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1、文摘索引型数据库,李春英图书馆信息咨询部,内容提要,1.文摘索引型数据库概况及特点2.中文文摘库3.外文文摘库,生物医学领域中外文摘索引数据库,美国全科医学文献数据库(Medline)荷兰医学文摘数据库(Embase)美国生物学文摘数据库(Biosis Previews)美国化学文摘数据库(CA on CD,SciFinder)美国科学引文索引数据库（SCI）中国生物医学文献数据库（CBM）中文生物医学期刊文献数据库（CMCC）,文摘索引数据库特点,提供原文的摘要信息摘要信息包括：题目、作者、刊名，或同论文相关信息数据量大，文献类型多、信息量大收录文献回溯年代长收录文献期刊种类多出版形式多样,
2、文摘索引数据库使用情况,文摘索引数据库掌握要领,1.数据库的概况2.数据库的结构3.数据库的检索界面4.数据库的检索技巧与方法,中国生物医学文献数据库,三个版本：1.CBMdisc2.CBMweb3.Sinomed,主要内容,1.CBM web检索系统2.CBM数据库3.数据库的组成结构4.CBM检索界面5.检索方法与技巧6.检索练习,CBM web检索系统,1.中国生物医学文献数据库检索系统(CBMLARS)(1)基于windows平台的检索软件CBMwin(CBMdisc for windows)(2)基于WWW平台的检索软件CBMweb(CBMdisc for Internet)2.特点
3、(1)兼容性好(2)词表辅助功能强(3)检索途径多(4)检索功能完备,CBM概况,1.编辑出版单位：中国医学科学院医学信息研究所2.类型：带有全文链接综合性书目型光盘数据库。3.收录情况：1978以来的近1600多种生物医学期刊，以及汇编、会议论文的文献题录，年增长量约26万条。该库涵盖了中文科技资料目录(医药卫生)、中文生物医学期刊目次数据库（CMCC）中收录的所有文献题录。4.更新周期：季度更新。,学科范围,基础医学临床医学预防医学药学中医学中药学,标引和分类,1.主题标引：根据美国国立医学图书馆的医学主题词表(即MeSH词表)，以及中国中医研究院图书情报研究所新版中医药学主题词表进行主题
4、标引。2.分类标引：根据中国图书资料分类法医学专业分类表R类 进行标引。,数据库结构,字段标识符 字段名称 AA 著者文摘 AB 文摘 AD 地址(第一著者地址)AU 著者 CA 索取号(医情所会议、汇编内部编码)CN 国内代码(国内期刊代码)CL 分类号 CT 特征词 IS ISSN(国际期刊代码)LA 语种(缺省值为中文)MA 会议地点 MH 主题词 MMH 主要概念主题词,字段标识符 字段名称 NI 团体著者 PG 页码 IP 期 PP 出版地(期刊出版地)PS 人名主题 PY 出版年 PT 文献类型 RF 参考文献数 SO 出处(复合字段TA，PY，VI，IP，PG)SU 增刊 TA
5、期刊名称 TI 中文题目 TT 英文题目 TW 关键词 VI 卷,检索界面,分别为：基本检索主题检索分类检索期刊检索作者检索索引检索限定检索定题检索,检索方法与技巧,检索方法：1.基本检索(自由词检索)2.主题检索(主题词检索)3.限制检索(限制性检索)4.列表检索5.二次检索,基本检索,检索举例1,艾滋病的中医药治疗方面的文献1.课题分析：艾滋病的中医药治疗2.选择数据库和相应的检索途径 CBM 自由词检索3.检索表达式 艾滋病 AND 中医药治疗4.检索及浏览结果5.调整检索策略6.保存结果和策略,基本检索步骤,1.选择检索字段(1)缺省字段：又称为默认字段，表示在中文题目、文摘、作者、主
6、题词、特征词、关键词、期刊字段。(2)全部字段：表示在所有可检索的字符型字段中查找用户输入的检索词。(3)指定字段：指仅在某一指定字段内检索用户输入的检索词，如中文标题、英文标题、作者、地址、期刊等2.输入检索词或检索表达式3.选择检索方式4.检索,检索方式,检索方式分为：包含检索和精确检索(1)包含检索 检索词包含于检索字符串中，如检索作者马智，可检索出作者为马智、马智明、马智慧等的文献。(2)精确检索 检索词与检索字符串完全相等，如检索作者马智，仅检索出作者为马智的文献，而不会将作者名中含有马智片段的文献代出。(3)所有字段均可进行包含检索，精确检索仅限于作者、期刊、卷、期、ISSN、出版
