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1、医学文献主题标引 Medical Literature Subject Indexing,李炯,主题标引规则,B类:有机体主题词,有机体主题词标引规则,有机体主题词允许组配的副主题词(P176表10-2),具体标引规则,一、微生物的结构除病毒外,标“微生物/细胞学”,/超微结构用于亚细胞成分。细菌的解剖学细菌/细胞学,而不标细菌/解剖学和组织学。病毒结构病毒/超微结构,不能组配/细胞学。,二、有机体的化学、化学成分和化学结构 1.有机体/化学+化学成分/恰当的副主题词,通常为/*分析例:肺炎球菌糖脂的特性 链球菌,肺炎/*化学 糖脂类/*分析,2.如有机体的细胞学结构被明确讨论,其可组配/化学
2、,一般为NIM。例:葡萄球菌细胞壁的甘氨酸成分 葡萄球菌属/*化学 甘氨酸/*分析 葡萄球菌属/超微结构 细胞壁/化学,3./化学不能与类(脊椎动物)组配,因通常研究的是动物某器官的化学,而不是整个动物的化学。例:狗肝脏钠的含量 肝/*化学 钠/*分析*狗 动物(特征词),三、药物、辐射对有机体的作用 1.标“有机体/药物作用+药物名称/药理学”“有机体/辐射效应+具体放射线类型”。对于药物、辐射影响到有机体的某个方面,可在有机体后组配相应的副主题词作为NIM。,例:链霉素对大肠杆菌的影响 大肠杆菌/*药物作用 链霉素/*药理学,链霉素对大肠杆菌核糖核酸蛋白体蛋白代谢的作用 大肠杆菌/*药物作
3、用 链霉素/*药理学 核糖核蛋白类/*代谢 大肠杆菌/代谢,2./药物作用、/辐射效应不与脊椎动物组配,四、微生物、原虫、病毒与分离和提纯微生物、原虫和病毒的分离,或通过免疫与遗传技术证实其存在,标“主题词/分离和提纯”例:通过DNA分析检测肺HIV-1 HIV-1/*分离和提纯 DNA,病毒/*分析 肺/*病毒学,五、微生物、寄生虫及相关感染或疾病1.一般标引原则/微生物学用于细菌、病毒和真菌的研究。/寄生虫学与无脊椎动物动物、脊椎动物和植物类组配,表示其寄生虫方面的研究。,器官或组织的微生物和寄生虫的存在感染 例:人皮肤表面金葡菌的分离 葡萄球菌,金黄色/*分离和提纯 皮肤/*微生物学 人
4、类(特征词),感染细胞系或培养细胞系经常用于微生物或寄生虫潜伏期不同方面的研究。标“被感染的细胞系、微生物或寄生虫/相应的副主题词+特殊的细胞/微生物学-寄生虫学-病毒学”。,例:培养巨噬细胞的克鲁斯锥虫感染 巨噬细胞/*寄生虫学 锥虫,克鲁斯/*生理学 细胞,培养的 动物(特征词),有时感染细胞系或培养细胞系可被作为疾病的模型进行研究,标相应的感染类主题词。例:人乙型肝炎细胞系模型病毒的生长发育研究 肝炎病毒,乙型/*生长和发育 肝炎,乙型/*病毒学 细胞系 人类(特征词),2.微生物与寄生虫的感染C1-C3中有许多感染和传染先组词常以隐晦形式出现,标引可能有一定困难。如疟原虫感染“疟疾”;
5、放线菌感染“放线菌病”;炭疽杆菌感染“炭疽病”;人的薄代氏百日咳杆菌感染“百日咳”;鼠疫巴斯德氏感染“鼠疫”;恙虫立克次氏体感染“丛林斑疹伤寒”,如疾病由有机体引起,标“疾病的先组主题词(如果主题词表上有)”例:腺病毒的感染*腺病毒科感染 不用腺病毒+感染,也不标腺病毒+病毒疾病,从疾病的定义即知道该病是由单一有机体引起,仅用疾病名称标引,不用有机体组配。例如:结核病“结核病”,不必再标“分枝杆菌,结核”;但若既讨论了疾病又讨论了有机体,则都标引。,标有机体感染主题词,而文章讨论的具体有机体的名称也是词表的主题词(该病的致病因素),标“疾病(IM)+有机体名称(IM)”例:间日疟原虫疟疾*疟疾
