生物化学核酸分解代谢.ppt

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1、第十一章核酸的酶促降解和核苷酸代谢,第一节 核苷酸的分解代谢第二节 核苷酸生物合成,第十一章、核苷酸代谢,第一节、核苷酸的分解代谢,生物体普遍存在的磷酸单酯酶或核苷酸酶可催化核苷酸的水解,而特异性强的磷酸单酯酶只能水解3-Nt或5-Nt。催化核苷水解的酶有2类,即核苷磷酸化酶和核苷水解酶 Ns phosphorylaseNs+PiPu or Py+pentose-1-P Ns hydrolaseNs+H2OPu or Py+pentoseNs phosphorylase存在广泛,反应可逆Ns hydrolase主要存在于植物和微生物,只对核糖核苷起作用,对脱氧核糖核苷无作用。,核酸酶(Nucl

2、ease)核酸酶是作用于核酸磷酸二酯键的水解酶,包括:1、核糖核酸酶(RNase),2、脱氧核糖核酸酶(DNase),其中能水解核酸分子内磷酸二酯键的酶又称为核酸内切酶(endonuclease),从核酸的一端逐个水解下核苷酸的酶称为核酸外切酶(exonuclease)。,食物核酸与蛋白结合为核蛋白体(Nucleoproteins)的形式,在胃中受胃酸作用水解为NAs和Proteins,NA在小肠被胰nuclease(包括DNase、RNase)降解为Pu-Nt、Py-Nt和Oligonucleotide。肠黏膜释放的phosphodiesterase并协同胰核酸酶进行消化,水解为单核苷酸肠黏

3、膜细胞中还有nucleotidase(phosphomonoesterase),水解Nt为Ns和Pi。脾、肝等组织中的nucleosidase进一步水解Ns为戊糖和碱基。,一、核苷酸分解,二、核苷酸三级水平的降解,三、嘌呤核苷酸分解的三级脱氨,(一)、嘌呤碱的分解,不同生物嘌呤碱的分解能力不同,代谢产物也不同,人和猿类及一些排尿酸的动物(鸟类、某些爬行类和昆虫)嘌呤的代谢产物为尿酸。,1、嘌呤分解中的脱氨作用,嘌呤碱的分解首先在各种脱氨酶的作用下水解脱氨,脱氨作用也可以在核苷或核苷酸的水平上进行。动物组织腺嘌呤脱氨酶含量极少,而腺嘌呤核苷脱氨酶及腺嘌呤核苷酸脱氨酶的活性较高,因此腺嘌呤的脱氨分

4、解主要在核苷或核苷酸水平上进行。鸟嘌呤脱氨酶分布广,脱氨分解主要在该酶的作用下进行。,(1)、鸟嘌呤脱氨,(2)、黄嘌呤的分解,(3)、尿酸生成,(二)、嘌呤核苷酸的分解,1、不同生物嘌呤核苷酸的分解产物不同,鸟、昆虫、人类,非灵长类哺乳动物,硬骨鱼,鱼、两栖类,甲壳类、无脊椎,2、黄嘌呤氧化酶(Xanthine Oxidase),催化次黄嘌呤和黄嘌呤氧化生产尿酸。酶为复合黄素酶,由两个相同的亚基组成,分子量260,000,每个亚基含一个FAD、一个钼原子和一个Fe4S4中心。反应要求分子氧作为电子受体,还原产物是H2O2,进入尿酸的氧来自水。底物与酶结合后,Mo(VI)被还原为Mo(IV),

5、电子经黄素、铁硫中心等传给O2,与氢离子生成H2O2,Mo(IV)氧化为Mo(VI)。,3、痛风(Gout),嘌呤碱分解代谢产生过多的尿酸,由于其溶解性很差,易形成尿酸钠结晶,沉积于男性的关节部位引起疼痛或灼痛痛风和肾结石。,痛风的尿酸钠晶体,4、别嘌呤醇与次黄嘌呤,(1)、别嘌呤醇的作用,别嘌呤醇,别黄嘌呤,(2)、别嘌呤醇的作用机理,(3)、自杀底物(Suicide Substrate),结构与次黄嘌呤很相似的别嘌呤醇(allopurinol),在黄嘌呤氧化酶的作用下氧化为别黄嘌呤(alloxanthine),后者与酶中心的Mo(IV)牢固结合,使Mo(IV)不易转变成Mo(VI)而成为酶