7、地、主题词、特征词、关键词、人名主题、分类号字段。,主题检索,主题检索,在主题词表中借助于主题词轮排表和树状结构表完成的一种检索方式。主题词和副主题词组配检索 艾滋病爱滋病AIDS,获得性免疫缺陷综合征/中医药疗法,主题词,什么是主题词？又称叙词，在标引和检索中用以表达文献主题的规范化的词或词组。主题词如何形成？哪些词可以作为主题词？副主题词又有什么作用？它和主题词是什么关系？主题词和自由词的区别？,主题词注释表,主题词树状结构表,主题词检索区,CBM中主题词,美国国立医学图书馆医学主题词表(MeSH)中译本中国中医药学主题词表,主题检索特点,基于主题概念检索文献，利于提高查全和查准率。主题检
8、索可用中文主题词、英文主题词及同义词进行查找，可浏览主题词注释信息和树形结构，帮助您确定恰当的主题词。通过设置是否加权、是否扩展、选择合适的副主题词，使检索结果更符合您的需求。,限制检索,CBM 保留了命令检索方式，方便习惯用命令方式检索的用户。在基本检索窗口检索输入框，直接键入字段标识符、逻辑算符和检索词等。字段标识符(1)字段标识符在前，表示精确查找。字段标识符必须用英文缩写。例：TA=中国癌症杂志；TA=癌症(2)字段标识符在后，表示对所指定字段的任意片段进行查找，即包含检索。字段标识符可用中文或英文缩写。例：癌症 IN TA;癌症 IN 刊名(3)字段标识符名称,CBM中检索表达式,1
9、.单个词或词组2.英文缩写或英文词组3.两个检索词，可以同时检索，用空格、逻辑运算符号连接4.#1 and#25.通配符号？或*6.连词符号，-,如：“IL-1”,列表检索,除了主题词表外，还包括：期刊检索分类检索作者检索索引检索,二次检索,在已有检索结果基础上再检索，逐步缩小检索范围。在检索输入框键入新的检索词，表示在上一个检索结果范围内进一步查询，与上一个检索词之间的关系为“AND”。,常用的逻辑运算符,逻辑与：AND 逻辑或：OR 逻辑非：AND NOT优先级：()AND NOT AND OR,通配符与截词符,通配符：？替代一个半角字符或全角字符。通配符：*替代任意个字符截词符：没有具体
10、的符号,范围算符,范围算符：仅用于数字字段的检索，如出版年等。=，=，=,检索结果,排序浏览套录打印,练习题,1.青少年近视针灸治疗方面的文献。2.拓扑替康治疗癌症方面的文献。3.美国医疗机构中多层次管理方面的文献。4.北京医科大学出版的有关生物化学方面的期刊有哪些？,CBM检索小结,主题词和自由词区别特征词年龄：青少年、儿童、老年、育龄妇女性别：男性、女性、雄性、雌性中草药主题词药物检索词：拉丁文,PubMed数据库,主要内容,1.数据库概况2.数据库检索机制3.数据库的组成结构4.检索界面5.检索方法与技巧6.检索练习,PubMed概况,1.创建机构：美国国家医学图书馆下设的美国生物技术信
11、息中心(NCBI)2.类型：Web数据库3.网址：4.特色：具有收录范围广、内容全、检索途径多、检索体系完备等特点，部分文献还可在网上直接免费获得全文。5.学科范围：生物医学、生命科学、行为科学、生物工程、化学等学科。6.与Medline光盘数据库的区别：检索机制、检索界面、检索方法以及收录文献数量不同。,PubMed数据来源,1.MEDLINE：包括OLDMEDLINE 2.In Process Citations：每天收录，尚未经规范处理的数据。3.Publisher-Supplied Citations：由出版商提供的电子文献，每条记录标有PubMed-as supplied by Pu
12、blisher。,PubMed检索机制,1自动转换匹配功能(Automatic Term Mapping)对于输入的检索词，PubMed先按一定的词表顺序进行对照匹配和转换，再进行检索。词表匹配转换顺序是：MeSH表(MeSH translation table)、期刊刊名表(Journal translation table)、全体作者表(Full author translation table)、作者索引(Author Index)、全体调查者表(Full investigator translation table)、调查者索引(Investigator Index)。如果在以上6个表
