分子生物学常用技术上.ppt

上传人:牧羊曲112 文档编号:5929618 上传时间:2023-09-05 格式:PPT 页数:121 大小:5.88MB
返回 下载 相关 举报
分子生物学常用技术上.ppt_第1页
第1页 / 共121页
分子生物学常用技术上.ppt_第2页
第2页 / 共121页
分子生物学常用技术上.ppt_第3页
第3页 / 共121页
分子生物学常用技术上.ppt_第4页
第4页 / 共121页
分子生物学常用技术上.ppt_第5页
第5页 / 共121页
点击查看更多>>
资源描述

《分子生物学常用技术上.ppt》由会员分享,可在线阅读,更多相关《分子生物学常用技术上.ppt(121页珍藏版)》请在三一办公上搜索。

1、分子生物学常用技术,PCR产物,A-T克隆,测序,重组表达载体,重 组 蛋 白,制备抗体,转 染 细 胞,(1)PCR(2)核酸的纯化:凝胶回收Kit(3)连接反应:16过夜/22 2h(4)CaCl2法制备感受态细胞:Kit(5)宿主菌的转化及蓝白筛选(6)挑克隆:2ml 含抗生素的LB(7)提质粒:Kit(8)重组质粒的鉴定:双酶切反应、菌落PCR(9)测序:生物技术服务公司(10)菌种保存:2030%甘油-LB,-20/-70,步骤:,(11)外源基因在哺乳动物细胞中的表达:质粒转染、电转染(12)目的基因表达的鉴定:RT-PCR、Northern Blot、原位杂交、Southern

2、Blot(13)目的蛋白表达的检测:原核表达:SDS-PAGE(重组蛋白诱导表达的诱导剂浓度、诱导时间和温度、重组蛋白表达的形式)、WB 真核表达:Western Blot、ELISA、免疫组化,(14)重组蛋白的纯化:亲和层析,His-tag/GST-tag(15)制备抗体:多抗和单抗(16)基因功能检测:提高/降低表达水平 细胞周期检测:流式细胞仪 细胞增殖检测:MTT 细胞凋亡检测:流式细胞仪、TUNEL、DNA Ladder 抑瘤活性检测:体外、体内 对血管化的影响。(17)作用机制,实验 XXX设备:加样器耗材试剂和配制方法:详细步骤:详细,1.核酸的分离纯化和鉴定:基因组DNA、总

3、RNA、质粒2.基因的克隆与鉴定方法3.外源基因转移技术和表达体系4.检测方法:电泳技术:agarose、SDS-PAGE 分子杂交:SB、NB、WB、基因芯片技术 DNA序列测定 生物信息学分析技术5.基因功能研究的方法6.组学研究技术:基因组学、蛋白质组学,内容,核酸的基本组成,Albrecht Kossel,1910年诺贝尔生理或医学奖,揭示核酸的化学成分,“其对蛋白质,包括核物质的研究工作为我们了解细胞化学作出了贡献”,Lord(Alexander R.)Todd,核苷酸的基本结构,1957年诺贝尔化学奖,“核苷和核苷辅酶”,1962年诺贝尔生理或医学奖,“发现核酸的分子结构及其对于生

4、命物质信息传递的重要意义”,DNA分子的二级结构,数量庞大dNTP(dATP,dCTP,dGTP,dTTP)3,5-磷酸二酯键(共价键)直线形多聚体方向:5-3,5 CAG.3,特点,DNA半保留复制,变性与复性,变性:指核酸双螺旋区的氢键断裂,变成单链,不涉及共价键断裂,不引起分子量降低。,一、核酸的分离、纯化和鉴定基因组DNA的分离、纯化:PCR、Southern-blot、构建基因组文库实验材料:哺乳动物组织(50100mg)哺乳动物细胞(5x105107)六孔板/T25,实验步骤:RT 匀浆:TE pH8.0 组织(液氮冻存、研磨)消化:EDTA、SDS、蛋白酶K、RNase、37/5

