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1、医学信息检索与利用,文献检索是一门关于如何查询，获取文献资料知识和信息的工具性课程。是培养人们独立学习能力的一种专门知识。由于科学技术发展的日新月异及新知识的快速增长，独立学习能力成为对信息时代新型劳动者素质的必然要求。调查研究表明，一个科技人员应用的知识总量大约只有20%是在学校学习中获取，而80%是在工作和生活中为适应需要而获得的。科学技术的飞速发展导致了文献资料的急剧增长。而它的开放性.平等性和交叉性为人们广泛而快捷地获取信息提供了极大的便利。但是，信息的过量，信息垃圾的产生等等弊端也给人们带来了巨大困惑。而通过文献检索这一门学科，可以帮助人们从浩瀚而深邃的文献信息中吸取适用的知识。并且
2、为你节约了宝贵的时间。,第一节 信息与信息类型一 基本概念,信息 信息可以认为是生物体或有一定功能的机器通过感觉器官或相应的设备同外界进行交流的一切内容的总括。人们可以把信息的概念分为三大类：第一类是有关客观物质世界的信息，既信息是事物存在的方式及其运动规律.特点的外在表现形式。第二类是有关人类主观精神世界的信息，它反映人类所感受的事物运动状态及其变化方式，处于意识和思维状态的信息。第三类是有关概念世界的信息，它反映人类所表述的事物运动状态及其变化方式，用语言.文字.图象.影视数据等各种载体来表示。,信息社会的特征是：1 在信息社会里起决定作用的不是资本而是信息和知识。信息已成为生产力.竞争力
3、和科技成就的象征；2 生产价值的增长主要靠知识和信息；3 从事信息产业的人员占相当大的比例。,知识 知识是人们通过信息 对自然界.人类社会以及思维活动规律的认识与掌握，是人的大脑通过思维重新组合的系统化信息的集合。,情报 情报来源于知识，而知识又来源于信息。任何情报都具有一定的知识和信息，但并非所有的知识.信息都能构成情报，只有那些经过加工并为用户所需要的特定的知识或信息，才称得上情报。情报是一种活化的信息和知识，是一种动态的信息和知识，他能被利用.被活化，否则它仍然是知识.信息的客观存在。,文献 凡属于人类的知识，用文字.图形.符号.声频等手段记录保存下来，并用以交流传播的一切物质形态的载体
4、，都统称为文献。,信息与知识、文献、情报的关系信息知识 情报 文 献,二 文献的种类,按文献载体形式分：纸张型 缩微型 声像型 机读型按文献发布的类型分：图书 期刊 资料按揭示信息内容分：一次文献 二次文献 三次文献一次文献是检索的主要对象，而二次检索是检索的手段和工具，三次文献两者兼备。,三 文献检索的基本原理1文献检索,文献检索可分为两部分，加工整理.使之能够被利用：利用。一句话，就是将文献按一定方式组织存储在某种载体上，并利用相应的方法或手段，从中找出符合需要的文献的过程。,2文献检索语言及检索途径,名称途径 是以书名.刊名或文章的题名（篇名）作为检索标志，利用书名目录（索引）.刊名目录
5、（索引）或题名索引查找文献的途径。著者途径 它是以文献上署名的著者.译者.编者的姓名或机关团体名称作为检索标识，利用著者索引或机构名称索引查找文献的途径。检索时一般是著者姓在前，用全称。名在后，用首字母。,分类途径 分类途径是以文献内容在分类系统中所属的类别（其表现形式为分类号）为检索标识，利用分类索引查找文献的途径。分类法 是一种直接体现知识分类的等级制概念标识系统。其主要特点是按学科.专业集中文献，从知识 分类的角度揭示多种不同文献在内容上的区别和联系，提供以学科分类为出发点的文献信息检索途径。分类法的类目用一种具有自然顺序的标记符号来代表，这就是分类号。分类号的主要作用在于明确各个类目之
6、间的先后顺序，以便排列目录和组织藏书。同时，分类号也是分类检索语言的语词。它代表一个类目，也就表示这个类目的含义，分类号系统也在一定程度上表达各类之间隶属.并列关系。,中图法的R类简表如下,：R 医药.卫生 R1预防卫生 R2中国医学 R3基础医学 R4临床医学 R5内科学 R51 传染病 R52 结核病 R53 寄生虫病 R54 心脏.血管（循环系）疾病 R55 血液及淋巴系疾病 R56 呼吸系及胸部疾病 R57 消化系及腹部疾病 R58 内分泌腺疾病及代谢病 R59 全身性疾病,（4）主题途径,主题途径是以表征文献内容特征的并经过规范化了的主题词为检索标识.利用主题索引查找文献的途径。主题
