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1、,聚丙烯酰胺凝胶电泳Polyacrylamide Gel Electrophoresis,PAGE,Li Li,一、PAG 的 组成,PAG是由丙烯酰胺(acrylamide,Acr)单体和N,N-亚甲双丙烯酰胺(N,N,N,N-methylene bixacrylamide,Bis)交联剂通过自由基聚合而成的一种多孔三维网状结构。Acr+Bis-多孔三维网状结构,(1)丙烯酰胺结构式,(2)亚甲双丙烯酰胺,二、PAG 的 聚 合,需要催化剂氧化还原系统作用,使Acr单体带有游离基,从而与Bis进行聚合。,(一)化学聚合:AP-TEMED系统,过硫酸胺(NH4)2S2O8(Ammonium p
2、ersulfate,AP)作为催化剂,四甲基乙二胺(TEMED)为加速剂。,AP在水溶液中能产生游离基SO42-,使丙烯酰胺单体的双键打开,活化形成自由基丙烯酰胺,然后游离Acr和Bis作用就能聚合形成凝胶。TEMED的游离碱基能促进AP的形成SO42-。注意:TEMED量多少都会影响催化作用,须在碱性条件下聚合 分子氧存在,聚合不完全,须去除分子氧,隔绝氧 升高温度能提高聚合,降低温度能延迟聚合,(二)光聚合:核黄素-TEMED系统,核黄素(riboflavin)在光照下(可见光或紫外光)分解,其黄素部分被还原成无色型,但在有氧条件下无色型又被氧化成带有游离基的黄素,其也能使Acr和Bis聚
3、合形成凝胶。注意:分离胶的合成一般采用化学聚合。因为若用光聚合,凝胶的孔径受光照强度与时间的影响,导致孔径大小不同,从而影响蛋白质的分离。,三、PAG的浓度与孔径的关系,PAG孔径的大小主要由Acr和Bis这两种单体的浓度决定。可以根据要分离物质分子的大小,选择合适的单体浓度。Acr/Bis:2040 完全透明且有弹性;10 很脆,易碎,不透明;100 糊状不成形,易破碎。,凝胶总浓度T100ml凝胶溶液中含有Acr和 Bis的总克数。T=(a+b)/m100%T越大,凝胶孔径越小,适用于分离分子量较小的物质。T越小,凝胶孔径越大,适用于分离分子量较大的物质。,CBis占单体与交联剂总量的百分
4、比。C=b/(a+b)100%当T固定时,Bis浓度在5%时孔径最小。,四、不 连 续 PAGE,按具体操作分 垂直板形电泳 圆盘电泳,按凝胶系统的均匀性分 连续PAGE 不连续PAGE,Disc-PAGE,电极槽缓冲液通常为pH8.3 Tris-甘氨酸缓冲液,Disc-PAGE,Disc-PAGE,分 离 原 理,1.浓缩效应1)凝胶层的不连续性 两层凝胶T与C不同孔径不同 浓缩胶孔径大,分离胶孔径小,蛋白质在大孔径浓缩胶中移动,受阻力小,移动速度快。,2)缓冲液离子成分的不连续性甘氨酸(pI=6.0)在pH8.3带负电,朝正极移动,进入浓缩胶(pH6.7),甘氨酸解离度()很小,有效迁移率
5、(M)很低,移动速度较慢,称为慢离子。HCl 是强电解质,=1,Cl-有效迁移率大,移动速度快,称快离子。蛋白质(pI6.0)带负电荷,有效迁移率介于两者之间。,pH8.3 Tris-甘氨酸缓冲液,甘氨酸,HCl,蛋白质,样品胶,浓缩胶,分离胶,样品,低电导区,3)pH值的不连续性 为了控制慢离子的解离度,从而控制其有效迁移率,必须使浓缩胶与分离胶之间pH值有所区别。,3.分子筛效应与电荷效应 进入分离胶后,Gly-成为快离子 分离胶只有电荷效应和分子筛效应,根据各蛋白质所带电荷不同、分子大小不同而分离,五、PAGE 的 特 点,1.具有分子筛效应,分辨率高2.样品不易扩散,用量少,灵敏度可达10-6g3.化学性质稳定,分子结构中富含酰胺基具有稳定的亲水基团4.凝胶不带电荷,消除了电渗现象5.机械强度好,有弹性,在一定浓度范围内无色透明6.网孔可调节,小 结,1.掌握(不连续)PAGE的原理2.掌握影响PAGE迁移率的因素3.掌握PAGE的操作注意点、试剂作用4.熟悉PAG的聚合,思 考 题,名词解释1.凝胶总浓度2.凝胶交联度问答题1.与CAME相比,PAGE有哪些特点。2.试比较CAME与PAGE操作的区别。3.简述不连续PAGE的原理。,