6、*间日疟原虫,没有有机体感染先组词,标“有机体名称(IM)+有机体同属关系最密切的上位词对应的疾病先组词(IM)”。例:雅巴猴致瘤痘病毒感染*痘病毒科感染*雅巴猴瘤病毒,一些病毒主题词中含有疾病名称,此疾病名称仅起说明作用。标引时,勿加标疾病概念,如“猪生殖与呼吸综合症病毒”。例:鸡脑脊髓炎病毒感染 细小RNA病毒科感染/*兽医学*脑脊髓炎病毒,禽*家禽疾病 鸡 动物(特征词)(但不能标脑脊髓炎/兽医学),3.生物体与/致病力/致病力:是指有机体能够使生物产生疾病的能力,而不是对动物或人体的造成感染这一事实。它常用于下列概念,如:“这种微生物只对一种动物或是对其它动物也有致病作用?”;“这种微
7、生物在这种条件下的致病作用的程度是怎样?”等等。当作者研究的题目是已经被感染或已在感染的时候(往往用“感染”或“例”这种字样),这时不应用/致病力。,/致病力除可用于人类或动物的体内研究外,也可用于体外研究、讨论生物体致病力的文献。例:消化链球菌对培养上皮细胞黏附毒力因子的研究 消化链球菌属/*致病力 上皮细胞/*微生物学 细菌粘附 细胞,培养的,4.宿主与寄生虫宿主中寄生虫的存在并不意味着一定要用疾病主题词标引。例:遭受血吸虫感染的钉螺 螺/*寄生虫学*血吸虫属 动物(特征词),对于研究宿主与寄生虫关系的文章,标“宿主/*寄生虫学+寄生虫/*适当副主题词(一般为/生理学)+宿主寄生虫关系(N
8、IM)”,有机体从一个宿主传播到另一个宿主:有机体/生理学,并据情况加标“疾病媒介”、“节肢动物媒介”、“昆虫媒介”、“疾病宿主”等,通常为IM。/传播仅限于C类疾病传播的使用。,例:采采蝇媒介锥体虫的传播 采采蝇/*寄生虫学 锥体虫/*生理学 昆虫媒介/*寄生虫学 动物(特征词),由于宿主、微生物有机体、寄生虫的发现或分布的地理位置很重要,故除了标宿主和有机体的名称外,还要标Z类地理主题词,但如果文章仅仅提到,也可以不标,要据文章来判断。,六、病毒主题词表中列有详细的脊椎动物病毒名称,要据词表中病毒或病毒类属的主题词来标引。主题词表中无此病毒,可根据文章中关于该病毒的类属或查阅Andrewe
9、s和Bereira合著脊椎动物病毒确定其类属。,如果文章中讨论病毒的宿主,标“病毒+宿主名称(IM或NIM决定于文章重点)”例:长尾猴逆转录病毒基因组研究 逆转录病毒,猴/*遗传学*基因组,病毒 长尾猴,黑/病毒学 动物(特征词),1.噬菌体(细菌的病毒)具体细菌的噬菌体,标“噬菌体(IM)+细菌/病毒学(NIM)”,只有当细菌的特性非常重要时才标其为IM词。,例:鼠伤寒沙门菌感染的细菌噬菌体P22的生物转运 细菌噬菌体P22/*代谢 沙门菌,鼠伤寒/*代谢 沙门菌,鼠伤寒/病毒学 生物转运,噬菌体的分型,标“噬菌体分型”。噬菌体强调的是噬菌,它的作用是攻击细菌,重点在病毒。标病毒为IM,细菌
10、为NIM;噬菌体分型作为实验室技术常被用于细菌的鉴定和分类,重点在细菌。则标细菌为IM,病毒为NIM。,(3)具体细菌的噬菌体分型,标“细菌/*分类+*细菌噬菌体分型”,无需加标“噬菌体”或先组的噬菌体名称主题词,除非专门论及菌株或噬菌体,此时标为NIM。,例:牛奶中葡萄球菌属的噬菌体分型 葡萄球菌属/*分类*细菌噬菌体分型 乳/*微生物学,七、低等生物的生活史、生活周期“生物名称/生长和发育”,“变态,生物学”这个主题词常做配合标引,由于它常是文章的重点,故通常为主要标引(IM)。,八、孢子孢子、细菌孢子和真菌孢子“有机体名称(IM)+孢子主题词(NIM)”。如文章重点是讲孢子和孢子形成,并
11、且指明是细菌孢子、真菌孢子或植物附带孢子时,可标IM。个别情况两者同时标为IM,九、真菌MeSH表有的真菌,直接标引。词表中没有某真菌名称,可先考虑词表中其所属的真菌种属名称主题词,如放线菌属、担子菌纲、皮肤真菌、半知菌纲、地衣、念珠菌属和酵母等。,若词表中仍没有专指的真菌种属时,必须查阅真菌名称-医学主题词对照表或查阅Ainsworth和Bisdy二人合著的真菌学辞典,根据定义提供的线索,借助这二本工具书,总能将其按真菌分类而准确标引之。,十、动物、植物、微生物的遗传学“动物、植物或微生物的名称/*遗传学”如涉及到专指的遗传学概念,标“有机体名称/*遗传学+*遗传学专指概念”。,十一、微生物