7、词按字顺排列，便于查找与主题词相关内容的文献。非常适合对相互交叉.相互渗透的课题进行检索。主题词 它是一种多元性检索用词。它是按照每篇文献内容及其学科性质，从特定事物的整体着眼，选定主题词表中能代表事物概念的.确切的.规范化的名词术语。它是代表文献内容的几个基本单词或词组（即主题词）。并把它作为检索标志。把这些主题词按字顺排列起来，就构成主题词主题索引。,主题词有单级主题和多级主题两种。单级主题在主题词下就可以找到所需文献。而多级主题则采用一级主题.二级主题.三级主题。一级主题就是主题词。二级主题也叫做副主题词。它是对主题词起限定作用的。三级主题也可以说是说明语，它对上面的主题词或副主题词做一
8、补充说明。主题词表是标引和检索人员的共同依据。各种检索工具有各自的主题词表，并通过参照系统做规范化处理，使同义词.近义词.同族词.相关词.主题词与非主题词在主题词表中都一目了然。也可通过参照系统指引读者，查找作为主题词的词和主题有关的主题词，扩大检索范围。,（5）关键词途径,关键词途径是以文献的篇名.摘要.以及正文部分出现的具有实质意义的语词为检索标志，利用关键词索引查找文献的途径。关键词未经规范化处理，不受主题词表控制，所以又称自由词。关键词又可以分题内题外关键词。,主题词与关键词的优缺点比较,主题词 采用的词语有较严格的“规范”，主要是对一个概念的同义词.近义词及变异词等进行适当归并，以保
9、证词语与概念的一一对应。进行概念组配检索。（主题词与副主题词组配，用副主题词对主题词进行限定）采用参照系统将某些非主题词指向采用的主题词，并显示相关主题词之间的相互关系。a 用代参照 seeb 相关参照 see relatedc词根参照,a 用代参照，揭示等同关系，规范词意。用“see”和“X”表示。Birth Control see Family Planning生育计划（见）计划生育（非主题词）（主题词）b 相关参照，揭示相关关系。其作用是扩大选词范围。用“see related”（参见）和“XR”（反参见）表示。在该主题词下列出相关参照Family Planning（计划生育）（主题词）
10、see relatedContraception（避孕）（主题词）XR Contraception“see related”前后都是主题词，两主题词之间有相关关系c 词根参照，一般用于解剖学用词。Consider also terms atglomervl_(肾小球),采用类似分类的方法编制主题词分类索引和等级索引。（树状结构表）主题词表每年都进行修改。保证了用词的准确性。采用主题倒置，便利在同一主题下进行检索。Anemia,Aplastic(贫血，再生障碍性)Anemia,Hemolytic（贫血，溶血性）Anemia,Hemolytic Autoimune（贫血，自身免疫性溶血性）Anem
11、ia,Hypochromic（贫血，低血色素性）Anemia,Neonatal（贫血，新生耳）Anemia,pernicious（贫血，恶性）查全率较高。由于它的“规范”，所以缺乏灵活性。,关键词 关键词使用方便。易被人接受。大大节省了检索系统的存储时间，缩短了检索工具出版的时差。随着现代科技发展.新概念.新名词的不断出现，关键词能很好地适应这种变化。它不显示词与词之间的等级关系和相关关系，增加了检索文献的难度。查全率不高。,第二节 计算机检索与数据库,一 计算机检索发展简史 1脱机检索 2连机检索 3光盘检索 4网络检索二 数据库的类型与结构 1数据库的类型书目数据库事实数据库数值数据库全文
12、数据库图象数据库,2 数据库的结构,1.文档(File)2.记录(Record)3.字段（Field）题名、著者、文献来源三个字段构成题录。题录是检索结果显示和文献后所列参考文献的常用格式，也是获取原文所需要的基本信息。,题录基本格式,药物流行病学研究方法王永铭等复旦大学药学院药理教研室药物流行病学杂志 2004.12.10 10（5）527531,由题录索取原文的途径,图书馆全文数据库作者馆际互借等.,三 计算机检索的途径,1自由词检索 2主题词检索 3分类检索 4著者检索 5引文检索 6机构检索 7刊名检索,8默认检索默认检索又称缺省检索.隐含检索，它是指在检索系统预先设定的多个字段中进行
