ACD ChemSketch 10 中文使用指南.doc

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1、ACD/ChemSketch Version 10.0 for Microsoft Windows 中文使用指南化学结构式和图形图像的绘制高级化学发展有限公司(ACD)本书版权归ACD公司所有。1997-2006ACD/LABS 是ACD公司商标。 Microsoft和Windows是微软公司在美国(或其他国家)注册商标。2006 IBM(International Business Machines)是国际商用机器公司注册商标。1994-2006Adobe,Acrobat, PDF(Portable Document Formats)及关联数据结构等都是Adobe系统组合公司在美国(或其他国

2、家)的注册商标。2006 Camtasia是TechSmith公司的注册商标,Camtasia Studio是TeachSmith公司的商标。 19992006 本指南中提到的所有商标均属于其拥有者。且所有的商标均是被许可的。本说明书中内容可能不在任何通告下进行改变,公司对以下情况不承担责任,包括但不限于商业或任何其他特殊用途。公司对使用该说明书而直接、间接、专门、附带的和因此而引起的任何错误不承担责任。目 录1.引 言81.1免费版81.2关于本指南81.2.1高级理解91.3鼠标惯用法101.4更多信息101.4.1如何联络我们111.4.2在线升级122.ACD/CHEMSKETCH基础

3、132.1目标:132.2启动ACD/ChemSketch132.3设定可兼容的文件类型132.3.1改变可兼容的文件类型142.4改变默认路径152.5安装附件162.6退出ChemSketch173.绘制简单结构183.1目标183.2画原子、化学键和标签183.2.1使用常用画图工具183.2.2双键和三键193.2.3个别原子的删除203.2.4撤销命令203.2.5聚合物203.2.6非原子213.2.7改变原子213.2.8使用连续画图工具233.2.9使用鼠标拖拽绘图233.2.10优化结构243.2.11编辑原子标签243.2.12使用画链工具253.3清除屏幕263.4使用A

4、CD/字典273.5翻转结构283.6输出303.6.1保存ChemSketch(.sk2)文件303.6.2保存结构为 MDL Molfile 格式303.6.3打印313.6.4在文件中插入结构式324.绘制更复杂结构334.1目标334.2使用基团表334.3使用环节构344.4删除原子和基团354.4.1同时删除多个原子364.5替换原子374.6设置双键和三键374.7标定电荷和定义阳离子与阴离子384.8标记键404.8.1原子团标记键414.9使用立体键424.10绘制配位键444.11离域电荷及曲线474.12更多键类型494.13改变原子属性525.超级结构、简化线性分子式和

5、化学反应式555.1目标555.22D优化555.2.1创建环烷烃结构555.2.2画环形的缩氨酸565.3简化线性分子式(SMILES Notations)585.3.1创建简化线性分子式585.3.2从简化线性分子式创建结构式595.4IUPAC国际化学标识分子式605.4.1生成国际化工标识分子式605.4.2从国际化学标识分子式生成结构625.53D优化625.5.1创建双2,2,2环己烷结构635.5.2创建三蝶烯结构645.5.3创建立方烷结构665.5.4创建C20球碳分子675.6绘制、标记和映射化学反应705.6.1绘制化学反应705.6.2标记化学反应715.6.3映射化学

6、反应725.6.4计算化学反应数据仅限商业版!746.高级绘制:模型766.1目标766.2概述766.3原子团表776.3.1创建荧光胺结构776.4快速模型工具796.4.1创建环状体聚物结构796.5模型窗口806.5.1创建DNA分子片断816.5.1.1绘制去氧核糖-5-磷酸盐链的图象816.5.1.2添加碱基826.6绘制复杂的生物化学结构836.6.1创建-麦芽糖酶结构836.7定义用户模型866.7.1模型窗口组织者866.7.2*.cfg模板文件877.计算宏观性质897.1概述897.2计算宏观性质897.2.1菜单命令897.2.2状态栏自动显示907.3计算单一同位素质

7、量918.特殊功能键938.1目标938.2同分异构体938.2.1举例958.2.2化学文献中的错误958.3字典978.4ACD/免费名称附件978.4.1ACD/免费名称的局限999.结构搜索仅限商业版!1009.1目标1009.2搜索结构1009.2.1通过哪些文件搜索1009.2.2鉴于搜索结果10310.创建绘画对象10510.1目标10510.2绘制反应能量图10510.2.1画一条曲线10510.2.2修改曲线10710.2.3绘制X、Y轴10810.3绘制各种不同轨道10910.3.1绘制p轨道10910.3.2绘制d轨道11010.3.3绘制pi轨道11210.4绘制真空蒸

