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1、肿瘤的基因诊断,温州医学院检验医学院温州医学院附一医检验科陶 志 华,肿瘤是细胞的异常增生 有结构、功能和代谢的异常 具有超过正常细胞增生能力,肿瘤概念,在细胞内核酸代谢的异常:肿瘤细胞和正常细胞的核酸代谢有显著的不同;不同类型肿瘤细胞的核酸代谢也有较大的差异;相同恶性程度肿瘤细胞的核酸代谢也有所不同。,肿瘤是一种分子病,癌基因的激活 抑癌基因的失活(或缺失),肿瘤发生机理,原癌基因癌基因病毒癌基因 肿瘤抑制基因 肿瘤转移相关基因 肿瘤耐药基因等,肿瘤相关基因,细胞基因组中具有能够使正常细胞发生恶性转化的基因 癌基因在正常细胞的基因组中 存在 不表达状态 表达水平不足以引起细胞的恶性转化,癌基
2、因:,表1细胞癌基因按其产物定位和功能分类,能够抑制细胞恶性转化或抑制细胞异常 增殖的基因 目前研究较多的有p53基因、pRB基因、p16蛋白、p15蛋白、p21等。,抑癌基因,表2 已确定的几种抑癌基因,野生型P53生物学活性,当DNA损伤的时候,P53基因就明显表达使细胞在G1期生长阻滞,促使细胞凋亡。抑制肿瘤细胞生长保持DNA完整性,包括肿瘤转移促进基因或肿瘤转移抑制 基因。,肿瘤转移相关基因,其表达使肿瘤细胞对药物产生耐药的基因。,肿瘤耐药基因,血小板衍生生长因子(PDGF)表皮生长因子(EGF)VGF基因等,肿瘤生长因子,肿瘤的基因诊断,肿瘤的基因诊断目前主要集中在以下几个方面:肿瘤
3、转移标志物肿瘤抗药基因突变的癌基因肿瘤相关的病毒基因,表3 肿瘤基因诊断的分子标志及其应用,可分为四大类 组织特异性基因标志 肿瘤特异性基因标志 血管生成因子 其它与肿瘤转移相关的分子及基质蛋白酶及其抑制剂,肿瘤转移基因标志物,组织特异性基因标志物,指肿瘤组织和/或起源正常组织所特有,在淋巴组织和血细胞中不存在的。如角质蛋白家族(CK)mRNA、粘蛋白基因、表皮生长因子受体(EGFR)mRNA等。.,肿瘤特异性基因标志物,存在于肿瘤及其起源的正常细胞中,不存在于其他细胞。如CEA mRNA、AFP mRNA、PSA mRNA等。,血管生成因子,如血管内皮细胞生长因子(VEGF)等。,肿瘤抗药基
4、因,对于肿瘤化疗效果及预后进行推测;还可以将肿瘤抗药基因导人骨髓细胞,特别是骨髓干细胞中,提高机体对于抗肿瘤化疗药物的耐受程度,如此可以加大抗肿瘤化疗药物的使用剂量,提高抗肿瘤化疗的治疗效果。,肿瘤抗药基因,多药抗性基因一l(MDR1),其编码的蛋白如P-糖蛋白起排流泵作用。.其它一些与细胞内药物代谢有关的基因也可以看作是肿瘤抗药基因,如谷胱苷肽S一转移酶(GST),可使机体解毒功能增强;癌基因 bcl-2的表达可抑制肿瘤化疗药物所诱导的肿瘤细胞程序化死亡等。.,突变的癌基因,癌基因的突变是癌基因激活的重要方式和途径。除了见到较大范围片段的缺失或插人以及染色体转位之外,大多数情况下,都是少数核
5、苷酸或单个碱基的突变。.癌基因点突变的检测 单链构象多态性(SSCP)检测技术等.,肿瘤相关的病毒基因,EB病毒(EBV)人乳头瘤病毒(HPV)乙型肝炎病毒(HBV)、丙型肝炎病毒(HCV)感染,对于这些肿瘤组织细胞中相关病毒基因及其编 码产物的检测,可以作为这些类型的肿瘤诊断的标志。,致瘤病毒引起的恶性转化作用引起了人们极大的关注,肿瘤基因诊断的常用方法,PCR、RT-PCRSouthern blot杂交技术、Northern blot杂交技术基因芯片基因测序。,肿瘤基因的分子诊断意义,1.肿瘤的早期诊断和筛选2.肿瘤疗效监测 3.肿瘤的预后判断 4.肿瘤微转移检测,肿瘤基因检测在肿瘤微转移
