《核苷酸与核酸》课件.ppt

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1、第 六 章核苷酸与核酸Nucleotides and Nucleic Acids,核 酸(nucleic acid),是以核苷酸为基本组成单位的生物大分子,携带和传递遗传信息。,1868年 Fridrich Miescher 从脓细胞中提取核素。1944年 Avery等人证实DNA是遗传物质。1953年 Watson和Crick发现DNA的双螺旋结构。1968年 Nirenberg发现遗传密码。1975年 Temin和Baltimore发现逆转录酶。1981年 Gilbert和Sanger建立DNA测序方法。1985年 Mullis发明PCR技术。1990年 美国启动人类基因组计划(HGP)。

2、1994年 中国人类基因组计划启动。2001年 美英等国完成人类基因组计划。,核酸研究的发展简史,第一节核酸概述The Generality of Nucleic Acids,一、核酸的基本结构单位是核苷酸,二、核苷酸由碱基、戊糖、磷酸组成,(一)核酸中的碱基,嘌呤(purine),腺嘌呤(adenine,A),鸟嘌呤(guanine,G),嘧啶(pyrimidine),胞嘧啶(cytosine,C),尿嘧啶(uracil,U),胸腺嘧啶(thymine,T),稀有碱基(rare base):核酸中含量甚少的碱基。大多数都是甲基化碱基。tRNA中含有较多的稀有碱基,可高达10%。,核酸中部分稀

3、有碱基,(二)核苷酸中的戊糖,H,(三)核苷:AR,GR,UR,CR,嘌呤N-9或嘧啶N-1与核糖C-1通过-N-糖苷键相连形成核苷(ribonucleoside)。,N,N,N,N,9,N,H,2,O,O,H,O,H,H,H,H,C,H,2,O,H,H,1,2,糖苷键,嘌呤N-9 或嘧啶N-1与脱氧核糖C-1通过-N-糖苷键相连形成脱氧核苷(deoxyribonucleoside)。,糖苷键,脱氧核苷:dAR,dGR,dTR,dCR,(四)核苷酸:AMP,GMP,UMP,CMP脱氧核苷酸:dAMP,dGMP,dTMP,dCMP,腺嘌呤核苷三磷酸 ATP,腺嘌呤脱氧核苷一磷酸 dAMP,环式腺

4、苷一磷酸cAMP(环磷酸腺苷),环式鸟苷一磷酸cGMP(环磷酸鸟苷),鸟苷四磷酸 ppGpp,核苷酸的功能,脱氧核苷酸:DNA的组成成分,为数不多的参与代谢的调节。核糖核苷酸:RNA的组成成分,还以多种方式参与细胞内的生理和生化过程。,体内重要的游离核苷酸及其衍生物,含核苷酸的生物活性物质:NAD+、NADP+、CoA-SH、FAD 等都含有 AMP,多磷酸核苷酸:NMP,NDP,NTP,环化核苷酸:cAMP,cGMP,cAMP,三、核苷酸通过3,5-磷酸二酯键连接成多聚核苷酸(核酸),3,5-磷酸二酯键是核酸的基本结构键,多聚核苷酸链方向性。,C,G,A,3,5-磷酸二酯键,多聚核苷酸链方向

5、性,四、核酸分为核糖核酸和脱氧核糖核酸两类,(一)RNA是单链多聚核糖核酸(二)DNA是单链或双链多聚脱氧核糖核酸(三)组成DNA和RNA成分不同(四)多聚核苷酸中核苷酸的排列顺序是核苷酸的基本结构(一级结构),核酸的一级结构:核酸中核苷酸的排列顺序,核苷酸间的差异主要是碱基不同,也称为碱基排列顺序。即碱基序列。,3,5-磷酸二酯键,书写方法,5 pApCpTpGpCpT-OH 3,5 A C T G C T 3,目 录,核酸分子大小表示法:单链DNA或RNA:碱基数目,base,kilobase.双链DNA或RNA:碱基对数目,base pair(bp)kilobase pair(kb)小的

