转录调控的信息学分析课件.ppt

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1、转录调控的信息学分析,31、园日涉以成趣,门虽设而常关。32、鼓腹无所思。朝起暮归眠。33、倾壶绝余沥,窥灶不见烟。34、春秋满四泽,夏云多奇峰,秋月扬明辉,冬岭秀孤松。35、丈夫志四海,我愿不知老。,转录调控的信息学分析转录调控的信息学分析31、园日涉以成趣,门虽设而常关。32、鼓腹无所思。朝起暮归眠。33、倾壶绝余沥,窥灶不见烟。34、春秋满四泽,夏云多奇峰,秋月扬明辉,冬岭秀孤松。35、丈夫志四海,我愿不知老。第十一章转录调控的信息学分析Bioinformatic Analysis ofTranscriptional Regulation汕头大学医学院许丽艳学习提纲重点:转录因子结合位点

2、的识别及其定位的基本概念和表示方法转录因子结合位点识别的操作步骤和相关算法的使用转录因子结合位点定位预测软件的使用,摘要:细节体现本质。在语文教学的过程中注意到细节,更能增强语文教学的有效性;看上去不起眼的细节,反映的是老师对学生心理特点的深刻把握,是对学生人格发自内心的尊重,同时也反映了老师丰富的教育素养和高超的教学艺术。细节是人们生活必须注意的问题,刘备对他的儿子讲过:“勿以善小而不为,勿以恶小而为之”。细节虽小,却能透射出教育的大理念、大智慧,所以,成功的教学必定离不开精彩的细节。同样的道理,作为语文教师,在课堂教学中,如果也能注意到细节,则会起到事半功倍的效果。教师在教学中的每一个细节

3、,一个提问,一句话,一个举动,往往会直接影响到学生的学习效果。因此,在课堂教学中,教师注重并且提高处理教学细节的能力,是不容忽视的。有一位老师就犯了一个小错误。在朗读前,教师提出了要求:“读准字音,读通句子,其他小朋友仔细倾听。”而教师在干什么呢?他在低头玩着他的智能手机。或许这只是个细节,但我们可以看出教师在无意间表现出来的行为却表明自己并没有在认真倾听。这样的细节在现在的课堂里并不少见:学生读错了,教师没有发现;学生说话出现了明显的语病也不指出;学生答不到点子上,教师就打断.凡此种种细节,都表明我们没有倾听,不愿倾听,不重视自己的微小行为。因此,教师要注意自己的小细节,你的小小的平静藏着的

4、是学生对你产生的欣赏,从细微之中改变学生对学习的主动性和积极性。要了解你的学生,关心你的学生,你就会体谅学生的苦衷;你就会更加善良,就会被学生从心底里接受,你就握着一把钥匙,一把让学生学业成功,也让你自己事业成功的钥匙。前不久,班上有一位学生的父亲从三楼的房子上摔下来,半身残废。这位学生在班上的表现突然一下子沉寂了,老师对这个细节观察在心中。经过仔细询问才知道事情的缘由。于是,组织班上的学生对这位学生进行物质上的一些帮助和精神上的一些抚慰。一个星期之后,这位学生又开心起来,焕发活泼的面貌。就像一株蔫了的花朵又开始抬起了自信的头。关注每一位学生,满足并提升每一位学生的发展需要。用细微的爱去唤起每

5、一位学生心底的学习热情,这是教师的重要责任。老师们,请把主要的地方重复一遍,这是细节;在快乐的地方露出微笑,这是细节;在愤怒的地方情绪高亢,这是细节;在悲伤的地方变得低沉,这是细节。教师的语言艺术修养在教学中占有很重要的地位,恰当的语言能使其教学平地生辉,具有磁铁般的吸引力,能起到较好的教学效果。多看学生的闪光点经验表明:在批评中长大的学生,会养成自卑、指责、挑剔的习性;在表扬中长大的学生,则会养成自信、欣赏、合作的习性。作为小学语文教师,必须学会用放大镜看学生的优点,从细微的地方发现学生的进步之处。在充满宽容和鼓励的气氛中,让我们的学生少一点自卑,多一些自信;少一点指责,多一些欣赏;少一点挑

6、剔,多一些合作,从而走向人格独立、身心健康的理想彼岸。吴波涛在我执教的班就读。一天下午,学校大课间时间。我利用这间隙去了解学生的课间活动情况,吴波涛在教室里大大吵闹,我首先当机立断制止打人行为,而后并没有批评喝斥,让他立刻到我办公室。自己冷静下来,理智地处理问题。在处理过程中,我发现这个学生的一些良好品质:能按时到指定地点是一种良好品质;能听从制止,过失并未发展也是良好品质;承认错误更是良好品质,并主动承认了错误。我在教育学生的过程中,积极地去发现学生的细小的优良的行为,从中去教育学生,赏识学生,鼓励他们向着好的方向发展和提高。语文老师要善于挖掘学生的闪光点,这个挖掘的过程就是关注学生细节的过