8、馏装置11310.4.1在图形上加注释11510.4.1.1文字注释11510.4.1.2插入注释框11710.4.1.3修改注释框的形状11710.4.1.4将元素编组/拆开11810.5绘制一个双链DNA螺旋结构11810.6绘制脂肪和胶体12310.6.1绘制脂肪12310.7创建表格12510.7.1绘制表格内容12610.7.2插入表格12710.7.3置入数据12710.7.4修改表格内容12910.7.5编辑表格外观13111.管理文件13311.1插入页眉和页脚13311.2转换成PDF仅限商业版!13411.3创建海报13512.结构模式中的样式13712.1目标13712.

9、2改变结构样式13712.2.1应用期刊样式13812.2.2准备发表13912.3创建用户样式14012.3.1用户定义样式:糖14012.3.2用户定义样式:磷酸盐14112.3.3用户定义样式:碱14212.3.4用户定义样式:强调14212.4应用现有样式14412.5设定默认样式14513.画图模式中的样式14613.1目标14613.2改变对象样式14613.3保存样式14713.4应用现有样式14713.5设置默认样式14813.6管理样式14914.创建汇报模型15014.1目标15014.2关于汇报模型15114.3输入汇报模型15114.4插入模型对象15114.5设定显示

10、参数15414.6编排模型对象16014.7保存和应用汇报模型1601. 引 言感谢您购买ACD/ChemSketch。我们一直致力于开发最简单易用、最强大有效的程序来用于化学结构、反应、示意图形的绘制以及化学相关的报告和演讲材料的设计。1.1 免费版从1999年4月开始,高级化学发展公司(ACD)在网站中的免费材料中(free stuff)提供免费的ChemSketch。重要启事:ACD ChemSketch的免费软件应该单独安装,也可以与其他目前可用的ACD/Labs免费软件安装在同一个文件夹中, 但不能包含任何商业版的ACD/Labs软件(既非免费软件)。所有关于免费软件的限制和常见问题

11、(FAQs)同样可以在我们的网站上找到:注意: 尽管我们不对ACD/ChemSketch免费版的用户提供技术支持, 我们鼓励用户将您的问题和要求发放到新闻组(Newsgroup)的网页上, 具体网址将在下面的章节中提到。1.2 关于本指南阅读完该指南您能够获得帮助您开始使用ACD/ChemSketch的工具,同时本指南也用于在线使用和“硬拷贝”版的打印和使用。本指南中使用的是教小屏幕的显示。本指南中的色彩和其他窗口元素的性质取决于默认的窗口显示性质。 本用户指南以电子形式提供,可使用通常使用的Microsoft Word阅读。如果您找不到您需要的目录标题,请使用搜索功能查找相关的字、词语。1.

12、2.1 高级理解本指南是ACD/Labs软件的技术支持文章的一部分。要循序渐进的学习ACD/Labs的产品,我们推荐您按以下步骤完成技术文章的学习(相关的文章都在ACD/Labs文章的文件夹中,DOCS):1.参考手册(CHEMSK_R.PDF)2. ACD/字典 用户指南 (DICT.PDF)和ACD/3D Viewer 3D阅读器 (3D.PDF)此外,如果能够对ACD/Labs的如下产品进行了解那是明智的(相关的文章都在ACD/Labs文章的文件夹中,DOCS):1. ACD/I-Lab (ILAB.PDF) 允许您得到基于互联网的对化工数据库和性质预测程序的立即通入的服务(可从免费下载

13、) 。2. ACD/ChemBasic (CHEMBAS.PDF)使用户能定制ACD/Labs的特殊编程语言软件(可从免费下载) 。3. ACD/Name to Structure (NAMESTR.PDF) 几乎能够为所有化学名称生成一个分子结构。ACD/Name to Structure根据IUPAC建议的关于有机, 生物化学, 和无机的命名原则可以给出相应化学有机物和天然产品衍生物IUPAC名称的结构式。1.3 鼠标惯用法在您使用本软件的过程中您可能会执行的个别动作,我们用如下的专业术语来描述。 指向(Point to):移动鼠标到一个物体。 点击或点击左键(click):移动鼠标到一个