5、5 抽提:酚、氯仿、异戊醇 沉淀:异丙醇/NaAc+无水乙醇 洗涤:75乙醇 干燥:风干 溶解:TE/H2O,注意事项:(1)试剂:pH值准确(2)蛋白酶K:20mg/ml,分装,-20,避免反复冻融(3)抽提:完全,不要触及蛋白层(4)干燥:避免过分(5)操作:小心,机械剪切作用,80100kb,2.总RNA的分离纯化:略,3.质粒:细菌等微生物细胞染色体以外,能独立进行 复制和遗传,赋予宿主细胞一定生物学性状 的共价闭环双链DNA分子。,合格质粒的组成要素,复制起始位点:原核1个,真核多个抗性基因多克隆位点启动子增强子终止信号加polyA信号,第二步:筛选标记:如抗性,决定使用什么筛选标记

6、:(1)Ampr:水解-内酰胺环,解除氨苄的毒性。(2)tetr:可以阻止四环素进入细胞。(3)camr:生成氯霉素羟乙酰基衍生物,使之失去毒性。(4)neor:氨基糖苷磷酸转移酶 使G418(长那霉素衍生物)失活。(5)hygr:使潮霉素失活。,如何阅读质粒?,第一步:质粒类型:Ori位置,原核/真核/穿梭质粒;,第三步:多克隆位点,内切酶位点,第四步:外源基因插入片段大小,10kb,大选大小找小,第五步:表达系统元件:启动子-核糖体结合位点-克隆位点-转录终止信号。克隆载体/表达载体,碱裂解法,Omega:Plasmid Mini KitI D6943-01?,4、核酸纯度的鉴定,OD26

7、0和OD280应大于0.05,OD260:DNA,RNA;OD280:蛋白质,浓度:1OD260:50g/ml 双链 DNA 40g/ml 单链 DNA,总RNA 35g/ml 单链RNA 20g/ml 单链寡核苷酸,纯度:OD260/OD280:蛋白质污染程度,DNA 1.8,RNA 1.72.1 OD260/OD230:碳水化合物污染程度,2.0,二、基因的克隆与鉴定方法,基因的化学合成目的基因的克隆策略(1)根据已知碱基或氨基酸序列克隆基因(2)根据表型变异克隆基因(3)基于图谱的基因克隆方法3.文库的构建与目的基因的克隆 4.PCR反应与目的基因的克隆5.目的基因克隆的鉴别与分析,基因

8、的化学合成前提条件:已知基因的核苷酸序列或蛋白质的氨基酸序列适用:分子量较小、价值极高的目的基因历史:1979年,Khorana等首次合成E coli酪氨酸tRNA基因方法:磷酸二酯法、磷酸三酯法、亚磷酸三酯法方式:固相合成法和自动合成法,2.目的基因的克隆策略,(1)根据已知碱基或氨基酸序列克隆基因 a.一个基因的序列已知:PCR技术,目的DNA片段,b.一个基因的一段碱基序列已知:反向PCR/RACE,cDNA全长;探针:筛选cDNA文库,cDNA全长,c.一个或多个物种的某种基因序列已知:同源性比较,保守序列,探针/引物,文库筛选/PCR,从新物种中 分离功能相似的基因,d.已知蛋白质的

9、氨基酸序列:密码子的兼并性,可能的 核苷酸序列,探针,筛选基因组/cDNA文库,基因序列,(2)根据表型变异克隆基因:未知序列基因的克隆,转座子示踪技术:又称转座子标签法,酵母和植物,a.提总RNA:具有对比意义的两组,注意痕量DNA的污染 b.反转录:得到细胞内所有基因的cDNA库 下游引物:12组,T12MN(M:A、C、G;N:A、C、G、T)c.PCR扩增:32P,35S 上游引物:2426组,10mer 下游引物:同反转录 共计288312种PCR反应,mRNA 差异显示:DD-PCR,1992,只能分离与某种 处理或特征有关的基因,步骤:,d.电泳:测序胶或非变性聚丙烯酰胺凝胶,放