6、的灭活物,这种底物类似物被称为自杀作用(底)物,这种作用被称为自杀作用。,四、嘧啶碱的分解,不同生物嘧啶碱的分解过程也不一样,一般情况下含氨基的嘧啶要先水解脱去氨基,脱氨基也可以在核苷或核苷酸水平上进行。,(一)、嘧啶还原途径的分解,(二)、嘧啶氧化途径的分解,1、尿嘧啶、胞嘧啶分解,2、胸腺嘧啶的分解,返回,第二节、核苷酸生物合成,可以通过两条完全不同的途径进行,1、从头合成途径:由磷酸戊糖先和尚未完成的Pu或Py环结合,在未完成的环上添加必要的部分,然后闭合成环。2、补救途径:由现成的Pu,Py,Pentose及Pi在酶的作用下直接合成核苷酸(NtSalvage Pathway);,一、嘌

7、呤核苷酸的从头合成途径,碳14标记的HCOOH和氮15标记的氨基酸与鸽肝匀浆物共培养,得到Pu各元素的来源,1950s由J.Buchanan和G.Robert Greenberg提出Hypoxanthine de novo synthesis假说,并证明Hypoxanthine Nt是Ade-Nt及Gua-Nt合成的前体。,一、嘌呤核苷酸的从头合成途径,合成所需物质:-D-ribose-5-P,ATP,Gln,Asp,GTP,N5,N10-methylene THFA,CO2。另需辅助因子:Mg2+,Mn2+,NAD+,THFA-CHO合成中先生成IMP,然后转变为AMP和GMP。,1、嘌呤环

8、元素的来源,2、嘌呤核苷酸的全程合成总图,嘌呤核苷酸的全程合成(反应1),5-磷酸核糖焦磷酸,5-磷酸核糖胺,嘌呤核苷酸的全程合成(反应2),甘氨酰胺核甘酸,5-磷酸核糖胺,嘌呤核苷酸的全程合成(反应3),1,甲酰甘氨酰胺核甘酸,甘氨酰胺核甘酸,嘌呤核苷酸的全程合成(反应4),甲酰甘氨酰胺核甘酸,甲酰甘氨咪唑核甘酸,嘌呤核苷酸的全程合成(反应5),甲酰甘氨咪唑核甘酸,5-氨基咪唑核甘酸,嘌呤核苷酸的全程合成(反应6),5-氨基咪唑4-羧基核甘酸,5-氨基咪唑4-N琥珀酸氨甲酰核甘酸,嘌呤核苷酸的全程合成(反应7),5-氨基咪唑4-N琥珀酸氨甲酰核甘酸,11,5-氨基咪唑甲酰胺核甘酸,嘌呤核苷酸

9、的全程合成(反应8),5-氨基咪唑甲酰胺核甘酸,5-甲酰胺基咪唑-4-氨甲酰核甘酸,嘌呤核苷酸的全程合成(反应9),5-甲酰胺基咪唑-4-氨甲酰核甘酸,次黄嘌呤核甘酸,3、由IMP合成AMP和GMP,磷酸核糖基焦磷酸(PRPP),5、嘌呤核苷酸合成的调节,(1)、大肠杆菌腺苷酸和鸟苷酸合成的调节,(2)、氨甲蝶呤,(3)氮丝氨酸等Gln类似物,二、补救途径,利用现成的嘌呤、嘧啶碱基、核甘通过腺嘌呤磷酸核糖基转移酶(APRT)及次黄嘌呤鸟嘌呤磷酸核糖基转移酶(HGPRT)实现AMP、IMP、GMP的补救合成。人体细胞大多为全程合成,但脑中多通过补救途径合成。,(一)、嘌呤核苷酸的补救合成,(二)

