《基因信息传递》PPT课件.ppt

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1、基因信息传递,第 三 篇,山西医科大学生物化学与分子生物学教研室杨涛,中心法则,DNA的生物合成DNA Biosynthesis,第 十 章,本章内容,第一节 DNA复制的特点第二节 DNA复制的酶学第三节 DNA生物合成过程第四节 逆转录第五节 DNA损伤与修复,DNA复制的特点,第一节,一、半保留复制(semiconservative replication),(一)概念(二)实验依据:密度梯度实验(三)生物学意义:1.保证遗传信息传递的忠实性 2.遗传和变异的统一,密度梯度实验,实验结果支持半保留复制的设想。,含重氮-DNA的细菌,第一代,第二代,梯度离心结果,二、双向复制(bidire

2、ctional replication),原核生物复制时,DNA从起始点(origin)向两个方向解链,形成两个延伸方向相反的复制叉,称为双向复制。,A.环状双链DNA及复制起始点B.复制中的两个复制叉C.复制接近终止点(termination,ter),三、半不连续复制(semi-discontinuous replication),顺着解链方向生成的子链,复制是连续进行的,这股链称为领头链。另一股链因为复制的方向与解链方向相反,不能顺着解链方向连续延长,这股不连续复制的链称为随从链。复制中的不连续片段称为岡崎片段(okazaki fragment)。领头链连续复制而随从链不连续复制,就是复

3、制的半不连续性。,领头链(leading strand),随从链(lagging strand),四、需要RNA引物(primer),DNA聚合酶不能直接聚合游离的dNTP,必须由一段核酸片段提供3OH末端。,DNA复制的酶学,第二节,一、DNA复制的体系,(一)底物:dNTP,N=A,T,C,G(二)模板:DNA单链(三)引物:RNA或延长中的DNA子链,提供3-OH末端使dNTP可以依次聚合(四)酶和蛋白质因子:,(dNMP)n+dNTP(dNMP)n+1+PPi,二、DNA复制的酶学,(一)解螺旋酶helicase:可以将DNA双链解开成为单链。大肠杆菌中发现的解螺旋酶为DnaB。,(二

4、)DNA拓扑异构酶DNA topoisomerase:通过切断并连接DNA双链中的一股或双股,改变DNA分子拓扑构象,避免DNA分子打结、缠绕、连环,在复制的全程中都起作用。类型:拓扑异构酶I和拓扑异构酶II。拓扑异构酶I能切断DNA双链中一股并再连接断端,反应不需ATP供能;拓扑异构酶II能使DNA双链同时发生断裂和再连接,需ATP供能。,(三)DNA单链结合蛋白 single chain binding protein-SSB:可以维持模板的单链状态并保护模板不受核酸酶的降解。随着DNA双链的不断解开,SSB能不断的与之结合、解离。,(四)引物酶primase:是一种RNA聚合酶,在复制的

5、起始点处以DNA为模板,催化合成一小段互补的RNA。引物酶能直接在单链DNA模板上催化游离的NTP合成一小段RNA,并由这一小段RNA引物提供3-OH,经DNA聚合酶催化链的延伸。,(五)DNA聚合酶 全称:依赖DNA的DNA聚合酶(DNA-dependent DNA polymerase)简称:DNA-pol 活性:53 的聚合活性 53核酸外切酶活性 35核酸外切酶活性,3 5外切酶活性,5 3外切酶活性,?,能切除突变的 DNA片段。,能辨认错配的碱基对,并将其水解。,1.原核生物的DNA聚合酶,功能:对复制中的错误进行校读,对复制和修复中出现的空隙进行填补。,DNA-pol(109kD

6、),323个氨基酸,小片段,5 核酸外切酶活性,大片段/Klenow 片段,604个氨基酸,DNA聚合酶活性 5 核酸外切酶活性,N 端,C 端,DNA-pol,Klenow片段是实验室合成DNA,进行分子生物学研究中常用的工具酶。,DNA-pol(120kD),DNA-pol II基因发生突变,细菌依然能存活。它参与DNA损伤的应急状态修复。,功能是原核生物复制延长中真正起催化作用的酶。,DNA-pol(250kD),2.真核生物的DNA聚合酶DNA-pol 起始引发,有引物酶活性DNA-pol 参与低保真度的复制 DNA-pol 在线粒体DNA复制中起催化作用DNA-pol 延长子链的主要

7、酶,有解螺旋酶活性DNA-pol 校读、修复和填补缺口,(六)DNA连接酶 DNA ligase 连接DNA链3-OH末端和相邻DNA链5-P末端,使二者生成磷酸二酯键,从而把两段相邻的DNA链连接成一条完整的链。,HO,5,3,3,5,DNA连接酶,ATP,ADP,5,3,5,3,三、DNA复制的保真性,(一)酶学依据:1.核酸外切酶活性和校读;2.复制的保真性和碱基选择(二)机制:1.遵守严格的碱基配对规律;2.聚合酶在复制延长中对碱基的选择功能;3.复制出错时有即时的校读功能,DNA生物合成过程,第三节,一、原核生物DNA生物合成,(一)起始阶段 1.辨认起始点,形成单链:2.合成引发体