14、物体,并按下鼠标左键。 点击右键(right-click):移动鼠标到一个物体,并按下鼠标右键。 双击(double-click):移动鼠标到一个物体,并迅速按下左键两次。 拖动(drag):当你移动鼠标时,按下鼠标左键并移动。 选择(select):通过点击或拖拽来突出或激活某个界面元素。1.4 更多信息要想了解更新的产品和服务,请访问我公司网站: 我们网站正以每天数以万计的“点击”的速率被访问.原因是:我们提供了很多有用的产品和信息。从2006年夏天,我们提供免费的ChemSketch 10.0,免费的ISIS 3D 附件,免费的CHEMDRAW扩展,和经济的“互动性界面实验室”讨论组,您

15、可以不用购买软件就可使用Java Applets 运行测试计算。还可下载许多以Lotus公司CAM形式的影像资料,这些资料显示各种软件包的操作。我们正不断更新关于我们网站的信息。网站将向你显示在哪一个科学会议方面你能访问ACD/Labs销售产品。通过我们的网页,您还能浏览常见问题页面或者在我们的新闻组访问“Chat”的连接。如果您想随时了解ACD公司化学软件的最新进展,情给我们网站中的广播站发邮件:如果您想加入ACD/Labs的讨论组,请您访问:1.4.1 如何联络我们可通过访问网站、电话、传真和邮件与我们联系,但最常用的方法是电子邮件。关于价格、销售、供货、和一般问题,请发邮件:info技术

16、和科学问题,请发邮件: support与我们联系时,请告诉我们软件拥有者的名字,版本号,产品证书号(这些信息可在帮助/关于文件中找到)。如果可能,请告诉我们供应商的名字。1.4.2 在线升级所有ACD计算机软件都可以在网上进行升级. 您需要准备好您的产品登记号, 并且用您安装了ACD 软件的计算机进行升级。通常升级只是很小的改进, 比如: 将实际版本从10.00升至10.01. 详情请参阅您的产品说明文件中的在线升级DOCSUP_CLNT.PDF。或与我们的技术支持部联系。2. ACD/ChemSketch基础2.1 目标:本章讲解如下内容: 如何启动ACD/ChemSketch 如何设定和改

17、变文件可兼容的文件类型(File Assosciation) 如何设定默认文件路径 如何退出ACD/ChemSketch2.2 启动ACD/ChemSketch 安装完毕后,按以下步骤操作可启动程序。1. 打开Windows。2. 双击图标,启动;或任务栏中,由开始菜单击图标;或在ACD 栏目中双击CHEM.exe程序文件;或从正在运行的其他ACD程序中的ACD/Labs 目录中选择ChemSketch。3. 如果是免费版本,您将看到15秒ACD产品滚动图象,请等待并点击取消键(Cancel)。2.3 设定可兼容的文件类型1. 在您第一次使用此软件时, 设定可兼容的文件类型(File Asso

18、ciations)对话框将出现. 2. 这些可兼容的形式包括CS ChemDraw(*.CHM), REACCS Rxnfiles (*.RXN), ISIS/Sketch (*.SKC) , 可能还有其他格式的文件, 这些文件都可以在ChemSketch 中打开. 具体做法是在您想要添加的选项前的方框内点上对号, 然后点击YES键即可。3. 如果您不知道或者不确切地知道 ChemSketch将打开的文件的扩展名, 不要选任何选项, 然后点击NO键。4. 然后今日诀窍(Tip of the Day)窗口将跳出, 您可以在阅读结束后关闭。2.3.1 改变可兼容的文件类型 在您没有选择可兼容文件类

19、型以前, ChemSketch将自动使用默认的文件类型,您可以随时改变默认文件类型, 只要在文件 (File)菜单下选择相关ACD产品命令(File Associations)即可。重要启事:如果在Window NT的系统中您没有被授权改变可兼容文件的同时选择File Associations的命令,会出现警告信息,请联系您的系统管理员解决问题。如果您已经选择了所有的可兼容文件类型, 一条信息会提示您已经选择了所有的文件类型-“all supported file types are already associated with the current application, 您可以通过W

