研究生实验-RuBPCase活性测定技术.ppt

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1、RuBPCase活性测定技术,1,5-二磷酸核酮糖羧化酶(E.C.4.1.1.39)14C放射性同位素示踪法,目 录,Rubisco的发现和催化反应Rubisco 的亚基组成Rubisco的体内外活化Rubisco的活性测定方法放射性同位素的使用和注意事项,1.Rubisco的发现和催化反应,1950s Wildman SG Fraction I protein 1954 Calvin RuBPCase purified 1968 Kawashima Fraction I protein crystallization Fraction I protein=RuBPCase 1970s RuB

2、POase found Nature、Science上文章认为它是光合作用的限速酶,甚至是产量的限速酶!,RuBPCase催化反应,以上两个反应为竞争性反应,:特征因子受酶一级序列和构象影响,(8ruc active site),特征因子,特征因子越大,利用低CO2的能力越强;对于C3植物有重要意义;生物越低等,特征因子越小;一般高等植物的特征因子50100,目前自然界发现最高的为海洋红藻的Rubisco,特征因子为210左右;Vmax同很难兼得。,低效率的酶,Turnover number 转换数 CAT:10000 RuBPCase:34 Site-directed mutation Sp

3、reizter等试图分子改造,2.Rubisco的亚基组成,Form I:L8S8 高等植物 Form II:(L2)n 光合细菌 Form III:古核生物 LSU叶绿体编码;SSU细胞核编码;自然界最丰富的蛋白质 Rubisco在叶绿体中含量达到300mg/ml,3.Rubisco的体内外活化,active form inactive form in vitro activation 用于活化的CO2不同于参与反应的CO2 Mg2+:20mM ACO2:10mM(NaHCO3),植物体内无法实现!,初始活性 initial activity 总活性 total activity 活化率,i

4、n vivo activation 1980s 拟南芥突变体 只在5 CO2生存 dif-2D电泳发现:突变体少47、50kDa两条蛋白带 鉴定为Rubisco activase RuBPCase体内活化由该酶负责!,白天activase利用光合作用“光反应”制造的ATP活化Rubisco;activase不耐高温,对于C4植物是光合作用的重要限速酶。,4.Rubisco的活性测定方法,酶活性的定义 RuBPCase活性常用测定方法偶联酶方法14C放射性同位素方法 测定单位时间内产物14PGA的增加。通过供给14C标记的底物CO2实现。,放射性底物14CO2通过NaH14CO3提供;RuBPC

5、ase预先体外活化;反应在30C下进行;未反应的14CO2用挥发性强酸HCl释放到大气中;最后留在闪烁瓶中的放射性完全来自14PGA;放射性强度用液体闪烁计数器测定。,试剂,研磨介质:pH7.7缓冲液为主;固定介质:100mM HEPES,20mM KCl,80mM MgCl2,12mM NaHCO3,1mM DTT NaH14CO3溶液;RuBP溶液;中止液:4N HCl 闪烁液,步骤,粗酶液的制备 称取0.2g左右的绿色功能叶片,加入2ml研磨介质研磨匀浆,再用2ml冲洗研钵,一起离心(10000 x g),取上清用小量筒测定体积,冰浴上待用。,步骤,初始活性的测定 1)往闪烁瓶中加入50

6、0l固定介质,放到水浴锅中保温;2)用微量进样器吸取10 l RuBP溶液加入到闪烁瓶中;3)用专用的微量进样器取10 l NaH14CO3溶液加入到闪烁瓶中;4)保温5min;5)加入100 l粗酶液启动反应,并开始计时;6)45s时加入500 l 中止液停止反应;7)烘干;。,步骤,总活性的测定 1)往闪烁瓶中加入500l固定介质,放到水浴锅中保温;2)加入100 l粗酶液;3)保温5min;4)用专用的微量进样器取10 l NaH14CO3溶液加入到闪烁瓶中;5)用微量进样器吸取10 l RuBP溶液加入到闪烁瓶中启动反应,并开始计时;6)45s时加入500 l 中止液停止反应;7)烘干

7、;。,活性计算,Dpmck:本底对照(不加粗酶液)比强:dpm/mol CO2t:反应时间,45sactivity单位:mol min-1 g-1 FW,5.放射性同位素的使用和注意事项,14C安全性 优点:软射线,穿透能力弱,无需昂贵防护措施,操作安全性较高;缺点:物理半衰期5000多年,反应废料难处理。,规范性 在指定地点进行指定同位素种类的操作,完成后立即清理现场,并用专门仪器检查有无污染。许可制度 只有经过专门培训后才能操作同位素。,思考题,一次测定RuBPCase活性中,取叶片0.2g,研磨离心后收集上清液得1.2ml,从中取10l样品测定活性。测得本底放射性为100dpm,初始活性为2100dpm,总活性为3100dpm,比强为3x105 dpm/mol CO2。请计算出该样品的初始活性、总活性(mol min-1 g-1 FW)以及活化率(%)。,仪器和设备,玻璃微量进样器 50ul 2支移液器1ml 3支移液器100ul 1支移液器500ul 1支研钵 1个/组小量筒10ml 1个/组水浴锅(温度计)离心管(5 or 7ml)白陶瓷盘 2个一次性手套 4包枪头(100ul和1ml)白大褂 2件,

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