10、射自显影e.克隆:PCR差异带的回收、扩增和克隆 f.Northern blotting鉴定:排除假阳性g.序列分析:Blast,递交新序列h.全长基因:RACE或筛选cDNA文库i.基因功能研究:生物信息学,扩增条件:前14个循环采用不严格扩增条件(降低退火温度,增加引物与Mg2+浓度),促使引物与模板的错配;后续PCR循环则采用严格的扩增条件。,基因片段的开放读框,氨基酸序列的功能结构域分析,注意:a.与常规PCR不同,该方法可以保持样品中不同模板的相对比例;b.由于某一刺激因素常常影响数十、甚至数百基因的表达变化,但并不是每个基因的表达变化在此过程都起着重要的作用;c.电泳显示的单一扩增

11、带并不表明它只含有单一的基因。,优点:操作简单、敏感、快速、重复性好、要求的起始RNA量 少、可同时检测某因素作用下表达升高与降低的基因。缺点:大规模地筛选,假阳性率高,得到的多为短片段,且都靠近3端,发展:EDD、ODD、GDD、LDD、FDD(增强、有序、基因组、长程、荧光),消减杂交:又称扣除杂交,克隆差异表达的基因,(3)基于图谱的基因克隆方法:依赖于遗传图谱和物理图谱,可以用来分离与已知分子标记紧密连锁的基因。,方法:染色体跳查:速度快,200kb片段 染色体步查:40kb片段,举例:囊性纤维化跨膜传导调节蛋白(CFTR)-囊性纤维化(常隐)亨廷顿病基因(HD)-亨廷顿病(常显)肌营

12、养不良基因(MD)-肌营养不良症(X隐),3.文库的构建与目的基因的克隆,分类:按组成基因文库的重组DNA片段的供体来源分为两类 cDNA文库:重组DNA片段来源于细胞表达出的mRNA,用于某类特定细胞中基因组的表达状态以及 表达基因的功能鉴定的研究。基因组文库:重组片段供体是某种特定生物个体的基因组DNA,主要用于基因组物理图谱构建、基因组序列分析、基因在染色体上的定位、基因组中基因的结构和 组织形式分析等方面的研究。,基因文库:指采用体外克隆技术得到的一个重组DNA分子群体。,(1)cDNA文库,步骤:cDNA合成,连接到质粒/噬菌体载体上,转化或感染大肠杆菌,产生cDNA文库。,cDNA

13、=copy DNA,cDNA文库的筛选:,(2)基因组文库,概念:是由大量独立克隆形成的群体,指能够代表某种 有机体整个基因组的一套克隆。,步骤:DNA样品的制备用限制性内切酶酶切基因组DNA 电泳分离回收约20kb的大片段与限制性内切酶处理 的载体连接在体外包装成噬菌体颗粒,侵染大肠杆 菌文库的扩增,4.PCR反应与目的基因的克隆,发展历史基本原理反应体系常见类型建立PCR实验室,Kary B.Mullis,Michael Smith,PCR和定点突变突变,1993年诺贝尔化学奖,“发明了聚合酶链反应(PCR)的方法”,“开创了基于寡聚核苷酸的定点突变 方法及其在蛋白质研究中的发展”,(1)

14、PCR发展史,1.1983年春,Mullis提出PCR的概念;2.1983年9月,Mullis用大肠杆菌DNA聚合酶做第一个PCR实验,只一个循环;3.1983年12月,同位素标记的10个循环后的49 bp长度的第一个PCR片断;4.1985年12月20日,Mullis的同事Saiki在Science上发了一篇论文,方法中用了PCR技术,导致Mullis的文章到处被拒;5.1985年10月25日申请PCR专利,1987年7月28日批准(专利号 4,683,202),这次Mullis是第一发明人。6.1986年5月,Mullis在冷泉港实验室做专题报告,全世界开始学习PCR方法;7.1986年6

