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1、医学文献检索,文献检索基础 李小平 医学文献检索教研室：,教 学 任 务教 学 目 的教 学 内 容 考 核 方 式,问题一：获取信息的主要途径是什么?图书？报纸？期刊？广播、电视？网络(电子邮件、搜索引擎、MSN、QQ等)？,问题二 你有过以下情况吗？1.信息过量，无法一一阅读；2.信息质量存在问题(垃圾信息太多,有用的信息获取不到)。,问题三：怎样判断你具备了信息素养？具有信息素养的人能够知道什么时候需要信息，能够有效地获取、评价和利用所需要的信息。美国图书馆协会ALA,1989,教学目的和任务,方法学：“授人以鱼，不如授人以渔”提高“信息素养”适应现代信息环境培养信息管理的能力,教学内容
2、文献检索的基本知识电子资源的介绍：中国生物医学文献服务系统（CBM）中国知识基础设施工程（CNKI）贵州省数字图书馆Pubmed西文生物医学期刊文献数据库（FMJS）、OVID、BMJ、OUP案例分析（数据库功能剖析）,考核方式,考试成绩（70%）+平时成绩（30%）,第一节 计算机检索与数据库第二节 如何制定检索式,第一节 计算机检索与数据库,（一）计算机检索的定义（二）数据库的结构与类型（三）检索原理与检索语言（四）计算机检索途径（五）计算机检索步骤,（一）计算机检索的定义,就是通过计算机及与其相连的通讯设备和线路在存储文献的数据库中查找信息的过程。,（二）数据库的结构与类型,1、数据库的
3、结构文档记录字段文档（file）：数据库中一部分记录的有序集合（顺排文档，倒排文档）记录（record）：描述原始信息的外部特征和内部特 征。数据库中一条记录代表一篇文献字段（field）：比记录更小的单位，是组成记录的 数据项目(如TI、AU、SO、AB）,例:CBM中的一条完整的记录,2、数据库的类型,（1）书目型数据库 是二次文献数据库，主要存贮相关主题领域的各类文献资料的书目信息，包括机读版的文摘、题录、目录、索引等。如：EM、IM、CA、BA,（2）全文型数据库(Full-text atabase)提供原始文献全文的浏览下载的数据库。如国内：CJFD、万方数字资源、维普全文数据库、超
4、星数字图书馆 国外：BMJ、OVID、OUP,（3）事实型数据库（Fact Database）:提供有关事物、人物、机构等方面的事 实性信息。如：Clinical Trials(临床试验数 据库)、中国中药数据库、疾病诊疗数据库、中国医药产品数据库、中药成方制剂标准数 据库,（4）数据型数据库（Numeric Database）提供数值性信息，包括各种统计数据、科学实验数据、各种测量数据等。如：WHOSIS和美国疾病控制与预防中心（CDC）的Data and Statistics等。可以获取死亡原因统计、卫生从业人员统计、人口统计、HIV/AIDS信息与数据统计数据和资料等统计数据,（5）多媒
5、体数据库(Multimedia Database):是数据库技术与多媒体技术相结合的产物，是文本、图像、声频、视频等多媒体信息的集合。如超星数字图书馆的学术视频数据库、网上报告厅、CNKI的图片数据库、美国的可视人、可视脑计划,1、文献检索 p1广义的定义：包括信息的存储和检索两个过程(Storage and Retrieval)。狭义的定义：是指根据用户的需求，利用检索工具或检索系统，查找出符合用户特定需要信息的过程。,（三）文献检索原理及检索语言,2、检索原理 原理：文献检索标识和存储标识的匹配过程,何为检索语言？,3、检索语言Retrieval language P9,1）定义：即情报检
6、索语言，是根据信息检索的需要创造出来的一种人工语言，是在文献检索领域中用来描述文献特征和表达信息检索提问的一种专用语言。,2）检索语言的种类：分类语言主题语言代码语言,分类语言(classification language)：,是直接体现知识分类的等级制概念标识系统 如杜威十进制分类号、国际十进制分类号、美国国会图书馆分类号、中图分类号（既国内普遍采用中国图书馆图书分类法）、人大法和科图法等。,中国图书馆图书分类法,体现学科的系统性，反映事物的从属、派生关系，并从上至下、从总体到局部层层划分，展开，是一种等级分明的语言。分为五大部类，22个大类，分别用22个大写字母表示（其中除掉L、M、W、