6、核酸片段(50bp),称为寡核苷酸(nt),第二节DNA的三维结构The Three Dimensional Structure of DNA,DNA的空间结构又分为二级结构(secondary structure)和高级结构。,DNA的空间结构(spatial structure),构成DNA的所有原子在三维空间具有确定的相对位置关系。,一、DNA的二级结构是双螺旋结构,(一)Waston和Crick提出DNA双螺旋结构模型,碱基组成分析A=T、G C,不同生物碱基组成不同,同生物、不同组织碱基组成相同,目 录,模型理论基础:hargaff 规则,获得了高质量的DNA分子的X射线衍射照片。,

7、DNA双螺旋结构模型要点(Watson,Crick,1953),1、反向平行、右手螺旋的双链结构:两条相互平行、走向相反的脱氧核苷酸链组成 围绕同一个螺旋轴形成右手螺旋 双螺旋结构的直径为2.37nm,螺距为3.54nm,目 录,亲水性的脱氧核糖-磷酸为骨架位于双链的外侧。疏水性的碱基位于双链的内侧。,碱基垂直螺旋轴与对側碱基形成氢键配对(互补配对形式:A=T;GC)。,目 录,2.DNA双链之间形成了互补碱基对,碱基互补配对:鸟嘌呤/胞嘧啶,碱基互补配对:腺嘌呤/胸腺嘧啶,大沟与小沟,大沟与小沟,目 录,互补碱基对的氢键维系DNA横向结构的稳定。相邻两个碱基对互相重叠产生的疏水作用,成称为碱

8、基堆积力(base stacking interaction)。维系DNA纵向结构的稳定,3、疏水作用力和氢键共同维系着DNA双螺旋结构的稳定。,碱基堆积作用力,(三)DNA双螺旋结构的多样性,(三)DNA双螺旋结构的多样性,B型DNA:Watson和Crick,右手螺旋(1953年)A型DNA:Wilkins(1953年)Z型DNA:Rich等,左手螺旋,(1979年),三种DNA构型的比较,(四)某些DNA 具有更复杂的螺旋结构,Hoogsteen碱基配对 形成三股螺旋DNA T*A=T C*G=C,H-DNA的结构,三链结构,鸟嘌呤之间通过Hoogsteen氢键形成特殊的四链结构(tet

9、raplex)。,四链结构,24条多聚鸟嘌呤核苷酸链形成四螺旋DNA,真核生物DNA3-末端是富含GT的多次重复序列,因而自身形成了折叠的四链结构。,回文结构:反向重复序列1、中线水平回折1800:5-TTAGCACCACGATT-3 3-AATCGTGGTGCTAA-52、水平回折:5-TTAGCACGTGCTAA-3 3-AATCGTGCACGATT-53、部分回折:5-TGCGATACTCATCGCA-3 3-ACGCTATGAGTAGCGT-5,3.在特异碱基序列基础上DNA局部可形成特殊结构,碱基序列依赖性的局部DNA 可形成发夹形或十字形结构,5-TGCGATACTCATCGCA-

10、33-ACGCTATGAGTAGCGT-5,二、DNA的三级结构是超螺旋结构,超螺旋结构(superhelix 或supercoil)DNA在双螺旋基础上通过扭曲、折叠形成的特定三级结构。即超螺旋结构。双螺旋缠绕过分或不足产生的张力,使DNA分子发生扭曲,以抵消张力,这种扭曲称为超螺旋结构。,意义DNA超螺旋结构整体或局部的拓扑学变化及其调控对于DNA复制和RNA转录过程具有关键作用。,(一)原核生物DNA的是环状超螺旋结构,大肠杆菌DNA,4639 bp,环状超螺旋结构,共价闭环双螺旋结构,(二)真核生物的线粒体、叶绿体DNA也是环状超螺旋结构,线粒体DNA(mtDNA):是一个封闭的双链环