20、indows Explorer选择选项:1. 打开 Windows Explorer, 选择您想选的选项:2. 按住 SHIFT键, 在要打开的文件上右击鼠标,在菜单中选择 Open With.3. 选择您要打开的文件相对应的文件类型, 然后选择 Always use this program(只要在前面的方框内打对号即可)。4. 点击 OK,然后关闭 Windows Explorer.2.4 改变默认路径如果您使用的是单一用户(可以单独使用的版本), 默认路径可能是没有任何问题的.如果您使用的是网络版本, 我们建议您改变您的默认路径,将您的文件保存在您自己的硬盘,而不是网络服务器。当做好了单

21、机路径后, 再在每一个单机上进行以下操作:1. 打开 ChemSketch 的窗口后,从Options菜单中选择 Preferences 命令键。2. 点击 General, 然后在默认栏内键入每次您要输入, 打开, 保存和输出文件的路径。注意: 在 Private 栏内, 您可以设定记录每次ChemSketch操作的设置。3. 点击 OK。2.5 安装附件从8.00的版本开始就可以安装附件了编写的用于扩展主要应用的一些程序(有.ADDON的扩展名)。每个附件都包含了用于当前记录或整个数据库的一整套命令。当附件被安装, 它的命令可能被安置或在工具栏作为按钮或在主菜单作为添加子菜单的命令, 或二

22、者都有。请按以下步骤安装附件:1. 从选择菜单, 选择附件组织者(Add-on Organizer)。2. 点击添加, 在出现的打开对话框中, 找到.ADDON 文件。点击打开将其添加至目录中。3. 用户化一些添加选项, 在目录选择它点击编辑:4. 在可用的命令框中,从ChemSketch界面选择命令是容易实现的。在插入区域, 选择添加命令应该增加的地方: 作为命令对菜单并且/或者作为按钮对一般工具栏(若通过附件自动执行)。点击OK。5. 点击OK在附件组织者对话框和核实是否菜单或按钮增加到界面。2.6 退出ChemSketch您能从以下方式中选择任意一种来退出程序: 在屏幕右上脚点击 。 在

23、 ACD/Labs 菜单中选择 Close All,这将退出所有ACD软件。 从File 菜单中选择 Exit ,这将只退出现有的软件。在退出之前, 计算机将提示您存盘。3. 绘制简单结构3.1 目标本章介绍绘制结构的一些基本知识, 这些功能只在结构模式适用。您将掌握以下的功能: 画原子, 化学键(单键, 双键, 三键, 共价键, 等等), 和标签。 翻转分子结构式。 选择, 旋转和扩大与缩小结构图。 将结构式输出至文件夹, 文件及打印机。 清理屏幕。3.2 画原子、化学键和标签ChemSketch 的基本功能是画化学键和原子, 您必须在结构模式进行以下操作: 3.2.1 使用常用画图工具当程

24、序开始时,常用画图工具是默认的。在这种模式下,您可以很容易地画直鏈和分支结构,并用元素周期表中的原子取代所画的原子。5. 在画图模式(Draw Mode)下,从原子工具条选择碳原子。6. 单击空白处,画出CH4。7. 单击CH4以增加一个CH3基团,并以标准键长连接。再双击同一个碳原子,画出 。8. 单击Set Bond Vertically , 将从上一步得到的结构旋转至。9. 单击结构工具栏中常用画图工具。10. 单击最右边的碳原子,画出。11. 重复以上步骤,画出一些结构, ,。3.2.2 双键和三键1.在3.2.1节的第7步所画的结构式中的最后一个单键上再次单击获得双键:2. 再次在双

25、键上单击获得三键:3. 再次在三键上点击将重新得到单键.3.2.3 个别原子的删除如果您加了过多的原子, 可以逐一去除原子:1. 点击Delete 键.2. 在以上的分子结构上进行逐一去除原子的练习.3.2.4 撤销命令另外一个重要的功能是如何恢复以前的界面设置:1.单击Undo键。这会将ChemSketch的界面恢复到以前的设置.注意: 点击 Undo键将会击活重做(Redo)键。2.多次单击恢复Undo键,直到将其恢复至以下结构:注意: Undo键可以连续点击50次.当您画比较复杂的结构或者物体时, 我们建议您养成及时保存文件的习惯。3.2.5 聚合物ChemSketch提供了聚合物结构的

