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1、Clin Gastroenterol Hepatol：消化性溃疡出血患者停用阿司匹林死亡率增加,你选用的工具,A 中国生物医学文献服务系统（SinoMed）B CNKI中国知网C 百度D GoogleE 万方F 维普,外文摘要信息获取(1),南方医科大学医学情报学教研室 梁丽明,PubMed简介PubMed与MedlinePubMed检索检索结果的处理个性化服务,外文摘要信息获取授课内容,PubMed简介,网址：世界最具权威性的医学文献数据库，由NLM（美国国立医学图书馆）NCBI（美国国家生物技术信息中心）向因特网用户提供免费文献检索服务(自1997-6-26起),收录70余个国家5400多
2、种生物医学期刊的题录与文摘，其中收录中文刊100余种，是世界上最权威的医学数据库。现有1950年以来的1900多万篇文献的记录(其中MEDLINE记录1700多万条)目前每年增加60余万条文献记录记录中90%的文献为英文。,PubMed简介,PubMed的外部链接功能,提供NCBI开发的分子生物学数据库的链接，如Nucleotide、Protein、Genome、OMIN、Structure、Taxonomy等。提供美国国立医学图书馆多种资源的链接提供相关文献（RELATED ARTICLES）的链接提供其它外部资源的链接，如生物医学期刊网站全文链接、NCBI资源。,PubMed与Medlin
3、e,MEDLINE,PubMed,合作？,竞争？,没关系？,PubMed与Medline,历史沿革1879年 印刷版创刊-Index Medicus（IM）1983年 Medline光盘数据库出版发行1997年 PubMed免费网络版,John Shaw Billings,PubMed文献包括三部分:Medline文献 占据绝大部分OldMedline 1966年以前的Medline文献非Medline文献 Medline收录期刊的非生物医学文献及最新文献。,PubMed检索,认识PubMed主页基本检索高级检索,NLMNational Library of Medicine(美国国立医学图书
4、馆）,NCBINational Center for Biotechnology Information(美国国家生物技术信息中心）,ENTREZ,PUBMED,Nucleotide,Structure,Genome,Popset,OMIM,Protein,PubMed生物医学文献Nucleotide核苷酸序列数据库Protein蛋白质序列数据库Structure大分子三维蛋白质结构Genome完整的基因组汇编Popset以DNA和Pro.分析生物间的进化关系Taxonomy分类学数据库OMIM孟德尔人类遗传学数据库Books生物医学网络版图书Probeset基因表达选集3D Domain特定
5、功能域三维结构,Entrez系统包含的数据库,基本检索,检索某主题的文献检索某一作者发表的文献检索发表在某期刊上的文献,基本检索:检索某主题的文献,检索有关肿瘤(cancer)的文献,cancer,标题,作者,出处,处理状态,PubMed数据类型（状态）,PubMed除了1966年以前的OldMedline，其余文献按处理过程分4种类型（或状态）,neoplasmsMeSH Terms OR neoplasmsAll Fields OR cancerAll Fields,检索有关紫杉醇（paclitaxel）用于癌症（cancer)治疗的文献,检索有关紫杉醇（paclitaxel）用于癌症（c
6、ancer)治疗的文献,Paclitaxel AND cancer,PubMed检索式输入规则,可输入单词、词组或句子进行检索可用的逻辑运算符：AND、NOT、OR（必须大写）布尔逻辑运算顺序是从左至右，圆括号优先,PubMed检索式输入规则,可使用截词符*，但词组强制、作者检索时无效,VaccinaVaccineVaccinesVaccinationvaccinated,Vaccin*,词组强制检索(精确检索)用双引号，例：“cancer stem cell“词组强制和截词检索时，系统的智能词语匹配功能将不再被执行例如：liver cancer*或liver cancer将不映射到 MeSH
7、 词 Liver Neoplasms,注意：所有的双引号、*、()、-等都必须是英文输入状态下（半角）输入。可在检索词后加字段名，进行限定字段检索。,PubMed常用检索字段,篇名字段检索 ti作者字段检索 au机构字段检索 ad出处字段检索 so刊名ta,常用字段（检索时大小写都可以）,请在PubMed数据库中检索南方医科大学(southern medical university)发表的文献,提示答案：southern medical universityad,请在PubMed数据库中检索南方医院(Nanfang Hospital,nan fang hospital)发表的篇名中含有糖尿病
8、(diabetes)的文献,选择正确的检索式：Nan fang hospital AND diabetesNan fang hospital AND diabetestiNan fang hospital OR nanfang hospitalad AND diabetestiNan fang hospitalad OR nanfang hospitalad AND diabetesti(Nan fang hospitalad OR nanfang hospitalad)AND diabetesti,自由词检索：检索某一作者发表的文献,Barry J.MarshallJ.Robin Warre
9、n,检索某作者发表的文献：,Marshall BJWarren JR,输入采用姓前名后，姓全拼，名缩写 02年以后实现了作者姓名智能转换，可用全拼姓名检索（仅限于02年以后的文献）。,自由词检索：检索某一作者发表的文献,作者姓名书写格式西方人姓名书写格式：First name、Middle Name、Last name。美国肯尼迪总统名为：John Frank Kenedy，Kenedy为Last name（姓）。Frank为Middle name，比较少看到，多看到 John F.Kenedy，中间名缩写了。如果看到姓名中间有逗号，则逗号前一定是姓。如：Kenedy,John F.,自由词检
10、索：检索某一作者发表的文献,Barry J.MarshallJ.Robin Warren,Marshall BJWarren JR,自由词检索：检索某一作者发表的文献,2、作者姓名书写格式中国人姓名格式：Last name、First name。如：钟世镇，就有如下拼写形式可供检索：Shi-zhen Zhong；Shi zhen ZhongZhong shi-zhen；Zhong，shi zhenZhong，shi-zhen zhong szShizhen Zhong，zhong shizhenzhong s,自由词检索：检索某一作者发表的文献,查找Paul Nurse发表的文献查找姓氏为“b
11、lack”的作者所发表的的文献,Paul Nurse Nurse P,Blackau,自由词检索：检索发表在某期刊上的文献,期刊检索检索时可输入期刊全名，如：molecular biology of the cell，系统自动转换为”mol biol cell”Journal Name；也可输入期刊标准缩写形式（如：mol biol cell）或期刊的ISSN（国际标准出版物编号，如：1059-1524）。如果期刊名是一个单词或恰好是MeSH词表中的词，如Gene Therapy、Science、Cell等，则必须在刊名后加so（出处字段标识符）。,我不记得字段,我想看看之前的操作,有高级检索
12、呢,高级检索（advanced search),字段选择,检索历史,解决问题,消化性溃疡出血患者停用低剂量阿司匹林治疗后，死亡和发生急性心血管事件的几率有多大还不清楚。来自瑞典卡罗林斯卡大学附属医院胃肠外科MARYAM DEROGAR等人对此进行了研究。该研究结果发表在临床胃肠病和肝脏病学(Clin Gastroenterol Hepatol）杂志上。,检索下列各题，记录你的检索操作过程及命中文献数我校高天明校长2007年在Journal of neuroscience发表了一篇文献，请找到这篇文献，并记录篇名和在PubMed的被引情况烟碱(Nicotine),俗名尼古丁,是烟草的重要成分，对胎儿（embryo,fetus)有一定的影响。请用篇名字段检索烟碱对胎儿影响的文献，并写出最早一篇综述的出处。思考：2007年11月出版的Science杂志发表了我校基础医学院细胞生物教研室留美学者白晓春博士的最新研究论文。请你从PubMed上找到该篇文献。,