13、检索。列如Medline 数据库中，Search 状态为默认检索所有非限制字段，包括标题.著者.文献出处.文摘.主题词等字段，但不包括语种.出版年等限制字段；CBMdisc 中的“缺省”检索是在中文标题.文摘.主题词.关键词.特征词.刊名6个字段中搜词检索；SCI 光盘数据库中有Basic Index 选项，供检索标题（Title word）,关键词（Keyword）和文摘（Abstractword.）,9限定检索不少数据库提供“limit”检索功能，用来对检索出结果进行数量限定。10其他检索途径,三 文献检索的方法和步骤,1 基本方法 常用法 顺查法，倒查法，抽查法 追溯法 分段法 浏览法,
14、四 检索的步骤,1 分析检索课题，明确检索要求 2选择数据库 3选择检索途径 4确定检索词 5构筑检索提问式上机检索操作 6调整检索策略 7输出检索结果 8获取原始文献 9创建文献跟踪服务,第三节 检索式编写与检索策略调整一 运算符,1布尔算符布尔算符有and,or,not 3 种（1）and and称为“逻辑与”，表示“相交”关系，可用来缩小检索范围。如：检索式 A and B（2）or or 称为“逻辑或”，表示“并列”关系，可用来扩大检索范围。如：检索式 A or B（3）not not称为“逻辑非”，表示“排斥”关系。如：A not B,（4）布尔算符用法,3个布尔算符中，not 优先
15、运算，and其次运算，or最后运算。如果要改变运算次序，用括号来表示括号内的运算符先运算。例如：检索式 甲肝 and 婴儿 or 乙肝and婴儿表示检索婴儿患甲型肝炎或乙型肝炎方面的文献记录。上述检索式也可以写成：（甲肝or乙肝）and婴儿。但写成甲肝or乙肝and婴儿它的检索结果就大不相同了。,2 位置算符位置算符又称邻近符表示检索词在记录中的间隔距离。位置算符适用于自由词检索。不同的检索系统的位置算符不尽相同。常见的有 near,N,W,adj 等。在WinSPIRS WinSPIRS 是运行Windows环境下的美国“银盘公司信息检索系统”(The Silver Platter Info
16、rmation System)WinSPIRS检索系统供检索银盘公司出版的Medline,EMBase,BA等多种光盘数据库。系统中位置算符的表达意思是：,near表示左右两个检索词出现在同一句句子中（有的数据库用same 表示）；near 1表示左右两个检索词紧相邻；near 2表示左右两个检索词之间可以有一个单词或没有单词；near 3表示左右两个检索词之间可以有两个或两个以下单词；依此类推。,比较检索“舌根”的几个检索词 tongue near1 base 只能出现 tongue base的记录tongue near2 base 可以命中出现tongue base和 base of to
17、ngue 的记录tongue near3 base 可以命中出现 tongue base.base of tongue 和 baseof the tongue 的记录。,3 字段限定符 不用字段限定检索时是在默认的几个基本字段中进行检索，字段限定检索则是在指定字段中进行检索。字段限定检索使检索趋向于查准。字段限定检索的表达形式有：“字段标识符检索词”，“字段标识符（检索词）”，“检索词、字段标识符”，最常见的形式是“检索词 in 字段标识符”。例如：hepatoma in ti-检索标题中含有hepatoma的记录；smith-b in au-检索著者字段中出现该著者的记录；顾玉东 in au
18、-同上；anemia in ti，mesh-检索标题字段或MeSH字段中出现anemia的记录；animal in tg-检索特征词字段中出现animal的记录；nature in so-检索期刊Nature上发表的文章；,4.截词符（truncation）,在英语中，有不少含义相同或相近的词与词干相同，词尾不同，如单复数词、英美不同拼词法、同一单词派生出来的名词、动词、动名词和分词等。为了查全，有时这些词都应编入检索式，用运算符or相连接。但这样做大大增加了键盘的输入工作，况且许多同根词未必都能记住。截词符的应用，简化了这一问题。常用的截词符有“*”和“?”。,*称为“无限截词”，表示任何数