26、绘制功能:1. 在结构工具栏上点击Polymers 键,出现聚合物面板后就可以进行如下设置的更改了:2. 通过点击或拖拽来选定产生聚合物的区域。当区域被选择, 聚合物出现在工作区: 3. 再次点击Polymers 键就可以离开聚合物绘制模式。3.2.6 非原子按照以下步骤来创建无终止的聚合物和弯键:1. 在原子工具栏,点击Pseudo Atom键。2. 点击结构的结束原子用空的原子替换他们。那么就可以得到一个无终止的聚合物了。3.2.7 改变原子按以下方式用一个原子工具栏中没有的元素替换当前元素:1. 点击撤销键直至回到下面的结构或者画出它:2. 单击原子工具条下的元素周期表(Periodic

27、 Table)键,打开元素周期表(Periodic Table of Elements):3. 单击元素周期表中的氟(Fluorine)键 , 注意现在氟 (Fluorine)键出现在原子工具条中。4. 单击最左边的碳(Carbon), 用氟原子替代碳原子: 注意: 当您选择了元素周期表中的某个元素时, 相应的元素键将自动加到原子工具条中。去除工具条中的原子键可以通过双击任何一个原子键或者双击原子工具条, 然后选择YES。但是后者将删除默认原子以外的所有原子键。3.2.8 使用连续画图工具当连续画图工具(Draw continuous Tool) 被激活后,只有在原子工具条中被选定的原子才能用

28、于画化学键。点击工具条中的原子键,可使其成为被选中的原子。这种连续画图工具模式在由一个选定原子“衍生”多个相同原子时,非常方便。1. 在结构工具栏中,点击连续画图键 。或者单击鼠标右键,选择画图模式。2. 在原子工具栏(Atoms)中选择原子。3. 点击最右边的碳原子,双击以“衍生”出F原子。在同一碳原子上双击,以“衍生”第二个F原子 。3.2.9 使用鼠标拖拽绘图在正常画图(Draw Normal)和连续画图(Draw Continuous)两种模式下,您可以从一个原子拖动鼠标到另一个原子,画出单键。如果您从一个空白处开始(或结束)拖动,将在开始处(或结束处)生成一个新的原子。在下面结构中,

29、点击一端的碳原子,拖动鼠标到另一端的碳原子。当正常画图(Draw Normal)和连续画图(Draw Continuous)被激活后,指向到终端碳的当中一个和扯拽到其它终端碳画以下结构:3.2.10 优化结构点击结构工具栏中“清洁” 命令,将使结构中所有的键长与角度平均化,得到如下结构:Clean命令不仅使键长和角度平均化,令结构看上去更好看,更使该结构符合于化学意义。例如循环结构,它将SP2轨道上的碳原子的键按120度分布,将SP轨道上的碳原子的键按180度分布。当画平面和立体异构体时,Clean命令保持以上特性将键长和角度平均化。3.2.11 编辑原子标签编辑原子标签工具允许您用简短的缩写

30、代替最终端的原子。1. 在原子工具栏中,点击原子标签工具 键,然后将鼠标移动到结构中最右端的F原子上。2. 在打开的编辑标签(Edit Label)对话框中,键入(CH2)3PH,再点击插入键(Insert),画出如下结构。3. 选择改变位置(Change Position), 然后点击原子标签,调换Ph 和(CH2)的位置得到以下结构:提示:如果在选中Change Position键后, 用手指按住Shift, 同时点击结构中的原子标签将达到与3.同样的效果。4. 利用已激活的编辑原子标签工具(Edit Atom Label) ,点击已得到的缩写,将编辑标签对话框再次打开,点击“展开”(Ex

31、pand)键,得到如下结构:3.2.12 使用画链工具使用画链工具,通过点击和拖动鼠标,您可以很容易地画出长、短键。1. 点击结构工具栏中画链工具键,将鼠标移动到键头所指的原子上。2. 按下鼠标键,向左拖动。当鼠标离开结构时,自动生成碳链。注意鼠标箭头旁的碳原子数(C#)随着碳原子的增减而变化: 3. 激活画链工具(Draw Chains),在原子工具栏中选择F原子,点击最左边的碳原子,衍生出F原子。点击结构工具栏中清洁工具键 ,得到如下结构: 3.3 清除屏幕如果您需要清除屏幕,您可以选择以下的一种方式: 从文件(File)菜单, 选择新建(New)。这将打开一个新的空白文件。 在左上方选择

