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1、肿瘤登记工具软件IARC-CHECK的使用,2011年4月 南京,软件的获得,软件可从如下网址下载：肿瘤登记工具软件（IARC/IACR Tools for Cancer Registries)可以免费使用,IARC/IACR Cancer Registries Tools,有关技术文档，Check and Conversion Programs for Cancer Registries，可从如下网址下载电子文件：,软件的安装,目前最新版本为2.05:iarccrgtools_205.zip，将下载的文件,解压缩到一个临时文件夹中，点击setup安装，一路Next下去,完成安装。,软件的运行
2、,程序安装完毕后，在windows开始菜单，点击：IARCcrgTools运行程序。,Conversions编码转换,肿瘤分类编码历史发展,ICD-6 1946,ICD-7 1955,ICD-8 1965,ICD-9 1975,ICD-10 1992,ICD-O-3 2000,ICD-O-2 1990,ICD-O-1 1976,MOTNAC 1968,SNOP 1965,SNDO 1951,1961,以解剖学为主,以形态学为主,解剖学和形态学,MOTNAC 1951,STAT CODE 1956,第二章 肿瘤,第二章 肿瘤,第二章 肿瘤,IARC/IACR Cancer Registries
3、Tools 提供了如下编码转换,ICD-9(1975)to ICD-O-2(1990)ICD-9(1975)and ICD-O-1 morphology(1976)to ICD-O-2(1990)ICD-10(1992)to ICD-O-2(1990)ICD-10(1992)and ICD-O-2 morphology(1990)to ICD-O-2(1990),IARC/IACR Cancer Registries Tools 提供了如下编码转换,ICD-O-1(1976)to ICD-O-2(1990)ICD-O Field Trial Edition(1988)to ICD-O-2(19
4、90)ICD-O-2(1990)to ICD-O-3(2000)ICD-O-2(1990)to ICD-9(1975)ICD-O-2(1990)to ICD-10(1992)ICD-O-3(2000)to ICD-10(1992),编码转换需注意的问题,编码必须准确和完整对解剖学部位要求使用ICD四位数编码，要编到小数点后一位；对形态学编码，要求有第5位行为编码，否则会造成编码转换过程中的错误和汇总统计分析错误。编码转换软件不能将所有编码全部转换，有一部分编码，需要由人工转换。,编码转换需注意的问题,男性阴茎癌ICD-9编码三位为187，四位编码为187.1-9，而无187.0编码，若编码为1
5、87.0，则会在编码转换时报错。The following cases cannot be converted to ICD-O-220010571 187.0 1 1964-07-06 37 2001-08-25 6?20011875 187.0 1 1937-05-19 64 2001-05-19 6?20021877 187.0 1 1942-02-17 60 2002-02-07 6?,编码转换需注意的问题,女性卵巢和其他子宫附件癌的ICD-9编码为183，卵巢癌的编码为183.0；若在编码时编仅编三位码183，则会在ICD-9转ICD-10时，转换成C57.9（女性生殖器官,未特指）
6、，而非卵巢癌的C56。,Tools工具,IARCcrg Tools软件工具,IARC CHECK 程序 Check程序对登记的病例记录的变量分二步进行审核,一是检查变量是否完整并在编码范围内的有效性检查，二是对不同变量之间是否合乎逻辑的一致性进行检查。IARC CHECK 程序最早是为了审核五大洲发病率第六卷数据，由Dr.Parkin等人编写的。先前的版本对解剖学部位和形态学编码的审核是基于ICD-O-1和ICD-O-2，当前版本是基于ICD-O-3。,IARCcrg Tools软件工具,Multiple primaries check 程序按照 IARC/IACR 多原发肿瘤定义规则，检查多
7、原发肿瘤。File Transfer 程序若在使用编码转换(Conversions）或数据审核（Check）程序时，提示数据文件格式不对，可以用File Transfer 程序修正数据格式；File Transfer可将逗号、制表键、分号等分隔各字段的文本文件，转换成程序可用的固定格式文件。,Check 程序变量的有效性审核,出生日期：必须是按照指定格式的有效日期，如1968/07/01；发病日期：必须是按照指定格式的有效日期，如2006/03/08；发病年龄：必须是数字格式，不大于105岁；如果出生日期和发病日期完整，年龄可以通过计算获得；如果出生日期不详，则年龄字段必须是空白或是999（年
8、龄不详）；性别：必须是有效编码，如1、2或9(不详)，不能有其它；,Check 程序变量的有效性审核,解剖学部位编码：必须是有效的ICD-O-3编码，如气管编码为C33，或C33.9，不能编码为C33.0、C33.8；形态学编码：必须是有效的ICD-O-3编码，如没有8006/3这个编码；行为编码：必须是0,1,2,3(或特殊编码 6 或 9)；分级编码：必须是有效的ICD-O-3编码。,Check 程序变量的一致性审核,Age/Incidence and birth dates 年龄/出生日期与发病日期Age/Site/Histology(ICD-O-3)年龄/部位/组织学Site/Hist
9、ology(ICD-O-3)部位/组织学Sex/Site 性别/部位,Check 程序变量的一致性审核,Sex/Histology(ICD-O-3)性别/组织学Behaviour/Site(ICD-O-3)行为/部位Behaviour/Histology(ICD-O-3)行为/组织学Grade/Histology(ICD-O-3)分级/组织学Basis of diagnosis/Histology(ICD-O-3)诊断依据/组织学,IARC/IACR Cancer Registries Tools 使用对数据格式的要求,数据库文件必须以文本格式存放,变量以间固定格式分隔；每一病例用一行,要求必
