《酶动力学》PPT课件.ppt

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1、第10章 酶动力学,研究酶促反应的速度以及影响酶促反应速度的各种因素,包括底物浓度、酶浓度、pH、温度、激活剂与抑制剂等。,1903 Henri,一、底物浓度对酶促反应速度的影响(单底物酶促反应),(一)中间复合物学说,中间复合物学说认为酶与底物先络合成一个中间产物,然后中间产物进一步分解成产物和游离的酶。中间复合物学说证据:p152,1903年,Henri以蔗糖酶研究底物浓度与反 应速率的关系,提出了酶与底物作用的“中间复合物学说”。,(二)“稳态理论”Briggs和Haldane 1925,稳态理论的贡献在于:ES的动态平衡不仅与 E+S ES有关,还与ES P+E有关。,所谓“稳态”:E

2、S的形成速度与分解速度相等、ES的浓度保持不 变的反应状态,米氏常数:,当Km及Vmax已知时,根据米氏方程可确定酶反应速度与底物浓度的关系。,米氏方程:,(三)用稳态理论推导米氏方程,1.当SKm时:,2.当S Km时:,3.当S=Km时:,根据米氏方程可以说明以下关系:,1.当SKm时:,2.当S Km时:,3.当S=Km时:,根据米氏方程可以说明以下关系:,即Km是当酶反应速度达到最大反应速度一半时的底物浓度,单位:molL-1或mmolL-1。,复 习,1、Km的物理意义当反应速度v=1/2 Vmax时,Km=S,Km的物理意义是:当反应速度达到最大反应速度一半时的底物的浓度。单位:m

3、olL-1或mmolL-1。Km是酶的特征常数之一,一般只与酶的种类、底物种类及反应条件有关,与酶的浓度无关。因此,在特定条件下测定酶的Km值,可以作为鉴别酶的一种手段。一些酶的Km值(见表10-1)。,(四)米氏方程中各参数的意义,有的酶可作用于几种底物,因而就有几个Km 值,其中Km最小的底物称该酶的最适底物或天然底物。因为:Km愈小(达到Vmax一半所需的底物浓度愈小),表示V对S 越灵敏。,1,2,2、Km可以判断酶专一性和天然底物,3、Km 与底物亲和力Km是ES分解速度(K2+K3)与形成速度(K1)的比值。Km值近似表示酶与底物之间的亲和程度:Km值愈大,表示亲和程度愈小。,4、

4、Km与米式方程的实际用途,V0.75 Vmax,(2)根据相对速度推测酶活性中心饱和度Y:,当v=Vmax时,表明酶的活性部位已全部被底物占据,v与S无关,只和E0成正比。当v=1/2 Vmax时,表示酶活性部位有一半被底物占据。,5、Kcat的意义:催化常数或转换数Kcat是指当酶被底物充分饱和时,每秒钟每个酶分子转换底物的分子数(称为转换数或催化常数),表示酶的最大催化活力的量度。,一些酶的转换数见表10-2。,(五)Km和Vmax的求解方法Lineweaver-Burk 双倒数作图法(最常用),1/V,斜率=Km/Vmax,(一)酶的最适pH最适pH:使酶促反应速度达到最大时的pH称为该

5、酶的最适pH。最适pH与底物种类、浓度及缓冲液成分有关。,虽然大部分酶的pH酶活曲线是钟罩形,但也有半钟形甚至直线形。,二、pH对酶促反应速度的影响,(二)pH影响酶活力的原因过酸或过碱会影响酶蛋白构象,使酶活性丧失。影响酶和底物分子解离状态,尤其是酶活性中心的解离状态,最终影响ES形成。影响酶分子中一些基团解离,这些基团的离子化状态影响酶的专一性及活性中心构象。,三、温度对酶促反应速度的影响,(一)最适温度及影响因素 最适温度:温度对酶促反应速度的影响有两个方面:1.温度升高,加快反应速度。2.温度升高,酶变性失活。最适温度不是酶的特征常数,它与底物种类、作用时间、pH、离子强度 等因素有关