32、创建新页按钮(New Page),创建新的一页。 在编辑菜单中选择“全选”按钮(Select All),再选择“删除”命令(Delete)。 在工具栏中(General toolbar)点击删除(Delete)按钮,点击空白处,再点击结构的任意部分,将其全部删除。3.4 使用ACD/字典我们允许您从普通药品名字中查找分子结构, 但这个模块是只可利用的在ACD/ChemSketch 的商业版本。如果您使用免费软件版本ACD/Dictionary是不可用的, 请跳过这个部分。1. 在参考工具栏点击ACD/字典按钮(ACD/Dictionary)来显示ACD/字典:2. 在对话框的标题栏上单击鼠标右

33、键来显示快捷菜单,确信没有选中复制带有命名的结构(Copy Structure with Name)。3. 在快速查找箱,输入咖啡因。当您键入名单即显示对应的名称。当必需的名称在表单中可见的时候,点击它来选择。对应的结构就会被显示在右边的预览区域。4. 将被选择的化合物置入工作区,点击OK即可。5. 结构阴影附有指针,指向空白区域并点击即可插入结构:注意:更多细节在ACD/Dictionary选项中, 参见ACD/Dictionary Users Gudie位于ACD/Labs文献文件夹(DOCSDICT.PDF) 。3.5 翻转结构您可以在结构工具栏中通过点击一个键来实现整个结构的旋转和翻转

34、。1. 我们拿前面一节字典中的或手工绘制的咖啡因为例,将下图中红线标记的双键进行翻转。2. 点击设置水平键(Set Bond Horizontally)然后再点击目标键使其处于水平,结构其它部分将相应转动。用该工具反复点击此键可使结构绕键不断翻转。3. 点击设置垂直键(Set Bond Vertically)然后点击目标键使其处于垂直,其它部分将相应翻转。4. 点击翻转键(Flip on Bond)然后点击目标键,结构将会绕着被点击的键转动。5. 首先选中整个分子(或基团),点击上下翻转(Flip Top to Bottom)按钮,则选中的结构或基团(若无选中项,则所有已绘结构)将从上部旋转至

35、下部。6. 点击左右翻转( Flip Left to Right)使被选结构或基团(若无选中项,则所有已绘结构)将从右方旋转至左方。注意:应用翻转工具可能改变立体结构。可以从选项(Options)菜单中选择参数(Preferences),然后切换至结构(Structure)标签来进行控制。保持立体构型(Keep Stereo Configuration on)选区将控制程序是否对分子的真实3D排列进行记忆:它可以保持真正的3D结构的分子结构. 我们建议选择Flips, 这样一来尽管位置改变了, 分子结构将和翻转以前的一样.否则,分子将变成原来分子的对应异构体:3.6 输出输出的方式有存盘, 打

36、印或者插入其他文件中, 如: MS Word, Excel等. 您还可以试试I-Lab服务。(参见ACD/I-Lab Users Guide位于ACD/Labs 文献文件夹,DOCSILAB.PDF)3.6.1 保存ChemSketch(.sk2)文件将我们在前一节中所画的结构式存为ACD 格式, SK2 格式的细节请参阅 文件名为example1.sk2。1. 从File菜单选择 Save。2. 在对话框中输入文件名和路径, 然后点击 OK。3.6.2 保存结构为 MDL Molfile 格式一种比较标准的文件格式是由MDL公司开发的MDL molfile格式。注意: 只有结构式可以存盘,

37、图象和文字不能以这种格式存盘。1. 选择您要存盘的结构式。2. 从文件夹(File)菜单选择输出(Export)命令, 在对话框下部的文件类型选择栏中选择MDL Molfiles:3. 输入文件名和路径, 点击 OK。3.6.3 打印其它方式保存您的工作将打印报告。在开始的打印之前, 核实页面设置。1. 若您想设置海报选项,从文件菜单, 选择页面设置显示您能指定纸张大小, 取向等(更多有关海报制作的细节可在11.3获得)。2. 点击OK保存。3. 点击全页(Full Page)键进行预览。4. 进行适当的调整。5. 从文件夹(File)菜单选择打印( Print) 或者点击。点击OK开始打印。

38、3.6.4 在文件中插入结构式有时侯您需要将结构式插入其他类型的文件中。例如: Word document, Excel spreadsheet等。1. 选择所需的结构式。2. 若想从图画板拷贝结构式, 单击拷贝键。或者从编辑(Edit)菜单键选择拷贝Copy命令。或者在键盘上按 CTRL+C 键。3. 然后在您选定的文件中, 点击粘贴(Paste)键。重要说明: 当把结构式粘贴至其他文件时, 如: Microsoft Excel, 结构式可能会变成数字或者图形(MDL molfile格式), 为了得到结构式, 可以点击特殊粘贴(Paste Special), 在粘贴选择(paste opti

