PubMed数据库.ppt

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1、PubMed数据库,人民医院图书馆2007年6月,PubMed登录方法,登录北京大学医学部图书馆网站http:/点击“电子资源”下的“文摘索引数据库”点击“PubMed世界医学文献数据库”或者直接登录网站,地址:http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?DB=pubmed,PubMed介绍,PubMed检索系统由隶属于美国国立图书馆(NIL)的国家生物信息中心(NCBI)开发通过PubMed检索系统,能检索到比MEDILNE收录范围更大的生物医学文献信息,并且具有以下优点:能上网即可获取该系统的相关信息,检索功能强,结果新,可免费检索MEDLIN

2、E、PREMEDLINE,部分记录还可链接到全文PubMed检索循证医学的研究和实践,PubMed 与MEDLINE的区别,PubMed收录范围广:MEDLINE收录的部分生命科学相关文章的非医学专业期刊(物理、天文、化学等)PubMed收录记录新:在MEDLINE数据标引前的最新题录PubMed文献类型全:提供电子原文链接(部分可免费获取全文),PubMed的收录范围,MEDLINE PbuMed-index for MEDLINE PREMEDLINE PubMed-in process 每日更新版面商直接提供的记录PubMed-as supplied by publisher 另外:Pu

3、bMed链接了与NLM有联系的杂志的网址,可得到更多杂志信息,其中部分网址提供免费的全文,PubMed主页,1、检索提问框2、特征栏(Feature Bar)3、PubMed Service,提问框,特征栏,注册个人帐户,可注册个人帐号,存储个人的检索策略,点击新帐户注册,填写相关注册信息,点击注册,您会在邮箱中收到确认信息,再次登陆个人帐户,可查看保存过 的内容,检索方法和检索结果显示/输出,开始检索之前,选择需要查询的数据库,点击后可见下拉菜单,检索提问框,位于“Search”下拉菜单右侧“for”之后的条形框,该框右侧的“GO”按钮用于执行检索功能,“Clear”用于清除检索提问框中的已

4、有的内容。由于检索提问框处于活动状态,进行检索时在每屏中均可见到检索提问框。,PubMed基本检索功能,在检索栏中输入:一个或多个检索词(系统默认空格为AND检索)如:hypertension therapy著者姓名,姓在前,名在后,如:smith ab刊名,可输全称或MEDLINE认可的标准缩写形式如:clin exp immunol布尔逻辑运算式:(运算符须大写)如:Stem ti AND neuroscience,截词检索:在单词末尾加上*,可作截词检索。例如 bacter*可以查到bacteria,bacterium,bacteriophage等。最多限150个单词。词组检索:hear

5、t failure 特指要加上“heart failure”,自动转换功能和自动扩展检索功能PbuMde设有自动转换提问词功能 当检索词输入到检索提问框执行检索功能时,系统自动将检索词逐一与主题词转换表(MeSH Translation table),杂志名转换表(Joumals Translation table),短语列表(Phrase Iist)和作者索引(Author Index)中的词进行核对,并转换、匹配为相对应的词。给短语加上双引号,则不执行自动转换提问词的功能。,具有对主题词和副主题词进行自动扩展检索的功能 如:hypertension therapy,系统自动对高血压的药物治

6、疗、饮食疗法等检索,字段检索,字段标记符(tag)使用规则:只能在词后加字段标记符,如:hypertention mh,cancertimh 为主题词缩写,必须用封闭的方括弧,大小写和空格会被忽略,如:liver mh=LiverMH。,在检索框内输入检索词,然后点击“Go”。检索结果列在下面,可看到该检索词下查到的综述文章,这种图标代表提供全文,用“Clear”清除前面的检索词后,输入另外一个检索词,在检索词尾不确定如何书写时,可用“*”替代,可选择检索结果显示的格式,显示字段选择(Display),Abstract report:来源期刊、标题、著者、著者地址、记录性质、文献类型、勘误、评

7、论、PMID或UI、摘要。Citation Report:显示除上述内容外,加MeSH叙词、化学物质名称、资助项目号等字段。MEDLINE Report:(最完整,有标识符),选择”AbstractPlus”显示方式时,可看到是否有全文链接,可选择每屏显示结果的数量,可选择检索结果排序的方式,可选择检索结果输出的方式,特征栏的功能,Feature Bar,该栏位于检索提问框下方,包括:“Limits”,“Preview/Index”,“History”,“Clipboard”,“Details”5个重要的、各具特色的辅助检索功能按钮,前3个按钮在辅助检索功能方面更为突出,后2个按钮的功能比较偏