8、:3.合成引物:,E.coli复制起始点 oriC,Dna A,Dna B、Dna C,DNA拓扑异构酶,引物酶,SSB,3,5,3,5,引发体和引物,含有解螺旋酶、DnaC蛋白、引物酶和DNA复制起始区域的复合结构称为引发体。,3,5,3,5,引物是由引物酶催化合成的短链RNA分子。,引物,引物酶,(二)延长阶段复制的延长指在DNA-pol催化下,dNTP以dNMP的方式逐个加入引物或延长中的子链上,其化学本质是磷酸二酯键的不断生成。,领头链的合成,随从链的合成,目 录,目 录,复制过程简图,(三)终止阶段 原核生物基因是环状DNA,双向复制的复制片段在复制的终止点(ter)处汇合。,随从链

9、上不连续性片段的连接,二、真核生物DNA生物合成,(一)DNA的复制只发生在S期(二)多复制子(三)真核细胞含有5种DNA聚合酶(四)端粒复制 染色体两端DNA子链上最后复制的RNA引物,去除后留下空隙。,目 录,5,3,3,5,5,3,3,5,+,5,3,3,3,3,5,5,1.端粒telemer:指真核生物染色体线性DNA分子末端的结构。2.结构特点:(1)由末端单链DNA序列和蛋白质构成。(2)末端DNA序列是多次重复的富含G、C碱基的短序列。,3.功能:(1)维持染色体的稳定性(2)维持DNA复制的完整性 4.端粒酶:由RNA和蛋白质组成(1)RNA发挥模板作用(2)蛋白质发挥逆转录酶

10、活性,端粒酶的催化延长作用,爬行模型,DNA聚合酶复制子链,进一步加工,逆转录(reverse transcription),第四节,一、概念,逆转录指遗传信息从RNA流向DNA,是RNA指导下的DNA合成过程,即以RNA为模板,四种dNTP为原料,合成与RNA互补的DNA单链。,二、逆转录酶(reverse transcriptase),催化逆转录过程的酶称逆转录酶,RNA病毒中都含有此酶。具有三种酶活性:RNA指导的DNA聚合酶 RNA酶 DNA指导的DNA聚合酶,三、合成过程,分子生物学研究可应用逆转录酶,作为获取基因工程目的基因的重要方法之一,此法称为cDNA法。,以mRNA为模板,经

11、逆转录合成的与mRNA碱基序列互补的DNA链。,试管内合成cDNA,cDNA complementary DNA,DNA损伤与修复,第五节,一、突变的意义,(一)突变是进化、分化的分子基础(二)突变导致基因型改变(三)突变导致死亡(四)突变是某些疾病的发病基础,二、引发突变的因素,(一)物理因素:紫外线(ultra violet,UV)、各种辐射,(二)化学因素:,三、突变的分子改变类型,(一)错配(mismatch)DNA分子上的碱基错配称点突变(point mutation)。1.转换:发生在同型碱基之间,即嘌呤代替另一嘌呤,或嘧啶代替另一嘧啶。2.颠换:发生在异型碱基之间,即嘌呤变嘧啶或

12、嘧啶变嘌呤。,镰形红细胞贫血病人Hb(HbS)亚基,正常成人Hb(HbA)亚基,(二)缺失(deletion)、插入(insertion)1.缺失:一个碱基或一段核苷酸链从DNA大分子上消失。2.插入:原来没有的一个碱基或一段核苷酸链插入到DNA大分子中间。3.缺失或插入都可导致框移(frame-shift)突变。框移突变是指三联体密码的阅读方式改变,造成蛋白质氨基酸排列顺序发生改变。,缺失引起框移突变,(三)重组(recombination)DNA分子内较大片段的交换,称为重组或重排。,目 录,四、DNA损伤的修复,(一)光修复(light repairing),(二)切除修复(excision repairing)是细胞内最重要和有效的修复机制,主要由DNA-pol和连接酶完成。,E.coli的切除修复机制,(三)重组修复(recombination repairing),(四)SOS修复当DNA损伤广泛难以继续复制时,由此而诱发出一系列复杂的反应。在E.coli,各种与修复有关的基因,组成一个称为调节子(regulon)的网络式调控系统。这种修复特异性低,对碱基的识别、选择能力差。通过SOS修复,复制如能继续,细胞是可存活的。然而DNA保留的错误较多,导致较广泛、长期的突变。,

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