《高通量测序技术平台流程与应用.ppt》由会员分享，可在线阅读，更多相关《高通量测序技术平台流程与应用.ppt（11页珍藏版）》请在三一办公上搜索。
1、Illumina Genome Analyzer系统应用方向,DNA Fragment文库测序DNA Mate-pair文库测序Small RNA测序数字化表达谱测序转录组测序DNA甲基化测序ChIP-seqMeta-Genomics DNA测序血浆微量DNA测序,基因组DNA的随机打断DNA片段的末端修复将A碱基加入到DNA片段的3末端在DNA片段的末端加上特定接头PCR扩增连上接头的DNA片段文库检测DNA在Cluster Station的成簇扩增IlluminaGenome Analyzer上的测序生物信息组装/分析,Illumina DNA Fragment文库测序流程,Illumin
2、a Mate-pair文库测序流程,基因组DNA随机打断特定大小片段（2-10kb范围可选）末端修复生物素标记环化获得来自大片段两端共计400-600 bp的DNA片段修饰、加接头PCR扩增连上接头的DNA片段文库检测DNA在Cluster Station上的成簇扩增Illumina Genome Analyzer上的测序生物信息组装/分析,Illumina Small RNA测序流程,从总 RNA中分离 small RNA5接头连接和纯化3接头连接纯化RT-PCR扩增Small RNA文库的纯化文库的检测DNA在Cluster Station成簇扩增Illumina Genome Analy
3、zer上的测序生物信息学分析,Illumina 数字化表达谱测序流程,mRNA的分离和cDNA第一链的合成cDNA第二链的合成限制性内切酶NlaIII的酶切连接GEX NlaIII Adapter 1限制性内切酶 MmeI 的酶切连接GEX Adapter 2Adapter连接cDNA产物和PCR富集文库的检测DNA在Cluster Station上的成簇扩增IlluminaGenome Analyzer上的测序生物信息学分析,Total RNA的DNase I 酶消化mRNA 分离和随机打断cDNA第一链和第二链的合成DNA片段的末端修复将“A”碱基加入到DNA片段的3末端在DNA片段的末端
4、加上特定接头PCR扩增连上接头的DNA片段文库的检测DNA在Cluster Station上的成簇扩增IlluminaGenome Analyzer上的测序生物信息学分析,Illumina 转录组测序流程,基因组DNA随机打断DNA片段的末端修复将 A 碱基加入到 DNA片段的3末端DNA片段末端加上特别处理的甲基化接头重亚硫酸盐处理去盐处理PCR扩增连上接头的DNA片段文库检测DNA 在Cluster Station上的成簇扩增Illumina Genome Analyzer上的测序生物信息学分析,Illumina DNA甲基化测序流程,染色质免疫共沉淀目的DNA片段DNA片段的末端修复将
5、A 碱基加入到 DNA片段的3末端DNA片段末端加上接头PCR扩增加上接头的DNA片段文库检测DNA在Cluster Station成簇扩增Illumina Genome Analyzer上的测序生物信息学分析,Illumina ChIP-seq测序流程,Meta基因组的提取DNA随机打断DNA片段末端修复将A碱基加入到DNA片段的3末端在DNA片段的末端加上接头纯化连接产物PCR扩增连上接头的DNA片段文库的检测DNA在Cluster Station的成簇扩增Illumina Genome Analyzer上的测序生物信息组装/分析,Illumina Meta-Genomics DNA测序流程,收集10-15ml孕妇外周血提取血浆中游离DNAQ-PCR定量总DNA含量构建DNA文库Agilent和Q-PCR检测文库浓度Cluster制备和Genome Analyzer上的测序Pipeline 和Eland分析计算每条染色体的Z-score值,Illumina 血浆微量DNA测序流程,知识回顾Knowledge Review,