39、ons)中, 选择ACD ChemSketch 2.0 Object 或者Picture键, 前者将结构式作为OLE物体插入, 因此您可以将插入的结构式通过ChemSketch 进行修改。4. 绘制更复杂结构4.1 目标在这一章中,主要讲解以下内容: 如何用化学基团表画化学基团; 如何迅速地画环结构; 如何删除和替换原子; 如何画双键和三键; 如何画原子的电荷,阳离子和阴离子; 如何改变不同原子的性能。4.2 使用基团表化学基团表(Table of Radicals)中包括预先画好的氨基酸及其保护基的结构,还有核甘酸及其他常用结构。1. 在常用工具栏(General toolbar)点击保存文

40、件(Save File),然后点击新页面(New Page)在同一文件中开始新的绘图。2. 在参考工具栏(References Toolbar)中点击基团表 (Table of Radicals),显示如下基团:3. 在表中点击环己烷键(Cyclohexane) 。环己烷键被选定,同时选定屏幕右边的参考工具栏(References toolbar)。4. 对环戊烷键和羟基重复以上步骤。注意:当基团表中新的化学基团被选中后,在参考工具栏中将自动添加该键。可通过双击该键或在参考工具栏再选择YES,删除该键。4.3 使用环节构1. 在右边参考工具栏中选择环戊烷键(Cyclopentane),或者从化

41、学基团表中选择。2. 在工作区点击创建新的五元环。3. 在同一工具栏中,选择环己烷离子,将鼠标移动到环戊烷键,再点击创建如下结构。4. 重复以上步骤,创建如下结构:5. 点击垂直键(Set Bond Vertically) ,再点击箭头所指的键,使结构围绕该键旋转:6. 在基团表中点击COOH按钮。7. 点击箭头所指的原子,以衍生出羧基:4.4 删除原子和基团我们将在 结构删除箭头所指的原子使其成为如下结构。您可以这样作:依次删除每个原子,或一次自动删除所有原子。4.4.1 同时删除多个原子在这个部分, 您将学会怎样立即删除所有必需的结构元素:1. 点击结构工具栏中套索开关键(Lasso on

42、/off) ,以激活套索选择模式。注意此时选择/移动工具 (Select/Move)也被激活。2. 用套索线围住所有要删除的原子。3. 点击工具栏中的删除(Delete)键。点击任意一个被选定的原子,将它们全部删除。或者在键盘上按Delete删除。注意:您可以通过套索(Lasso selector) 和矩形套索(Rectangle selector) 选定原子、键和图象。不选择图象时,点击任意空白即可。4.5 替换原子替换箭头所指的原子,使结构成为:1. 点击原子工具栏(Atoms toolbar)中氮原子键,再点击所有细箭头指定的碳原子。2. 点击原子工具栏中氧原子键,再点击三个粗箭头指定的

43、碳原子。注意:在连续画图模式下,您不能替换原子(见3.2.8章)4.6 设置双键和三键1. 在(DrawNormal),(Draw Continuous)或(Draw Chains)任一处于激活状态下时,点击箭头所指的键使其变成双键: 2. 使用改变双键(Change Double Bond)或氢原子位置(Hydrogen Position)键,可以使结构更精细。选定这个键,并点击箭头所在的氢原子和双键。注意:氢原子围绕氮原子和氧原子移动,双键围绕单键移动。3. 在常用工具栏,点击保存文件,然后点击新建页面。4.7 标定电荷和定义阳离子与阴离子本章将画下列结构:1. 在原子工具栏中选择碳原子

44、键Carbon ,并且保证通用画图工具处于激活状态( Draw Normal ),画出如下结构:2. 选择氮键( Nitrogen ),并且点击中间的碳键,用氮替换碳:3. 点击原子工具栏中的Increment (+) Charge 键 的右下角的三角形扩展得到以下各项:Increment (+) Charge 正电荷Decrement (-) Charge负电荷Radical自由基;Positive Radical Ion正离子基;Negative Radical Ion负离子基.4. 点击负电荷Decrement (-) Charge 键 ,然后点击NH ,得到一个阴离子:5. 右击鼠标得到正电荷键Incremen

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