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1、第十章DNA的生物合成(复制)DNA Replication,遗传信息传递的中心法则,DNA的生物合成:细胞内合成DNA的过程1、复制:以DNA作为模板指导的DNA合成,即将DNA携带的信息传至子代DNA。2、反转录:DNA合成也可以RNA为模扳指导合成作用,见于RNA病毒。3、修复合成:当各种因素引起DNA损伤时,损伤DNA可修复合成,校正错误,完成正确合成,以保持DNA结构 的稳定性和遗传信息的准确性。,第一节 DNA 复制 一、复制的特征(一)半保留复制-semiconservative replication 两个子代分子中各有一条链来自亲代,各有另一条新合成的链,这种复制方式叫半保留
2、复制。提问 DNA的合成是否为全保留复制方式?DNA的合成是否为混合式复制方式?DNA的合成是否为半保留复制方式?实验证据:1957年 M.Meselson 和F.W.Stahl用大 肠杆菌为材料,在含15N和14N的NH4cl中培养证实了半保留复制方式。(图11-1)Cscl梯度离心的结果。(图11-2),(二)复制的起始点与方向 亲代DNA开链,复制起始点呈叉型移动。(图11-3)1、复制起始点:DNA复制要从DNA分子的特定部位开始,此部位称复制起始点。(图11-3加)原核:仅含一个,约245 bp,特殊的重复序列。真核:多个起始点 例:酵母17号染色体含400个。2、复制方向:含三种机
3、制 2个起点,2个叉,各合一条链(腺病毒)。一个起点一个叉,同方向合成两条链(质粒ColEI一个起点2个叉,不同方向合成两条链,此为常见方式。(图11-4),(三)半不连续合成semidiscontinuous replication,在DNA复制过程中,一条链是连续合成的,而另一条链是不连续合成。体内仅含催化53合成的DNA酶。60年代冈琦片段的发现解决了这个问题:合成53前导链(leading strand)是连续的,方向与复制叉一致。合成3 5随从链时,方向与叉相反,合成不连续,各片段连成一条链。(图11-5),打结与解结环连与解环连(图11-6)(2)解链酶(helicase)-复制蛋
4、白rep 作用:ATP供能时,解开DNA双链。原核:编码解链酶的基因是dnaB,DnaB表示蛋白产物。前导链结合rep蛋白,随从链 结合解链酶II(图11-7)。(3)单链结合蛋白-single strand binding protein-SSB 作用:SSB与解开DNA单链结合,保护稳定DNA。与新复制DNA单链结合,以防降解。超螺旋DNA 拓扑酶 松弛 解链酶 解开双链 SSB 复制开始,2、引发(需引发酶及引发前体参与)(1)引物酶(primase)作用:以DNA为模板,自53合成RNA小片段,3末端为-OH,长短:十几到几十个核苷酸。原核:dnaG基因编码DnaG蛋白即引物酶。(2)
5、引发前体(preprimosome)由多种蛋白因子组成复合物。作用:合成RNA引物,沿随从链复制叉的行进方向移动,在不同部位,合成RNA引物。总结:合成RNA引物,在引物3-OH末段进行DNA片段合成。(表11-1)(二)DNA链的延长反应体系:DNA模板,DNA聚合酶,dNTP,引物,Mg2+离子,过程:引物3-OH dNTP ppi 引物-dNMP反应式:DNA+dNTP(DNA)n+1+ppi 反应机理:(图11-8加1)磷亲核攻击。真核与原核中DNA聚合酶(DNA polymorase-DNApol有几种类型,作用方式相同,但各具特性及功能。1、大肠杆菌DNA聚合酶(3种)(1)pol
6、:催化53的聚合作用,合成20个核苷酸即离开模板,填充空隙。有3 5外切酶活性,去除错误碱基的校对作用。有53外切酶活性,去除RNA引物及修正错误碱基。(图11-8加2)(2)pol:53 DNA合成及3 5外切,酶活性,体内功能不清楚。(3)pol:DNA链延长起主要作用,细菌中1000dNTP/秒加入。3 5外切酶活性,校对作用,与pol 配合错误率降至10-6。(图11-8)(图11-9)(表11-2)(4)DNA复制的保真性:遵守严格的碱基配对规律。聚合酶对碱基的选择功能。聚合酶对错误碱基的校读(proofread)作用。2、真核生物DNA pol特性与大肠杆菌相似,共五种:(表11-
7、3)pol:催化前导链及随从连的合成,需增殖细胞核抗原蛋白PCNA(proliferatating cell nucleus antigen-PCNA)的参与。,Pol:与引发酶配合,参与随从链的合成。RFA(replication factor A):DNA延长中RFA与单链结合起到SSB的作用。(三)终止 连接酶(ligase):作用-使相邻的DNA片段,以3 5 磷酸二酯键相连,需ATP。反应原理:(图11-10)P5-DNA E-AMP E+ATP E-AMP中间体 E-AMP-5DNA DNA-3-op-5-DNA Ho-3-DNA 前导链是连续合成的,随从链在连接酶作用下连成一条链