11、状分子。人mtDNA全长16,569个碱基对,共计37个基因,分别编码13个蛋白质、2个rRNA、22个tRNA。,(三)拓扑异构酶改变超螺旋的数量和类型,正超螺旋(positive supercoil)双螺旋缠绕过分产生的超螺旋,为左手超螺旋。,负超螺旋(negative supercoil)双螺旋缠绕不足产生的超螺旋,为右手超螺旋。,1核酸拓扑同分异构体,环状DNA的三种拓扑异构体示意图,松弛形环状,负超螺旋(右手),正超螺旋(左手),环状 B-DNA:2000 bp、右手双螺旋周数 200,Lk:双螺旋周数,2拓扑连环数,Lk Tw+Wr,Lk:拓扑连环数(linking number)

12、闭合环状 DNA 双链的互绕数。实际双螺旋周数Tw:扭曲数(twisting number)松弛形DNA双螺旋周数(Lk0),由构象决定的。B-DNA:Tw=Lk0=碱基对数除以10;2000 bp:Tw=200 B-DNA:右手螺旋,Tw为+;Z-DNA:左手螺旋,Tw为-Wr:超螺旋数或缠绕数(writhing number)Wr=Lk=Lk-Lk0,拓扑同分异构体的产生环状 B-DNA:2000 bp LK0=+200 右手螺旋 松弛形:Lk=Lk0=200 Wr=Lk-Lk0=200-200=0 正超螺旋:Lk=202 Wr=202-200=+2 Wr为正,左手超螺旋 负超螺旋:Lk=

13、198 Wr=198-200=-2 Wr为负,右手超螺旋,拓扑同分异构体的产生 环状 Z-DNA 2400 bp LK0=-200 左手螺旋 松弛形:Lk=Lk0=-200 Wr=Lk-Lk0=-200+200=0 正超螺旋:Lk=-202 Wr=-202+200=-2 Wr为负,右手超螺旋 负超螺旋:Lk=-198 Wr=-198+200=+2 Wr为正,左手超螺旋,3.比超螺旋(specific superhelix)超螺旋密度(superhelical density)Wr/Tw,或(Lk-Lk0)/Lk0 正超螺旋:=(202200)/200=2/200=0.01 负超螺旋:=(198

14、200)/200=-2/200=-0.01:DNA拓扑同分异构体超螺旋方向和数量。,3、拓扑异构酶(Topoisomerase)催化DNA连环数的改变,概念:能够引起拓扑异构反应的酶。作用:既能切开又能连接DNA,DNA解链时切开DNA,使DNA拓扑异构体发生改变,不至于打结,适当时候又把切口封闭,,类型:大肠杆菌:至少有2型4种拓扑异构酶。型拓扑异构酶:拓扑异构酶 拓扑异构酶,功能:去除负超螺旋而松弛DNA;型拓扑异构酶:拓扑异构酶 拓扑异构酶,功能:是引入负超螺旋。,真核生物细胞:I型拓扑异构酶:拓扑异构酶I 和III;II型拓扑异构酶:拓扑异构酶II和II。与原核生物的拓扑异构酶不同,拓

15、扑异构酶I:能消除负超螺旋,也能消除正超螺旋,拓扑异构酶III只消除负螺旋,但活性较低。,三、真核生物DNA与组蛋白组成高度有序的染色体,(一)核小体(nucleosome)是染色质的基本组成单位,由DNA和蛋白质构成。,双链DNA缠绕在组蛋白核心上构成核小体:组成:DNA:约 200 bp 组蛋白:H1、H2A、H2B、H3、H4,2组蛋白是小分子量的碱性蛋白质,5种组蛋白:分子量和氨基酸序列有差异;分子量:1121kD,富含精氨酸和赖氨酸。H3,H4氨基酸序列高度保守,序列相似性多,提示功能相同。H1、H2A、H2B的相似性很少。,核心颗粒:146bp H2A,H2B,H3,H4各两分子1

