果三位都用G、C,则配对容易,分解难;三位都用A、U,则相反。一般地说,高表达的基因,要求翻译速度快,要求密码子和反密码子配对快、分手也快。,

2、(2)密码子的使用有一定的统计规律 对同义密码子的使用存在着偏爱不同种属偏爱的密码子不同 人类基因组:密码子第三位取A、U的情况占90%而第三位取G、C仅占10%密码子的使用偏性与基因功能、蛋白质结构相关,(3)密码子中的密码 三个碱基的位置与所编码的氨基酸性质存在着联系例如:芳香族氨基酸以U作为第一位碱基中间位置碱基的性质与氨基酸是亲疏水性相关疏水氨基酸的密码子,其第二位碱基是U亲水氨基酸的密码子,其第二位碱基是A第二位碱基是G、C的密码子所编码的氨基酸亲水性、疏水性居中。,基因组信息人类基因组:编码区域只占1%-3%对于非编码序列,尚不清楚其含义或功能非编码区域对于生命活动具有重要的意义

3、包括内含子、简单重复序列、移动元件、伪基因 重复序列:卫星(satellite)DNA小卫星(mini-satellite)DNA微卫星(micro-satellite)顺式调控元件:启动子、增强子、沉默子,2、探索遗传语言 用语言学的方法进行研究自然语言计算机程序设计语言遗传语言二进制序列0、1的长程关联性分析结果:编码区域 自然语言非编码区域 程序设计语言蛋白质编码区域所包含的信息相当于待加工的“数据”数据经过加工处理以后产生对应的蛋白质;而非编码区域则相当于“程序”或“指令”,确定如何在时间和空间方面控制基因的表达和蛋白质的合成,用密码学方法进行研究是否存在其它密码?调控信息密码?蛋白质

4、结构的密码?编码在DNA上的一维程序如何在四维时空中控制生命体的生长发育,3、关于生物复杂性生物的复杂性不仅仅是基因的数目人类基因约为30000个线虫有20000个基因,230000/220000=210000103000,4、基因组计划带来的希望 实验数据的积累速度在迅速地增加 计算机科学和技术也在不断地发展,单个基因组分析基因序列基因功能基因的表达调控基因产物基因多态性,比较基因组分析物种关系物种进化物种起源,人、鼠基因组比较,人基因组 鼠基因组 鼠染色体上的颜色和数字代表在人染色体上对应的片段.,老鼠约75%的基因与人类相同。,SARS 基因组(Severe Acute Respiratory Syndrome),全基因组核酸搜索结果,分段核酸搜索结果,全基因组蛋白质搜索结果,THE END,

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