10、、Lesch-Nyhan Syndrome(自毁容貌综合症),HGPRT(次黄嘌呤鸟嘌呤磷酸核糖基转移酶)缺陷的男性儿童表现为一种自毁容貌综合症,为先天性遗传疾病(缺乏HGPRT),行为对立,侵略性强,自咬手指、脚趾、嘴唇等,智力低下。,自毁容貌综合症机理,三、嘧啶核苷酸的合成,从头合成途径 生物有机体利用CO2、NH3及天冬氨酸合成核苷酸的途径。嘧啶核苷酸的合成包括:补救途径 生物有机体利用碱基或核苷和磷酸核糖合成核苷酸的途径。,(一)、从头合成途径,1、嘧啶环元素的来源,2、氨甲酰磷酸合成氨甲酰Asp,3、乳清酸的合成,4、乳清酸合成UMP,5、嘧啶核苷酸的全程合成:由乳清酸合成UTP和C

11、TP,6、UTP合成CTP,7、嘧啶核苷酸合成的调节,8、嘧啶核苷酸的合成受到反馈抑制的调节,细菌嘧啶核苷酸合成速度的调节很大程度受到Asp羧甲基转移酶(ATCase)的调节,产物CTP对反应为抑制作用。细菌ATCase分子有6个催化亚基和6个调节亚基组成,催化亚基与底物分子结合,变构调节亚基与变构调节物CTP结合。与亚基一样,整个酶分子有两种构象:活性形式和非活性形式,CTP未与调节亚基结合时,酶的活性最大;CTP积累并与调节亚基结合时,调节亚基构象改变并带动催化亚基构象改变,酶变为无活性形式。ATP阻止由CTP所引起改变的改变。,CTP和ATP对天门冬氨酸羧甲基转移酶的变构调节,(二)、嘧

12、啶核苷酸的补救合成,UMP磷酸核糖基转移酶Ura+PRPPUMP+PPi 尿嘧啶磷酸化酶Ura+1-P-RUridine+Pi 尿苷激酶 Uridine+ATPUMP+ADPCytosine不能与PRPP作用。,三、三磷酸核苷酸的合成,1.AMP生成ATP 核甘酸激酶AMP+ATP2ADP glycolytic enzymes or oxidative phosphorylationADPATP2.ATP通过核苷单磷酸激酶生成其他NDPATP+NMPADP+NDP3.NTP的生成 Ns diphosphate kinaseNTPD+NDPANDPD+NTPA,四、脱氧核糖核苷酸的合成,以核糖核

13、苷酸为原料,通过NDP还原酶将核糖分子还原为脱氧核糖。核糖核苷酸必须先行转化为二磷酸核苷酸(NDP)水平,再还原为脱氧核苷二磷酸水平。除需还原酶外,还需另两种氧还蛋白参与,即硫氧还蛋白(thioredoxin)和谷氧还蛋白(glutaredoxin)。产物为dNDP。进一步在激酶的作用下形成相应的dNTP。,(一)、脱氧核苷酸的合成,1、核糖核苷酸还原酶催化核糖核苷酸还原为脱氧核糖核苷酸,2、核糖核苷酸还原酶,Tyr,Fe2+,3、核糖核苷酸还原酶作用的可能机制,4、脱氧核苷酸合成机理,5、硫氧还蛋白,7、硫氧还蛋白还原酶,8、谷氧还蛋白还原酶,9、脱氧核苷三磷酸对核糖核苷酸还原酶的调节,(二)、dTMP的生物合成,存在两种不同途径:补救和全程合成补救途径以完成的Thy为原料,先生成dT,再形成dTMP。,1、胸苷酸的合成,2、dTMP的生物合成,全程合成途径以dUMP为原料N5,N10-methylene THFA为甲基供体,由dTMP synthetase 催化生成。,1、由胸苷酸合成酶和二氢叶酸还原酶催化的dUMP合成dTMP,2、二氢叶酸还原酶,3、胸苷酸合成酶与二氢叶酸还原酶,氟尿嘧啶,4、胸苷酸合成和叶酸代谢作为化学治疗的靶位点,5、dUMP到dTMP的转变及FdUMP的抑制,五、dNTP的生成,六、NAD的合成,七、NAD的合成过程,八、FAD的合成,返回,

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