真菌类四分子分析与作.ppt

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1、Chap 7 真菌类四分子分析与作图,一.真菌作为遗传学材料的优势二.四分子分析三.着丝粒作图四.分类,一.真菌作为遗传学材料的优势,真菌是一种单倍体(无显隐之分,通过表型即可 推 出基因型)分析一次减数分裂的产物 较 二倍体简单可进行无性繁殖,且周期短,二.四分子分析,四分子分析:是对四分子孢子进行遗传学的分析顺序四分子:第一个孢子来自于一条染色单体,第二个孢子来自于这条染色单体的姐妹染色单体,第三、四个孢子来自于前一条染色体的同源染色体的姐妹染色单体,二.四分子分析,三.着丝粒作图(染色体作图的一种特例),着丝粒作图:利用四分子分析法,测定基因与着丝粒间的 距离称为着丝粒作图,顺序四分子可

2、记录着丝粒的行为(减数分裂期着丝粒没分裂,减数分裂期着丝粒发生分离。)顺序四分子记录了减数分裂的过程。(姐妹染色单体发生分离,减二后期,着丝粒分开),一对基因的染色体作图,材料:粗糙脉孢霉 有两种不同接合型的脉孢菌菌株:一种是能合成赖氨酸(lysine)的野生型菌株(记作lys+,或+),该菌株成熟的子囊孢子呈黑色。另一种是赖氨酸缺陷型(记作lys-或-),这种菌株的子囊孢子成熟较迟,呈灰色。,将这两种菌株杂交:杂种子囊减数分裂的产物根据黑色孢子和灰色孢子的赖氨酸 缺陷型(lys-)野生型(lys+),排列次序可有6种子囊型,其计数的结果:,子囊类型 1 2 3 4 5 6+-+-+-+-+-

3、+-+-+-+-+-数目 105 129 7 5 10 16分类 MI MI M M M M,M模式:即在减数分裂期带有lys+的两条染色单体移向一极,而带有lys-的两条染色单体移向另一极,即lys+/lys-这对基因在减数分裂就发生分离。,M模式:由于lys+/lys-这对基因与着丝粒发生了一次单交换,所以在减数分裂这对基因没有发生分离,而分离发生在减数分裂期,即姐妹染色单体发生分离的的时期。,M模式图(仅代表一种可能),M模式(仅代表一种可能),重组率RF(+lys)=M/(M+M1)0.5100%,两对基因的染色体作图,1、利用顺序四分子分析,同样可以进行两个基因的连锁作图nic(ni

4、cotinic acid)为烟酸依赖型 nade(adenine)为腺嘌呤依赖型 a2、不考虑同源染色体随机趋向,不考虑姐妹染色单体趋向3、两对基因的杂交实验,可产生(66)36种不同的子囊型,归纳为7种基本的的子囊型,序号 1 2 3 4 5 6 7子囊型+a+a+a+a+a n a n+n a n a n+n a n+a+a n+n a n a n+n+n a n+分离类型MIMI MIMI MIMII MIIMI MIIMII MIIMII MIIMII类别PDNPD TT PD NPDT数目808 1 90 5 90 1 5,四.归类与重组率,1.归类(1)分裂分离模式:MI MII

5、MI:非交换+-+MII:发生交换+-+-+-+-+-+-,(2)四分子类型 亲二型(PD):即有两种基因型与亲本一样。非亲二型(NPD):即有两种基因型与亲本不一样。T型:四种中有两种与母本一样。,2、是否连锁:亲本重组,即 PDNPD,3、计算重组率,判断是否同臂,n、a在染色体上的排列可能有两种方式:在着丝粒的同侧或者是异侧有三种方法判断,分别如下:,(1)通过计算n与a两个基因间的重组率与着丝粒与他们的单个距离做对比 0.5T+NPDRF(na)=100%=5.2%,5.2CM PD+NPD+T 5.055.2=10.259.3 由此可知:n与a同臂,(2)通过PD与NPD的频率 如果

6、n、a在异侧上,则PD与NPD都是由双交换形成,因而PD与NPD的频率相等。但是,上表的实验数据显示,同处MM的PD子囊数为90,同处MM的NPD子囊数为1。即PD多于NPD,即n与a同侧,(3)通过子囊(5)(6)来判断 若子囊数(5)=(6),则为异臂;若子囊数(5)(6),则为同臂。,4、被低估的重组率 A:RF(n)=0.5(4)+(5)+(6)+(7)/总数 100%B:RF(a)=0.5(3)+(5)+(6)+(7)/总数 100%C:RF(na)=0.5(2)+(3)+(4)+(6)+(7)/总数 100%,被低估的重组率 A+B-C=(1+5+1+5/2)/1000100%=0.95%,thanks,

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