12、源或动物源1.组织、细胞成分、激素、酶及其他生物活性物质的微生物或动物源,一般标为NIM。若该动物是文章讨论的重点,也可标为IM。,从美国蝙蝠分离唾液腺病毒 翼手目/*病毒学 巨细胞病毒/*分离和提纯 美国 动物(特征词),蝙蝠唾液腺病毒*巨细胞病毒 翼手目/病毒学 动物(特征词),2.在细胞系和组织培养的研究中,需据文献确定正确的特征词“人类”或“动物”。对于动物,若非文章的重点,作为NIM,若动物特征或器官对于研究有重要意义,标为IM。,例:更生霉素对细胞分裂的影响(实验材料和方法表明试验的材料为大鼠细胞系)更生霉素/*药理学 细胞分裂/*药物作用 细胞系 大鼠(特征词)动物(特征词),一
13、种新的大鼠巨噬细胞系的描述 巨噬细胞/*细胞学*细胞系*大鼠 动物(特征词),3.许多免疫学研究中,常用一动物为实验对象,另一动物为免疫物质或组织来源。两个或以上动物出现在一篇文章中时,每个动物与/免疫学组配与否据文章而定,通常标实验动物为特征词,用免疫物质源性动物做主题词组配/免疫学。,注射猪抗胰岛素抗体于豚鼠的抗体反应*胰岛素抗体 猪/*免疫学*抗体形成 豚鼠(特征词)动物(特征词),十二、灵长目1.主题词表中有“灵长目”这个主题词,但很少遇到写关于灵长目总论的文章,而更多的文章是论及人和猴及猿的。,2.要将分类学上或古生物学上的人作为动物归入灵长目,灵长目包括类人猿和猿猴,标“人科”主题
14、词,同时加标特征词“人类”。当标“悬猴科”“猕猴科”等其他灵长目主题词时,标“动物”特征词。,十三、实验动物和非实验动物1.实验动物:除“鸡胚”外,还有一些经常用于试验研究的哺乳动物被列为特征词。用于试验研究的任何动物将被标为特征词或NIM词。,总而言之:常规实验动物作特征词常规实验动物不用于试验,而是文献重点作IM并组配/副主题词非常规动物,既使用于试验作IM词并组配/副主题词,例:狮子肝氨基酸代谢的研究 氨基酸类/*代谢 肝/*代谢 狮/*代谢 动物(特征词),不同品种牛血小板黏附性能的研究 牛/*血液*血小板黏附 动物(特征词),肝氨基酸的代谢研究(材料和方法指明肝来自牛)氨基酸类/*代
15、谢 肝/*代谢 牛(特征词)动物(特征词),2.“大鼠,近交系”与“小鼠,近交系”:用二者及其下位词来标引近交系大鼠或小鼠。若某一近交系为两近交系杂交产生,则同时标这两个近交系主题词。若杂交的两个近交系一为MeSH词,一为非MeSH,则除标已有的MeSH词外,还需标“大鼠,近交系”与小鼠,近交系”。,3.无脊椎动物:标引无脊椎动物的器官或生理过程时,标特定的动物组配适当的副主题词为IM,而研究的器官或生理过程为NIM。例:蚊子口腔部位结构研究 蚊科/*解剖学和组织学 口腔/解剖学和组织学 动物(特征词),用无脊椎动物进行细胞或超微结构研究时,要将动物自身结构研究与该动物作为细胞或亚细胞的材料来
16、源区别开来。前者:无脊椎动物将被作为IM,细胞主题词为IM或NIM。后者:无脊椎动物将被标为NIM,细胞主题词被标为IM。,例:关于蜱线粒体的葡萄糖消耗量研究(文献来自寄生虫学杂志)葡萄糖/*代谢 线粒体/*代谢 蜱/*代谢 蜱/超微结构 动物(特征词),轴突内的钙代谢(材料和方法指明实验材料为鱿鱼大轴突)钙/*代谢 轴突/*代谢 鱿鱼 动物(特征词),动物作为IM时,常需组配副主题词。尤其是比较解剖学和比较生理学的研究,常规标动物为IM/相应副主题词。兽医文献,也应标兽医动物为IM/相应副主题词。有一些动物的文献在标引时不用副主题词,如“美国人最喜欢的玩赏动物”,标引时视具体情况而定。,大肠杆菌及L型致病性的研究 静脉毒瘾者废弃的注射器中传染性HIV-1的检测 地中海诺卡氏菌丙氨酸脱氢酶的纯化和性质 三磷酸腺苷生物发光法快速测定食品中细菌的含量 仔猪大肠杆菌病K88-K99-987P-F41四价亚单位疫苗制苗株的生物学特性 感染性腹泻患儿C-反应蛋白定量检测的临床意义 大豆异黄酮对60Co-线照射小鼠肝组织过氧化状态的影响,