10、须包括以下变量:(1)登记号；(2)性别；(3)年龄；(4)出生日期；(5)发病日期；(6)解剖学部位编码(ICD-O-3)；(7)组织学编码(ICD-O-3)；(8)肿瘤行为编码(ICD-O-3)；(9)肿瘤分级编码(ICD-O-3)；(10)诊断依据编码；,数据格式举例,200301001 2 70 19321022 20030405 20030722 7 0 C20.C209 8010 39 C209 8010 39200301002 1 39 19630911 20030205 20030811 2 0 C22.9 C220 8000 39 C220 8000 39200301003
11、1 64 19380413 20030106 20030708 2 0 C34.9 C349 8000 39 C349 8000 39200301004 2 44 19590530 20031002 20040525 7 0 C66.C669 8010 39 C669 8010 39200301005 2 65 19380714 20030723 20040205 2 0 C20.C209 8000 39 C209 8000 39200301006 1 76 19261025 20030509 20040124 2 0 C34.0 C340 8000 39 C340 8000 39200301
12、007 1 59 19431003 20030410 20030521 2 0 C22.9 C220 8000 39 C220 8000 39200301008 2 78 19241125 20030122 20030805 2 0 C22.9 C220 8000 39 C220 8000 39200301009 1 83 19191119 20030506 20030807 2 0 C16.9 C169 8000 39 C169 8000 39200301010 1 72 19310209 20031005 20050818 7 0 C22.9 C220 8010 39 C220 8010
13、39200301019 2 84 19180511 20030225 20040208 7 0 C53.9 C539 8070 39 C539 8070 39200301020 1 74 19290116 20030819 20040419 7 0 C16.1 C161 8010 39 C161 8010 39File specification:1-9 Year and ID11-11 Sex13-15 Age17-24 Date of birth26-33 Date of diagnosis35-42 Date of death44-44 Basis46-46 DCO48-52 ICD-1
14、054-57 ICD-O259-62 ICD-O2-morphology64-65 I CD-O2 Behavior and grade67-70 ICD-O372-75 ICD-O3-morphology77-78 ICD-O3 Behavior and grade,使用crg Tools编码转换,打开IARCcrgToolsConversionsICD-0-3-ICD10点击Input File栏下的Browse按钮，选取Input文件(以文本格式存放,固定列宽)在Output File栏中键入输出文件名下一步,编码转换示例ICD-O-3到ICD10,定义字段Registration Nu
15、mberSex(male 1,female 0）TopographyHistologyBehaviourGrade,编码转换示例ICD-O-3到ICD10,编码转换示例ICD-O-3到ICD10,程序生成3个文件:结果输出文件：fbie03_o3to10.txt错误的记录文件：fbie03.eo3to10需要注意的记录文件：fbie03.wo3to10,编码转换示例ICD-O-3到ICD10,输出文件与原文件相比,多出一列ICD-10编码,编码转换示例ICD-O-3到ICD10,有5条错误的编码无法进行转换,程序在转换过程中,实际上也是对原编码进行了一次检查.,程序可对错误信息做出提示,编码转
16、换示例ICD-O-3到ICD10,有1条需要注意的记录,程序认为是”不太常见的行为编码”,需要对原始病例进行核实.,程序可对错误信息做出提示,使用crg ToolsCheck示例,打开IARCcrgToolsToolsIARC/IACR Check点击Input File栏下的Browse按钮，选取Input文件(以文本格式存放,固定列宽)在Output File栏中键入输出文件名下一步,使用crg ToolsCheck示例,定义字段Registration NumberSexTopography(ICD-O-3)Histology(ICD-O-3)Behaviour(ICD-O-3)Grad
17、e(ICD-O-3)Basis of DiagnosisIncidence dateBirth dateAge,使用crg ToolsCheck示例,定义性别编码定义年龄不明编码定义诊断依据形态学编码定义日期格式,使用crg ToolsCheck示例,使用crg ToolsCheck示例,程序生成3个文件:结果输出文件：fb03_chk.txt错误的记录文件：fbie03.err需要注意的记录文件：fbie03.chk,使用crg ToolsCheck示例,主程序界面中,有审检查结果的日志。,使用crg ToolsCheck示例,.txt结果输出文件中的记录是通过审核的合格记录。,使用crg ToolsCheck示例,.err文件中的记录是未通过审核的有错误的记录。,使用crg ToolsCheck示例,.chk文件中的记录是未通过审核,需要再核的记录。,谢谢！,