6、。温血动物酶的最适温度3540;植物酶最适温度4050;微生物差别大,如细菌Taq DNA聚合酶70。温度系数Q10:温度升高10,反应速度与原来的反应速度之比,大多数酶的Q10一般为12。,四、激活剂对酶促反应速度的影响,(一)无机离子的激活作用无机离子:1.金属离子:K+、Na+、Mg2+、Zn2+、Fe 2+、Ca2+等;2.无机阴离子:Cl、Br、PO43等;,特点:1.激活剂的选择性,即不同的离子激活不同的酶。2.不同离子之间有拮抗作用和可替代作用,如Na+与K+、Mg2与Ca2之间常常拮抗,但Mg2与Zn2+常可替代。3.激活剂的浓度要适中,过高往往有抑制作用,150mM,激活剂:

7、凡是能提高酶活性的物质,都称为激活剂。包括无机离子或简单有机化合物。,许多金属离子是酶的辅助因子,是酶的组成成分,参与催化反应中的电子传递。有些金属离子可与酶分子肽链上侧链基团结合,稳定酶分子的活性构象。有的金属离子通过生成螯合物,在酶与底物结合中起桥梁作用。,(二)小分子有机物的激活作用 1.某些激活剂(如Cys、GSH)能还原巯基酶中的某些二硫键使成-SH,-SH是巯基酶起催化作用所需的基团,提高了酶活性。2.金属螯合剂,如EDTA(乙二胺四乙酸),可络合一些重金属离子,解除它们对酶的抑制,从而使酶活升高。,五、抑制剂对酶促反应速度的影响,失活(inactivation):凡是酶活力的降低

8、或丧失都称为酶的失活。抑制(inhibition):使酶活力下降或丧失但并不引起酶蛋白变性,它主要改变酶活性中心的化学性质。抑制剂(inhibitor):引起酶的抑制作用的物质称为酶的抑制剂。,研究抑制剂对酶的作用有重大的意义:(1)药物作用机理和抑制剂型药物的设计与开发;抗癌药(2)了解生物体的代谢途径,进行人为调控或代谢控制发酵;(3)通过抑制剂试验研究酶活性中心的构象及其化学功能基团,不仅可以设计药物,而且也是酶工程和化学修饰酶、酶工业的基础。,(一)抑制程度的两种表示方法1、相对活力2、抑制分数,(二)抑制作用的类型1、不可逆的抑制作用:,抑制剂与酶的必需基团共价结合,使酶的活性丧失,

9、无法用透析、超滤等物理方法除去抑制剂而使酶复活。,+IEI,2、可逆的抑制作用:,抑制剂与酶以非共价键结合引起酶活力降低或丧失,可以用透折、超滤等物理方法除去抑制剂而使酶复活。,根据可逆抑制剂与底物的关系分为:(1)竞争性抑制(2)非竞争性抑制(3)反竞争性抑制,抑制程度是由酶与抑制剂之间的亲和力大小、抑制剂的浓度以及底物的浓度决定。,(1)竞争性抑制(Competitive inhibition)酶活性部位是不能同时结合底物与抑制剂的。抑制剂具有与底物相似的化学结构,竞争酶的活性中心,并与酶形成可逆的EI复合物,阻止底物与酶结合;可以通过增加底物浓度(即提高底物的竞争能力)而解除此种抑制。,

10、例如,丙二酸是琥珀酸脱氢酶的竞争性抑制剂。,琥珀酸,丙二酸,(2)非竞争性抑制(noncompetitive inhibition)底物和抑制剂可以同时与酶结合,但是,中间的三元复合物ESI不能进一步分解为产物,因此,酶的活性降低;抑制剂与酶活性中心以外的基团结合,其结构与底物无共同之处;不能用增加底物浓度的办法来消除非竞争性抑制作用。例如;某些重金属离子(Cu2+、Hg2+、Pb2+)对酶的抑制属于非竞争性抑制。,酶只有在与底物结合后,才能与抑制剂结合。E+SES+I ESI 常见于多底物的酶促反应中。,(3)反竞争性抑制(uncompetitive inhibition),(三)可逆抑制作

