分子动力学模拟的基本步骤.docx

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分子动力学模拟的基本步骤碳纳米管管壁上C-C 原子之间形成强的相互作用健, 而在垂直管壁的方向为弱的健相互作用, 使得C-Si 之间相互作用很弱, 因而碳纳米管在低温下可以作为硅的惰性容器, 从而也可以作为合成硅纳米线的模板. 由于碳纳米管-硅纳米线复合材料具有更高的热稳定性, 预计将来在纳米电子学和微电子器件中将有潜在的应用价值. 分子动力学模拟的基本步骤 1 2 3 4 5 6 确定研究对象 分子的初始位置和速度 势能模型分子间作用力 分子运动方程的建立 周期性边界条件 位能截断 对于分子数为N的模拟体系,原则上任何两个分子问都存在相互作用,那么在计算体系位能时须进行N(N-I)2次运算,一般情况下要占总模拟时间的80左右,非常消耗机时。为提高计算效率,在实际模拟过程应进行势能截断,最为常用的方法是球形截断法,截断半径一般取26D(D为分子的直径),这样对截断距离之外分子间的相互作用就可以忽略,模拟过程中减少了计算量。 7 实施模拟 在周期性边界条件、时间平均等效于系综平均等基本假设之上,通过求解体系的运动方程组得到各粒子在不同时刻的位置和速度。体系达到充分平衡后,再经过几千、几万甚至几十万步的运算,体系的一些热力学参量可以通过统计平均得出。

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