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1、生物医学文献数据库PubMed,数据库简介,PubMed是美国国立医学图书馆(NLM) 的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统。收录1966年以来的包含医学、护理、牙科、兽医、健康保健系统及前临床科学的文献。这些数据来源于70多个国家和地区的4000多种生物医学期刊。数据类型:期刊论文、综述、以及会议论文等。,PUBMED检索途径,一、基本检索区二、辅助检索区三、个性化检索区,基本检索区,辅助检索区提供辅助检索功能,个性化检索区,PubMed主页,一、基本检索,可对任何具有实质意义的词都可以进行检索,如: 1.词语检索 自动匹配功能 2.精确检索 用“ ”进行强制短
2、语检索 3.截词检索 用通配符 ?,*检索 4.逻辑组配检索 AND OR NOT 5.作者检索 6.期刊检索,一、基本检索,1.词语检索,自动匹配转换.,自动匹配转换功能,主题词索引 作者索引 期刊索引,自动匹配转换过程.,2.精确检索,一、基本检索,强制将其作为一个词组检索,3.截词检索,一、基本检索,无限截词检索,3.截词检索,一、基本检索,有限截词检索,4.逻辑组配检索,一、基本检索,逻辑组配检索,(1)通过“limit”的”search by author”,5.作者检索,一、基本检索,一、基本检索,(2)用字段限定au检索,5.作者检索,一、基本检索,5.作者检索,(3)通过系统自
3、动匹配功能自动检索,一、基本检索,6.期刊检索,(1)用字段限定ta检索,一、基本检索,(2)通过系统自动匹配功能自动检索,6.期刊检索,一、基本检索,(3)通过“limit”的“search by journal”,6.期刊检索,一、基本检索,6.期刊检索,(4)通过“期刊数据库”检索,一、基本检索,6.期刊检索,一、基本检索,点击选中,发送至检索恇,6.期刊检索,一、基本检索,点击执行检索,6.期刊检索,一、基本检索,6.期刊检索,检索结果,二、辅助检索区,1.Limit (限定检索)2.Preview/index(预览/索引)3.History(检索史)4.Clipborard(剪贴板)
4、5.Detail(检索式详览),作者限定,添加作者姓名输入框,清除限定,期刊限定,作者姓名索引选词,多作者逻辑匹配选项,全文、免费全文、摘要限定,日期限定,1.Limit 对检索结果进行多重限定,出版日期限定,入库日期限定,研究对象人/动物限定,研究对象性别限定,语种限定,子文档限定,文献类型限定,研究对象年龄限定,检索字段限定,执行检索,清除所有限定,2.Previw/index(检索策略预览),浏览检索式改变检索式 (可用检索式编号#1 OR #2)浏览索引(index),检索预览,检索历史,索引加词检索,步骤3 索引选词,步骤4 确定与检索栏中检索提问的逻辑关系,步骤2 输入待选词,步骤
5、1 点击预览和索引,检索式回顾编辑检索式如#3 AND child,3.History(检索史),检索历史回顾,检索式,检索时间,检出篇数,检索式编号可替代检索式进行输入检索如:#5 AND #6,用于暂时存放选中的文献,以备集中显示、打印或存盘。,4.Clipboard(剪贴板),检索时间,4.Clipboard(剪贴板),点击剪贴板显示被剪贴的内容,5.Details (匹配过程),显示检索词转换匹配运算详细过程用途:转换、确定规范词如:liver cancer liver neoplasms修改检索策略,显示数据库自动匹配转换过程,检索词转换,显示用户输入的检索式,检索明细,5.Deta
6、ils (匹配过程),三、个性化检索,1.Mesh Database2.引文匹配器3.临床问题,三、个性化检索,1.Mesh Database确定规范检索词查看词义注释、树状结构表副主题词、扩展、主要主题词 例:欲查肾衰竭的饮食疗法相关文献?,MeSH Database 规范主题词数据库检索肾衰竭饮食疗法课题,1.输入检索词,3.点按规范词可获详细注解,2.执行浏览,主题词注释,可选副主题词,限定作为主要主题词匹配,不进行下位词扩检,该主题词所替代的非规范词形式,主题词树形结构表:显示该词的学科隶属关系,可选副主题词,选择检索,点击执行检索,检出结果更为专指,通过MeSH Database检索
7、的结果,其中4篇综述文献,2.引文匹配器(Citation Matcher):,Single citation matcher(单篇引文匹配器) 查找特定文献进行补缺,以查文献的准确信息。如查找:由Chang PY(taiwan yi xue hui za zhi ) 撰写、 1975 发表文献的其他著者Batch citation matcher(批量引文匹配器),输入待检刊名,输入待检第一著者,特定文献查找(已知文献第一著者,欲查其他信息如其他著者等),得出其他著者,用于核对批量文献信息,插入文件,输入EMAIL地址,输入已知文献信息,3.临床问题(Clinical Queries),专门
8、为临床医生设计的一种检索服务,Search by clinical study categoryFind systematic reviewsSpecial queries,3.临床问题(Clinical Queries),用于临床问题的检索,3.临床问题(Clinical Queries),输入检索词,检索设置,3.临床问题(Clinical Queries),检索结果,检索结果输出,显示检索结果保存检索结果保存检索策略打印检索结果,显示字段选择(Display),Abstract :来源期刊、标题、著者、著者地址、记录性质、文献类型、勘误、评论、PMID或UI、摘要。Summery:作者C
9、itation : 显示除上述内容外,加MeSH叙词、化学物质名称、资助项目号等字段。MEDLINE : (最完整,有标识符),显示格式选择,显示字段选择(Display),记录选择,单一记录:著者姓名所有记录:选定记录: 方框内打钩,输出格式选择(send to),选中题录(或文摘)后Text: 文本格式,用浏览器文件保存File : 文件格式保存Clipboad :暂存需下载记录,多项检索后一起保存。 最多允许存储500条,保留8小时。 Email: 通过邮件发送Other: 全文传递服务等申请,需帐号、收费,获取原文及相关资源,1.联机获取原文( free full text artic
10、le)2. link out3.向有关图书馆索要4.其他数据库资源(生物信息学等),文摘中的期刊图标链接,Linkout链接,点击获取原文,检索实例,1.哮喘的药物治疗(asthma, drug therapy) asthma/drug therapy2.阿司匹林治疗心肌梗死(aspirin, therapeutic use, myocardial infarction, drug therapy)aspirin/therapeutic use ANDmyocardial infarction/drug therapy,1.哮喘的药物治疗,选择MeSH Database输入检索词(单词、词组)
11、(不能输有运算符的语句如:asthma AND therapy),点击相关规范词,选择副主题词,选择检索,执行检索,检索结果题录:著者、篇名、刊名,2.阿司匹林治疗心肌梗死,首先,将概念切分成2个面:Aspirin/治疗应用心肌梗死/药物治疗然后,分别进行规范词选择检索,这里是第一个概念面检出的文献,18885条记录,第二个概念面进行规范词选择检索,这是第二个概念面检出的结果10112条记录,在检索历史中进行2个概念面的编辑检索(注意逻辑符AND大写),这是2个概念面逻辑AND的检索结果1003条记录,再进行限定检索,限定文献发表的时间,可以输入具体时间年、月、日,这是两个概念2005年-2006年逻辑AND检索结果77条记录,