《生物化学第十三章蛋白质.ppt》由会员分享，可在线阅读，更多相关《生物化学第十三章蛋白质.ppt（67页珍藏版）》请在三一办公上搜索。
1、是生物功能的载体,是生物功能的执行者,protein,第十三章：蛋白质的生物合成,1 遗传密码 2 核糖体 3 转移RNA的功能 4 蛋白质生物合成的分子机制 5 真核生物与原核生物 蛋白质合成的差异,概述,第十三章：蛋白质的生物合成,概 述,mRNAPr就好象以一种语言翻译成另一种语言时的情形相似，所以称以mRNA为模板的蛋白质合成过程为翻译(translation)。,碱基序列氨基酸序列,蛋白质合成的方向为NC端。,参与蛋白质生物合成的物质,原料-氨基酸mRNA-模板tRNA-运输氨基酸工具合成场所-核糖体酶及多种蛋白质因子ATP、GTP,合成过程复杂 参与成分多,一、遗传信息的传递二、遗
2、传密码三、遗传密码的特点,1 遗传密码(genetic code),一、遗传信息的传递,DNA,mRNA,蛋白质,数据记录,图纸,楼房,你们看，我才有实用功能！,mRNA中的相邻的三个核苷酸组成的三联体代氨基酸就像电报中的阿拉伯字母代表文字一样，所以称三联体为遗传密码。三联体密码子是mRNA上三个连续的核苷酸,二、遗传密码,遗传密码的破译：前后差不多经历了近7年的时间（1961年-1966年），Ochoa、Khorana 和Nirenberg是最主要的功臣。,遗传密码字典,起始、终止？,遗传密码字典,1.无标点符号，且相邻密码子互不重叠。2.简并性：指一种氨基酸对应着两个或更多个密码子。（有6
3、1个为20种标准氨基酸编码）。在64组密码子中，有61个为氨基酸密码子。但是标准氨基酸有20种）。AUG是起始密码；UAG、UAA、UGA是终止密码子，它们不代表任何氨基酸。,三、遗传密码的特点,氨基酸密码子的兼并性,降低突变率,3.变偶性（摇摆性）tRNA反密码子与密码子配对第一位、二位碱基严格，第三位碱基可变的现象变偶性。同义密码子：对应于同一种氨基酸的不同密码子。大多数同义密码子差别在第三位核苷酸。密码子可用XY UC 或 XYAG 表示。即第三个核苷酸的专一性较差。,密码的变偶性（摆动性）,次黄嘌呤 I,反义密码子与密码子之间的碱基配对,通用性：原核和真核生物共使用同一套遗传密码。这也
4、是转基因的基础。但自80年代研究发现,人、牛和酵母线粒体内:UGA由终止密码色氨酸 AUA由异亮氨酸甲硫氨酸 CUA由亮苏氨酸,特例:,4.密码的通用性和变异性,密码的防错系统,密码表是一个故障-安全系统：密码的编排具有防错功能，密码子中碱基顺序与其相应的氨基酸物理化学性质有着巧妙关系。密码子中第二位碱基决定其氨基酸极性。,中间碱基是U,编码的氨基酸是非极性、疏水的和支链的，常在球蛋白的内部。中间碱基是C,编码的氨基酸是非极性或不带电荷的极性侧链。中间碱基是A或G，相应氨基酸具有亲水性，在球蛋白的外周。第一位碱基是A或C,第二位碱基是A或G,第三位碱基可以是任意的，相应氨基酸具有亲水侧链并有碱
5、性。前两位是AG,第三位碱基是任意的，相应氨基酸为酸性氨基酸。,2 核糖体(ribosome)（一）核糖体是蛋白质合成的部位（二）核糖体的组成和结构（三）核糖体的功能,核糖体是蛋白质合成的部位,早在1950年放射性同位素标记的氨基酸注射到大白鼠体内等一系列实验结果清楚地指出,核糖体是细胞内蛋白质合成的部位,核糖体的组成和结构,核糖体的功能蛋白质合成的工厂催化蛋白质合成,Paul Zamecnik,核糖体是蛋白质生物合成的场所,核糖体结合位点,行使翻译功能 的核糖体,核糖核蛋白体,概述,多聚核糖体,3 转移RNA的功能,2.tRNA是遗传信息的转换器,3.tRNA靠两个活性部位实现翻译,1.tR
6、NA是氨基酸的运载工具,tRNA是真正的翻译者,tRNA通过两个活性部位转运氨基酸,Mahlon Hoagland,发现了tRNA,tRNA转运活化的氨基酸至mRNA模板上,mRNA和tRNA结合模式图,4 蛋白质生物合成的分子机制,（一）氨基酸的激活（二）在核糖体上合成多肽（三）肽链合成后的“加工处理”（四）蛋白质合成所需的能量（五）活性肽合成的特征,4 蛋白质生物合成的分子机制,（一）氨基酸的激活,氨基酸的活化,包括：肽链合成的起始、延长、终止和释放等(大肠杆菌)。1.肽链合成的起始起始复合体的形成 需要30S核糖体亚基、50S亚基、mRNA、甲硫氨酰-tRNA、起始因子IF1 IF2 I
