《实验五DNA限制性酶切和琼脂糖凝胶电.ppt》由会员分享,可在线阅读,更多相关《实验五DNA限制性酶切和琼脂糖凝胶电.ppt(21页珍藏版)》请在三一办公上搜索。
1、实验五DNA限制性酶切和琼脂糖凝胶电泳,限制性内切酶,EcoR I Restriction Enzyme,识别序列:-GAATT C-C TTAAG-,Hind III Restriction Enzyme,识别序列:-AAGCT T-T TCGAA-,每一种限制性内切酶都有特定的反应条件 pH范围:7.58.0 缓冲液组份:Tris(三羟甲基氨基甲烷)NaCl、MgCl2、巯基乙醇 温度:37,琼脂糖凝胶电泳,是一种简便、快速的分离纯化和鉴定核酸的方法。,琼脂糖是一种线性多糖聚合物。琼脂糖粉末加热到熔点后冷却凝固,会形成良好的电泳介质。,电 泳,在电场的作用下,在某种支持介质上,将一个混合物
2、分离成若干条区带的过程。,琼脂糖凝胶的浓度与DNA分离范围,试 剂,TBE电泳缓冲液 45mmol/L Tris-硼酸,1mmol/L EDTA,pH 8.0加样缓冲液 0.25%溴酚蓝(深蓝色,300bp)0.25%xylene cyanlo FF(天蓝色,2000bp)40%蔗糖EB(溴化乙锭)染色液(有毒)0.5ug/ml,用水配制,溴化乙锭(ethidium bromide,EB),是一种扁平分子荧光染料,可嵌入核酸的碱基对之间,在紫外线激发下,发出桔红色荧光。电泳结束后,将凝胶浸入 0.5ug/ml的EB溶液中染色10min。在紫外光照射下可见核酸电泳带,DNA量一般5ng。,操作步
3、骤,酶切反应,反应体系 DNA 5ul 10 x Buffer 2ul Hind III 3ul H2O 10ul Total 20ul混匀,37度保温30分钟,制 胶,用电极缓冲液(0.5TBE)配制0.7%的琼脂糖胶20mL0.14g琼脂糖,20mL 0.5TBE微波炉加热至沸腾,确定琼脂糖完全溶解冷却至60左右准备好梳子和胶槽,倒入琼脂糖溶液,冷却凝固,点 样,Sample 1自提DNA 5ul+2ul Loading Dye Sample 2自提DNA酶切液20ul+4ul Loading Dye Sample 3-DNA 5ul+2ul Loading Dye Sample 4-DN
4、A 酶切液20ul+4ul Loading Dye 点样:Sample 1和3各7ul Sample 2和4各10ul,电 泳,接通电源,150v电泳0.5小时,染色和观察,切断电源,取出胶模,将凝胶放入EB染色液中,染色10分钟取出凝胶,紫外灯下观察DNA电泳带型,警告,EB诱变染色和观察时一定要带手套!,提 示,1 自提DNA2 自提DNA/Hind III 3-DNA/Hind III 4-DNA,结果记录与分析,绘制电泳图谱,-DNA/Hind III Marker,-DNA/Hind III Marker 用Hind III彻底降解-DNA贮藏缓冲液:10mmol/L Tris-HCl(pH7.5),10mol/L NaCl,1mol/L EDTA,-DNA/Hind III Markers片段大小(bp)和电泳带型示意图,点样孔,23130,9416,6557,4361,2322,2027,