15、月,Cetus公司纯化了第一种高温菌DNA聚合酶,Taq DNA polymerase,这是1985年春天Mullis建议做的;8.1988年,第一台PCR仪问世;9.1991年,Hoffman LaRoche以3亿美元代价从Cetus公司获得全权开发权。10.1993年,Mullis获得诺贝尔化学奖,PCR和DNA重组技术一样意义深远。,PCR仪的变迁,1.三个水浴锅,用手移动(Mullis等人当时用的)2.电加热块 自来水冷却(PE,1988)3.电加热块 内置循环液冷却(PE,1989)4.三个加热块 机械手(Stratagene,1994)5.半导体制冷和加热(MJ,PE,BioMet

16、ra,Eppendrof)6.温度梯度,荧光检测(如 Roche的Lightcycler)7.风加热8.Lab-on-chip式的PCR仪(所谓的芯片PCR)中国的状况 1.1991年出现三个水浴锅+机械手原始PCR仪(华美,复日等);2.现在以半导体(Peltier板)制冷式为主(杭州博日,上海天呈,厦门安普利等)。,PCR相关的术语和产品,T-vectorHotStart TaqRT-PCRRAPD-PCRDDRT-PCRLM-PCRInverse PCRNested PCRReal-time PCRRACEFlow chip PCR,TASMultiplex PCRImmuno PCRA

17、symmetric PCRLP-PCRNASBA Recombinant PCR AFLPSSCPIn situ PCRTaqMan/SYBR green,(2)原理:模板变性、引物退火、DNA 聚合酶进行DNA链延伸,PCR产物呈指数方式增加,2530个循环,理论109 分子,实际105107,PCR产物生成曲线,logDNA,Cycles,PCR,3-4 小时,特点:特异性、有效性、忠实性,1.操作简便省时;2.灵敏度高;3.特异性较强,但有一定的假阳性率。提高退火温度可以提高特异性;4.对原始材料的质量要求较低;5.有一定程度的单核苷酸错误掺入。因为Taq DNA聚合酶缺乏35核酸外切酶

18、活性,不能纠正反应中发生的错误核苷酸掺入。,a.模板DNA:单链或双链DNA,避免DNA聚合酶抑制剂和能结合 DNA的蛋白质污染。,b.引物:人工合成的两段与待扩增靶DNA侧翼片段互补的寡核苷酸。0.10.5 mol/L,c.Mg2+的浓度:反应产物的特异性和产量,1.5mmol/L。,d.dNTP:50200mol/L,四种dNTP浓度相同。,e.Taq 酶:Klenow/Taq酶/高保真Taq酶,2.5U/100l。,f.参数:94 5min-30(94 30sec-55 30sec-721 min)-72 7min,(3)组成,10Taq Buffer 2.5l引物(10mol/L)21

19、l H2O:管内总nmol数/10(ml)dNTP(2.5mmol/L)2.0lH2O 16.2lTaq酶(0.5U/l)1.3l 4模板 1l,25l PCR体系,PCR mix::存于-20,2.5mM dNTP 80l10Taq buffer 100lH2O 648l,25l体系:20l反应15l体系:12l反应,温度高,特异性高,2XMaster Mix=dNTP+Taq酶+Taq buffer+loading buffer,H2O 7l引物(10mol/L)21lMaster Mix 10ul模板 1l,Kit:天根生化,2XPfu Master Mix,加A尾?,影响因素,模板:n

20、g级的质粒DNA,g级基因组DNA。引物:引物浓度不宜偏高,否则易形成引物二聚体。特异性Mg2+浓度:特异性及产量dNTPs浓度:正确性和产量 Taq酶用量:非特异性循环参数:常规为2530个循环,DNA聚合酶催化DNA链的延伸,DNA聚合酶的活性,大肠杆菌的 DNA聚合酶,聚合酶:修复合成,不参与DNA复制,真核细胞的 DNA聚合酶:DNA聚合酶、mt,应用:双链DNA的3末端标记,Taq DNA聚合酶(Thermus aquaticus,Cetus/Roche)Tth DNA聚合酶(Thermus thermophilus,Toyobo)Pfu DNA聚合酶(Pyrococcus furi