16、46bp,14 0bp,连接区:60bp H1,核小体的结构示意图,a 组蛋白八聚体核心 b 核小体 c 直径30nm纤维的剖面图显示H1的位置 d 核小体组成串珠样的染色质,a,c,b,d,(二)核小体进一步组装成染色质/染色体,DNA双螺旋结构:2 nm第1层次:核小体:200bp,10nm,体积减少6倍第2层次:纤维状结构:6个核小体卷曲,30nm,40倍第3层次:柱状结构:300nm染色质:700nm,1000倍染色体:1400nm,10000倍,端粒,着丝粒,端粒,端粒和着丝粒的结构示意图,基因,分散的重复序列和多重复制起点,(三)真核生物染色体有端粒和着丝粒两个功能区,1端粒(te

17、lomere):是染色体末端的结构,端粒 DNA:重复序列:5-(TxGy)n,比 3-(AxCy)n 长12-16nt。人 1000-1700次,单细胞 20-100 端粒蛋白:结合端粒DNA,保护染色体3末端 TRF-1、TRF-2(telomere repeat binding factor)结合端粒DNA形成T环端粒末端结构。端粒酶:含酶蛋白和RNA 以端粒酶RNA为模板,延长染色体3末端。,端粒酶,端粒酶RNA,模板DNA结合蛋白,TRF1和TRF2,端粒结构,a 端粒末端DNA序列和端粒酶及端粒酶中的RNA序列 b 端粒末端结构示意图,图 a,图 b,2着丝粒是连接两个染色单体的中

18、心部位,着丝粒(centromere)在有丝分裂时,使染色体均等有序地进入子代细胞。着丝粒结构:富含AT,序列简单。酵母着丝粒长130bp。高等真核生物细胞的着丝粒,含有上千个串联短序列拷贝。不同的物种着丝粒重复序列变化很大,反映进化速率快慢。着丝粒DNA的确切功能依然不清楚。,四、DNA是遗传的物质基础,以基因的形式携带和传递遗传信息。DNA的碱基序列含有遗传信息,可作为复制和转录的模板传递遗传信息。是生命遗传的物质基础,也是生命活动的信息基础。,基因的遗传学定义:是携带遗传信息的结构单位,控制遗传形状的功能单位。,基因从结构上定义:(Principles of Biochemistry 3

19、th)A segment of a DNA molecule that contains the information required for the synthesis of a functional biological product,whether protein or RNA,is referred to as a gene.(P325)A gene,therefore,is all of DNA that encodes the primary sequence of some final gene product,such as a polypeptide or an RNA

20、 with a structural or catalytic function.(P908)编码有功能的多肽链或RNA所必需的DNA片段。,(二)细胞中全部遗传信息称为基因组(genome),基因组(genome)一个细胞或病毒的全部遗传信息。绝大多数生物个体的基因组是DNA,但有些病毒的基因组是RNA。,在真核生物体,基因组是指一套完整的单倍体的染色体DNA和线粒体DNA的全部序列。,All of a cells genes and intergenic DNA(the DNA between genes)form the cellular genome.P907,人类基因组:3X109

21、bp 30%编码蛋白质相关,1.5%编码外显子;45%转座子DNA,可从基因组的一处转移到另一处的长短不一的重复序列。25%其它序列:3%为SSR(简单重复短序列),存在端粒和着丝粒。,(三)常染色质与异染色质的DNA活性不同,常染色质(euchromatin),相对比较伸展,是基因表达活跃区域。对DNase敏感。异染色质(heterochromatin),折叠压缩程度较高,是转录不活跃的区段,占染色质的10%,如着丝粒、端粒等。,第三节 RNA的结构与功能 RNA Structure and Function,RNA通常以单链的形式存在,但有复杂的局部二级结构或三级结构。RNA比DNA小的多

22、。RNA的种类、大小和结构远比DNA表现出多样性。RNA与蛋白质共同负责基因的表达和表达过程的调控。,RNA的特点:,一、动物细胞内有4大类RNA,动物细胞内主要的RNA种类及功能,二、信使RNA:具有共同的基本结构框架和编码功能,*真核mRNA的成熟:由hnRNA经过剪切,目 录,mRNA结构特点:,氨基酸编码区5非翻译区、3非翻译区5末端帽子结构(m7GpppNm-)3末端多聚腺苷酸(polyA)结构,帽子结构,(一)5-端具有共同的帽结构 真核生物mRNA的5末端7甲基鸟苷-三磷酸鸟苷结构称为帽子结构。,5,5-磷酸二酯键,转录后在5末端加上一个7-甲基鸟苷,同时第一或第二个核苷酸的C2