13、中都找不到相匹配的词，PubMed将把短语分开，以单词为单位，分别重复以上的过程，检索时各个词之间是AND逻辑关系。2短语检索(Phrase Searching)也可称为强迫词组检索，即，如果要将短语作为一个词组进行检索，可用双引号“”将其引起来。如：“drug therapy”作为词组进行检索的词，系统不进行自动转换匹配，也不进行MeSH词的扩检。,1.逻辑运算符：逻辑与：AND，逻辑或：OR，逻辑非：NOT。当一个检索表达式中同时含有三个运算符时，运算顺序从左至右，括号可以改变运算顺序。2.截词符：*，一个词或字拼写出部分字母后面加上一个截词符，chem*表示用词根进行检索。Heart a
14、ttack*会关闭自动转换匹配检索词，myocardial infarction,myocardial stunning,shock等词 3.双引号：“”，表示对引号中的短语进行检索。4.检索字段标识符：tag，tag为字段名称。ti，au，ta，so，la，pt。,PubMed检索运算符,常用字段组成,标识符 字段名称TI TitleAU AuthorAD AffiliationAB AbstractDP Publication DateEDAT Entrez DateSO SourceTA Journal Title AbbreviationMH MeSH TermsPT Publicat
15、ion Type,检索界面,基本检索限定检索高级检索MeSH Database检索引文匹配器(Citation Matcher)临床查询(Clinical Queries),PubMed检索方法,1.基本检索：在基本检索界面下完成的检索方法2.高级检索：高级检索界面下进行的检索方法3.MeSH Database检索：主题词检索,基本检索,基本检索,1.关键词、词(词组)或短语：2.作者：Smith JS 或 Smithau3.期刊刊名：GENE THERAPYTA，JAMATA4.截词：CHEMO*5.复杂表达式：CANCER AND THERAPY6.#1 AND#2,限定检索,限定检索,1
16、.限制检索或条件检索：Limits(1)日期：Date of publicationDP原始文献出版日期；Entrez DateEDAT文献首次录入PubMed日期；MeSH DateMHDA文献被MeSH词条标引日期。(2)地址：单个词加标识符ad(3)带有摘要文献的检索：CANCER AND hasabstract(4)数据库子集的限定：特殊主题的检索 AMERICAN AND history sb 2.限定检索结束后，及时取消限定条件,点击取消,高级检索,高级检索,MeSH Database检索,输入查找的主题词,主题词注释,树状结构表,款目词,检索步骤,Journals Databas
17、es,主题、刊名全称或缩写、ISSN,单篇文献匹配器,临床咨询,特殊专题咨询,检索结果,显示保存打印,检索策略的存储和调用,使用My NCBI(Cubby)首先要登记注册保存检索策略定期浏览新的检索结果,其它功能,全文链接相关文献链接相关数据库的链接RSS阅读器的使用,检索练习,1.利巴韦林（ribavirin）治疗SARS方面的综述文献2.微量元素缺乏(trace element deficiency)与皮肤病(skin diseases)关系方面的文献3.眼结核(ocular tuberculosis)引起失明(blindness)的文献（比较基本检索和主题词检索的结果）4.北京大学刘民教授发表的英文文献5.CANCER LETTERS期刊上查找有关基因治疗方面的文献,PubMed检索小结,1.任何一项研究主题都有多个检索途径，要比较多个检索途径的结果，那个更适合该项研究主题2.Search Details描述检索过程3.*关闭自动转换匹配功能4.限定检索条件要及时关闭，否则会影响后续的检索结果,谢谢！,