21、osus,Stratagene)Deep Vent DNA聚合酶(Bio-labs)Tfl DNA聚合酶(Thermus flavus,Promega)Tli DNA聚合酶(Thermococcus litoralis,Promega)Vent DNA聚合酶(Bio-labs)Pwo DNA聚合酶(Pyrococcus woesei,Roche)Pfx DNA聚合酶(Thermococcus kodakaraensis,Invitrogen)Dynazyme DNA聚合酶(Thermus brockianus,Finnazyme)FD DNA聚合酶(Thermus sterophilus?,复

22、旦大学)Tma,Tne,KOD,耐高温DNA聚合酶种类,1)长度一般为18-25个碱基;2)尽可能择碱基随机分布的序列;3)两条引物的G+C的百分比应尽量相似,多为4555%;4)避免引物内部形成二级结构;5)两引物之间不应发生互补,特别是在3端;6)引物3末端碱基可以影响Taq酶的延伸效率,最好选T、G 或C,而非A;7)引物5端允许有一段序列不与模板配对,内切酶,保护碱基。,引物设计,原则,软件/网站:?,第一步:查找目的基因序列:mRNA序列(NCBI,GenBank),第二步:核酸内切酶位点分析,此处粘贴序列,第三步:选择载体,原核表达载体:His:pET,pRSET GST:pGEX

23、真核表达载体:pcDNA3,pcDNA3.1 myc:pCMV-myc,pcDNAmyc/His,pSecTag2 HA:pcMV-HA Flag GFP:pEGGFP-N,pEGFP-C,pIRES2-EGFP RFP病毒表达载体:pAdEasy。,His-tag,GGAGAA,1 atg aat ttt caa cag agg ctg caa agc ctg tgg act tta gcc aga 451 M N F Q Q R L Q S L W T L A R 1546 ccc ttc tgc cct cct ttg ctg gcg aca gcc tct caa atg cag at

24、g 9016 P F C P P L L A T A S Q M Q M 30541 gac gta gaa gca gct ctg acc aaa gcc ctt ggg gaa gtg gac att 585181 D V E A A L T K A L G E V D I 195586 ctt ctg acc tgg atg cag aaa ttc tac aag ctc tga 621196 L L T W M Q K F Y K L*,。,5 保护碱基+酶切位点+起始密码+目的基因5末端序列 3,1 atg aat ttt caa cag agg ctg caa agc ctg tg

25、g act tta gcc aga 451 M N F Q Q R L Q S L W T L A R 15,上游引物,上游有标签 读框,586 ctt ctg acc tgg atg cag aaa ttc tac aag ctc tga 621196 L L T W M Q K F Y K L*,下游引物:反向互补,5 保护碱基+酶切位点+终止密码+目的基因3末端反向互补序列 3,下游有标签 读框,1)T=2(A+T)+4(G+C)-35 2)T=22+1.46 ln35 ln=2(G or C)+(A or T)2035nt 3)T=81.5+16.6lgJ+0.41(G+C%)-(60

26、0/l)-0.63(FA%)J+=monovalent cations l=oligonucleotide length FA=formamide 1470nt,温度高,特异性高,退火温度,图PCR产物电泳结果(1.5%Agarose)1.DNA相对分子质量DL2000;2.PCR产物;3.PCR空白对照。,a.样品准备区:提取核酸,在没有DNA的干净环境中进行,PCR实验室,b.前PCR区:加样区,配制所用的试剂。,c.后PCR区:反应后处理样品 这一区域的所有试剂和仪器不能用于任何前PCR活动,a.阴性(无模板)、阳性对照(阳性模板)b.配制PCR混合物:PCR buffer+dNTP+H

27、2Oc.控制污染:靶序列污染,气溶胶,注意事项,实验室分区;紫外线(距离1m,400W/cm2)照射;更换试剂;换仪器;换实验室;用另一套引物;用化学法修饰DNA;停试验。,限制性核酸内切酶:,识别DNA的特异序列,并在识别位点或其周围切割双链DNA的一类核酸内切酶。,+,Bam H,命名原则,EcoR I,“发现限制性内切酶及其在分子遗传学方面的应用”,1978年诺贝尔生理或医学奖,Werner Arber Daniel Nathans Hamilton O Smith,按组织特点分类:,GGCA,酶活性单位,一个活性单位:在适当的反应条件,1小时,完全酶解1g DNA底物,限制性内切酶的量

