医学文献检索总论1(仇晓春).ppt

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1、医学文献检索概述,仇 晓 春上海交通大学医学院医学文献检索教研室Tel:021-64679741,世界医学协会赫尔辛基宣言,涉及人体的医学研究必须遵从普遍接受的科学原则,应对科学文献和相关资料全面了解,并有充分的实验和动物试验(如有必要)的基础上进行。-世界医学协会赫尔辛基宣言 11/30,概述,医学文献,概述,信息与知识,信息(Information):广义(客观性):信息是事物存在和运动状态及其特性的反映;狭义(主观性):信息是针对一定对象的需要而传递的有参考价值的新信息和新知识。知识(Knowledge):是信息的一部分,系统化的信息才是知识,概述,信息是使人原有的知识结构发生变化的那一

2、小部分内容。KS+I=KS+S=KS+KSK=knowledge(知识),S=structure(结构),I=information(信息)-英 B.C.Brookes 1980,布鲁克斯信息理论,概述,信息素养,概述,信息素养与信息意识,信息素养(Information Literacy)是人们能够判断确定何时需要信息、并能够对信息进行检索、评价和有效利用的能力。信息素养包括信息意识、信息技能和信息伦理三方面;信息意识(Information Consciousness)是指信息与信息事业在人们头脑中的综合反映,主要是指人们对信息重要性的认识程度和需求信息的迫切程度,以及捕捉信息、分析信息、

3、判断信息和吸引信息的自觉程度。,概述,知事(Know-What):知道是什么,即事实知识 知因(Know-Why):知道为什么,即原理知识 知窍(Know-How):知道怎样,即技能知识 知人(Know-Who):知道谁有知识,人力知识 显性知识:知事、知因 隐性知识:知窍、知人 知识的“波粒二相性”,知识的类型:,概述,文 献,文献(Document,Literature)是指记录着知识的载体;医学文献就是记录着医学知识、信息的物质载体,如医学图书、期刊、会议录等。,概述,印刷型,缩微型,电子文献,按载体类型分,文献的类型,一次文献(原始文献)二次文献(书目文献、索引)三次文献(教科书、参考

4、工具书、综述)零次文献(私人笔记、试验记录、设计草图、口头交流的信息等),按加工深度划分,文献的类型,全文型数据库(一次文献)Elsevier(MD consult)、Wiley、Springer、EBSCO host、Proquest、Karger、BMJ、OVID(LWW)BMC、Pubmed central、PLoS CHKD、万方数据、维普文摘型数据库(二次文献)Medline(Pubmed)、Embase、WHOlis、SCI CBMdisc、CBA 事实型数据库(三次文献)Clinical Evidence、Cochrane library、EBMR,常用医学文献数据库的类型,概述

5、,http:/,电子文献资源,概述,文摘类检索工具:Pubmed(free)、MedlineOVID、MedlineEBSCO E CBM(Sinomed)引文类检索工具:Web of knowledge Scopus,电子文献资源,全文期刊资源:Sciencedirect、Springerlink、Wiley、BMJ、LWW、Karger、Informa 万方期刊网、中国期刊网(清华同方)、中国科技期刊数据库(重庆维普)龙源期刊网西文全文期刊索引:EBSCO Host A to Z 整合检索,电子文献资源,概述,循证医学文献库:Best Practice、Dynamed、Micromedex

6、 Cochrane(引进中)医学影像资源库:Imaging Consult(MDC)、SMART(EBSCO)实验室指南:Springer protocols,电子文献资源,概述,图 书,连续出版物,特种文献,教科书,工具书,报 纸,期 刊,科技报告,专利文献,学位论文,标准规范,政府出版物,产品资料,会议文献,专著,文献的类型,按出版类型划分,期刊影响因子,期刊影响因子(Impact Factor,IF)指期刊近两年的平均被引用率,最早是由美国情报学家SCI创始人尤金加菲尔德(Eugene Garfield)博士在1972年提出来的。IF=(C2+C3)/(A2+A3)以1996年Scien

