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1、植物叶片DNA的提取 DNA extraction,实验一,实验原理,利用基因组DNA较长的特性,可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。加入一定量的异丙醇或乙醇,基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中,可用玻棒将其取出,而小分子DNA则只形成颗粒状沉淀附于壁上及底部,从而达到提取的目的。在提取过程中,染色体会发生机械断裂,产生大小不同的片段,因此分离基因组DNA时应尽量在温和的条件下操作,如尽量减少酚/氯仿抽提、混匀过程要轻缓,以保证得到较长的DNA。一般来说,构建基因组文库,初始DNA长度必须在100kb以上,否则酶切后两边都带合适末端的有效片段很少。而进行RFLP和PCR分析
2、,DNA长度可短至50kb,在该长度以上,可保证酶切后产生RFLP片段(20kb以下),并可保证包含PCR所扩增的片段(一般2kb以下)。不同生物(植物、动物、微生物)的基因组DNA的提取方法有所不同;不同种类或同一种类的不同组织因其细胞结构及所含的成分不同,分离方法也有差异。在提取某种特殊组织的DNA时必须参照文献和经验建立相应的提取方法,以获得可用的DNA大分子,尤其是组织中的多糖和酶类物质对随后的酶切、PCR反应等有较强的抑制作用,因此用富含这类物质的材料提取基因组DNA时,应考虑除去多糖和酚类物质。,实验材料和试剂,实验材料:植物幼嫩叶子。实验所需试剂:,提取缓冲液:100 mmol/
3、L TrisCl(pH8.0),20mmol/L EDTA,500 mmol/L NaCl,1.5%SDS2.80:4:16/氯仿:戊醇:乙醇 3.RnaseA母液 其它试剂:液氮、异丙醇、TE缓冲液,无水乙醇、70%乙醇、3mol/L NaAc。,实验仪器,离心机,各种型号的微量移液枪,研钵,不同型号的eppendorf管,实验步骤:水稻幼苗或叶片0.1-0.2g,剪碎,置研钵中,加入1mL提取缓冲液,研磨成浆;2.吸入1.5mL EP管中,剧烈摇动混匀;3.60水浴保温30-60min,不时颠倒混匀;4.室温下10000rpm离心5min;5.小心吸上清于新的离心管中,加入等体积氯仿,剧烈
4、震动;6.室温下10000rpm离心5min;7.小心将上清吸入新的离心管中;8.加入1倍体积异丙醇,室温下放置片刻即出现絮状DNA沉淀。8000rpm离心5min,弃掉上清;75酒精洗一次,晾干沉淀;10.加入5L RNaseA(10g/L),37 10min,除去RNA。11.加50-100l水融解,-20贮存。,1.植物叶子0.1-0.2g,剪碎置预冷研钵中,加入1mL提取缓冲液,研磨成浆,2.吸入1.5mLeppendorf 管中,摇动混匀,3.60水浴保温30-60min,4.10000rpm离心5min,5.吸上清于新的离心管中,加入等体积氯仿,颠倒混匀,6.再次10000rpm离
5、心5min;将上清小心吸入新的离心管中;,7.加入1倍体积异丙醇,-20 放置10min,出现絮状DNA沉淀;随后8000rpm离心5min,弃掉上清;75酒精洗沉淀一次晾干沉淀;加5L RNaseA(10g/L),37 10min,除去RNA;加50-100L的TE Buffer,取1-5L电泳检测;其余-20 贮存备用。,DNA样品在0.7%Agarose胶上电泳(例图),实验注意事项,微量移液枪的使用一定要规范,吸取氯仿等有机试剂要注意不要将试剂吸入枪中;提取过程中的机械力可能使大分子DNA断裂成小片段,所以为保证DNA的完整性,各步操作均应较温和,避免剧烈震荡。,思考题:为什么构建DNA文库时,一定要用大分 子DNA?2.如何检测和保证DNA的质量?,