28、。,标准的酶解反应:50l反应体系,1U内切酶,最适反应条件,1小时,1g DNA完全降解。,单酶切/双酶切反应:30 l,37 24h,1.质粒2,5.质粒2种内切酶3.DNA/Hind 4.DL2000,迁移率:同样大小分子 超螺旋 线性分子 缺口或松弛 环状 线性/缺口,影响因素,DNA:纯度、甲基化程度、分子结构缓冲液:pH值溶液:离子种类及浓度消化反应的温度反应体系中甘油浓度,星号活力:Star活力,改变酶反应条件,识别特异性降低,共性,(*),甘油含量高:酶量不超过反应体积的10%;1/30 内切酶用量过大:100U/gDNA;210U/g DNA 离子强度低:25mmol/L;推

29、荐Buffer pH值高:pH7.58.5,EcoRI出现*;pH7.0 含有机溶剂:DMSO,乙酸等;DNA纯度 二价阳离子:Mn+,Co+,Zn+等;Mg+,诱发因素:,Bam H,+,Hind,+,平端切口,粘端切口,有些限制性内切酶虽然识别序列不完全相同,但切割DNA后,产生相同的粘性末端,称为同尾酶。这两个相同的粘性末端称为配伍未端(compatible end)。,Bam H,Bg l,+,+,T4DNA连接酶 16 12h 4 12h 室温 15min,连接,Bam H切割反应,T4 DNA连接酶,同一限制酶切位点连接,Eco R切割位点,Bg l切割位点,配伍末端的连接情况和同

30、一限制酶切位点连接相似。,不同限制酶切位点的连接,平端连接,Eco R,人工接头,互补现象,pUC系列质粒(lac操纵子),-半乳糖苷酶氨基端,细菌(-半乳糖苷酶氨基端缺陷型),蓝色菌落,外源DNA插入,白色菌落,-半乳糖苷酶,缺陷型,蓝白筛选,a.大量扩增目的核酸片段b.检测基因的整合、表达情况c.在核酸中引入突变d.核酸测序e.克隆新基因f.生物多态性的研究,应用,医学领域,a.疾病基因检测/遗传病的产前诊断b.致病病原体的检测 c.肿瘤治疗中癌基因的检测 会推广到大部分疾病治疗前的检测 d.DNA指纹、个体识别、亲子关系鉴别、法医物证 e.其他:动、植物检疫(转基因动植物检测),长片段P

31、CR,Taq酶:LA Taq酶(5U/50l反应)dNTP:2.5mM 8 l延伸:5min循环:25,-Hind,第一轮PCR,巢式PCR:模板数低,增加特异性扩增,提高扩增效率。需要两到三对引物,反转录PCR:RE-PCR,略,b.当突变位于基因的中间部位时,可以采用以下方法。,研究蛋白质结构与功能之间复杂关系的重要工具。,定点突变:,a.突变位点位于基因两侧,在引物中加突变碱基;,方法一,方法二,定量PCR,普通PCR:对终产物进行定性和半定量分析;PCR 产物的长度从100bp数kb。定量PCR:实时检测每个循环扩增产物量的变化;通过Ct值和标准曲线对起始模板定量分析;PCR产物长度一

32、般在 60150 bps。,logDNA,不同样品有不同的生成曲线,非特异性:SYBR Green:与DNA双链的小沟结合,双链时 有荧光,单链时无荧光。特异性:Taq man:水解型杂交探针,5端有报告基团R,3端 有荧光淬灭基团Q,R和Q分开时有荧光。Molecular Beacon:分子信标,一端有荧光素,另一 端有淬灭剂的发夹探针,环与目标序列互 补,颈由互补配对序列组成。,荧光标记试剂,SYBR green,SYBR green,优点:对DNA模板没有选择性,适用于任何DNA;使用方便,不必设计复杂探针;非常便宜,$1/PCR 反应缺点:容易与非特异性双链结合,产生假阳性,需要努力

