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1、,液体活检在肿瘤精准治疗中的研究进展郑秋红福建省肿瘤医院,福建省肿瘤研究所福建省肿瘤生物治疗重点实验室2016.4.21,内容摘要液体活检1) cfDNA& ctDNA&CTC概念和最新研究进展2)液体活检应用和意义二.CTC/CTSC研究方法和进展三.我们的研究,液态活检来源于肿瘤组织,存在于血液中循环肿瘤细胞(CTC)循环肿瘤DNA( ctDNA)肿瘤外泌体 exosome提示肿瘤发展进程及抗药性等信息,指导个体化精准治疗copyDiaz LA Jr, Bardelli A Liquid Biopsies: Genotyping Circulating Tumor DNA. Jslin O
2、ncol. 2014; 32(6)579-586,cfDNAsWhat:循环游离DNA,机体细胞释放入外周血循环后发生部分降解的内源性DNA。高度片段化,约170bp8 Source:正常细胞、异常细胞(如肿瘤细胞),病毒DNA等8 State:半衰期短,动态表达量,核小体以单个、双联或三联的形式进入血液,并逐步分解,ctDNAwhat:循环肿瘤DNA,是指肿瘤细胞DNA经脱落或细胞凋亡后释放进入循环系统。一种特征性的肿瘤生物标记物,可以被定性、定量和追踪。Source:来源于肿瘤细胞的 cfDNA,属于 cfDNA的83325种类型。不同患者的水平差异显著,受肿瘤负荷,分期等因素的影响,cf
3、dna ctDNATumorHea lthyinflamed tissueBiology of releasemacrakisTumor fractionLow tumor fraction * 1%of ClDNAe10% High tumor fractiondPCR(Ref, es,e8Detectonof GIDNACapp-seq(RTAm-Seg(RefWhole Methylome Ref 10nical valueDiagnosisTrotmanEllen Heitzer, Peter Ulz, and Jochen B.Geig Circulating Tumor DNA a
4、s a Liquid Biopsy for Cancer.Clinical Chemistry. 2015, 112-123,ctDNA-高通量测序种种任神APP-Seg( cancer personalizedprofiling by deep sequencing)癌症个体化深度测序分析方法:利用定制化的st目Laerblood draw blood drawsNimbleGen SegCap EZ Choice Library fE为”筛选器“对样本靶向捕获后再深度测序,灵敏度高,特异性强且经济可行。2:利用数字错误抑制(IDES)的方法和CAPP-SeqCAPP-seq( ctDNA测
5、序方法),能够检测到频率低至0004%的突变等位基因genotyping monitoring,cfDNA一片段谱系分析GenomE-wide, in vivo nucleosome map from celI-free DNA in plasmDeep sequencing otcirculating cell-freeDNA yields a dense,genome-WIdeqnucleosome occupancythat enables identificationchromatinof its cell-types of originpotentially enabling the
6、Identiytissues-of-crigin of cell- re DNA using nucleosome maps noninvasive monitoringtissue contributnaaxtiss ue contributinof a broader set of Lymphoid Myeloid口Maow口口) Cancerous tssuesMatthew w. Snyder, Martin Kircher, Andrew J. Hillet al. Cell-ree DNA Comprises an In Vivo NucleosomeFootprint that
7、Informs Its Tissues-Of-Origin cell 2016 Jan 14: 164(1-2): 57-68.,CTCWhat:循环肿瘤细胞,是指从实体瘤中脱离出来并进入外周血液循环的肿瘤细胞Source:原发肿瘤和转移灶都会释放CTC可检测到的CTC是肿瘤细胞在循环系统微环境下生存竞争的结果39,液体活检应用价值(监测肿瘤特异性突变发现肿Primary tumorTumor resectionbiopsyEllen Heitzer, Peter UIz, and Jochen B.Geig Circulating Tumor DNA as a Liquid Biopsy for CancerClinical Chemistry. 2015, 112-123,