7、程。在细节上多鼓励表扬他们,将他们融于班集体这个温暖的大家庭中,感受到大家庭的温暖,从而使其正确地认识自己,努力学习。不断的小事情上,小问题上发现和积累,慢慢成长,慢慢成熟。毕业祝福明天,你们就要毕业了!亲爱的老师想跟你们说说心里话。“长亭外,古道边,芳草碧连天”当离别的钟声在校园敲响时,耳畔再次响起这首送别歌。亲爱的同学们,校园里的风景依然,而你们却不再成为其中的最美。在钟声里,在歌声中,你们将告别母校,踏上新的征程。挥手之际,想要对你们的叮咛太多,期望太切,老师愿你们携手上路,亦祝你们一路顺风。坚持,永不言败。进入中学,课程门类多了,学习时间长了,自由空间少了,这些都可能会让你无所适从。逆

8、水行舟,不进则退。意志薄弱的会选择退缩,只有坚持到底方能为自己迎来一片艳阳天。还记得一年级你们入学时,那一张张可爱的小脸犹在眼前,如今你们已成长为一个个有着自己思想,有着独立个性的少年。学校举行运动会,面对强势的竞争对手,你们个个不甘落后,每个人都有一股不服输的劲儿。努力和汗水,成就了我们班一个个集体冠军的辉煌。欢呼,跳跃,拥抱,我们享受到了坚持带给我们的莫大快乐。所以,同学们,无论遇到多大的挑战,任何时候都不要轻言放弃,成功就一定会垂青于你。诚信,坦荡做人。先成人,后成材,尽管已无数次地对你们说过,到了分别的时候,还是会想到它。在学习中,在生活中,诚信是我们的做人之本。也许,你聪慧不及别人,

9、也许,你才干稍有逊色,但是,你待人真诚,虚怀若谷,你会拥有许多朋友,这是世界上无可取代的财富。想想打破花瓶的列宁,想想可敬的哈尔威船长,相信你们会做得更好。同学们,在六年的学习中,我们共同走进了一个多姿多彩的世界,领略了世界上最旖旎的风光。在探究中我们尽情沐浴着学习的快乐,在合作中我们共同享受着收获的惬意。如今,号角已吹响,远方在召唤,你们已经整装待发,将要出海远航,请记住,你们走出了校园,却走不出老师们的牵挂,走出校园,你们会发现,前面的天空更加灿烂。希望你们在未来的日子里,继续努力,不断进取,将广阔的世界尽收你们更广阔的心中。永远为你们祝福的郭老师2012年5月毕业骊歌在这充满离愁别绪的日

10、子里,最后,有一首诗献给所有的同学们:明天,我们就要踏上新的旅途,哪怕友情也不能阻断我们的脚步。不能判断大家再相逢的百分数,回忆将成为我们共享的全部。把回忆包上保鲜膜,并埋在心底最深处。我们要相信,它将青春永驻。曾经,我们走过风雨,彩虹的美丽我们一起目睹。将来,没有了你们的陪伴,一定会有一段更坎坷的路。六个春夏等不及回顾,毕业居然来得如此仓促。来吧,我们一起祈福:让每个人的未来都畅通无阻!,第十一章转录调控的信息学分析Bioinformatic Analysis ofTranscriptional Regulation汕头大学医学院许丽艳,学习提纲重点:转录因子结合位点的识别及其定位的基本概念

11、和表示方法转录因子结合位点识别的操作步骤和相关算法的使用转录因子结合位点定位预测软件的使用,学习提纲难点转录因子结合位点识别的操作步骤和相关算法的使用熟悉:转录调控相关数据库,第一节引Introduction基因转录调节的基本模式ansarIgenegene regulatory proteinsfactors RNA polymerase llregulatoryproteinscis-regulatorypromoterthe gene control region for gene X,基因转录调节机制的研究方法实验方法荧光素酶报告基因(luciferase report gene)凝胶

12、迁移(electrophoreticmobility shift assays染色质免疫沉淀(ChP)DNase足迹法(DNase footprinting)信息学分析,第二节转录调控的高通量实验测定High-throughput Techniques inTranscriptional Regulation AnalysisChIP技术创立者20世纪80年代末Alexander Varshavsky等人(ce.1988,53(6):937-947),基本实验过程:甲醛交联,稳定蛋白质DNA复合物裂解细胞,分离蛋白质-DNA复合物加入特异性抗体,沉淀蛋白质DNA复合物去交联,纯化DNA应用PC

13、R技术,特异性扩增目的DNA片段,Cross imk howells OooNsoluble chmplify DNAImmunoprecipitateand LabchIP-chipimminocomplexes oPCRChIP PCR,特点针对某一特定候选转录因子,是否特异性结合于所调节的靶基因某一预定区域内,如启动子区,进行检测。对同一DNA底物,可以运用多种不同的抗体,分别进行免疫共沉淀,以确定多种结合蛋白在同一染色质片段上的结合。,ChIP-chip技术创立者:2000年,Richard A.Young等人(Science.2000,290(5500):2306-2309)特点:ChIP和芯片技术的联合运用全基因组范围内的定位分析靶基因群的高通量分析,36、自己的鞋子,自己知道紧在哪里。西班牙37、我们唯一不会改正的缺点是软弱。拉罗什福科38、我这个人走得很慢,但是我从不后退。亚伯拉罕林肯39、勿问成功的秘诀为何,且尽全力做你应该做的事吧。美华纳40、学而不思则罔,思而不学则殆。孔子,xiexie!,谢谢!,

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