7、F3、GTP 的参与。,（二）在核糖体上合成多肽链,参与大肠杆菌的起始因子有三个：IF-1和IF-2:促进tRNAfMet,mRNA,30S小亚基结合。IF-3:使已完成合成的核糖体大小亚基解聚。真核生物的起始因子更多，至少有九个：eIF-1,eIF-2,.,（起始复合体的形成）,1.肽链合成的起始,30S亚基 mRNA IF3-IF1复合物,30S mRNA GTP-fMet tRNA-IF2-IF1复合物,70S起始复合物,mRNA+30S亚基-IF3,IF-1,70S起始复合物,肽链合成的起始,万事俱备只待延长！,肽键的形成，增加氨基酸,在延长因子EFTu和EFTs和GTP的作用下：（1
8、）进位（Entry）（2）转肽(transpeptidation)（脱落）（3）移位（translocation）循环一次，延长一个氨基酸。,*2.肽链的延长,在氨基酸的掺入过程中有3个重复的延伸反应：当起始复合物形成以后，肽链的合成即进入延伸阶段，延伸阶段所发生的主要事件是进位、转肽和移位且不断的循环。过程：,（1）进位 一个新的氨酰-tRNA 进入A位参与：延长因子Tu、TsGTP,进位,（2）转肽(transpeptidation)转肽酶催化P位上的fMet(肽酰基)转入A位，形成肽键。脱落：空载的tRNA随之脱落，离开核糖体。,怎样成键？,转肽,（3）移位核糖体沿mRNA 链 5 3
9、方向移动一个密码子距离，,移位,进位,肽键形成,移位,进位,(TuTs),肽键形成,3,（EF-G）,肽链的延长,当A位进入终止密码（UAA,UGA,UAG）时，即宣告翻译终止。原核生物中有三种释放因子(release factors RF);在RF-3的辅助下，释放因子RF-1（识别UAA或UAG密码子）或RF-2（识别UGA密码子）与核糖体结合，这种识别过程需要GTP并改变了核糖体的构象，肽酰转移酶的功能发生瞬时变化，转变成酯酶功能，将连接肽链与P位点tRNA的肽酰酯键水解开，肽链从核糖体上释放，mRNA与tRNA解离，核糖体大小亚基解体。离开了mRNA的核糖体又可重新参与参与新的翻译。,
10、各种成分 分道扬镳,3.终止与释放,3.终止与释放,3、肽链合成的终止和释放,多聚核糖体：,1.去头：脱甲酰基酶催化水解除去N端的甲酰基(细菌)再切去一个或多个N端氨基酸。(在真核生物中，N端的甲硫氨酸常常在肽链的其他部分还未完全合成时就已经水解下来)。2.合成信号肽：某些蛋白质在氨基末端额外生成15-30个氨基酸组成的信号序列(信号肽)，用以引导蛋白质的定部位。最后由特异的肽酶切除。3.氨基酸羟基的磷酸化：某些蛋白质氨酸残基中的羟基可通过酶促磷酸化（酶被活化等）。,(三)肽链合成后的“加工处理”,4.胱氨酸的生成:两个半胱氨酸通过二硫键形成。5.某些氨基酸的侧链的专一性的改变。6.去掉部分肽
11、段：专一性的蛋白酶水解7.多肽链之间以及多肽链与辅助成分之间的缔合：结合蛋白质由多个肽链与其他辅助成分(如脂类、核酸、血红素等)结合形成有活性的蛋白质。8.新生多肽链折叠成有活性的构象：生物体内蛋白质多肽链的准确折叠和组装过程需要辅助蛋白质参与。,指与新生多肽链或部分折叠的蛋白质结合，参与其 准确折叠和组装的辅助蛋白质，也称监护蛋白。功能：（1）诱发多肽链折叠成正确构象，（2）加速折叠或组装成天然构象的进程。（3）无序列偏爱性。ATP供能，分子伴侣一旦与新生多肽结合，就可以通过设置的障碍来阻止错误的装配或通过降低正确装配所需的活化能，以促进多肽链的折叠。,分子伴侣,每形成一个肽键至少需要4个高
12、能键：1.每一分子氨酰-tRNA的形成需要两个高能磷酸基团。2.在延长过程中有一分子GTP水解成GDP。在移位过程中又有一分子GTP水解，蛋白质合成反应实际上是不可逆的。大量的能量消用于保证mRNA的遗传信息翻译成蛋白质的氨酸序列的准确性。,（四）蛋白质合成所需的能量,人体大多活性肽由非活性前体经加工而来。加工内容：链的裂解、酰化、乙酰化、糖基化和硫酯化等。活性肽生物合成途径的两个特征：(1)由起始位的甲硫氨酸残基领先合成至20肽左右的信号肽片段。信号肽最后被内质网腔膜上的信号肽酶除去。信号肽酶裂解位点往往是信号肽的羧基端残基与丙氨酸或甘氨酸或丝氨酸形成的肽键；,（五）活性肽合成的特征,(2)形成的激素原前体转移到高尔基体复合体区域进行选择性酶促加工。酶切位点往往为配对的碱性氨基酸残基的序列，尤其以Lys-Arg为主，尚有ArgLys，LysLys，Arg-Arg。,（五）活性肽合成的特征,5 真核生物与原核生物蛋白质 合成的差异 机制基本相似，参与的因子更多，更复杂。1.真核起始：甲硫氨酰tRNA，eIF-2和GTP先形成起始 复合物。,2.延伸与终止：真核蛋白质合成延伸及终止过程与原核类似，相应的因子见表。,