8、。拓扑酶DNA复制后 DNA超螺旋装配成染色体(图11-11),三、真核生物复制的特点1、复制速度:是原核的1/10,但复制起始点多。2、引物和冈琦片段小于原核,引物为10个,片段100200;原核引物十几几十,片段10002000。3、复制需DNA pol及多种因子参加,pol pol 在核内起主要作用。4、pol 为线粒体复制酶。5、DNA复制位于细胞周期的S期。第二节 反转录作用(reverse transcription)RNA指导下的DNA合成作用,以RNA为模板在反转录酶催化下,由dNTP聚合成DNA的作用,新生DNA分子存有RNA基因组的信息。体系 RNA模板、反转录酶、引物tR
9、NA、dNTP Zn2+,一、反转录酶过程背景:1970年Temin等人自Rous肉瘤病毒(RSV)中发现一种酶,此酶催化RNA合成DNA,合成方向53。反转录酶:作用:1、RNA指导的DNA合成。2、RNA水解反应。3、DNA指导的DNA合成。特点:无外切酶活性,转录错误率高2X104。图11-12二、反转录酶病毒(retrovirus)性质:一类RNA病毒,含反转录酶,因致癌又称RNA肿瘤病毒。如HIV-人类免疫缺陷病毒,可引起AIDS。1、组成:核心RNA,蛋白外壳。,2、病毒生活周期:早、晚两期早期:进入细胞后放出病毒RNA DNA整合进宿主染色体。晚期:转录和翻译。例1、RSV基因结
10、构图,全长10kb(图11-13)1、gag:编码四种病毒核心结构蛋白。2、pol:编码反转录酶。3、env:编码外壳蛋白。4、src:编码的蛋白引起细胞转化。5、LTR:调节表达序列。例2、HIV:感染人T4淋巴细胞,使病人丧失免疫能力,死于感染。基因结构含gag、pol、env和两个LTR,功能同RSV。,不同:另含Sor、Trs、tat及3orf,这四种基因变异速度快,给疫苗研制带来困难。三、意义1、补充了中心法则。2、加深了对RNA病毒致癌、致病的认识。3、利用反转录酶,进行基因操作,制备cDNA。,四端粒酶(Telomerase)真核线性染色体末端叫端区,含重复序列TTTGGG。组成
11、:RNA(含端区重复序列约1.5拷贝)蛋白质作用:可作为反转录酶,以含端区DNA重复序列拷贝的RNA作模板,合成端区DNA片段。(图11-14)生物学意义:1、合成端区,保证染色体复制的完整性。2、保护DNA末段降解及相互融合。第三节 DNA的修复合成意义:DNA复制中的错误若保留下来,在体细胞将影响功能;在性细胞将影响后代,体内的修复系统保证了DNA复制的高度精确性。,一、突变的意义1、进化、分化的分子基础。2、基因型改变。(表型不变)3、致死性的突变。(消灭病原体)4、某些疾病的发病基础。二、突变的因素及类型1、DNA损伤因素:物理-紫外线 化学-诱变剂 2、DNA损伤类型:(表11-4)
12、(1)环丁基二聚体:相邻dTTP形成二聚体,干扰DNA合成。大肠杆菌、酵母含光化酶,可切开环丁基环,反应需要光。(2)脱嘌呤作用:正常体内即有碱基与核糖的糖苷键断裂嘌呤脱落。,(3)脱氨基作用:常发生在嘧啶。例如:胞嘧啶脱氨基 尿嘧啶 使C:G改为U:G.(图11-15)三、DNA损伤修复机制1、光修复:略2、切除修复:先切除DNA损伤序列,再合成补充切除的片段。参与的因子 UvrA、UvrB、UvrC(图11-16)3、重组修复:切除错误片段,自另一条复制好的链中找相应片段补充。反应需要RecA等蛋白参与。4、SOS修复:DNA损伤后,应急诱导产生的修复作用称SOS修复,此系统由十几个修复蛋
13、白组成。调控蛋白LexA参与此系统的启动。四、真核生物DNA损伤的修复,1、DNA修复缺陷疾病。(表11-5)2、酵母的紫外损伤修复系:RAD(radiation sensitive,RAD)基因:(1)rad 3基因:编码解链酶(2)rad10基因:编码蛋白与大肠杆菌UvrA及UvrC 蛋白的序列相似,提示与大肠杆菌DNA修复机制相似。,图 11-2 CsCl梯度离心,图 11-3 复制叉,11-3-1 DNA复制起始点,图 11-6 拓扑酶I及II的作用特点,图 11-7 rep解链酶,图 11-8-1 DNA Pol 催化的链延长反应,DNAPol肽链上具有三核酶活性区,图 11-8 DNA Pol III的二聚体作用,图 11-9 DNA Pol III催化前导链与随从链的合成,图11-6 大肠杆菌中DNA聚合酶,表 11-3 真核生物DNA聚合酶,图 11-10 连接反应,图 11-11复制全程,图 11-13 RSV与HIV基因图,图 11-14 端粒酶,表 11-5 与DNA修复缺陷有关的疾病,图 11-15 损伤机制,