7、Y）。,中图法22大类是基础，每一类下根据学科内容层层细分为二级、三级、四级类目。,R（医药卫生）一级类目,R 1 R 2 R3 R4R9 二级类目 预防医学、卫生学 中国医学 基础医学 临床医学,R31 R32 R33 三级类目医用一般科学 人体形态学 人体生理学,R321 R322 四级类目 人体胚胎学 人体解剖学,主题语言(subject language)按照是否规范化分为：关键词主题词,关键词：从文献篇名、文摘、全文中抽取出来能表达文献主题内容（论述的对象、观点、见解和结论）的词语。特点:未经规范处理的自然语言;优点：能及时反映新观点，新方法，新发现及 新术语；缺点：用词不统一，易漏
8、检。,主题词：在标引和检索文献时用来表达文献 主题的规范化的词或词组。对同一 概念的同义词、近义词进行“规 范”，以确保词语和概念的一一对 应。特点：规范化、统一化优点：提高查全率和查准率 便于调整检索范围 能限定文献的主题概念,举例：,AIDS艾滋病爱滋病HIV感染,获得性免疫缺陷综合征,规范化处理,主题词,关键词,代码语言(code language)：,对所论述事物某一方面的特征，用代码加以描述和标引。（如化学物质的分子式、结构图；文献登记号；基因符号；专利号；ISBN、ISSN、CN号等）,（四）计算机检索途径,自由词检索主题词检索题名检索著者检索机构检索刊名检索默认检索分类检索引文检
9、索,分析检索课题,确定检索词,选择数据库,构筑检索式上机检索,浏览结果,输出结果,否,是,（五）检索步骤,第二节 如何制定检索式,（一）检索式与运算符的定义（二）运算符类型及其应用（三）检索效果评价,（一）检索式与运算符的定义,检索式：用运算符将多个检索词连接起来 构成的式子称成为检索式。运算符：用来表达词与词之间的逻辑关系 和限定关系的符号。,（二）运算符类型及其应用,1、布尔逻辑运算符:boolean operator 2、位置符:position operator3、截词符:truncation node4、限定符:limit incantations,布尔逻辑算符，由英国数学家乔治布尔
10、提出；表达检索词之间的逻辑关系；包括：AND、OR、NOT。,1、布尔逻辑运算符：,1、布尔算符 AND 的含义及应用,（1）含义：AND又称为逻辑“与”，表示“相交”关系，用于缩小检索范围（查准率）,（2）应用形式：A AND B,检索词：干扰素 白血病 词间关系：同时出现/逻辑与/AND 检索式为：干扰素 AND 白血病,例1：查找“干扰素治疗白血病”的有关文献,能直接用“干扰素治疗白血病”吗？,2）布尔算符 OR 的含义及应用,含义：“OR”又称为逻辑“或”，表示“并列”关系，扩大检索范围（查全率）,应用 表示形式：A OR B,A,B,例如:查找有关艾滋病的文献 检索词为：艾滋病 爱滋
11、病 AIDS 获得性免疫缺陷综合征 词间关系：并列/或者/OR 检索式为：艾滋病 OR 爱滋病 OR AIDS OR 获得 性免疫缺陷综合征,CBM检索结果,用OR 连接的多个相同主题概念的检索词的检索结果最多，查全率最高。,总结：提高查全率从以下几个方面考虑,全称、简称及缩写同时使用；规范词（主题词）兼顾自由词（关键词）；查上位词时勿忘下位词；注意外来词译写变化；采用多途径检索。,例2：用CBM查找乳腺肿瘤的检索结果,例3：用PUBMED检索近乳腺肿瘤的检索结果,例4：用CBM查找脑血管疾病的有关文献,例5 用CBM查找拉米夫定的有关文献,例6 免疫性疾病的文献（多途径检索）,主题词表检索、
12、分类词表检索、基本检索,含义：NOT又称为逻辑“非”，用于 排除不需要的检索结果 应用 表示形式：A NOT B,3、布尔算符 NOT 的含义及表示形式,A,B,思考题：白血病非放射性治疗,检索词为：白血病 非放射性治疗词间关系：AND检索式为：白血病 AND 非放射治疗,没有？可能吗？怎么办？,思考题：白血病非放射性治疗,检索词为：白血病 放射性治疗词间关系：AND检索式为：白血病 AND 治疗 NOT 放射治疗,注意事项,1、运算符前后的检索词的位置能否交换 在检索式中只有AND、OR前后的检索 标识可以交换；检索式中有NOT时前后检索词不能交换。,注意事项,2、运算符的顺序 AND、OR