19、量的字符，用来查相同词根的所有词。例如，输入immun*，可一次性查出含有immun，immune，immunal，immunity，immunology，immunization，immunizations的记录。?称为“有限截词”，表示一个字符或零个字符。例如，输入computer?来检索，可以查到含有computer，computers，computering，computerize 的记录，但对含有computerization的记录检索无效。用pe?diatrics检索，可检索到含有pediatrics和peadiatrics的记录。,二、检索式编写,检索式又称检索提问式（query
20、），是情报用户向检索系统表达文献需求的句式。简单提问式和复合提问式。简单提问式只含一个检索词，只表达一个简单的检索概念，例如：SARShepatitis b virus in ti（乙型肝炎病毒）舒喘灵 吴阶平 in au,复合提问式含有两个或两个以上的检索词，用布尔算符或位置算符相连接。【例1】acute near3 pancreatitis and(mice or mouse)（急性胰腺炎的小鼠实验）“胰腺炎”之间用位置算符near3是因为其间有可能出现以下词汇：necrotizing（坏死型），biliary（胆汁型），gallstone（结石型），severe（严重型），and chr
21、onic（及慢性）等词汇。Mice是mouse（小鼠）的复数。,【例2】(renal calculi or kidney calculi or kidney stone*)and(surgery or operation)（肾结石的手术治疗）Kidney stone后用截词符表示同时需要检索含有kidney stones的文献记录。为了使文献查全，本检索式列出了“肾结石”的3个同义词 和“手术治疗”的两个同义词。在无主题词的数据库中，提问式中的检索词只检索命中与著者用词完全一致的文献记录，即不命中同义词。检索式中列全同义词，是用于检索无主题词字段的数据库。对于有主题词字段的数据库，不必如此。例
22、如通过Medline检索此课题，提问式应写成：kidney calculi-surgery其中kidney calculi是Medline 的主题词，surgery是副主题词。,【例3】Asthma-chemically-induced and aspirin-adverse-effects（阿司匹林诱发哮喘）本例是检索Medline数据库的检索式。其中asthma（哮喘）是主题词，chemically induced（化学诱导）是副主题词，Aspirin是主题词，adverse effects（副作用）是副主题词。副主题词必须紧跟在主题词后面使用。主题词和副主题词在不同的数据库中未必相同。在
23、数据库EMBase中，“阿司匹林”所用主题词是acetylsalicylic acid，而不是aspirin，药物“副作用”方面的副主题词是adverse drug reaction（用于药物主题词后面）和side-effect（用于疾病主题词后面）。,【例4】心脏瓣膜疾病的综述文献 本例如果查CBMdisc，检索式可能用：心脏瓣膜疾病 and 综述 in pt；如果检索Mediline，有人会用检索式：heart valves diseases and review in pt。这两个检索式都会造成明显的漏检。“心脏瓣膜疾病”是数据库CBMdisc中的主题词，heart valves dis
24、eases是 Medline的主题词。该主题词还有10多个下拉位主题词，如：主动脉瓣关闭不全、主动脉瓣狭窄、二尖瓣闭锁不全、三尖瓣闭锁等。要查全各种心脏瓣膜疾病方面的文献，应当使用下拉位词扩检（见第三章第一节和第三章第三节）。检索式中的综述 in pt和review in pt表示检索综述文献。,检索要领与检索策略的调整,当文献量过少时如何进行扩检：删除某个用and连接的不重要的检索词。增加用or连接的检索词。位置算符放宽。检索词后用截词符。多用副主题词。用下位类主题词扩检。同时用主题词和关键词检索，用or连接。用著者检索、分类检索进行检索补充。多选几个数据库检索。,当文献量过多时如何进行缩检：增加用and连接的检索词、或用二次检索。用特定的副主题词进行限定。用字段限定检索。进行文献类型、语种、核心期刊、年份等的限定检索。进入更专指的分类范围内输词检索。,