6、检测中应用举例,前列腺癌特异性基因DD3PCA3,DD3PCA3是一种非编码RNA的基因,定位于9q2122染色体。它为前列腺癌特异性基因之一,DD3PCA3 mRNA仅在前列腺癌细胞中表达,而在其它正常组织和癌组织以及细胞系中均不表达。,DD3 mRNA 14外显子扩增结果,M:50bp DNA Ladder;1:LNCaP阳性对照;2 3:PCa;4:PIN;5 6:BPH;7:直肠癌;8:直肠癌癌旁;9:结肠癌;10:结肠癌癌旁;11:乳腺癌;12:甲状腺癌;13:胃癌;14:胃癌癌旁;15:膀胱癌;16:软组织纤维肉瘤;17:转移性腺癌;18:淋巴结转移性黑色素瘤;19:卵巢成熟性畸胎
7、瘤;20:正常肝脏;21:胆囊;22:胎盘;23:试剂空白。,DD3 mRNA 13外显子扩增结果,M:50bp DNA Ladder;1:LNCaP阳性对照;2 3:PCa;4:PIN;5 6:BPH;7:直肠癌;8:直肠癌癌旁;9:结肠癌;10:结肠癌癌旁;11:乳腺癌;12:甲状腺癌;13:胃癌;14:胃癌癌旁;15:膀胱癌;16:软组织纤维肉瘤;17:转移性腺癌;18:淋巴结转移性黑色素瘤;19:卵巢成熟性畸胎瘤;20:正常肝脏;21:胆囊;22:胎盘;23:试剂空白。,DD3 mRNA 34外显子扩增结果,M:50bp DNA Ladder;1:LNCaP阳性对照;2 3:PCa;4
8、:PIN;5 6:BPH;7:直肠癌;8:直肠癌癌旁;9:结肠癌;10:结肠癌癌旁;11:乳腺癌;12:甲状腺癌;13:胃癌;14:胃癌癌旁;15:膀胱癌;16:软组织纤维肉瘤;17:转移性腺癌;18:淋巴结转移性黑色素瘤;19:卵巢成熟性畸胎瘤;20:正常肝脏;21:胆囊;22:胎盘;23:试剂空白。,前列腺组织和其他肿瘤组织及癌旁组织DD3 mRNA检测结果,M:50bp DNA标准;1:LNCaP阳性对照;2:BPH;3:健康男性志愿者;410为PCa;11为试剂空白。,外周血DD3 mRNA的RT-PCR扩增电泳图,RT-PCR检测结果,44例PCa组中13例可见DD3 mRNA阳性结
9、果(其中B期、C期及D期分别有为0例、2例,11例)。30例BPH患者和18名健康男性志愿者标本中均未检出DD3 mRNA。,外周血DD3 mRNA的巢式RT-PCR扩增电泳图,M:50bp DNA分子量标准;1:LNCaP阳性对照;2:阴性对照(女性);3:BPH患者;4:健康男性志愿者;58:未治疗的PCa;9:试剂空白,巢式RT-PCR检测结果,44例PCa组中21例可见DD3 mRNA阳性结果(其中B期、C期、D期分别有1例、5例、15例)30例BPH患者和18名健康男性志愿者均未见阳性结果,两种方法对PCa患者外周血DD3 mRNA检出率比较,外周血DD3 mRNA巢式RT-PCR方法的灵敏度,M:50bp DNA分子量标准;16:依次为105、104、103、102、101、1个LNCaP细胞/ml全血;7:阴性对照;8:试剂空白,不同前列腺疾病患者其外周血DD3 mRNA检出率比较,巢式RT-PCR,PCa不同临床分期未治疗组和治疗组DD3 mRNA阳性率比较(%,例数),巢式RT-PCR,谢 谢!,