《真核基因组》PPT课件.ppt

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1、第八章 真核生物基因组的结构,真核细胞与原核细胞在基因转录翻译及DNA的空间结构方面的差异:,1.真核细胞基因转录产物为单顺反子。一个结构基因经过转录和翻译生成一个mRNA分子和一条多肽链;2.真核细胞DNA与组蛋白和大量非组蛋白结合,只有一小部分DNA是裸露的;3.存在重复序列,重复次数可达百万次以上;4.大部分基因含有内含子,因此,基因是不连续的;,真核细胞与原核细胞在基因转录翻译及DNA的空间结构方面的差异:,5.真核生物能够有序地根据生长发育阶段的需要进行DNA重排,还能在需要时增加细胞内某些基因的拷贝数。6.原核生物中,转录的调节区都很小,大都位于转录起始点上游不远处,调控蛋白结合到

2、调节位点可直接促进或抑制RNA聚合酶对它的结合。真核生物中,基因转录的调节区大得多,他们可以远离核心启动子达几百个甚至上千个碱基对。调节区与蛋白质结合通过改变整个所控制基因5上游区DNA构型来影响它与RNA聚合酶的结合能力。,真核细胞与原核细胞在基因转录翻译及DNA的空间结构方面的差异:,7.真核生物的RNA在细胞核中合成,经过转运穿过核膜,在细胞质中翻译成蛋白质。原核生物转录与翻译在时间上和空间上没有明显的界限;8.许多真核生物的基因只有经过复杂的成熟和剪接过程,才能被顺利地翻译成蛋白质。,8.1 C-值悖理(C-value paradox),C-值(C-value):在真核生物中,每种生物

3、的单倍体基因组的DNA总量是恒定的,称之为C-值,C-值是每种生物的一个特性。C-值悖理:生物体的形态学的复杂程度与C-值大小的不一致,称为C-值悖理。,不同种类的C值范围分布,8.2 重复序列,真核生物的DNA分为4类:单一序列(unique senquence)中度重复序列(moderately senquence)高度重复序列(highly repetitive senquence)反向重复序列(inverted repetitive sequence),单一序列(unique senquence),在整个基因组中只出现一次或少数几次的序列,在小鼠中约占基因组的70。卵清蛋白基因,珠蛋白

4、基因,中度重复序列(moderately senquence),重复次数为几十次到几千次。在小鼠中约占20。如rRNA基因、tRNA基因和某些蛋白质(如组蛋白、肌动蛋白、角蛋白等)的基因。,高度重复序列(highly repetitive senquence),重复几百万次,一般是少于10个核苷酸残基组成的短片段。如异染色质上的卫星DNA。它们是不翻译的片段。在小鼠中约占基因组的10。,反向重复序列(inverted repetitive sequence),8.3成簇的基因家族,基因家族(gene family):真核细胞中许多相关的基因常按功能成套组合,被称为基因家族。根据基因家族的情况目

5、前可分为三种类型,简单多基因家族;复杂多基因家族;由发育阶段控制的多基因家族。,简单多基因家族,rRNA基因组织成一套并重复,复杂多基因家族,组蛋白基因是成簇的并串联重复许多次,由发育阶段控制的多基因家族,人类血红蛋白的基因是按发育的次序安排在两个簇中,8.4割裂基因(split gene),割裂基因(split gene):在真核生物中,大多数编码蛋白质的基因是不连续的,即在其编码氨基酸的序列之间插入了不编码的序列,故称为割裂基因。,8.5 细胞器中的基因组,1.叶绿体基因组(ctDNA)比较大,高等植物的通常为140kb左右,低等真核生物的小于200kb。,叶绿体基因组,Ct DNA基因组

6、成有以下特点:,(1)基因组由两个IR和一个 SSC及一个 LS(2)IRA和IRB,编码相同,方向相反。(3)ctDNA启动子和原核生物的相似,基因产生单顺反子或多顺反子的mRNA;(4)不同ctDNA基因组成和数目几乎是相同的,产物多为类囊体的成分或和氧化还原反应有关;(5)其tRNA基因中有内含子,有的位于D环上,此和原核及真核生物核tRNA都不相同;(6)所有叶绿体基因转录的mRNA都由叶绿体核糖体翻译。,2.线粒体基因组,不同生物线粒体基因组的大小差别很大。动物细胞的线粒体基因组比较小,人、小鼠和奶牛的由于很小,已经做了全序列分析,都是16.5kb左右。每个细胞中有几百个线粒体,每个线粒体中又有多拷贝的DNA。不同植物线粒体DNA的大小差别很大,但是最小的约为100kb左右。,mt DNA的基因组成,(1)闭合环状DNA(2)基因数目和排列顺序相同(3)有D环和2个复制起始点(4)基因间没有间隔,因此每个基因不可 能都有自己的启动子。,mt DNA密码子与核基因密码子的差异,(1)AUA编码Met,而不是Ile;(2)UGA编码Trp,而不是终止密码子(3)AGA,AGG编码Arg,而不是终止密码子。,

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