11、用与不可逆抑制作用的鉴别 1、看通过透析、超滤、凝胶过滤等方法能否除去抑制剂;2、通过v E动力学曲线区分。,曲线1:无抑制剂曲线2:不可逆抑制剂曲线3:可逆抑制剂,(四)可逆抑制作用的动力学推出三种抑制方程:(1)竞争性抑制(2)非竞争性抑制(3)反竞争性抑制,Vmax不变;Km变大,而且随I浓度的增大而增大,1、竞争性抑制:,2、非竞争性抑制,动力学方程:,Km不变,Vmax降至Vmax/(1+I/Ki),3、反竞争性抑制,Km及Vmax都变小,动力学方程:,有无抑制剂时酶促反应的最大速度与Km值的比较,类型 方程式 Vmax Km,反竞争性抑制,非竞争性抑制,竞争性抑制,无抑制剂,Vma

12、x Km,不变 增加,减小 不变,减小 减小,总 结,(五)一些重要的抑制剂,1、不可逆抑制剂 有机磷化合物 有机磷化合物的化学结构式,Y为氧或硫。含氧的为磷酸酯类,含硫的为硫代磷酸基类。目前含硫的硫代磷酸酯类农药由于属剧毒类,现多已停止生产。市场上农药多为磷酸酯类。,有机磷农药呈油状或结晶状,淡黄至棕色,稍有挥发性。较易通过皮肤和黏膜、呼吸道及消化道吸收。在中毒死亡者中,因服有机磷农药中毒致死者占83.6%。,病 因,使用性中毒,生活性中毒,生产性中毒,有机磷化合物能与乙酰胆碱酯酶的活性部位的SerOH形成磷酯键,强烈地抑制酶的活力,使乙酰胆碱不能够被分解而过分积累,导致神经系统过于兴奋,引

13、起神经系统功能失调而中毒致死。,中毒机制:有机磷农药和胆碱酯酶结合示意图,解毒剂:PAM(解磷定)可以把磷酰化胆碱酯酶上的磷酸根除去,使酶复活。,青霉素:不可逆抑制糖肽转肽酶,Kcat型不可逆抑制剂(自杀性底物,suicide substrate)这种抑制剂是根据酶的催化反应机制来设计的,它们与天然底物的结构类似,其本身也是酶的底物,既能与酶结合,也能被催化发生反应,但在其分子中具有潜伏反应基团,当酶对它进行催化反应时,该基团会被暴露或活化,并立即与酶活性中心内的必需基团共价结合,引起不可逆抑制。此种抑制专一性强,又是经酶催化后引起,被称为自杀性底物。例如:卤代-D-Ala是细菌中丙氨酸消旋酶的不可逆抑制剂。,2、可逆抑制剂竞争性抑制剂(Competitive inhibition)一些竞争性抑制剂与天然代谢物结构相似,能选择性抑制病菌和癌细胞在代谢过程中的某些酶,而具有抗菌和抗癌作用。如磺胺类药物和抗癌药。,磺胺类药物及其抗菌机理(以对氨基苯磺酰胺为例说明)细菌是以对氨基苯甲酸为原料合成二氢叶酸的。二氢叶酸是核酸的嘌呤核苷酸合成中的重要原料成分,对氨基苯磺酰胺是对氨基苯甲酸的结构类似物。,这样,对氨基苯磺酰胺可与对氨基苯甲酸相互竞争,抑制二氢叶酸合成酶的活性,影响二氢叶酸的合成,导致细菌的生长繁殖受到抑制,从而达到治病的效果。,嘌呤核苷酸,

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