33、优化反应条件;对引物特异性要求较高。,应用范围:起始模板测定;基因型分析;溶解曲线分析。,Taq Man,ABI 公司1995年11月申请专利。,应用范围:起始模板定量,基因型分析,目的基因定量,产物鉴定,SNP分析。,优点:对目标序列的特异性高,阴性结果确定;设计相对简单,与目标序列某一区域互补;重复性比较好。缺点:只适合一个特定的目标;委托公司标记,价格较高;不易找到本底低的探针。,Taq Man,Molecular Beacon,Molecular Beacon,应用范围:起始模板定量,基因型分析,产物鉴定,SNP分析。,优点:高特异性,是对目标序列检测SNP最敏感的试剂之一;荧光背景低

34、。缺点:只能用于一个特定目标;设计困难;价格较高。,方法比较,附加:http:/taxonomy.zoology.gla.ac.uk/rcruicks/additives.html,PCR的网上资源,5.目的基因克隆的鉴别与分析,选择:指在宿主细胞生长过程中施加了某些选择压力,由于重组DNA分子导入获得了某些性状的细胞可以生存。分两类:载体存在时的简单选择和利用对一定突变的补偿 特性通过直接选择来克隆目的基因筛选:指对选择过程中存活的细菌克隆或形成的噬菌斑群体进行 分析,从中寻找目的基因克隆,筛选的方法必须具有高度 的专一性和灵敏度。,目的克隆的鉴定是基因分离过程中最为困难的环节,(1)遗传学

35、选择和筛选方法 利用抗生素选择宿主细胞是否包含载体分子,如:氨苄青霉素抗性质粒 重组克隆选择方法中,常用蓝白筛选,即插入失活。,(2)核酸杂交筛选:又称鸟枪法途径,使用已经定性的探针对文库进行筛 选,可以找到目的克隆。探针:cDNA、基因组DNA、寡核苷酸片段和RNA,(3)表达文库的免疫学筛选:即通过对目的基因表达产生的蛋白质产物进行 免疫学筛选,先将合成的cDNA连接到带有启动子的载体上构建表达文 库,用特定蛋白的抗体作为探针进行筛选,通过表达产物与抗体的特异 性结合在文库中寻找目的cDNA克隆。,(4)目的基因的定性分析:最确切的基因分析方法是序列分析。,思考题:,做PCR实验之前,你应

36、该做哪些准备工作?设计引物时,需要注意哪些问题?一位同学未能将PCR产物连入表达载体,请分析可能是哪些环节出问题?你是如何理解质粒的?如果你做某个实验,三次都未得到你想要的结果,你准备下一步怎么办?,1.王镜岩等主编,生物化学,第三版,高等教育出版社,2002年。2.张迺蘅主编,医学分子生物学,北京医科大学出版社,1999年。3.徐钤主编,基因的分子生物学,中国科学技术出版社,1992年。4.Horton HR,et al.Principles of Biochemistry.Third edition.2002.5.Mader SS.Biology.Fifth edition.1996.,参考文献,6.金冬雁,黎孟枫译.分子克隆试验指南7.颜子颖,王海林译.精编分子生物学试验指南8.黄培堂等译.PCR技术试验指南9.姜泊等.分子生物学常用实验方法10.郑晓飞主编,RNA实验技术手册,科学出版社,2004年。11.徐子勤,功能基因组学,科学出版社,2007年12.Weaver RF.Molecular Biology.2e,2002(影印版)13.公司Protocol:Invitrogen,Clontech,Santa Cruz,Promega,ToKaRa,Tiangen,谢谢,

展开阅读全文
相关资源
猜你喜欢
相关搜索
资源标签

当前位置:首页 > 生活休闲 > 在线阅读


备案号:宁ICP备20000045号-2

经营许可证:宁B2-20210002

宁公网安备 64010402000987号