8、重检索之后的显示。,三.PubMed的辅助检索功能,Limits(检索限制选择)字段限制:著者、刊名、篇名、滤过(filter原文收藏处)等数据输入时间:默认检索可回溯到1966年,限制选择30天-10年7种文献类型限制:7种语种:12种子文档:(01年新增2种Space Life Sciences and Bioethics),可使用限制功能,将搜索范围设定在特定的年龄组、性别组、人类或动物学范围,设定只搜索包含全文的文献,设定搜索范围为PubMed数据库的某一子数据库,设定检索时间限制,将搜索范围设定在一个特定的域,点击“Go”,将搜索限定在某一特定的文献类型,使用限制功能后,大大减少了文

9、摘数量,Previw/index(检索策略预览),浏览检索式改变检索式(可用检索式编号#1 OR#2)浏览索引(index),点击“预览/索引”,浏览检索式,对检索式进行管理,或者编写二次检索式,3号和6号检索式组合后得到的检索结果,(3)History功能键,历史记录中保存的是你所有的查询方案与查询结果 History显示:查询方案、查询时间、查询到的文献数量 使用History可以看到最近100次的查询结果,点击“历史”,浏览检索史,(4)Details功能键,显示检索词转换匹配运算详细过程用途:转换、确定规范词 如:liver cancer liver neoplasms修改检索策略,点

10、击“细节”,查看细节信息,然后决定是否保存,保存前的提示信息,如果您需要更新的检索结果,请选择“是”,(5)Clipboard功能键,您可查看剪贴板上最近500条记录这些记录在休止状态8个小时后自动消失如果想保存剪贴板上的信息,保存到My CNBI collections,将检索结果发送至剪贴板,最多保存500条,可发送到My NCBI Collections,再次登录,检索前首先登录个人帐户,输入用户名和密码,查看保存过的检索式,可以重新运行检索或者在此基础上编写新的检索式,例如:做一个“Insulin”和1号检索式的组合检索,检索结果,全文链接和保存,举例:选择“AbstractPlus”

11、,显示方式,有全文链接的文章,有类似的图标,可直接点击,这是网页版全文,可点击左侧各功能项,续上页,续上页,续上页,续上页,续上页,可点击图使之变大,续上页,对于参考文献,有免费全文的可点击链接,可点击PDF格式,点击保存副本,选择保存路径,相关文献的全文链接,PubMed Service,位于主页左侧,列中有“PubMed Service”栏目,有以下内容:Jornal Database(杂志数据库)MeSH Database(主题词浏览器)Single Citation Matcher(单篇引文匹配器)Batch Citation Matcher(多篇引文匹配器)Clinical Quer

12、ies(临床提问)Link Out(与链接有关的功能)Cubby(与存储有关的功能),PubMed Service,MeSH Database(医学主题词浏览器)在“MeSH Database”检索提问框内输入检索词后系统将自动主题词表进行匹配检索,有的非主题词将转换为主题词,可浏览主题词的定义、浏览树状结构并进行选择,并能提供可供组配的副主题词进行检索,还提供是否只针对主要主题词检索及是否进行扩展检索等功能,2.Journal Browser(期刊浏览器)刊名全称、MEDLINE 的期刊缩写或国际标准期刊号(ISSN)。通过journals with links to full-text w

13、ebsites,便可链接入所有与PubMed建立链接的生物医学期刊列表。目前约有两千六百多种期刊。3.Citation Matcher(引文匹配器),Clinical Queries(临床提问):1、列有临床医生常用的类目,如therapy(治疗)、Diagnosis(诊断)、etiology(病因)和prognosis(预后)2、检索质量侧重点过滤器:Sensityvity(查全率)和Specificity(查准率)3、2001年11月以后加上了Systematic Reviews(系统综述过滤器),主要检索系统综述文献、meta分析等文献。,五、应用Clinical Queries检索循证医学文献,有关高血压治疗文献,有关高血压合并糖尿病的诊断,有关高血压的系统综述,如有问题请咨询人民医院图书馆联系人:王英杰联系方式:68325936,

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