7、ce杂志为例:A21995年出版的文献数1037(篇),A31994年出版的文献数1054(篇),C21995年出版的文献在1996年被引用的次数24189(次),C31994年出版的文献在1996年被引用的次数25170(次)。IF23.605(次篇)。,概述,核心期刊,核心期刊(Core Journal)是指那些发表该学科(或该领域)论文较多、使用率(含被引率、摘转率和流通率)较高、学术影响较大的期刊。它们具有数量少(一般占期刊总数的5%),但信息量大(占期刊信息量的50%以上);浏览核心期刊可在较短的时间 内掌握较多的信息,了解最新 的科研动态等。,概述,国际三大索引:SCI科学引文索引

8、:Science Citation Index EI工程索引:The Engineering Index ISTP科技会议录索引:Index to Scientific&Technical Proceedings 国内三大自科核心期刊目录中文核心期刊(医学:223种)-北京大学图书馆中国科技论文统计源期刊-中国科学技术信息研究所中国科学引文数据库(CSCD)-中国科学院文献情报中心,核心期刊,概述,医学文献的现状和发展趋势,数量大、增长快出版类型复杂多种内容分散、交叉、重复 新陈代谢频繁、传播迅速 文献发表时滞严重,概述,8000 articles published per day25,00

9、0 biomedical journals in print1500 medical articles onto Medline per day,Whats so difficult about medical articles?,概述,OA Journal Successes:PLoS Biology,features works of exceptional significance in all areas of biological science,from molecules to ecosystems,including works at the interface with ot

10、her disciplines,such as chemistry,medicine,and mathematicsPublic Library of Scienceimpact factor:14.7,概述,信息检索(Information Retrieval),广义的信息检索是指将信息按一定方式组织和存贮起来,并根据用户的需求找出所需要的信息的过程。狭义的信息检索是指从信息存贮系统中查找出特定信息的过程。文献检索(Document Retrieval)数据检索(Data Retrieval)事实检索(Fact Retrieval),概述,用户,输入检索需求,分析转换处理需求,数据库,概念词

11、典控制词表,信息源,筛选录,分类索引文档预处理,匹配运算,检索结果,文献检索的原理,检索语言,分类检索语言 中国图书馆分类法 主题检索语言 关键词法 主题词法 代码检索语言,概述,主题检索语言,主题检索语言 是用词语来表达各种概念,将各种要领完全按字顺排列。它具有直观性、专指性、适应性、集中性、多元性的特点。主题检索语言包括标题词、单元词、叙词和关键词,统称主题法系统,主要有汉语主题词表中医药主题词表、美国医学主题词表Medical Subject Headings,MeSH。MeSH有16000多个主题词,分15个大类(A-N,Z),102个小类,还有82个副主题词,Subheadings,

12、分字顺表达式 Alphabetic List和树状结构Tree Structure两部分。,概述,自然检索语言引擎,概述,概 述,主题检索语言引擎,对于自然医学语汇中同义词、近义词学名与俗名的处理例:Cancer,Tumor*Neoplasms(近义词)German Measles*Rubella(同义词)Vitamin C*Ascorbic Acid(学、俗名)Apoplexy*Cerebrovascular DisordersDeoxyribonucleic Acid*DNA(繁、简称)非典*严重急性呼吸道综合症乙酰水杨酸,阿斯匹林*阿司匹林,MeSH作用1:规范自由词,概 述,MeSH作

13、用2:扩展下位(树型结构表),按照学科性质,词义范围的上下类属和派生关系,将字顺表中的主题词分别划分为15个大类,依次用A-N及Z代表。,等级关系:Diseases C Neoplasms C4 Neoplasms by Site(NON MeSH)C4.588 Digestive System Neoplasms Gastrointestinal Neoplasms Intestinal Neoplasms Colonic Neoplasms Colorectal Neoplasms HereditaryNonpolyposis,代表疾病类Diseases,肿瘤,消化系统肿瘤,概 述,检索步骤,1、分析检索课题 2、选择数据库 3、选择检索途径 4、确定检索词 5、构筑检索提问式并作检索操作6、调整检索策略 7、输出检索结果8、获取原始文献 9、创建文献跟踪服务,概述,检索途径,文献外表特征的检索途径:文献名称途径、著者途径等文献内容特征的检索途径:分类途径,主题途径等,概述,检索效果的评价,查全率(R)=a/(a+c)*100%查准率(P)=a/(a+b)*100%,概述,仇 晓 春上海交通大学医学院医学文献检索教研室Tel:021-64679741,谢 谢!,

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