23、也进行甲基化,形成m7GpppNm-。,帽子结构的功能:维持mRNA 5末端稳定性。与帽结合蛋白(cap binding proteins,CBPs)结合,转运mRNA到细胞质。与核蛋白体、翻译起始因子的结合,参与翻译起始过程。,(二)3-末端具有多聚A尾结构 真核mRNA的3末端多聚腺苷酸poly(A)结构,称为多聚A尾。PolyA与PolyA结合蛋白(PolyA binding protein,PABP)结合,每1020个碱基结合一个PABP单体。形成PolyA蛋白质多聚体复合物。mRNA核内向胞质的转移;维持mRNA3末端稳定性。,mRNA分子从5-末端的AUG开始,每3个核苷酸为一组,

24、决定肽链上一个氨基酸,称为三联体密码(triplet code)或密码子(codon)。由AUG及其以后的连续三联体密码(无终止信号)组成的核苷酸序列称为开放阅读框(open reading frame,ORF),是多肽链的编码序列。,(三)信使RNA中间序列编码多肽链,(一)tRNA分子含有较多稀有碱基7495个核苷酸组成,含 1020%稀有碱基,如 DHU具有 TC(:假尿嘧啶核苷)3末端为 CCA-OH 5末端大多数为G,三、转运RNA具有特征性的分子结构,tRNA的功能 活化、搬运氨基酸到核糖体,参与蛋白质的翻译。,tRNA中含有多种稀有碱基,1 3,1.氨基酸臂 2.反密码环 3.D

25、HU环 4.TC环 5.额外环,(二)tRNA的二级结构形似三叶草,tRNA单链局部碱基互补形成双链结构。茎环结构(stem-loop)发夹结构(hairpin)。,3-末端都以CCA结尾。3-末端的A与氨基酸共价连结,携带氨基酸不同的tRNA结合不同氨基酸。tRNATyr:未结合酪氨酸的tRNA(未结合)Tyr-tRNATyr:已结合酪氨酸的tRNA(已结合),tRNA的3-末端连接氨基酸,tRNA的反密码子环上有一个由三个核苷酸构成的反密码子(anticodon)。tRNA上的反密码子依照碱基互补的原则识别mRNA上的密码子。,tRNA的反密码子识别mRNA的密码子,(三)tRNA的三级结

26、构呈倒L型,环,氨基酸臂,DHU环,反密码环,反密码子,tRNA三级结构及氢键的位置,*rRNA的结构,四、核糖体RNA的结构更复杂,*rRNA的种类(根据沉降系数),真核生物5S rRNA28S rRNA5.8S rRNA18S rRNA,原核生物5S rRNA23S rRNA16S rRNA,(一)原核生物有3种rRNA,真核生物有4种rRNA,(二)原核生物和真核生物的核糖体均由容易解聚的大、小两个亚基组成。,rRNA与核糖体蛋白质共同构成核糖体。核糖体是蛋白质生物合成的场所,为肽链合成所需要的mRNA、tRNA、多种蛋白因子提供了相互结合的位点和相互作用的空间环境。,(三)核糖体是蛋白

27、质合成的场所,五、细胞内尚有大量其他小分子RNA,除三种RNA外,细胞存在的其他种类小分子RNA,统称为非mRNA小RNA,非mRNA小RNA(small non-messenger RNAs,snmRNAs)。,snmRNAs的种类核内小RNA核仁小RNA胞质小RNA催化性小RNA小片段干涉 RNA(siRNA),研究细胞中snmRNAs的种类、结构和功能。同一生物体内不同种类的细胞、同一细胞在不同时间、不同状态下snmRNAs的表达具有时间和空间特异性。参与基因的表达和转录调控。,RNA组学,(一)细胞核内小RNA 参与mRNA前体的剪接过程,(二)催化性RNA也参与特殊RNA剪接,具有催