13、、NOT在同一个检索式中 出现时，其运算顺序为：NOTANDOR，如果需改变运算顺序，应将先运算的部 分加上括号。,注意事项,3、运算符的输入状态必须在中文 的半角或英文；布尔逻辑算符 前后要空格。,2、位置符,作用：表示两个检索词之间位置的检索符。用于 缩小检索范围包括：NEARWITH,1、表示前后两个检索词出现在同一个句子中；2、near后加上数字时，表示两个检索词之间 所间隔单词的数量为0至数字-1个,要求左右两个检索词出现在同一个字段中。,应用举例（一）,NEAR形式：A NEAR（n）B实例：检索乳腺肿瘤的检索式可简化为：breast near1(cancer or neoplas
14、ms or Tumor or sarcoma or carcinoma),应用举例（二）,WITH形式：A WITH B实例：Leukemia with complications,3、截词符,作用：表示不确定字符的检索运算符，用于扩大检索范围包括：“*”(%、$)无限截词符“？”有限截词符（通配符),1）无限截词符的应用,中间有多个修饰性词语的一组名词 词组、短语 后缀形式多样化及复合词,急性*胰腺炎 可表示:急性胰腺炎、急性重症胰腺炎、急性胆源性胰腺炎、急性出血坏死型胰腺炎、急性出血性胰腺炎等 截词符前后相同，截词位置不同的多个词的并列关系。,急性%胰腺炎可检索出急性胰腺炎、急性重症胰腺炎
15、、急性胆源性胰腺炎、急性出血坏死型胰腺炎等,检索结果（CBM）,急性%胰腺炎的检索结果页,immun*该检索式可表示：immune、immunity、immunology、immunohistochemical 等所有前面为immun，后面形式多样 化的单词及复合词的并列关系。,使用MEDLINE（06/7-06/10）查找免疫相关的文献结果,2）有限截词符的应用,外文词汇翻译时有同音异形字的情况 外文词汇由于发音不同导致翻译不同 外文数据库检索时有的词有单复数的表 达形式 外文数据库检索时有的词英美拼写有个 别差异时,Lamivudine：拉米夫定、拉米呋定、拉米福定、拉米扶定、拉米氟定,A
16、lzheimer Disease：阿尔茨海默病、阿尔兹海默病、阿尔次海默病,Protein？：可检出含Proteins 和Protein的文章 注：“?”必须在半角或英文状态下输入,思考？,例如：股骨?骨折：可检出含股骨头骨折 和股骨颈骨折、股骨干骨折、股骨 髁骨折的文章。,还可以扩大检索范围吗？,使用无限截词符,4、限定符,作用：对特定字段的限定检索，包括：“in”、“=”、“”、“.”等表现形式：检索标识 限定符 字段名 实例：PY=2003；shi j s in au；shi j sau shi j s.au,总结：提高查准率从以下几个方面着手,检索结果多时采用“AND”缩小检索范围检索
17、下位词时不使用上位词使用“NOT”将不需要的检索标识排除将“AND”改为限制词语间位置关系的位置符使用限定符限定检索标识所在字段,（三）检索效果评价,1、评价标准 查全率、查准率、漏检率、误检率 查全率P=a/（a+c）100%查准率R=a/（a+b）100%（a：检出的相关文献量；b：检出的非相关文献量；c：系统中未检出的相关文献）,2、影响检索效果的因素,1）影响查全率的因素 文献存储：收录不全；词汇缺乏控制和专指；词表结构不完整；标引不详或遗漏等信息检索：策略简单；逻辑组配不当；途径和方法太少；业务不熟；系统不具备截词功能等。,2）影响查准率的因素,检索词准确性不够；组配不严密或错 误；选词及词间关系不正确；检索式专指不够；面宽于检索要求；系统不具备逻辑非；截词位置不当等。,请写出下列各题的检索式维生素C结合维生素E在美容方面的应用伤寒的诊断、治疗的文献霍奇金氏病的发病机制上肢骨的解剖艾滋病疫苗的制备,思考题,Thank You!,
