可变剪切对基因进化模式和功能的影响.ppt

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可变剪切对基因进化模式和功能的影响,张亮生,动植物存在大量的可变剪切,人体不同组织中,95%的多外显子基因存在可变剪切水稻48%的基因存在可变剪切可变剪切有组织特异性How,what,and why?,Pan,et al Nature Genetics,2009Lu,et al Genome Res,2010,已知可变剪切的功能,可变剪切调控基因的功能基因的可变剪切导致疾病的发生在基因进化过过程中可变剪切起着重要的作用还有其他功能?,用新一代测序对基因注释,新一代测序技术是发现可变剪切的有效手段可变剪切注释策略1.全长基因和cDNA同时Mapping2.设计算法?参数:Mismatch等等数据库?,基因复制(进化)与可变剪切,重复基因的可变剪切分析(1).Segmental duplication(2).Tandem duplication(3).Retroposition单拷贝基因可变剪切情况外显子化基因可变剪切事件的起源和演化,可变剪切与基因家族,那些基因家族容易发生可变剪切,可变剪切在不同基因家族中有偏好性?成员多的基因家族容易发生可变剪切?那些功能基因容易发生可变剪切?,非常谢谢大家的聆听,科学网博客:Google 张亮生,

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