28、化作用的小RNA亦被称为核酶(ribozyme)或催化性RNA(catalytic RNA)。催化特定RNA降解,在RNA合成后的剪接中具有重要作用。RHA基因组剪切。,(三)核仁小RNA参与rRNA中核苷酸残基的修饰,(四)小干扰RNA参与转录后调控,siRNA是生物宿主对外源基因表达的双链RNA进行切割,所产生的特定长度和特定核酸序列的小片段RNA。siRNA可以与外源基因表达的mRNA相结合,并诱发这些mRNA的降解。基于此机理,人们发明了RNA干扰技术。双链RNA对基因表达的抑制作用,被称为RNA干扰(RNA interference,RNAi)。,小片段干扰RNA(small int

29、erfering RNA,siRNA),miRNA是体内基因表达产物,与siRNA有相似的功能,在基因表达调控中起重要作用。对生长发育和行为具有十分深远和复杂的影响,与人类疾病发生发展密切相关。对miRNA的研究还处在理论水平,对它的应用还有待进一步探讨。以miRNA为靶点或者以miRNA为诊断和治疗手段的设想,将成为研究的一个焦点。,微小RNA:(microRNA,miRNA):,近几年生命科学研究的热点,2001-2003年Science杂志连续将siRNA、miRNA、RNA干扰方面的研究评为十大科技突破。siRNA和miRNA调控基因表达,影响细胞的许多功能,使人们重新认识RNA分子在

30、细胞进化和功能作用的地位以及广泛的应用前景。,siRNA、miRNA的研究,第 四 节核 酸 的 理 化 性 质Physical-chemical Characters of Nucleic Acids,目 录,一、核酸可被酸、碱水解,目 录,核酸中的糖苷键和磷酸酯键都能被酸、碱和酶水解。DNA易被酸水解RNA易被碱水解,二、核酸是两性化合物,(一)碱基可发生互变异构,酮式,烯醇式,氨式,亚氨式,(二)碱基在体液环境中以碱性解离为主(三)核酸分子是酸性化合物 核酸为多元酸,具有较强的酸性。可与金属离子成盐,不溶于乙醇或异丙醇,三、核酸溶液有高分子性质,粘度:DNA RNA、dsDNA ssDN

31、A 粘度大,易断裂。沉降系数:不同空间结构,沉降速率不同;线性 环状 超螺旋的DNA;超速离心分离。,四、核酸有紫外线吸收的特性,核酸的紫外吸收:OD260单核苷酸 ssDNA(或RNA)dsDNA,碱基的紫外吸收光谱,1.DNA或RNA的定量OD260=1.0相当于50g/ml双链DNA40g/ml单链DNA(或RNA)20g/ml寡核苷酸2.判断核酸样品的纯度DNA纯品:OD260/OD280=1.8RNA纯品:OD260/OD280=2.0,OD260的应用,五、核酸具有变性、复性和杂交行为,定义:在理化因素作用下,DNA双链解开成两条单链的过程。本质:破坏氢键,改变空间结构。方法:强酸

32、、碱,加热,变性试剂(尿素、酰胺)、有机溶剂(乙醇、丙酮)等。理化性质变化:OD260增高.,(一)核酸变性时空间构象破坏,DNA变性的本质是双链间氢键的断裂,变性引起紫外吸收值的改变,DNA的紫外吸收光谱,增色效应:DNA变性时其溶液OD260增高的现象。,DNA的解链曲线,连续加热DNA的过程中以温度相对于A260值作图,所得的曲线称为解链曲线。,解链过程中,紫外吸光度的变化达到最大变化值的一半时所对应的温度。,解链温度(melting temperature,Tm),热变性,解链温度(melting temperature,Tm):变性是在一个相当窄的温度范围内完成。,(二)Tm值是DN

33、A变性的重要参数,在变性温度范围内,紫外吸收值达到最大值的50%时的温度称为DNA的解链温度,又称融解温度。,Tm值的影响因素:1DNA均一性决定熔解温度范围大小:均质DNA Tm范围小、异质DNA Tm范围大。2G-C碱基对含量决定熔解温度高:G-C与Tm值呈正比3介质中的离子强度影响变性:离子强度低、易变性,Tm低;高盐保存。,(三)变性的核酸可以复性与分子杂交,DNA复性(renaturation):在适当条件下,变性DNA的两条互补链可恢复天然的双螺旋构象,这一现象称为复性。,退火(annealing):热变性的DNA经缓慢冷却后复性,这一过程称为退火。,1变性的核酸可复性,减色效应:

34、DNA复性时,其溶液OD260降低。,DNA复性影响因素:分子量大、浓度小、重复序列多,复性快,2.具有同源序列的核酸分子可相互杂交,核酸分子杂交(hybridyzation):不同来源,但具互补序列的核酸,按碱基配对原则形成杂化双链的过程。杂化双链:DNA与DNA分子,DNA与RNA分子,RNA与RNA分子间形成。,DNA-DNA杂交双链分子,不同来源的DNA分子,核酸分子杂交的应用(1)Southern印迹可检测DNA(2)Northern印迹用于检测RNA Western印迹用于检测蛋白质,(3)斑点印迹杂交(Dot blot)(4)DNA芯片(DNA microarray)技术也是利用

35、核酸杂交原理设计的。,第 五 节核 酸 酶 Nucleases,核酸酶是指所有可以水解核酸的酶一、核酸酶的分类有多种方法(一)按底物专一性分类DNA酶(deoxyribonuclease,DNase):专一降解DNA。RNA酶(ribonuclease,RNase):专一降解RNA。,(二)按对底物作用方式不同分类核酸内切酶:限制性核酸内切酶 非特异性限制性核酸内切酶。核酸外切酶:53或35核酸外切酶。(三)按对底物二级结构的专一性分类双链酶:作用于双链核酸单链酶:作用于单链核酸,二、核糖核酸酶是一类RNA内切酶,(一)胰核糖核酸酶(RNase1):嘧啶核苷酸(二)RNaseT1:鸟嘌呤核苷酸

36、(三)RNaseT2:腺嘌呤核苷酸,3种核酸酶作用位点,Py:嘧啶核苷酸;Pu:嘌呤核苷酸,三、脱氧核糖核酸酶是一类DNA消化酶,(一)胰DNase:切割单链/双链,产物DNA是5-磷酸末端的寡聚核苷酸(二)脾DNase:产物是3-磷酸末端的寡聚核苷酸(三)BAL 31 核酸酶:DNA外切酶活性为主。(四)限制性内切核酸酶:具有位点特异性。,四、N-糖苷酶可移去碱基,N-糖苷酶(glycosidase):水解核苷酸的N-糖苷键,切除核苷酸的碱基。有碱基特异性或非特异性的糖苷酶。,第六节重要的核酸分离、分析技术Techniques for Isolation and Identification

37、 of Nuclear Acids,一、分离核酸有多种方法,(一)酚抽提法是分离核酸的基本方法1酚抽提法可抽提DNA 2酚抽提法也可提取RNA(二)超速离心可分离核酸(三)凝胶电泳法分离核酸很常用(四)层析法分离核酸与分离蛋白质原理基本相同1亲和层析法分离特异核酸2凝胶过滤层析又称分子筛过滤,(一)Sanger法又称双脱氧终止法(二)Maxam和Gilbert法是化学裂解测序(三)tRNA序列分析比DNA测序更复杂,二、两种方法常用于核苷酸序列测定,Sanger双脱氧法DNA测序,返回,双脱氧三磷酸核苷酸,ddATP,目的和要求,掌握:核酸的组成与一级结构;DNA双螺旋结构模型特点;mRNA和tRNA结构与功能;核酸理化性质及其应用。熟悉:DNA超螺旋结构与DNA的功能;rRNA的结构与功能;核酸酶与核酶。,

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